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针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子,理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言,PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们,PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势,小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制,通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力,因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现,以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病,例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外,这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前,已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET,雌激素受体(ER),雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献:
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.


抗感染 >
沙粒 细菌 CMV 肠道病毒 丝状病毒 真菌 HBV HCV HIV HSV 流感病毒 寄生物 逆转录酶 RSV SARS冠状病毒
抗体- 药物偶联物 >
ADC细胞毒素 ADC连接器 Drug-Linker Conjugates for ADC 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
细胞凋亡 >
细胞凋亡 Bcl-2家族 c-Myc的 胱天蛋白酶 DAPK Ferroptosis IAP MDM-2/p53 PKD RIP激酶 存活 胸苷酸合成酶 TNF受体
自噬 >
自噬 LRRK2 ULK 自噬
细胞周期/DNA损伤 >
叶酸 APC ATM/ATR 极光激酶 酪蛋白激酶 CDK 检查点激酶(Chk) CRISPR/Cas9 去泛素化酶 DNA烷基化剂/交联剂 DNA-PK DNA/RNA合成 真核起始因子(eIF) G-四链体 Haspin激酶 HDAC HSP IRE1 驱动蛋白 LIM激酶(LIMK) 微管/微管蛋白 MPS1 核苷抗代谢药/类似物 P97 PAK PARP PERK Polo样激酶(PLK) PPAR RAD51 岩石 抗衰老酶 SRPK 端粒酶 TOPK 拓扑异构酶 WEE1
细胞骨架 >
Arp2/3复合物 动力素 间隙连接蛋白 Integrin 驱动蛋白 微管/微管蛋白 MPS1 肌球蛋白 PAK
表观遗传学 >
AMPK 极光激酶 DNA甲基转移酶 表观遗传读者域 HDAC 组蛋白乙酰转移酶 组蛋白去甲基化酶 组蛋白甲基转移酶 JAK 微RNA PARP PKC 抗衰老酶 蛋白质精氨酸脱亚胺酶
G 蛋白偶联受体/G 蛋白 >
5-HT受体 腺苷受体 腺苷酸环化酶 脂联素受体 肾上腺素能受体 血管紧张素受体 Bombesin Receptor 缓激肽受体 大麻素受体 CaSR的 CCR CGRP受体 胆囊收缩素受体 CRFR CXCR 多巴胺受体 EBI2/GPR183 内皮素受体 GHSR 胰高血糖素受体 糖皮质激素受体 GNRH受体 GPCR19 GPR109A GPR119 GPR120 GPR139 GPR40 GPR55 GPR84 鸟苷酸环化酶 组胺受体 咪唑啉受体 白三烯受体 LPL受体 由mAChR MCHR1(GPR24) 褪黑激素受体 谷氨酸受体 Motilin Receptor 神经激肽受体 神经肽Y受体 神经降压素受体 阿片受体 食欲素受体(OX受体) 催产素受体 P2Y受体 前列腺素受体 蛋白酶激活受体(PAR) 拉斯 RGS蛋白质 Sigma Receptor 生长抑素受体 TSH受体 Urotensin Receptor 血管加压素受体 黑皮素受体
免疫及炎症 >
芳基烃受体 CCR 补充系统 COX CXCR FLAP 组胺受体 IFNAR 白细胞介素相关 IRAK MyD88的 一氧化氮合酶 NOD样受体(NLR) PD-1/PD-L1 PGE合成酶 盐诱导激酶(SIK) SPHK 血小板生成素受体 Toll样受体(TLR) 精氨酸
JAK/STAT信号通路 >
EGFR JAK 皮姆 STAT
MAPK/ERK信号通路 >
ERK JNK KLF MAP3K MAP4K MAPKAPK2(MK2) MEK 混合谱系激酶 MNK p38 MAPK 拉夫 核糖体S6激酶(RSK)
跨膜转运 >
ATP合成酶 BCRP 钙通道 CFTR 氯离子通道 CRAC频道 CRM1 EAAT2 GABA受体 GLYT HCN频道 iGluR 单胺转运蛋白 单羧酸转运蛋白 Na+/Ca2+交换器 Na+/HCO3-协同转运蛋白 Na+/K+ATP酶 胆碱受体 NKCC P-糖蛋白 P2X受体 钾通道 质子泵 SGLT 钠通道 TRP频道 URAT1
代谢酶/蛋白酶 >
15-PGDH 5 alpha还原酶 5脂氧合酶 乙酰辅酶A羧化酶 酰基转移酶 腺苷脱氨酶 腺苷激酶 醛脱氢酶(ALDH) 醛糖还原酶 氨肽酶 血管紧张素转换酶(ACE) ATGL ATP柠檬酸裂解酶 碳酸酐酶 组织蛋白酶 CETP COMT 细胞色素P450 二肽基肽酶 多巴胺β-羟化酶 E1/E2/E3酶 弹性蛋白酶 烯醇化酶 FAAH FABP 因子Xa 法呢基转移酶 脂肪酸合成酶(FAS) FXR 葡萄糖激酶 GSNOR 谷胱甘肽S-转移酶 HCV蛋白酶 己糖激酶 HIF/HIF脯氨酰-羟化酶 艾滋病毒整合酶 HIV蛋白酶 HMG-CoA还原酶(HMGCR) HSP 吲哚胺2,3-二氧化酶(IDO) 异柠檬酸脱氢酶(IDH) 乳酸脱氢酶 LXR MAGL 盐皮质激素受体 线粒体代谢 MMP NAMPT NEDD8活化酶 脑啡肽酶 PAI-1 PDHK PGC-1α 磷酸酶 磷酸二酯酶(PDE) 磷脂 前胶原C蛋白酶 蛋白酶体 丙酮酸激酶 RAR/RXR 肾素 ROR Ser/Thr蛋白酶 SGK 硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD) 凝血酶 色氨酸羟化酶 酪氨酸酶 黄嘌呤氧化酶
神经信号通路 >
5-HT受体 疼痛 腺苷激酶 β淀粉样蛋白 β-分泌 蛋白激酶 CGRP受体 COMT 多巴胺受体 多巴胺转运蛋白 FAAH GABA受体 GLYT iGluR 咪唑啉受体 mAChR 褪黑激素受体 单胺氧化酶 胆碱受体 神经激肽受体 阿片受体 5-羟色胺转运蛋白 γ分泌酶
NF-κB信号通路 >
NF-κB IKK KEAP1-Nrf2 MALT1
PI3K/Akt/mTOR 信号通路 >
AKT AMPK ATM/ATR DNA-PK GSK-3 MELK mTOR PDK-1 PI3K PI4K PIKfyve PTEN
蛋白裂解靶向嵌合体 >
PROTAC E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate E3 Ligase的配体 PROTAC Linker 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
蛋白酪氨酸激酶 >
ACK1 ALK BCR-ABL BMX激酶 BTK c-FMS c-Kit c-Met的/HGFR 盘基蛋白结构域受体 DYRK EGFR 艾弗林受体 FAK FGFR FLT3 IGF-1R 胰岛素受体 IRAK ITK PDGFR PKA PYK2 ROS SRC SYK TAM Receptor Trk Receptor VEGFR
干细胞及 Wnt 通路 >
酪蛋白激酶 ERK GLI GSK-3 Hedgehog Hippo (MST) JAK Notch OCT3/4 PKA 豪猪 岩石 SFRP-1 SMO STAT TGF-β/Smad蛋白 Wnt信号 YAP β-catenin γ分泌酶
TGF-beta/Smad 信号通路 >
TGF-β/Smad蛋白 PKC 岩石 TGF-β受体
维生素 D 相关 >
VD/VDR
其他 >
雄激素受体 芳香 雌激素受体/ERR 孕激素受体 甲状腺激素受体 其他
PROTAC CDK9 Degrader-1结构式

PROTAC CDK9 Degrader-1

PROTAC CDK9 Degrader-1 是一种有选择性的 CDK9 降解剂。

  • CAS号:2118356-96-8
  • 分子式:C33H35N5O7
  • 分子量:613.66
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
TNF-α-IN-1结构式

TNF-α-IN-1

TNF-α-IN-1是 TNF-α 抑制剂,来自专利 US20030096841A1,化合物实例 I-7.

  • CAS号:444287-49-4
  • 分子式:C16H14ClN3O5
  • 分子量:363.753
  • 类别:E3 Ligase的配体
  • 密度:1.5±0.1 g/cm3
  • 沸点:718.6±60.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:388.4±32.9 °C
E3连接酶Ligand-Linker共轭物7结构式

E3连接酶Ligand-Linker共轭物7

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 7是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

  • CAS号:2064292-52-8
  • 分子式:
  • 分子量:700.29
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
PROTAC BET降解剂-2结构式

PROTAC BET降解剂-2

PROTAC BET degrader-2 是一种强效的 溴域及末端外 (BET) 蛋白的降解剂,在 RS4;11 细胞中测得其对细胞生长的 IC50 值为 9.6 nM,并能实现肿瘤消退。

  • CAS号:2093388-33-9
  • 分子式:C41H42N10O6
  • 分子量:770.84
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
MZP-54结构式

MZP-54

MZP-54 是基于 PROTAC 技术的一种选择性的 BRD3/4 降解剂,对 Brd4BD2 的 Kd 值为 4 nM。

  • CAS号:2010159-47-2
  • 分子式:C55H66ClN7O9S
  • 分子量:1036.67
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
dTRIM24结构式

dTRIM24

dTRIM24 是一种选择性的双功能基于 PROTAC 技术的 TRIM24 降解剂。

  • CAS号:2170695-14-2
  • 分子式:C55H68N8O13S2
  • 分子量:1113.3
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
2-(2,6-二氧代-哌啶-3-基)-4-羟基-异吲哚-1,3-二酮结构式

2-(2,6-二氧代-哌啶-3-基)-4-羟基-异吲哚-1,3-二酮

E3 ligase Ligand 2是用于 PROTAC 技术中的E3连接酶配体。

  • CAS号:5054-59-1
  • 分子式:C13H10N2O5
  • 分子量:274.229
  • 类别:E3 Ligase的配体
  • 密度:1.6±0.1 g/cm3
  • 沸点:568.3±45.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:297.5±28.7 °C
PROTAC BRD9 Degrader-1结构式

PROTAC BRD9 Degrader-1

PROTAC BRD9 Degrader-1 是一种先导 PROTAC BRD9 化学降解剂,可用作研究 BAF 复合物的选择性探针。

  • CAS号:2097971-01-0
  • 分子式:C42H45N7O12S2
  • 分子量:903.98
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
BRD4降解AT1结构式

BRD4降解AT1

BRD4 degrader AT1 是基于 PROTAC 技术的一种高度选择性的 Brd4 降解剂,在细胞中对 Brd4BD2 的 Kd 值为 44 nM。

  • CAS号:2098836-45-2
  • 分子式:C48H58ClN9O5S3
  • 分子量:972.68
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker共轭物11结构式

E3连接酶Ligand-Linker共轭物11

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate 11 是一种合成化合物,由 E3 泛素连接酶的配体和一个 PROTAC 接头组成,该化合物将靶蛋白和泛素化机制结合在一起。

  • CAS号:1835705-61-7
  • 分子式:
  • 分子量:749.44
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 12结构式

E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 12

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 12是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

  • CAS号:1797406-80-4
  • 分子式:C30H43N7O7S
  • 分子量:645.77
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
蛋白质降解剂1盐酸盐结构式

蛋白质降解剂1盐酸盐

Protein degrader 1 hydrochloride可用于HaloPROTACs的合成。

  • CAS号:1448189-80-7
  • 分子式:C22H31ClN4O3S
  • 分子量:467.025
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
Protac连接子5结构式

Protac连接子5

Protac linker 5是用于将酪氨酸激酶 (TKI) 抑制剂连接到E3招募配体上的一种 PROTAC 连接体。

  • CAS号:2245697-83-8
  • 分子式:C27H40ClN5O4S
  • 分子量:566.16
  • 类别:癌症
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker共轭物4结构式

E3连接酶Ligand-Linker共轭物4

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 4 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

  • CAS号:1797406-81-5
  • 分子式:C32H47N7O8S
  • 分子量:689.82
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
MZP-55结构式

MZP-55

MZP-55 是基于 PROTAC 技术的一种选择性的 BRD3/4 降解剂,对 Brd4BD2 的 Kd 值为 8 nM。

  • CAS号:2010159-48-3
  • 分子式:C57H70ClN7O10S
  • 分子量:1080.72
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
dBET6结构式

dBET6

dBET6 是一种高效的,选择性的,细胞透过的基于 PROTAC 技术的 BET 降解剂,IC50 值为 14 nM,具有抗肿瘤活性。

  • CAS号:1950634-92-0
  • 分子式:C42H45ClN8O7S
  • 分子量:841.37
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
靶蛋白结合部分6结构式

靶蛋白结合部分6

Target Protein-binding moiety 6 是一种能够与 BRD9 结合的结构,用于抑制 BRD9 的活性。

  • CAS号:2097512-23-5
  • 分子式:C23H25N3O7S2
  • 分子量:519.59
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶配体4结构式

E3连接酶配体4

E3 ligase Ligand 4 是一种 E3 泛素连接酶的配体,可用于 PROTAC 技术研究。

  • CAS号:835616-60-9
  • 分子式:C13H9FN2O4
  • 分子量:276.22000
  • 类别:E3 Ligase的配体
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker共轭物5结构式

E3连接酶Ligand-Linker共轭物5

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 5 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

  • CAS号:2097971-11-2
  • 分子式:
  • 分子量:656.23
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21结构式

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

  • CAS号:1957236-20-2
  • 分子式:
  • 分子量:506.51
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
SJFα结构式

SJFα

SJFα 是一种含 13 个原子连接桥的 PROTAC。SJFα 降解 p38α,DC50 为 7.16 nM,但降解 p38δ 效果较差 (DC50=299 nM),且在浓度高达 2.5 μM 时也不会降解其他 p38 亚型 (β 和 γ)。

  • CAS号:2254609-27-1
  • 分子式:C59H67F2N7O11S
  • 分子量:1120.27
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20结构式

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成 (参考文献中的化合物 DL7-TL)。

  • CAS号:1950635-15-0
  • 分子式:
  • 分子量:458.51
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
ARV-771结构式

ARV-771

ARV-771 是 PROTAC 类的有效的 BET 降解剂。对 BRD2, BRD3 和 BRD4 的 Kd 值分别为 4.7, 7.6 和 7.6 nM。

  • CAS号:1949837-12-0
  • 分子式:C49H60ClN9O7S2
  • 分子量:986.640
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:1.4±0.1 g/cm3
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
MZ 1结构式

MZ 1

MZ 1 是基于 PROTAC 技术的 BRD4 蛋白质降解剂。

  • CAS号:1797406-69-9
  • 分子式:
  • 分子量:1002.64
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
靶蛋白结合部分4结构式

靶蛋白结合部分4

Target Protein-binding moiety 4 是一个 BRD4(1) 抑制剂,其 IC50 值为 7.9 μM。

  • CAS号:1300019-38-8
  • 分子式:C20H17ClN4O3
  • 分子量:396.83
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 17结构式

E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 17

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 17 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

  • CAS号:1950635-16-1
  • 分子式:C25H31F3N4O8
  • 分子量:572.53
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker共轭物14结构式

E3连接酶Ligand-Linker共轭物14

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 14是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

  • CAS号:1957236-21-3
  • 分子式:
  • 分子量:620.53
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
PROTAC Linker 2结构式

PROTAC Linker 2

PROTAC Linker 2 是用于将酪氨酸激酶 (TKI) 抑制剂连接到E3招募配体上的一种 PROTAC 连接体。

  • CAS号:1835705-52-6
  • 分子式:C21H41ClO4
  • 分子量:393
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22结构式

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 结合了 E3 连接酶配体和连接桥,可用于治疗 EZH2 介导的癌症。

  • CAS号:2225940-52-1
  • 分子式:C23H32N4O8
  • 分子量:492.52
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 13结构式

E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 13

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 13是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

  • CAS号:2010159-45-0
  • 分子式:
  • 分子量:601.72
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A
  • ad1
  • ad2
  • ad3
  • ad4
  • ad5
  • ad6