PROTAC分子本身含有三个不同的部分:用于结合靶蛋白的配体,用于结合E3连接酶的配体,以及连接这两个配体的连接体。 PROTAC(蛋白水解 - 靶向嵌合体)是双功能分子,其使靶蛋白与E3泛素连接酶空间接近,以触发靶泛素化和随后的蛋白酶体降解。连接酶多泛素化活性向新底物蛋白的有效重定向需要形成连接酶:PROTAC:靶三元复合物,一种对降解分子的细胞活性至关重要的中间物质。 PROTAC作用模式的一个特征是它们的亚化学计量催化活性,这减轻了对传统抑制剂的目标接合和占据的要求。由晶体结构引导设计的新PROTAC分子显示出对其BH家族成员Brd2和Brd3诱导细胞耗竭Brd4的精确选择性。


抗感染 >
沙粒 细菌 CMV 肠道病毒 丝状病毒 真菌 HBV HCV HIV HSV 流感病毒 寄生物 逆转录酶 RSV SARS冠状病毒
抗体- 药物偶联物 >
ADC细胞毒素 ADC连接器 Drug-Linker Conjugates for ADC 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
细胞凋亡 >
细胞凋亡 Bcl-2家族 c-Myc的 胱天蛋白酶 DAPK Ferroptosis IAP MDM-2/p53 PKD RIP激酶 存活 胸苷酸合成酶 TNF受体
自噬 >
自噬 LRRK2 ULK 自噬
细胞周期/DNA损伤 >
叶酸 APC ATM/ATR 极光激酶 酪蛋白激酶 CDK 检查点激酶(Chk) CRISPR/Cas9 去泛素化酶 DNA烷基化剂/交联剂 DNA-PK DNA/RNA合成 真核起始因子(eIF) G-四链体 Haspin激酶 HDAC HSP IRE1 驱动蛋白 LIM激酶(LIMK) 微管/微管蛋白 MPS1 核苷抗代谢药/类似物 P97 PAK PARP PERK Polo样激酶(PLK) PPAR RAD51 岩石 抗衰老酶 SRPK 端粒酶 TOPK 拓扑异构酶 WEE1
细胞骨架 >
Arp2/3复合物 动力素 间隙连接蛋白 Integrin 驱动蛋白 微管/微管蛋白 MPS1 肌球蛋白 PAK
表观遗传学 >
AMPK 极光激酶 DNA甲基转移酶 表观遗传读者域 HDAC 组蛋白乙酰转移酶 组蛋白去甲基化酶 组蛋白甲基转移酶 JAK 微RNA PARP PKC 抗衰老酶 蛋白质精氨酸脱亚胺酶
G 蛋白偶联受体/G 蛋白 >
5-HT受体 腺苷受体 腺苷酸环化酶 脂联素受体 肾上腺素能受体 血管紧张素受体 Bombesin Receptor 缓激肽受体 大麻素受体 CaSR的 CCR CGRP受体 胆囊收缩素受体 CRFR CXCR 多巴胺受体 EBI2/GPR183 内皮素受体 GHSR 胰高血糖素受体 糖皮质激素受体 GNRH受体 GPCR19 GPR109A GPR119 GPR120 GPR139 GPR40 GPR55 GPR84 鸟苷酸环化酶 组胺受体 咪唑啉受体 白三烯受体 LPL受体 由mAChR MCHR1(GPR24) 褪黑激素受体 谷氨酸受体 Motilin Receptor 神经激肽受体 神经肽Y受体 神经降压素受体 阿片受体 食欲素受体(OX受体) 催产素受体 P2Y受体 前列腺素受体 蛋白酶激活受体(PAR) 拉斯 RGS蛋白质 Sigma Receptor 生长抑素受体 TSH受体 Urotensin Receptor 血管加压素受体 黑皮素受体
免疫及炎症 >
芳基烃受体 CCR 补充系统 COX CXCR FLAP 组胺受体 IFNAR 白细胞介素相关 IRAK MyD88的 一氧化氮合酶 NOD样受体(NLR) PD-1/PD-L1 PGE合成酶 盐诱导激酶(SIK) SPHK 血小板生成素受体 Toll样受体(TLR) 精氨酸
JAK/STAT信号通路 >
EGFR JAK 皮姆 STAT
MAPK/ERK信号通路 >
ERK JNK KLF MAP3K MAP4K MAPKAPK2(MK2) MEK 混合谱系激酶 MNK p38 MAPK 拉夫 核糖体S6激酶(RSK)
跨膜转运 >
ATP合成酶 BCRP 钙通道 CFTR 氯离子通道 CRAC频道 CRM1 EAAT2 GABA受体 GLYT HCN频道 iGluR 单胺转运蛋白 单羧酸转运蛋白 Na+/Ca2+交换器 Na+/HCO3-协同转运蛋白 Na+/K+ATP酶 胆碱受体 NKCC P-糖蛋白 P2X受体 钾通道 质子泵 SGLT 钠通道 TRP频道 URAT1
代谢酶/蛋白酶 >
15-PGDH 5 alpha还原酶 5脂氧合酶 乙酰辅酶A羧化酶 酰基转移酶 腺苷脱氨酶 腺苷激酶 醛脱氢酶(ALDH) 醛糖还原酶 氨肽酶 血管紧张素转换酶(ACE) ATGL ATP柠檬酸裂解酶 碳酸酐酶 组织蛋白酶 CETP COMT 细胞色素P450 二肽基肽酶 多巴胺β-羟化酶 E1/E2/E3酶 弹性蛋白酶 烯醇化酶 FAAH FABP 因子Xa 法呢基转移酶 脂肪酸合成酶(FAS) FXR 葡萄糖激酶 GSNOR 谷胱甘肽S-转移酶 HCV蛋白酶 己糖激酶 HIF/HIF脯氨酰-羟化酶 艾滋病毒整合酶 HIV蛋白酶 HMG-CoA还原酶(HMGCR) HSP 吲哚胺2,3-二氧化酶(IDO) 异柠檬酸脱氢酶(IDH) 乳酸脱氢酶 LXR MAGL 盐皮质激素受体 线粒体代谢 MMP NAMPT NEDD8活化酶 脑啡肽酶 PAI-1 PDHK PGC-1α 磷酸酶 磷酸二酯酶(PDE) 磷脂 前胶原C蛋白酶 蛋白酶体 丙酮酸激酶 RAR/RXR 肾素 ROR Ser/Thr蛋白酶 SGK 硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD) 凝血酶 色氨酸羟化酶 酪氨酸酶 黄嘌呤氧化酶
神经信号通路 >
5-HT受体 疼痛 腺苷激酶 β淀粉样蛋白 β-分泌 蛋白激酶 CGRP受体 COMT 多巴胺受体 多巴胺转运蛋白 FAAH GABA受体 GLYT iGluR 咪唑啉受体 mAChR 褪黑激素受体 单胺氧化酶 胆碱受体 神经激肽受体 阿片受体 5-羟色胺转运蛋白 γ分泌酶
NF-κB信号通路 >
NF-κB IKK KEAP1-Nrf2 MALT1
PI3K/Akt/mTOR 信号通路 >
AKT AMPK ATM/ATR DNA-PK GSK-3 MELK mTOR PDK-1 PI3K PI4K PIKfyve PTEN
蛋白裂解靶向嵌合体 >
PROTAC E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate E3 Ligase的配体 PROTAC Linker 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
蛋白酪氨酸激酶 >
ACK1 ALK BCR-ABL BMX激酶 BTK c-FMS c-Kit c-Met的/HGFR 盘基蛋白结构域受体 DYRK EGFR 艾弗林受体 FAK FGFR FLT3 IGF-1R 胰岛素受体 IRAK ITK PDGFR PKA PYK2 ROS SRC SYK TAM Receptor Trk Receptor VEGFR
干细胞及 Wnt 通路 >
酪蛋白激酶 ERK GLI GSK-3 Hedgehog Hippo (MST) JAK Notch OCT3/4 PKA 豪猪 岩石 SFRP-1 SMO STAT TGF-β/Smad蛋白 Wnt信号 YAP β-catenin γ分泌酶
TGF-beta/Smad 信号通路 >
TGF-β/Smad蛋白 PKC 岩石 TGF-β受体
维生素 D 相关 >
VD/VDR
其他 >
雄激素受体 芳香 雌激素受体/ERR 孕激素受体 甲状腺激素受体 其他

PROTAC CDK9 Degrader-1

PROTAC CDK9 Degrader-1 是一种有选择性的 CDK9 降解剂。

  • CAS号:2118356-96-8
  • 分子式:C33H35N5O7
  • 分子量:613.66
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC BTK Degrader-6

PROTAC BTK降解物-6(化合物15)是一种PROTAC-BTK降解物(DC50:3.18nM。PROTAC-BTK降解物-6具有抗炎活性,抑制NF-κB活化,并抑制促炎细胞因子(如IL-1β、IL-6)的表达[1]。

  • CAS号:2767204-39-5
  • 分子式:C45H47N11O6
  • 分子量:837.92
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

E3连接酶配体9

E3 ligase Ligand 9 是用于 PROTAC 技术,可连接到E3连接酶的,BETd-260的一个配体。BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 51 pM。

  • CAS号:2093388-45-3
  • 分子式:C18H23N3O3
  • 分子量:329.39
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC FKBP Degrader-3

PROTAC FKBP Degrader-3 是一种包含 FKBP 配体结合基团,linker 和 VHL 结合基团的 PROTAC。PROTAC FKBP Degrader-3 是一种有效的 FKBP 降解剂。

  • CAS号:2079056-43-0
  • 分子式:C68H90N6O17S
  • 分子量:1295.54
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC α-synuclein degrader 5

PROTACα-突触核蛋白降解器5是一种高选择性的α-突触蛋白聚集体小分子降解器(PROTAC),其DC50为7.51μM,最高降解率Dmax为89%。PROTACα-突触核蛋白降解器5含有探针分子sery308和E3连接酶配体。PROTACα-突触核蛋白降解物5可用于神经疾病研究[1]。

  • CAS号:2781922-42-5
  • 分子式:C39H41N7O10
  • 分子量:767.78
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

SNX7886

SNX7886 是一种有效的 CDK8/19 蛋白降解剂。SNX7886 在 293细胞中降解 CDK 8 和 CDK 19,降解率分别为 90% 和 80%。

  • CAS号:2924557-42-4
  • 分子式:C52H59N9O7
  • 分子量:922.08
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC MEK1 Degrader-1

PROTAC MEK1降解器-1是一种靶向MEK1的PROTAC,pIC50值为7.0。PROTAC MEK1降解物-1由MEK1抑制剂和von Hippel-Lindau配体组成。PROTAC MEK1降解物-1可抑制ERK1/2磷酸化。PROTAC MEK1降解物-1显示出对A375细胞的抗增殖活性[1]。

  • CAS号:2671004-41-2
  • 分子式:C53H66FIN8O11S2
  • 分子量:1201.17
  • 类别:ERK
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC BET Degrader-10

PROTAC BET Degrader-10 是有效 BET BRD4降解剂,DC50 为 49 nM,详细信息请参考专利 WO2017007612A1,example 37。

  • CAS号:1957234-97-7
  • 分子式:C39H39ClN8O6S
  • 分子量:783.29
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

HEMTAC CDK4/6 degrader 1

HEMTAC CDK4/6降解器1是由HSP90和CDK4/6配体连接的PROTAC,Kd值为35.7μM。HEMTAC CDK4/6降解剂1诱导B16F10黑色素瘤细胞中CDK4/6的降解。HEMTAC CDK4/6降解剂1在G0/G1期阻滞细胞周期并诱导细胞凋亡。HEMTAC CDK4/6降解剂1可用于癌症研究[1]。

  • CAS号:2821803-61-4
  • 分子式:C48H53ClN16O4
  • 分子量:953.49
  • 类别:细胞凋亡
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

MS4077

MS4077 是间变性淋巴瘤激酶 (ALK) PROTAC (降解物),结合 ALK, Kd 为 37 nM。

  • CAS号:2230077-10-6
  • 分子式:C55H72ClN9O13S
  • 分子量:1134.73
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

MS98

MS98是一种高效、选择性的PROTAC AKT降解剂。MS98消耗细胞总AKT(T-AKT),DC50值为78 nM。MS98分别以4nm、140nm和8.1nm的Kds与AKT1、AKT2和AKT3结合[1]。

  • CAS号:2376137-31-2
  • 分子式:C58H81ClN10O7S
  • 分子量:1097.84
  • 类别:AKT
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

GBD-9

GBD-9是一种双机制降解剂,通过募集E3连接酶cereblon(CRBN)有效降解BTK和GSPT1。GBD-9既作为PROTAC分子诱导BTK降解,又作为分子胶降解GSPT1。GBD-9有效抑制癌症细胞生长[1]。

  • CAS号:2864408-92-2
  • 分子式:C44H47N9O6
  • 分子量:797.90
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

FC-11

FC-11是PROTAC FAK降解剂(DC90:1 nM)。FC-11含有CRBN配体泊马度胺(HY-10984)、接头和FAK配体PF562271(HY-10459)。FC-11在各种细胞中降解FAK,TM3中的DC50为310 pM,PA1中的DC50s为80 pM,MDA-MB-436中为330 pM,LNCaP中为370 pM,Ramos细胞中为40 pM[1]。

  • CAS号:2271035-37-9
  • 分子式:C41H42F3N13O9S
  • 分子量:949.91
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

CD147 degrader 1

CD147降解器1是PROTAC靶向CD147,DC50值为6.72µM。CD147降解物1抑制细胞增殖、迁移和侵袭。CD147降解剂1降低CD147、MMP9和p-STAT3蛋白的表达。CD147降解剂1显示抗癌活性[1]。

  • CAS号:2416740-37-7
  • 分子式:C38H42N4O11
  • 分子量:730.76
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

SJF620

SJF620 是一种 PROTAC BTK 降解剂,DC50 为 7.9 nM。

  • CAS号:2376187-16-3
  • 分子式:C41H44N8O7
  • 分子量:760.84
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

CMP98

CMP98 是一种 PROTAC,但不能诱导 VHL 降解。CMP98 可用作 CM11 的阴性对照化合物。

  • CAS号:2244684-50-0
  • 分子式:C58H82N8O14S2
  • 分子量:1179.45
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

A031

A031是一种高效的PROTAC雄激素受体(AR)降解剂,AR蛋白降解的IC50值小于0.25μM。A031对患有人类前列腺癌症(VCaP)的斑马鱼的肿瘤生长具有抑制作用[1]。

  • CAS号:2682255-44-1
  • 分子式:C50H61ClN10O7S
  • 分子量:981.60
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

JH-XI-10-02

JH-XI-10-02 是一种有效、选择性的 CDK8 降解剂,基于 PROTAC 技术,IC50 值为 159 nM。JH-XI-10-02 降解 CDK8 蛋白,但对其 mRNA 水平没有影响。JH-XI-10-02 对 CDK19 无作用。

  • CAS号:2209085-22-1
  • 分子式:C53H69N5O9
  • 分子量:920.14
  • 类别:CDK
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

ARD-61

ARD-61是一种高效、有效和特异的雄激素受体(AR)降解剂。ARD-61能有效地诱导AR+癌细胞系中的AR和孕酮受体(PR)降解。在小鼠MDA-MB-453异种移植模型中,ARD-61诱导细胞凋亡并有效诱导肿瘤生长抑制[1]。

  • CAS号:2316837-08-6
  • 分子式:C61H71ClN8O7S
  • 分子量:1095.78
  • 类别:细胞凋亡
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC GPX4 degrader-1

PROTAC GPX4降解器-1(DC-2)是一种基于PROTAC的GPX4去除器,在HT1080细胞中的DC50为0.03μM[1]。

  • CAS号:2916433-81-1
  • 分子式:C50H57ClN10O10
  • 分子量:993.50
  • 类别:Ferroptosis
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

KRAS G12D inhibitor 17

KRAS G12D抑制剂17(实施例8)是喹唑啉连接的(4R)-4-羟基-L-丙酰胺化合物,诱导G12D突变KRAS蛋白降解[1]。

  • CAS号:2821793-99-9
  • 分子式:C60H65FN12O7S
  • 分子量:1117.30
  • 类别:拉斯
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC KRAS G12C degrader-2

PROTAC KRAS G12C降解物-2(化合物432)是K-Ras蛋白水解的调节剂。PROTAC KRAS G12C降解物-2是一种双功能化合物,其一端含有细胞凋亡蛋白的蜡样蛋白抑制剂(IAP),另一端含有结合KRAS的部分[1]。

  • CAS号:2378257-72-6
  • 分子式:C51H53ClFN9O7
  • 分子量:958.47
  • 类别:拉斯
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

JPS016

JPS016是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS016降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS016是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

  • CAS号:2669785-77-5
  • 分子式:C48H63N7O8S
  • 分子量:898.12
  • 类别:HDAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

JPS014

JPS014是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS014降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS014是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

  • CAS号:2669785-76-4
  • 分子式:C46H59N7O7S
  • 分子量:854.07
  • 类别:HDAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

BCL6 PROTAC 1

BCL6 PROTAC 1是一种选择性B细胞淋巴瘤6(BCL6)PROTAC。BCL6 PROTAC 1抑制BCL6细胞报告子,IC50值为8.8µM。BCL6 PROTAC 1在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)细胞系中显著降解BCL6。BCL6 PROTAC 1可用于肿瘤相关研究[1]。

  • CAS号:2257479-54-0
  • 分子式:C45H52ClN9O12
  • 分子量:946.40
  • 类别:Bcl-2家族
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC K-Ras Degrader-1

PROTAC K-Ras Degrader-1 是一种基于 PROTAC 技术的有效的 K-Ras 降解剂,在 SW1573 中对其降解率为 ≥70%。

  • CAS号:2378258-52-5
  • 分子式:C53H62N10O10
  • 分子量:999.12
  • 类别:拉斯
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

QCA570

QCA570 是基于 PROTAC 技术的 BET 的强效降解剂,其对 BRD4 BD1 蛋白的 IC50 值为 10 nM。

  • CAS号:2207569-08-0
  • 分子式:C39H33N7O4S
  • 分子量:695.798
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

XZ739

XZ739 是一种基于 CRBN 的 PROTAC BCL-XL 降解剂,作用于 MOLT-4 细胞,处理 16 小时后,DC50 值为 2.5 nM。XZ739 还通过 caspase 介导的凋亡 (apoptosis) 诱导细胞死亡。

  • CAS号:2365172-19-4
  • 分子式:C65H76ClF3N8O12S3
  • 分子量:1349.99
  • 类别:细胞凋亡
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

乙酸-五聚乙二醇-乙酸

PEG6-(CH2CO2H)2 是一个对称的 PEG 连接桥,用于 Homo-PROTACs 的合成。Homo-PROTACs 是能诱导自降解的 VHL E3 泛素连接酶二价小分子二聚体。

  • CAS号:77855-76-6
  • 分子式:C14H26O10
  • 分子量:354.35
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Homo-PROTAC cereblon降解剂1

Homo-PROTAC cereblon degrader 1 (compound 15a) 是 CRBN 蛋白的高效降解剂,对IKZF1和IKZF3的影响很小。

  • CAS号:2244520-98-5
  • 分子式:C32H32N6O10
  • 分子量:660.63
  • 类别:E1/E2/E3酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A