表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

Y02224

Y02224是一种BET抑制剂。对白血病细胞具有合理的抗增殖作用。

• CAS号：1853988-48-3
• 分子式：C₂₀H₁₇BrN₂O₄S
• 分子量：461.33
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromodomain IN-1

Bromodomain IN-1 是一种有效的选择性 Bromodomain 抑制剂,详细信息请参考专利文献 WO2016069578A1 中的化合物 4。

• CAS号：1914120-48-1
• 分子式：C₂₂H₂₃ClN₄O₃S
• 分子量：458.96
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

蛋白激酶 C (19-31)

Protein Kinase C (19-31)是蛋白激酶 C (PKC)的抑制剂,是由 PKCa (残基 19-31) 伪底物调控域衍生而来,25 位丝氨酸取代野生型丙氨酸作为蛋白激酶 C 底物肽,用于检测蛋白激酶 C 的活性。Protein kinase C (PKC) 通过磷酸化丝氨酸和苏氨酸氨基酸残基上的羟基来调控其它蛋白的功能。

• CAS号：121545-65-1
• 分子式：C₆₇H₁₁₈N₂₆O₁₆
• 分子量：1543.82
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-44

HDAC-IN-44是一种HDAC抑制剂,IC50值为61.2 nM。HDAC-IN-44对多种癌细胞系显示出高抗癌活性[1]。

• CAS号：2414921-46-1
• 分子式：C₂₆H₂₇BrN₄O₄
• 分子量：539.42
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK-IN-3

AMPK-IN-3(化合物67)是一种有效且选择性的AMPK抑制剂,其对AMPK(α2)、AMPK和KDR的IC50s分别为60.7、107和3820 nM。AMPK-IN-3抑制AMPK不会影响细胞活性或对K562细胞产生显著的细胞毒性。AMPK-IN-3可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2417674-27-0
• 分子式：C₂₅H₃₃N₅O₃
• 分子量：451.56
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BB-CL-脒

BB-Cl-Amidine 是肽基精氨酸脱胺酶 (PAD) 的抑制剂。

• CAS号：1802637-39-3
• 分子式：C₂₆H₂₆ClN₅O
• 分子量：459.970
• 类别：炎症/免疫

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

12-O-十四烷酰佛波醋酸酯-13

Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) 是一种佛波酯,是常用的 PKC 活化剂。

• CAS号：16561-29-8
• 分子式：C₃₆H₅₆O₈
• 分子量：616.825
• 类别：PKC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：698.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：208.1±25.0 °C

WAY-354574

WAY-354574 是一种靶向脱乙酰酶 (Sirtuin) 的活性分子,可用于亨廷顿病 (HD) 的研究。

• CAS号：851873-40-0
• 分子式：C₂₀H₂₃ClN₂O₃S
• 分子量：406.92622
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-(7-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-4,4-二甲基-8-硝基苯并吡喃并[4,3-c]吡唑-1(4H)-基)苯甲酸

Lin28-let-7a antagonist 1 对 Lin28-let-7a 的结合有明显的拮抗作用,其对 Lin28A-let-7a-1 结合的 IC50 值为 4.03 μM。

• CAS号：2024548-03-4
• 分子式：C₃₁H₂₉N₅O₇
• 分子量：583.59
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DHAQ DIACETATE

米托蒽醌二乙酸酯是一种有效的拓扑异构酶II抑制剂。米托蒽醌二乙酸酯也抑制蛋白激酶C(PKC)活性,IC50为8.5μM。米托蒽醌二乙酸酯诱导B-CLL(B-慢性淋巴细胞白血病)细胞凋亡。米托蒽醌二乙酸酯具有抗肿瘤活性[1][2][3][4]。米托蒽醌二乙酸酯还具有抗正痘病毒活性,EC50分别为0.25μM和0.8μM,用于牛痘和猴痘[5]。

• CAS号：70711-41-0
• 分子式：C₂₄H₃₂N₄O₈
• 分子量：504.53300
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.45g/cm3
• 沸点：805.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：203-5ºC
• 闪点：441.1ºC

戊柔比星

Valrubicin 是一种化疗剂,能够抑制 TPA 和 PDBu 诱导的 PKC 活化,IC50 值分别为 0.85 和 1.25 μM,具有抗肿瘤和抗炎作用。

• CAS号：56124-62-0
• 分子式：C₃₄H₃₆F₃NO₁₃
• 分子量：723.644
• 类别：PKC

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：867.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：116-117ºC
• 闪点：478.6±34.3 °C

BRD4 Inhibitor-18

BRD4抑制剂-18是一种高效的BRD4抑制剂,IC50值为110 nM。BRD4抑制剂-18具有疏水性乙酰环戊基侧链。BRD4抑制剂18能显著抑制高BRD4水平的MV-4-11细胞的增殖。BRD4抑制剂-18具有促凋亡和G0/G1周期阻滞活性[1]。

• CAS号：2451219-73-9
• 分子式：C₂₆H₂₆ClN₃O₃S
• 分子量：496.02
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PRMT5-IN-9

PRMT5-IN-9是一种新型的用于治疗癌症的PRMT5抑制剂,IC50为0.01μM。

• CAS号：2691869-52-8
• 分子式：C₂₅H₂₃F₃N₆O
• 分子量：480.48
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EZH2-IN-13

EZH2-IN-13是一种有效的EZH2抑制剂,有关详细信息,请参阅专利WO2017139404中的化合物73。EZH2-IN-13可用于研究与EZH2活性相关的癌症或癌前病变[1]。

• CAS号：1403255-41-3
• 分子式：C₃₄H₄₅N₅O₃
• 分子量：571.75
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-6

HDAC6-IN-6(化合物6a)是一种有效的BBB穿透HDAC6抑制剂,IC50为0.025μM。HDAC6-IN-6对aβ1-42自聚集和乙酰胆碱酯酶具有较强的抑制活性,IC50值分别为3.0和0.72μM。HDAC6-IN-6可促进神经轴突生长,而无明显神经毒性【1】。

• CAS号：2413603-10-6
• 分子式：C₂₀H₁₅N₃O₂
• 分子量：329.35
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pivanex

Pivanex (AN-9) 是丁酸的衍生物,是 HDAC 的抑制剂,具有抗转移和抗血管生成的活性。Pivanex (AN-9) 可下调bcr-abl 蛋白,增强凋亡。

• CAS号：122110-53-6
• 分子式：C₁₀H₁₈O₄
• 分子量：202.24800
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.008g/cm3
• 沸点：249.3ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：113ºC

LSD1-IN-12

LSD1-IN-12(化合物2)是一种有效的LSD1抑制剂,Ki值分别为1.1μM(LSD1)、61μM(LSD2)、2.3μM(MAO-a)和3.5μM(MAO-B)[1]。

• CAS号：1228143-76-7
• 分子式：C₁₆H₁₆N₂O
• 分子量：252.31
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N1-methyl-N1-[[4-[4-(1-methylethoxy)phenyl]-1H-pyrrol-3-yl]methyl]-1,2-ethanediamine,trihydrochloride

MS023三盐酸盐是一种强效、选择性和细胞活性的人I型蛋白精氨酸甲基转移酶(PRMTs)抑制剂,PRMT1、PRMT3、PRMT4、PRMT6和PRMT8的IC50分别为301119、83、4和5nM[1]。

• CAS号：2108631-19-0
• 分子式：C₁₇H₂₈Cl₃N₃O
• 分子量：396.78
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氯化飞燕草素

Delphinidin氯化物是一种花青素,从浆果和红酒中分离出来。Delphinidin氯化物显示内皮依赖性血管舒张。Delphinidin氯化物还可以调节JAK/STAT3和MAPKISE信号,诱导HCT116细胞凋亡[1][2][3]。

• CAS号：528-53-0
• 分子式：C₁₅H₁₁ClO₇
• 分子量：338.697
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3946 (rough estimate)
• 沸点：454.94°C (rough estimate)
• 熔点：>350ºC
• 闪点：N/A

HDAC-IN-29

HDAC-IN-29(化合物13b)是一种有效的pan-HDAC抑制剂。HDAC-IN-29具有抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2695593-95-2
• 分子式：C₂₀H₂₃N₃O₄S
• 分子量：401.48
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT5 inhibitor 4

SIRT5抑制剂4(化合物11)是一种有效、选择性的SIRT5抑制物,SIRT5和其他SIRT亚型的IC50值分别为26.4和>400μM[1]。

• CAS号：708992-34-1
• 分子式：C₁₈H₁₅N₃O₄S
• 分子量：369.39
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-38

HDAC-IN-38(化合物13)是一种有效的HDAC抑制剂。HDAC-IN-38对HDAC1、2、3、5、6和8表现出类似的微摩尔抑制活性。HDAC-IN-38增加脑血流量(CBF),减轻认知障碍,改善海马萎缩。HDAC-IN-38还可增加组蛋白乙酰化水平(H3K14或H4K5)[1]。

• CAS号：2408123-36-2
• 分子式：C₂₇H₂₈ClN₃O₂
• 分子量：461.98
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-IN-9

BET-IN-9是从专利WO2022012456A1化合物实施例1中提取的BET抑制剂【1】。

• CAS号：2758778-88-8
• 分子式：C₂₂H₂₄N₄O₃
• 分子量：392.45
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RG-101

RG-101是一种肝细胞靶向的N-乙酰半乳糖胺结合寡核苷酸,可拮抗miR-122。miR-122是丙型肝炎病毒(HCV)复制的重要宿主因子[1]。

• CAS号：1929655-04-8
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

6,11-二氢-N-[3-(4-吗啉)丙基]-5-氧代-5H-茚并[1,2-c]异喹啉-9-磺酰胺

INO-1001 是一种有效的,选择性聚 (ADP-核糖) 聚合酶 (PARP) 抑制剂,IC50 为 0.05-1 μM。INO-1001 是有效的辐射敏感性增强剂,可通过干扰 DNA 修复机制来增强辐射诱导的细胞杀伤,从而导致坏死细胞死亡。INO-1001 具有抗肿瘤作用。

• CAS号：501364-82-5
• 分子式：C₂₃H₂₅N₃O₄S
• 分子量：439.52700
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aurora A inhibitor 2

Aurora A抑制剂2(化合物16h)是一种有效的Aurora A激酶抑制剂,IC50为21.94 nM。Aurora A抑制剂2诱导MDA-MB-231细胞中的caspase依赖性凋亡【1】。

• CAS号：2412144-74-0
• 分子式：C₂₄H₂₆N₆O₃
• 分子量：446.50
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CW 008

CW 008 是吡唑-吡啶的衍生物,是 CREB 或 PKA 途径激动剂。CW 008 也是一种干细胞分化剂。CW 008 可刺激人类 MSC 的成骨细胞分化,并增加卵巢切除小鼠的骨形成。CW008 通过激活 cAMP/PKA/CREB 信号通路、抑制瘦素分泌来促进成骨作用。

• CAS号：1134613-19-6
• 分子式：C₂₁H₁₄F₂N₆O₂
• 分子量：420.372
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PRMT5-IN-29

PRMT5-IN-29是一种强效口服活性PRMT5抑制剂,IC50为1.5μΜ。PRMT5-IN-29具有研究晚期癌症的潜力[1]。

• CAS号：2242788-69-6
• 分子式：C₁₈H₂₀Cl₃N₅O₅
• 分子量：492.74
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SP2509

SP2509 是有效的,选择性的 LSD1 拮抗剂,IC50 值为 13 nM。

• CAS号：1423715-09-6
• 分子式：C₁₉H₂₀ClN₃O₅S
• 分子量：437.897
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

STO-609醋酸盐

STO-609醋酸盐是Ca2+/钙调蛋白依赖性蛋白激酶(CaM-KK)的选择性和细胞可渗透性抑制剂,重组CaM-KK-α和CaM-KKβ的Ki值分别为80和15ng/mL。STO-609醋酸盐抑制HeLa细胞裂解物中AMP活化蛋白激酶(AMPKK)活性,IC50～0.02g/ml。

• CAS号：1173022-21-3
• 分子式：C₂₁H₁₄N₂O₅
• 分子量：374.35
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A