表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

Y02224

Y02224是一种BET抑制剂。对白血病细胞具有合理的抗增殖作用。

• CAS号：1853988-48-3
• 分子式：C₂₀H₁₇BrN₂O₄S
• 分子量：461.33
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

鲁索利替尼磷酸盐

Ruxolitinib phosphate是一种有效的 JAK1/2 抑制剂, IC50 分别为3.3 nM/2.8 nM,比JAK3选择性高130倍。

• CAS号：1092939-17-7
• 分子式：C₁₇H₂₁N₆O₄P
• 分子量：404.360
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

9-羟基十八酸

9-羟基十八烷酸(9-HSA)是一种HDAC1抑制剂,在5μM时可抑制约66.4%的HDAC1酶活性。9-羟基十八烷酸显示出抗癌活性[1]。

• CAS号：3384-24-5
• 分子式：C₁₈H₃₆O₃
• 分子量：300.48
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AU-15330

AU-15330是SWI/SNF ATP酶亚单位SMARCA2和SMARCA4的蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)降解物。AU-15330在前列腺癌异种移植模型中诱导对肿瘤生长的有效抑制,并与AR拮抗剂恩扎鲁胺协同作用。AU-15330在无毒性的去势耐受性前列腺癌(CRPC)模型中诱导疾病缓解[1]。

• CAS号：2380274-50-8
• 分子式：C₃₉H₄₉N₉O₅S
• 分子量：755.93
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

7-氯-4-(1-哌嗪基)喹啉

7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种重要的药物化学支架。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种有效的sirtuin抑制剂,并可抑制5-羟色胺摄取(IC50为50μM)。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物对P。IC50分别为1.18μM和0.97μM的恶性疟原虫[1]。

• CAS号：837-52-5
• 分子式：C₁₃H₁₄ClN₃
• 分子量：247.72300
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.257 g/cm3
• 沸点：433.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：113-116ºC
• 闪点：216ºC

软木肟酸

Suberoyl bis-hydroxamic acid (Suberohydroxamic acid; SBHA) 是竞争性且可透过细胞的 HDAC1 和 HDAC3 抑制剂,ID50 值分别为 0.25 μM 和 0.30 μM。Suberoyl bis-hydroxamic acid 使肿瘤细胞易于凋亡 (apoptosis) 并促进线粒体凋亡途径。Suberoyl bis-hydroxamic acid 可用于甲状腺髓样癌 (MTC) 的研究。

• CAS号：38937-66-5
• 分子式：C₈H₁₆N₂O₄
• 分子量：204.224
• 类别：HDAC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：153-155ºC(lit.)
• 闪点：N/A

Bromodomain IN-1

Bromodomain IN-1 是一种有效的选择性 Bromodomain 抑制剂,详细信息请参考专利文献 WO2016069578A1 中的化合物 4。

• CAS号：1914120-48-1
• 分子式：C₂₂H₂₃ClN₄O₃S
• 分子量：458.96
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lepzacitinib

Lepzacitinib是一种针对JAK1/3的Janus激酶抑制剂。乐扎西替尼具有抗炎作用,可抑制特应性皮炎和其他皮肤病[1]。

• CAS号：2321488-47-3
• 分子式：C₁₈H₂₁N₅O₃
• 分子量：355.39
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

蛋白激酶 C (19-31)

Protein Kinase C (19-31)是蛋白激酶 C (PKC)的抑制剂,是由 PKCa (残基 19-31) 伪底物调控域衍生而来,25 位丝氨酸取代野生型丙氨酸作为蛋白激酶 C 底物肽,用于检测蛋白激酶 C 的活性。Protein kinase C (PKC) 通过磷酸化丝氨酸和苏氨酸氨基酸残基上的羟基来调控其它蛋白的功能。

• CAS号：121545-65-1
• 分子式：C₆₇H₁₁₈N₂₆O₁₆
• 分子量：1543.82
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-44

HDAC-IN-44是一种HDAC抑制剂,IC50值为61.2 nM。HDAC-IN-44对多种癌细胞系显示出高抗癌活性[1]。

• CAS号：2414921-46-1
• 分子式：C₂₆H₂₇BrN₄O₄
• 分子量：539.42
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ARTD10/PARP10-IN-1

ARTD10/PARP10-IN-1(化合物23)是一种有效的非选择性PARP抑制剂,靶向单ADP核糖转移酶ARTD7/PARP15、ARTD8/PARP14、ARTD10/PPARP10和多(ADP核糖)聚合酶-1(ARTD1/PARP1),IC50分别为1.7μM、1.6μM、0.8μM和4.4μM[1]。

• CAS号：1708103-76-7
• 分子式：C₁₂H₁₂N₂O₄
• 分子量：248.23
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PRMT5-IN-3

PRMT5-IN-3是一种PRMT5抑制剂,对肿瘤细胞具有合成致死性,但与DNA损伤剂结合产生的副作用很少。

• CAS号：2159123-14-3
• 分子式：C₂₂H₂₃F₃N₄O₃
• 分子量：448.44
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methylstat

甲基stat是一种有效的组蛋白去甲基化酶抑制剂。Methylstat显示出低细胞毒性的抗增殖活性。甲基stat诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞在G0/G1期。甲基stat增加p53和p21蛋白水平的表达。甲基stat抑制各种细胞因子诱导的血管生成。Methylstat可用作化学探针,以解决其在血管生成中的作用[1][2]。

• CAS号：1310877-95-2
• 分子式：C₂₈H₃₁N₃O₆
• 分子量：505.562
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Alisertib sodium

Alisertib(MLN 8237)钠是一种口服活性和选择性极光A激酶抑制剂(IC50=1.2 nM),它与极光A激酶结合,导致有丝分裂纺锤体异常、有丝分裂累积。Alisertib钠通过靶向白血病细胞中的AKT/mTOR/AMPK/p38通路诱导凋亡和自噬。抗肿瘤活性[1][2][3]。

• CAS号：1028486-06-7
• 分子式：C₂₇H₁₉ClFN₄NaO₄
• 分子量：540.90500
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SF2523

SF2523 是一种有效的选择性 PI3K 抑制剂,抑制 PI3Kα,PI3Kγ,DNA-PK,BRD4 和 mTOR,IC50 分别为 34 nM,158 nM,9 nM,241 nM 和 280 nM。

• CAS号：1174428-47-7
• 分子式：C₁₉H₁₇NO₅S
• 分子量：371.414
• 类别：DNA-PK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK-IN-3

AMPK-IN-3(化合物67)是一种有效且选择性的AMPK抑制剂,其对AMPK(α2)、AMPK和KDR的IC50s分别为60.7、107和3820 nM。AMPK-IN-3抑制AMPK不会影响细胞活性或对K562细胞产生显著的细胞毒性。AMPK-IN-3可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2417674-27-0
• 分子式：C₂₅H₃₃N₅O₃
• 分子量：451.56
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT6 activator 12q

SIRT6激活剂12q是有效的、选择性的和口服活性的SIRT6激活物,SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6的IC50值分别为171.20、>200、>200和0.58µM。SIRT6激活剂12q抑制细胞生长和迁移。SIRT6激活剂12q诱导G2期细胞凋亡和细胞周期阻滞。SIRT6激活剂12q显示出抗癌活性[1]。

• CAS号：2601734-99-8
• 分子式：C₃₁H₂₂N₂O₂
• 分子量：454.53
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4,5,7,8,-四甲氧基黄酮

6-​Demethoxytangeretin 6-去甲氧基三苯甲基黄嘌呤是从柑橘 (Citrus depressa) 分离的黄酮。 6-Demethoxytangeretin 具有抗炎和抗过敏活性,通过间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 和丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 途径抑制人肥大细胞中 IL-6 的产生和基因表达。6-​Demethoxytangeretin 促进 CRE 介导的转录 (与海马神经元的学习和记忆相关)。

• CAS号：6601-66-7
• 分子式：C₁₉H₁₈O₆
• 分子量：342.343
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.243±0.06 g/cm3
• 沸点：536.9±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：216-217 ºC
• 闪点：237.5±30.2 °C

NCGC00244536

NCGC00244536是高效的 KDM4B 抑制剂,IC50 值为10 nM。

• CAS号：2003260-55-5
• 分子式：C₂₅H₂₂N₂O₂
• 分子量：382.45
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Dcg066

DCG066是一种G9a体外抑制剂。

• CAS号：494786-13-9
• 分子式：C₃₀H₃₁F₆N₃O₂
• 分子量：579.58
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丹参二醇C

丹参二醇C是一种S-腺苷甲硫氨酸竞争性EZH2(组蛋白甲基转移酶)抑制剂,IC50为0.55μM,用于抑制甲基转移酶活性。丹参二醇C也是巨噬细胞中Nrf2和Sirtuin 1(Sirt1)的激活剂。丹参二醇C具有抗癌活性,可用于动脉粥样硬化研究[1][2]。

• CAS号：97465-71-9
• 分子式：C₁₈H₁₆O₅
• 分子量：312.317
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：561.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：293.4±30.1 °C

反式-3-(氰基甲基)-3-(4-(6-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]吡嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)环丁烷腈

Tyk2-IN-8 (compound 10) 是一种选择性的 TYK2 抑制剂,结合到 TYK2 催化活性的 JH1 结构域,IC50 值为 17 nM,用于治疗用于治疗银屑病。

• CAS号：2127109-84-4
• 分子式：C₂₀H₁₇N₉
• 分子量：383.41
• 类别：JAK

• 密度：1.46±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LEM-14

LEM-14是组蛋白赖氨酸甲基转移酶NSD2(MMSET/WHSC1)的特异性抑制剂,体外IC50为132μM,对密切相关的NSD1和NSD3无活性。

• CAS号：1814881-70-3
• 分子式：C₂₅H₂₆N₄O₄S
• 分子量：478.567
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DOT1L-IN-1

Dot1L-IN-1是高效,选择性,结构新颖的 Dot1L 抑制剂,Ki 为2 pM。

• CAS号：2088518-50-5
• 分子式：C₃₂H₃₆ClN₉O₂S
• 分子量：646.21
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BB-CL-脒

BB-Cl-Amidine 是肽基精氨酸脱胺酶 (PAD) 的抑制剂。

• CAS号：1802637-39-3
• 分子式：C₂₆H₂₆ClN₅O
• 分子量：459.970
• 类别：炎症/免疫

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MI-2-2

MI-2-2是一种有效的梅宁MLL抑制剂。MI-2-2以低纳摩尔亲和力(Kd=22nM)与menin结合,并非常有效地破坏menin和MLL之间的二价蛋白质-蛋白质相互作用。MI-2-2在MLL白血病细胞中具有特异且非常显著的活性,包括抑制细胞增殖、下调Hoxa9表达和分化[1]。

• CAS号：1454920-20-7
• 分子式：C₁₇H₂₀F₃N₅S₂
• 分子量：415.499
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：515.1±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：265.3±32.9 °C

Remetinostat

Remetinostat (SHP-141) 是一种基于羟肟酸的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 的抑制剂,目前正在开发应用与治疗皮肤T细胞淋巴瘤[1]。

• CAS号：946150-57-8
• 分子式：C₁₆H₂₁NO₆
• 分子量：323.34100
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

仙茅苷

Curculigoside 是 C. orchioide 中的主要皂苷,具有显着的抗氧化,抗骨质疏松,抗抑郁和神经保护作用。通过调节 JAK/STAT/NF-κB 信号传导途径,在体内和体外表现出显着的抗关节炎作用。

• CAS号：85643-19-2
• 分子式：C₂₂H₂₆O₁₁
• 分子量：466.435
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：734.9±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：158-160ºC
• 闪点：253.8±26.4 °C

S2101

S 2101 是一个赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂,其 IC50 值为 0.99 μM, Ki 值为 0.61 μM,Kinact/Ki 值为 4560 M/s。

• CAS号：1239262-36-2
• 分子式：C₁₆H₁₆ClF₂NO
• 分子量：311.75
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EED degrader-1

PROTAC EED降解剂-1是一种pKD为9.02的PROTAC靶向EED。PROTAC EED degrader-1是一种针对EED亚单位的多梳抑制复合物2(PRC2)抑制剂(pIC50=8.17)[1]。

• CAS号：2639882-72-5
• 分子式：C₅₅H₆₀FN₁₁O₈S
• 分子量：1054.20
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A