表观遗传读者域

基因表达和染色质状态的表观遗传调节因子包括所谓的编码器，擦除器和染色质修饰的读者。阅读器结构域的特征性示例包括通常结合乙酰赖氨酸和染色质组织修饰物（chromo），恶性脑肿瘤（MBT），植物的溴结构域同源域（PHD）和通常与甲基赖氨酸相关的Tudor域。对表观遗传阅读器的研究受到了针对乙基 - 赖氨酸阅读器的溴结构域和末端外基序（BET）家族的选择性抑制剂的发现的极大影响。人类基因组编码46种蛋白质，其中含有61个溴结构域，聚集在8个家族中。不同的实验方法用于鉴定第一种BET抑制剂，GSK 525762A和（+） - JQ-1。 Polycomb组（PcG）蛋白，zeste同源物2（EZH2）的增强子，在促进组蛋白H3赖氨酸27三甲基化（H3K27me3）和表观遗传基因沉默中具有重要作用。 EZH2的这种功能对细胞增殖和细胞分化的抑制很重要，并且与癌症进展有关。细胞周期蛋白依赖性激酶通过EZH2的磷酸化调节表观遗传基因沉默。在许多类型的癌症中，包括淋巴瘤和白血病，EZH2被假定通过异常组蛋白和DNA甲基化发挥其致癌作用，导致肿瘤抑制基因的沉默。 p300 / CBP不仅是转录衔接子，还是组蛋白乙酰转移酶。

(3-甲基-6-(4-甲基-3-(甲基磺酰胺基)苯基)-[1,2,4]三唑并[4,3-b]哒嗪-8-基)氨基甲酸乙酯

Bromosporine对于BRD2,BRD4,BRD9和CECR2的IC50分别为410nM、290nM、122nM和17nM。

• CAS号：1619994-69-2
• 分子式：C₁₇H₂₀N₆O₄S
• 分子量：404.444
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PBRM1-BD2-IN-6

PBRM1-BD2-IN-6是一种有效的PBRM1溴域抑制剂,IC50值为0.22µM。PBRM1-BD2-IN-6显示出抗增殖活性。PBRM1-BD2-IN-6具有研究PBRM1依赖性癌症的潜力[1]。

• CAS号：2819989-67-6
• 分子式：C₁₆H₁₅ClN₂O
• 分子量：286.76
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET23

dBET23是BRD4异双功能小分子配体(PROTAC),在细胞降解测定中表现出BRD4 BD1(DC50/5h=50nM)的显着和选择性降解。

• CAS号：1957234-83-1
• 分子式：C₄₃H₄₅ClN₈O₉S
• 分子量：885.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BAY-299

BAY-299 是一种非常有效的双重抑制剂,抑制 BRPF2 溴结构域 (BD),TAF1 BD2,和 TAF1L BD2,IC50 分别为 67 nM,8 nM 和 106 nM。

• CAS号：2080306-23-4
• 分子式：C₂₅H₂₃N₃O₄
• 分子量：429.468
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：688.7±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：370.3±31.5 °C

CBP/p300-IN-14

CBP/p300-IN-14是CBP/EP300(赖氨酸乙酰转移酶)的有效抑制剂,IC50为3.3nM(从专利WO2021213521A1,化合物27中提取)[1]。

• CAS号：2725036-10-0
• 分子式：C₃₀H₃₁F₂N₇O₂
• 分子量：559.61
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZEN-3219

ZEN-3219 是一种 BET 抑制剂,抑制 BRD4(BD1),BRD4(BD2) 和 BRD4(BD1BD2) 的 IC50 分别为 0.48, 0.16 和 0.47 μM。ZEN-3219 可用于形成 PROTAC 分子,从而诱导 BRD4 降解。

• CAS号：1952264-34-4
• 分子式：C₁₉H₁₈N₂O₃
• 分子量：322.36
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PLK1/BRD4-IN-1

PLK1/BRD4-IN-1(9b)是一种口服活性双PLK1和BRD4抑制剂,其IC50值分别为22 nM和109 nM,与PLK1和BRD4相比。PLK1/BRD4-IN-1诱导细胞周期阻滞和凋亡,下调几种增殖相关癌基因的转录,并显示出良好的体内抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2412707-81-2
• 分子式：C₃₁H₄₃N₉O₂
• 分子量：573.73
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-20

PROTAC BRD4降解剂-20(化合物195)是一种双功能化合物,也是BRD4的降解剂[1]。

• CAS号：2086300-61-8
• 分子式：C₅₅H₅₈ClN₉O₇S₂
• 分子量：1056.69
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SGC-iMLLT

SGC-iMLLT 是一种有效、选择性的 MLLT1/3-histone 相互作用抑制剂,与 MLLT1 YD 上的 Kac/Kcr 结合位点结合,对 MLLT1 YD (ENL/YEATS1) (IC50, 0.26 μM; Kd, 0.129 μM) 和 MLLT3 YD (AF9/YEATS3) (Kd, 0.077 μM) 具有很高的亲和性。

• CAS号：2255338-25-9
• 分子式：C₂₂H₂₄N₆O
• 分子量：388.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-17

PROTAC BRD4降解剂-17(化合物13i)是一种强效的PROTAC BR D4降解剂,其IC50值为29.54 nM(BRD4(BD1))和3.82 nM(BR D4(BD2))。PROTAC BRD4降解物-17显著减弱G2/M进展相关细胞周期蛋白B1的表达。PROTAC BRD4降解物-17显著诱导MV-4-11细胞凋亡[1]。

• CAS号：2585561-49-3
• 分子式：C₄₉H₄₇N₇O₉
• 分子量：877.94
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tazemetostat (EPZ-6438)

Tazemetostat (EPZ-6438) 是一种有效,选择性,口服的 EZH2 抑制剂,Ki 和 IC50 分别为2.5和11 nM。

• CAS号：1403254-99-8
• 分子式：C₃₄H₄₄N₄O₄
• 分子量：572.738
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：750.8±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：407.9±32.9 °C

A-485

A-485 是 p300/CBP 的强效选择性催化抑制剂,对 p300 和 CBP 的 IC50 值分别为 9.8 nM 和 2.6 nM。

• CAS号：1889279-16-6
• 分子式：C₂₅H₂₄F₄N₄O₅
• 分子量：536.48
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BY27

BY27 是一种有效、选择性的 BET BD2 抑制剂,对 BRD2,BRD3,BRD4 和 BRDT 的 BD2 结构域的选择性分别是 BD1 的 38、5、7 和 21 倍。BY27 具有抗癌作用。

• CAS号：2247236-59-3
• 分子式：C₂₂H₂₁ClN₆
• 分子量：404.90
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GNE-886

GNE-886是一种有效的选择性CECR2溴结构域抑制剂,IC50为16 nM；对40个溴结构域的选择性较宽,对BRD9,BRD7,TAF1(2)和BRD4(1)的选择性>100倍；具有非常有利的测量动力学溶解度为122uM,是CECR2溴结构域的合适体外工具化合物。

• CAS号：2101957-05-3
• 分子式：C₂₈H₃₀N₆O₃
• 分子量：498.576
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：796.3±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：435.4±32.9 °C

Olinone

奥林酮是一种选择性BRD4 BrD1抑制剂[1]。奥林酮可加速小鼠原代少突胶质细胞祖细胞向分化的进程[2]。

• CAS号：1770789-37-1
• 分子式：C₁₇H₂₁N₃O₂
• 分子量：299.37
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：675.6±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：362.4±31.5 °C

Bromodomain inhibitor-9

溴代甲烷抑制剂-9是一种选择性抑制BRD4-1(Kd:12nM)的溴代甲烷化合物抑制剂。溴代主抑制剂-9可用于研究与全身或组织炎症、脂质代谢、纤维化或慢性自身免疫性疾病相关的疾病或病症[1]。

• CAS号：1870849-34-5
• 分子式：C₂₄H₂₈N₄O₅S
• 分子量：484.57
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-CBP/p300 ligand 2

沙利度胺NH CBP/p300配体2(P-007)是一种基于PROTAC的CBP和p300降解剂(从专利WO2020173440中提取)[1]。

• CAS号：2484739-21-9
• 分子式：C₄₈H₅₇F₂N₁₁O₆
• 分子量：922.03
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-5

PROTAC BRD4 Degrader-5 是一种基于 PROTAC 的 BRD4 降解剂,可有效降解 HER2 阳性和阴性乳腺癌细胞系中的 BRD4。

• CAS号：2409538-70-9
• 分子式：C₅₀H₆₂ClN₉O₈S₂
• 分子量：1016.67
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OF-1

OF-1是BRPF1B和BRPF2 bromodomain抑制剂,Kd值分别为100nM和500nM,对BRD4结合能力弱39倍。

• CAS号：919973-83-4
• 分子式：C₁₇H₁₈BrN₃O₄S
• 分子量：440.311
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：573.8±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：300.8±32.9 °C

NSC 228155

NSC 228155 是一种有效的 KIX-KIDCREB 的激酶诱导结构域 (KID) 和 KIX (KID 相互作用结构域,来自 CBP) 的相互作用,IC50 值为 0.36 μM。在活的 HEK 293T 细胞中,NSC 228155 对 CREB 介导的基因转录的抑制作用并非选择性的。

• CAS号：113104-25-9
• 分子式：C₁₁H₆N₄O₄S
• 分子量：290.255
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.7±0.1 g/cm3
• 沸点：627.3±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：333.2±34.3 °C

PROTAC BRD4 Degrader-6

PROTAC BRD4 Degrader-6(化合物32a)是一种有效的小分子BRD4降解剂,对BRD4 BD1的IC50值为2.7 nM。PROTAC BRD4 Degrader6可有效降解BRD4蛋白并抑制c-Myc的表达。PROTAC-BRD4-Degrader-6抑制胰腺癌细胞系BxPC3的增殖并诱导凋亡。PROTAC BRD4-Degrader-6可用于人类胰腺癌研究[1]。

• CAS号：2410947-56-5
• 分子式：C₄₃H₄₀F₂N₁₀O₁₀S
• 分子量：926.90
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET1

dBET1 是基于 PROTAC 技术的有效的 BRD4 蛋白质降解物,其 EC50 值为 430 nM。

• CAS号：1799711-21-9
• 分子式：C₃₈H₃₇ClN₈O₇S
• 分子量：785.268
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VZ185

VZ185 是高效,快速,选择性的 BRD7/9 PROTAC 降解剂,DC50 分别为4.5 和 1.8 nM。

• CAS号：2306193-61-1
• 分子式：C₅₃H₆₇FN₈O₈S
• 分子量：995.21
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-BAY 002

BET-BAY 002是BET小分子抑制剂,对多发性骨髓瘤模型有效。

• CAS号：1588521-78-1
• 分子式：C₂₂H₁₈ClN₅O
• 分子量：403.864
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：635.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：338.3±34.3 °C

米维布塞

Mivebresib是一种有效且可口服的溴结构域和末端结构域 (BET) 抑制剂。 Mivebresib与 BRD4结合的 Ki 为1.5 nM。

• CAS号：1445993-26-9
• 分子式：C₂₂H₁₉F₂N₃O₄S
• 分子量：459.466
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：608.9±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：322.0±34.3 °C

L-45

L-45 是第一个有效的选择性 p300/CBP 相关因子 (PCAF) 溴结构域 (Brd) 抑制剂,Kd 为 126±15 nM。

• CAS号：2079885-05-3
• 分子式：C₂₁H₂₄N₆
• 分子量：360.46
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ziftomenib

Ziftomenib是一种具有抗肿瘤活性的menin-MLL相互作用抑制剂(WO2017161028A1,化合物151)[1]。

• CAS号：2134675-36-6
• 分子式：C₃₃H₄₂F₃N₉O₂S₂
• 分子量：717.87
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1盐酸盐

PF-CBP1盐酸盐是一种CREB结合蛋白溴区的高度选择性抑制剂。

• CAS号：2070014-93-4
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃·HCl
• 分子量：525.08
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成。

• CAS号：1799711-24-2
• 分子式：C₁₉H₂₂N₄O₆
• 分子量：402.4
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A