组蛋白去甲基化酶

组蛋白甲基化涉及两类酶：甲基转移酶和去甲基化酶。虽然甲基转移酶负责建立甲基化模式，但去甲基化酶不仅能从组蛋白中除去甲基，还能除去其他蛋白质。组蛋白去甲基化酶不仅靶向组蛋白尾部的甲基化位点，还与非组蛋白蛋白（例如p53）上的甲基化位点相互作用。组蛋白赖氨酸脱甲基酶（KDM）由于其在染色质组织中的调节作用以及它们与包括癌症和精神障碍在内的疾病的紧密关联而作为药物靶标受到关注。 JMJD1A（也称为KDM3A）是从组蛋白赖氨酸H3K9中去除甲基的去甲基化合物。它在各种细胞过程中发挥重要作用，包括精子发生，能量代谢，干细胞调节和性别展示。含有Jumonji结构域的3（Jmjd3）已被鉴定为组蛋白去甲基化酶，其特异性催化从H3K27me3中去除甲基化。

LSD1-IN-12

LSD1-IN-12(化合物2)是一种有效的LSD1抑制剂,Ki值分别为1.1μM(LSD1)、61μM(LSD2)、2.3μM(MAO-a)和3.5μM(MAO-B)[1]。

• CAS号：1228143-76-7
• 分子式：C₁₆H₁₆N₂O
• 分子量：252.31
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SP2509

SP2509 是有效的,选择性的 LSD1 拮抗剂,IC50 值为 13 nM。

• CAS号：1423715-09-6
• 分子式：C₁₉H₂₀ClN₃O₅S
• 分子量：437.897
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DL-2-羟基葡萄糖酸-13C5,二钠盐未标记-13C5

α-羟基戊二酸-13C5(钠)是13C标记的α-羟基谷氨酸钠[1]。α-羟基戊二酸(2-羟基戊二酸)钠是戊二酸的一种α-羟基酸形式。α-羟基戊二酸钠是多种α-酮戊二酸依赖性双加氧酶的竞争性抑制剂,包括组蛋白去甲基酶和5-甲基胞嘧啶(5mC)羟化酶的TET家族[2]。

• CAS号：2482467-23-0
• 分子式：₁₃C₅H₈NaO₅
• 分子量：176.07
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

α-Hydroxyglutaric acid

α-Hydroxyglutaric acid (2-Hydroxyglutarate) 是戊二酸的 α-羟基酸形式。α-Hydroxyglutaric acid 是多种 α-酮戊二酸依赖性双加氧酶 (包括 histone demethylases 和 5-甲基胞嘧啶羟化酶 (5-methlycytosine (5mC) hydroxylases) 的 TET 家族) 的竞争性抑制剂。

• CAS号：2889-31-8
• 分子式：C₅H₆O₅--
• 分子量：146.09800
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

YUKA1

YUKA1 是一种有效、可透过细胞的赖氨酸脱甲基化酶 (KDM5A) 抑制剂,IC50 值为 2.66 μM,对 KDM5C 的作用较弱,IC50 值为 7.12 μM,对 KDM5B,KDM6A 或 KDM6B 无所用。YUKA1 可增加人细胞中 H3K4me3 的水平,具有抗肿瘤活性。

• CAS号：708991-09-7
• 分子式：C₁₃H₁₆N₄O₂S
• 分子量：292.36
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bomedemstat ditosylate

Bomedemstat(IMG-7289)二糖基化物是骨髓增生性肿瘤(MPN)小鼠模型中表观遗传活性赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)的口服和不可逆抑制剂。Bomedemstat可用于急性髓细胞白血病(AML)和骨髓纤维化(MF)的研究。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：1990504-72-7
• 分子式：C₄₂H₅₀FN₇O₈S₂
• 分子量：864.02
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CBB1003

CBB1003是组蛋白去甲基化酶LSD1抑制剂,IC50值为10.54uM。

• CAS号：1379573-88-2
• 分子式：C₂₅H₃₁N₉O₄
• 分子量：521.57200
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

S2157

S2157 是 N-烷基化的反式环丙胺 (TCP) 衍生物,是一种有效的赖氨酸特异性脱甲基酶 1 (LSD1) 抑制剂。S2157 在超级增强子区域增加 H3K9 甲基化和相应的 H3K27 脱乙酰化。S2157 抑制 NOTCH3 和 TAL1 基因的转录,从而诱导 TCP 抵抗性急性淋巴细胞白血病 T-ALL 细胞凋亡 (apoptosis)。S2157 有效地透过血脑屏障,几乎可以完全根除 T-ALL 细胞移植小鼠的中枢神经系统白血病。

• CAS号：2262488-39-9
• 分子式：C₂₃H₂₈ClF₂N₃O₂
• 分子量：451.94
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LSD1-IN-24

LSD1-IN-24(化合物3S)是一种选择性LSD1抑制剂,其IC50为0.247μM。LSD1-IN-24可以介导PD-L1的表达,增强T细胞杀伤反应,可用于癌症研究[1]。

• CAS号：4734-59-2
• 分子式：C₁₈H₂₀N₂OS
• 分子量：312.43
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RN-1 dihydrochloride

RN-1盐酸是一种有效的、脑渗透剂、不可逆和选择性赖氨酸特异性脱甲基酶1(LSD1)抑制剂,IC50为70 nM。RN-1盐酸对LSD1的选择性高于MAO-A和MAO-B,IC50值分别为0.51μM和2.785μM[1][2]。

• CAS号：1781835-13-9
• 分子式：C₂₃H₃₁Cl₂N₃O₂
• 分子量：452.42
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KDM2B-IN-4

KDM2B-IN-4是一种组蛋白去甲基酶KDM2B抑制剂,从专利WO201611224A1化合物182b中提取。KDM2B-IN-4可用于癌症研究[1]。

• CAS号：1966933-85-6
• 分子式：C₂₄H₂₈N₂O₂
• 分子量：376.49
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

T-3775440盐酸盐

T-3775440 (hydrochloride) 是一种赖氨酸特异性脱甲基酶1 (LSD1) 的不可逆性抑制剂,其 IC50 值为 2.1 nM。

• CAS号：1422535-52-1
• 分子式：C₁₈H₂₃ClN₄O
• 分子量：346.85
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KDM2B-IN-3

KDM2B-IN-3是一种组蛋白去甲基酶KDM2B抑制剂,从专利WO201611224A1化合物183c中提取。KDM2B-IN-3可用于癌症研究[1]。

• CAS号：1966933-87-8
• 分子式：C₂₅H₃₀N₂O₂
• 分子量：390.52
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JQKD82

JQKD82(JADA82)是一种细胞通透性和选择性KDM5抑制剂。JQKD82增加H3K4me3,可用于多发性骨髓瘤的研究[1]。

• CAS号：2410512-38-6
• 分子式：C₂₇H₄₀N₄O₅
• 分子量：500.63
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bomedemstat

Bomedemstat(IMG-7289)是骨髓增生性肿瘤(MPN)小鼠模型中表观遗传活性赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)的口服不可逆抑制剂。Bomedemstat可用于急性髓细胞白血病(AML)和骨髓纤维化(MF)的研究。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：1990504-34-1
• 分子式：C₂₈H₃₄FN₇O₂
• 分子量：519.61
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Zavondemstat

Zavondemstat是具有抗肿瘤活性的组蛋白赖氨酸去甲基酶4D(KDM4D)抑制剂[1]。

• CAS号：1851412-93-5
• 分子式：C₂₆H₂₉N₃O₃
• 分子量：431.53
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KDM4C-IN-1

KDM4C-IN-1(化合物4d)是一种有效的KDM4C抑制剂,IC50为8 nM。KDM4C-IN-1分别抑制IC50为0.8µM和1.1µM的HepG2和A549细胞的生长[1]。

• CAS号：1026011-17-5
• 分子式：C₁₅H₁₄N₄O₃
• 分子量：298.30
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KDM5A-IN-1

KDM5A-IN-1是组蛋白去甲基化酶抑制剂。

• CAS号：1905481-36-8
• 分子式：C₁₅H₂₂N₄O₂
• 分子量：290.361
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：592.6±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：312.2±30.1 °C

GSK-J4

GSK-J4是一种有效的H3K27me3组蛋白赖氨酸脱甲基酶 (KDM) 抑制剂,抑制 KDM6B和KDM6A的 IC50 分别为8.6 μM 和 6.6 μM。

• CAS号：1373423-53-0
• 分子式：C₂₄H₂₇N₅O₂
• 分子量：417.504
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：581.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：305.3±30.1 °C

KDM5-C70

KDM5-C70 是一种 KDM5-C49 的乙酯衍生物,是一种有效的,细胞可渗透的泛 KDM5 组蛋白脱甲基酶抑制剂。KDM5-C70 在骨髓瘤细胞中具有抗增殖作用,从而导致 H3K4me3 水平在全基因组范围内升高。

• CAS号：1596348-32-1
• 分子式：C₁₇H₂₈N₄O₃
• 分子量：336.429
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：466.6±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：236.0±28.7 °C

AS8351

AS8351 是一种 KDM5B 抑制剂,可以诱导和维持有活性的染色质标记从而促进心肌细胞样细胞的产生。

• CAS号：796-42-9
• 分子式：C₁₇H₁₃N₃O₂
• 分子量：291.30400
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.364g/cm3
• 沸点：503.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：266 °C
• 闪点：258.3ºC

NCGC00244536

NCGC00244536是高效的 KDM4B 抑制剂,IC50 值为10 nM。

• CAS号：2003260-55-5
• 分子式：C₂₅H₂₂N₂O₂
• 分子量：382.45
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-J5 hydrochloride

GSK-J5 hydrochloride 是具有细胞的 GSK J2 (HY-15648A) 的细胞渗透酯衍生物,无活性。GSK-J5 hydrochloride 也是GSK-J4 (HY-15648B) 的异构体,常被用作阴性基团。

• CAS号：1797983-32-4
• 分子式：C₂₄H₂₈ClN₅O₂
• 分子量：453.96
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

科林

Corin 是组氨酸赖氨酸特异性去甲基化酶 (LSD1) 和组氨酸脱乙酰化酶 (HDAC) 的双重抑制剂,其对 LSD1 的 Ki(inact) 值为 110 nM,对 HDAC1 的 IC50 值为 147 nM。

• CAS号：1808113-09-8
• 分子式：C₂₆H₂₈N₄O₂
• 分子量：428.53
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DDP-38003二盐酸盐

DDP-38003 dihydrochloride是新颖有口服活性的KDM1A/LSD1抑制剂,IC50值为84 nM。

• CAS号：1831167-98-6
• 分子式：C₂₁H₂₈Cl₂N₄O
• 分子量：423.379
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HPCG

2-(3-羟基吡啶甲酰氨基)乙酸是一种2OG加氧酶抑制剂,IC50值为3.4μM。2-(3-羟基吡啶甲酰氨基)乙酸可以用作潜在治疗研究的功能探针[1]。

• CAS号：3458-69-3
• 分子式：C₈H₈N₂O₄
• 分子量：196.16000
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KDM4D-IN-1

KDM4D-IN-1 是一种新型组蛋白赖氨酸去甲基化酶 4D (KDM4D) 抑制剂,IC50 为 0.41±0.03 μM。

• CAS号：2098902-68-0
• 分子式：C₁₁H₇N₅O
• 分子量：225.21
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

反苯环丙胺半硫酸盐

Tranylcypromine hemisulfate是一种用于治疗抑郁症的不可逆,非选择性 MAO 抑制剂。

• CAS号：13492-01-8
• 分子式：C₉H₁₂NO₂S_0.5
• 分子量：182.23
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.065g/cm3
• 沸点：218.3ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：90.8ºC

(1S,2R)-2-苯基环丙胺盐酸盐

(1S,2R)-氨酰环丙烷盐酸盐是一种有效的抗抑郁剂。(1S,2R)-盐酸川芎嗪可抑制MAO和LSD1[1][2]。

• CAS号：4548-34-9
• 分子式：C₉H₁₂ClN
• 分子量：169.65100
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PFI-90

PFI-90是组蛋白去甲基酶(KDM3B)的选择性抑制剂,可抑制PAX3-FOXO1的作用。PFI-90诱导细胞凋亡和肌源性分化,导致细胞死亡增加。PFI-90具有潜在的抗肿瘤活性。(专利WO2021101929A1)。

• CAS号：53995-62-3
• 分子式：C₁₁H₁₀N₄O
• 分子量：214.22300
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A