表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

AU-15330

AU-15330是SWI/SNF ATP酶亚单位SMARCA2和SMARCA4的蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)降解物。AU-15330在前列腺癌异种移植模型中诱导对肿瘤生长的有效抑制,并与AR拮抗剂恩扎鲁胺协同作用。AU-15330在无毒性的去势耐受性前列腺癌(CRPC)模型中诱导疾病缓解[1]。

• CAS号：2380274-50-8
• 分子式：C₃₉H₄₉N₉O₅S
• 分子量：755.93
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

7-氯-4-(1-哌嗪基)喹啉

7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种重要的药物化学支架。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种有效的sirtuin抑制剂,并可抑制5-羟色胺摄取(IC50为50μM)。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物对P。IC50分别为1.18μM和0.97μM的恶性疟原虫[1]。

• CAS号：837-52-5
• 分子式：C₁₃H₁₄ClN₃
• 分子量：247.72300
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.257 g/cm3
• 沸点：433.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：113-116ºC
• 闪点：216ºC

Methylstat

甲基stat是一种有效的组蛋白去甲基化酶抑制剂。Methylstat显示出低细胞毒性的抗增殖活性。甲基stat诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞在G0/G1期。甲基stat增加p53和p21蛋白水平的表达。甲基stat抑制各种细胞因子诱导的血管生成。Methylstat可用作化学探针,以解决其在血管生成中的作用[1][2]。

• CAS号：1310877-95-2
• 分子式：C₂₈H₃₁N₃O₆
• 分子量：505.562
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Alisertib sodium

Alisertib(MLN 8237)钠是一种口服活性和选择性极光A激酶抑制剂(IC50=1.2 nM),它与极光A激酶结合,导致有丝分裂纺锤体异常、有丝分裂累积。Alisertib钠通过靶向白血病细胞中的AKT/mTOR/AMPK/p38通路诱导凋亡和自噬。抗肿瘤活性[1][2][3]。

• CAS号：1028486-06-7
• 分子式：C₂₇H₁₉ClFN₄NaO₄
• 分子量：540.90500
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT6 activator 12q

SIRT6激活剂12q是有效的、选择性的和口服活性的SIRT6激活物,SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6的IC50值分别为171.20、>200、>200和0.58µM。SIRT6激活剂12q抑制细胞生长和迁移。SIRT6激活剂12q诱导G2期细胞凋亡和细胞周期阻滞。SIRT6激活剂12q显示出抗癌活性[1]。

• CAS号：2601734-99-8
• 分子式：C₃₁H₂₂N₂O₂
• 分子量：454.53
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Dcg066

DCG066是一种G9a体外抑制剂。

• CAS号：494786-13-9
• 分子式：C₃₀H₃₁F₆N₃O₂
• 分子量：579.58
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LEM-14

LEM-14是组蛋白赖氨酸甲基转移酶NSD2(MMSET/WHSC1)的特异性抑制剂,体外IC50为132μM,对密切相关的NSD1和NSD3无活性。

• CAS号：1814881-70-3
• 分子式：C₂₅H₂₆N₄O₄S
• 分子量：478.567
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Remetinostat

Remetinostat (SHP-141) 是一种基于羟肟酸的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 的抑制剂,目前正在开发应用与治疗皮肤T细胞淋巴瘤[1]。

• CAS号：946150-57-8
• 分子式：C₁₆H₂₁NO₆
• 分子量：323.34100
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

仙茅苷

Curculigoside 是 C. orchioide 中的主要皂苷,具有显着的抗氧化,抗骨质疏松,抗抑郁和神经保护作用。通过调节 JAK/STAT/NF-κB 信号传导途径,在体内和体外表现出显着的抗关节炎作用。

• CAS号：85643-19-2
• 分子式：C₂₂H₂₆O₁₁
• 分子量：466.435
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：734.9±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：158-160ºC
• 闪点：253.8±26.4 °C

S2101

S 2101 是一个赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂,其 IC50 值为 0.99 μM, Ki 值为 0.61 μM,Kinact/Ki 值为 4560 M/s。

• CAS号：1239262-36-2
• 分子式：C₁₆H₁₆ClF₂NO
• 分子量：311.75
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LSD1-UM-109

LSD1-UM-109 是一种强效且可逆的 LSD1 抑制剂,IC50 为 3.1 nM。LSD1-UM-109 抑制细胞生长,在 MV4;11 急性白血病细胞系中的 IC50 值为 0.6 nM,在 H1417 小细胞肺癌细胞系中的 IC50 值为 1.1 nM。

• CAS号：2252446-26-5
• 分子式：C₂₉H₂₇FN₆
• 分子量：478.56
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CBP/p300-IN-19

CBP/p300-IN-19是一种有效的p300/CBP HAT抑制剂,对于p300 HAT、CBP-HAT、PCAF和Myst3,IC50s分别为1.4、2.2、>100、>100µM。CBP/p300-IN-19具有抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2592638-13-4
• 分子式：C₃₀H₂₇N₃O₃
• 分子量：477.55
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Nimucitinib

尼穆西替尼是一种Janus激酶(JAK)抑制剂[1]。

• CAS号：2740557-24-6
• 分子式：C₂₅H₂₆F₂N₆O₂
• 分子量：480.51
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSC 33994

NSC 33994 (G6) 是选择性的 JAK2 抑制剂,其 IC50 值为 60 nM。

• CAS号：82058-16-0
• 分子式：C₂₈H₄₂N₂O₂
• 分子量：438.64500
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EPZ-719

EPZ-719是一种新型有效的SETD2抑制剂(IC50=0.005μM),与其他组蛋白甲基转移酶相比具有高选择性。

• CAS号：2697176-16-0
• 分子式：C₂₂H₃₁FN₄O₃S
• 分子量：450.57
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-31

HDAC-IN-31是一种高效、选择性和口服活性的HDAC抑制剂,对于HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC8,其IC50s分别为84.90、168.0、442.7、>10000 nM。HDAC-IN-31在G2/M期诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞。HDAC-IN-31具有良好的抗肿瘤作用。HDAC-IN-31具有研究弥漫性大B细胞淋巴瘤的潜力【1】。

• CAS号：1916505-13-9
• 分子式：C₂₅H₂₄N₄O₂
• 分子量：412.48
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-萘乙烯基酮

ZM 449829 是有效的、选择性和ATP竞争性的 JAK3 抑制剂,pIC50 值为 6.8。ZM 449829 是可用于研究 JAK3 的药理学工具。

• CAS号：4452-06-6
• 分子式：C₁₃H₁₀O
• 分子量：182.218
• 类别：JAK

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：319.3±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：137.5±15.3 °C

EPZ004777

EPZ004777 是一种有效的选择性 DOT1L 抑制剂,IC50 为 0.4 nM。

• CAS号：1338466-77-5
• 分子式：C₂₈H₄₁N₇O₄
• 分子量：539.670
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：740.7±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：401.7±32.9 °C

GSK2801

GSK2801是BAZ2A和BAZ2B高效选择性抑制剂,Kd值分别为136nM和257nM。

• CAS号：1619994-68-1
• 分子式：C₂₀H₂₁NO₄S
• 分子量：371.450
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PTG-0861

PTG-0861(JG-265)是一种新型高效、选择性HDAC6抑制剂,IC50为5.92 nM,选择性是其他HDACs的36倍以上。PTG-0861(JG-265)显示HDAC6细胞靶向结合,EC50为0.59μm(ELISA),体外和细胞选择性优于HDAC6选择性抑制剂西他林他汀(ACY-241)。PTG-0861(JG-265)对多种血癌细胞系(如MV4-11、MM1S)具有一定的抑制作用,同时对非恶性细胞和CD-1小鼠的细胞毒性有限。PTG-0861(JG-265)具有良好的体外药代动力学,在细胞和体内均具有良好的安全性。

• CAS号：2494082-34-5
• 分子式：C₁₅H₉F₅N₂O₃
• 分子量：360.24
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙戊酸钠

Valproic acid sodium salt是一种用于治疗癫痫,双相情感障碍和偏头痛的抗惊厥药。 Valproic acid抑制组蛋白脱乙酰基酶1 (HDAC1) 的 IC50 为 0.4 mM。

• CAS号：1069-66-5
• 分子式：C₈H₁₅NaO₂
• 分子量：166.193
• 类别：自噬

• 密度：1.0803 g/cm3
• 沸点：220ºC at 760 mmHg
• 熔点：300 °C
• 闪点：STABILITY

5-氯-2(1H)-吡啶酮 (2E)-(苯基-2-吡啶基亚甲基)腙

JIB-04 是 Jumonji 组蛋白去甲基酶 (Jumonji histone demethylase) 广谱抑制剂,能抑制 JARID1A,JMJD2E,JMJD3,JMJD2A,JMJD2B,JMJD2C 和 JMJD2D 的活性,其 IC50 值分别为 230,340,855,445,435,1100 和 290 nM。

• CAS号：199596-05-9
• 分子式：C₁₇H₁₃ClN₄
• 分子量：308.765
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：472.9±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：239.8±31.5 °C

CBP/p300-IN-19 hydrochloride

CBP/p300-IN-19盐酸盐是一种有效的选择性p300/CBP-HAT抑制剂,对于p300-HAT、CBP-HAT、PCAF和Myst3,IC50s分别为1.4、2.2、>100、>100µM。CBP/p300-IN-19盐酸盐具有抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2592638-14-5
• 分子式：C₃₀H₂₈ClN₃O₃
• 分子量：514.01
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-1

PROTAC BRD4 Degrader-1 是有效的 BRD4 degrader 降解剂,抑制 BRD4 BD1 的 IC50 为 41.8 nM。PROTAC BRD4 Degrader-1 可以有效降解 BRD4 蛋白并抑制 c-Myc 表达。

• CAS号：2133360-00-4
• 分子式：C₄₀H₃₇N₉O₈
• 分子量：771.78
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(3-(咪唑并[2,1-b]噻唑-6-基)苯基)-2-甲氧基苯甲酰胺

Sirtuin调制器2(化合物132)是一种ED50等于或小于50μM的Sirtuiin调制器[1]。

• CAS号：667910-69-2
• 分子式：C₁₉H₁₅N₃O₂S
• 分子量：349.41
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-苯基丁酸

Benzenebutyric acid 是一种组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 和内质网应激 (ER) 抑制剂,可用于癌症和感染等疾病的研究。

• CAS号：1821-12-1
• 分子式：C₁₀H₁₂O₂
• 分子量：164.201
• 类别：HDAC

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：290.7±9.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：49-52ºC
• 闪点：187.9±13.9 °C

N-[[[4-(乙酰氨基)苯基]氨基]硫代甲酰]-4-叔丁基苯甲酰胺

Tenovin-1 是 sirtuin 1 和 sirtuin 2 的抑制剂,同时可激活 p53,在癌症研究中可能具有潜在的治疗作用。

• CAS号：380315-80-0
• 分子式：C₂₀H₂₃N₃O₂S
• 分子量：369.480
• 类别：MDM-2/p53

• 密度：1.238±0.06 g/cm3 (20 ºC 760 Torr)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BAZ2-ICR

BAZ2-ICR 是一种有效的,选择性的,具有细胞活性和口服活性的 BAZ2A/B 溴结构域抑制剂,IC50 分别为 130 nM 和 180 nM,Kd 分别为 109 nM 和 170 nM。BAZ2-ICR 结合 BAZ2A/B 的选择性比 CECR2 高 10-15 倍,比其他溴结构域 高 100 倍以上。BAZ2-ICR 是一种表观遗传化学探针。

• CAS号：1665195-94-7
• 分子式：C₂₀H₁₉N₇
• 分子量：357.412
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：632.8±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：336.5±31.5 °C

Y06137

Y06137 是一种有效的选择性 BET 抑制剂,可与 BRD4(1) 溴结构域结合,Kd 值为 81 nM。具有抗肿瘤活性。

• CAS号：2226534-49-0
• 分子式：C₂₇H₃₂N₄O₂
• 分子量：444.57
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-去氮腺嘌呤A

3-Deazaneplanocin A hydrochloride 是一种有效的组蛋白甲基转移酶 (EZH2) 抑制剂。

• CAS号：120964-45-6
• 分子式：C₁₂H₁₅ClN₄O₃
• 分子量：298.725
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：168-169℃
• 闪点：N/A