表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

Ifidancitinib

Ifidancitinib是JAK激酶1/3的有效和选择性抑制剂。Ifidancitinib可用于过敏、哮喘和自身免疫性疾病的研究[1]。

• CAS号：1236667-40-5
• 分子式：C₂₀H₁₈FN₅O₃
• 分子量：395.39
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：1003.0±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：560.4±34.3 °C

HDAC6/HSP90-IN-1

HDAC6/HSP90-IN-1(化合物17)是HDAC6和HSP90的有效和选择性双重抑制剂,IC50值分别为4.3和46.8 nM。HDAC6/HSP90-IN-1下调INF-γ处理的H1975肺癌细胞PD-L1的表达。HDAC6/HSP90-IN-1抑制人类H1975异种移植小鼠的肿瘤生长[1]。

• CAS号：2411955-43-4
• 分子式：C₂₈H₃₇N₃O₆
• 分子量：511.61
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

6-O-Isobutyrylbritannilactone

6-O-异丁酰内酯是一种天然的黑素生成抑制剂。6-O-异丁酰不列颠内酯是一种倍半萜,可以从菊粉的花中分离出来。6-O-异丁酰不列颠内酯抑制B16F10细胞中IBMX(HY-12318)诱导的黑色素生成。6-O-异丁酰不列颠内酯还调节ERK、PI3K/AKT和CREB,在斑马鱼胚胎模型中显示出抗黑色素原活性[1]。

• CAS号：1259933-02-2
• 分子式：C₁₉H₂₈O₅
• 分子量：336.42
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

INCB054329外消旋

INCB054329 Racemate 是 BET 蛋白的抑制剂。

• CAS号：1628607-62-4
• 分子式：C₁₉H₁₆N₄O₃
• 分子量：348.36
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-IN-20

BET-IN-20 (compound 10) 是 BRD4 BD1 的抑制剂 (IC50=1.9 nM),具有抗癌活性。BET-IN-20 可促急性髓系白血病 (AML) 细胞凋亡,将细胞周期阻滞在 G0/G1 期。BET-IN-20 还抑制 c-Myc 和 CDK6,增强 PARP 裂解。

• CAS号：1300735-76-5
• 分子式：C₂₅H₂₄N₄O₂
• 分子量：412.48
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

盐酸巴多昔芬

Gandotinib (LY2784544) 是一种有效的 JAK2 抑制剂,IC50 为 3 nM。Gandotinib (LY2784544) 也抑制FLT3,FLT4,FGFR2,TYK2 和 TRKB,IC50 分别为 4,25,32,44 和 95 nM。

• CAS号：1229236-86-5
• 分子式：C₂₃H₂₅ClFN₇O
• 分子量：469.942
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-26

JAK-IN-26(化合物2)是一种口服活性JAK抑制剂,具有良好的药代动力学特性。JAK-IN-26抑制Jurkat细胞中IFN-α2B诱导的STAT3磷酸化(IC50=17.2 nM)[1]。

• CAS号：2417134-93-9
• 分子式：C₂₂H₂₄N₆O₃
• 分子量：420.46
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

罗米鲁曲

Lomeguatrib 是一种有效的 MGMT 抑制剂,在非细胞体系和 MCF-7 细胞体系中,IC50 值分别为 9 nM 和 ∼6 nM。

• CAS号：192441-08-0
• 分子式：C₁₀H₈BrN₅OS
• 分子量：326.172
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.9±0.1 g/cm3
• 沸点：683.8±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：367.3±34.3 °C

PF-06726304 acetate

PF-06726304 acetate 是一种有效的选择性 EZH2 抑制剂。PF-06726304 acetate 抑制野生型和 Y641N 突变型 EZH2,Ki 分别为 0.7 和 3.0 nM。PF-06726304 acetate 具有强效的抗肿瘤生长活性。

• CAS号：2080306-28-9
• 分子式：C₂₄H₂₅Cl₂N₃O₅
• 分子量：506.38
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

YF479

YF479是一种新型HDAC抑制剂,与羟肟酸(SAHA)相比,在体外和体内表现出更强的抗肿瘤活性。

• CAS号：1803281-22-2
• 分子式：C₂₂H₂₇BrN₂O₅
• 分子量：479.36
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4 Inhibitor-28

BRD4 Inhibitor-28 (Compound 18) 是一种口服活性的 BRD4 抑制剂。BRD4 Inhibitor-28 抑制 BRD40-BD1、BRD40-BD2,IC50 为 15、55 nM。 BRD4 Inhibitor-28 还抑制 BRD2-BD1、BRD3-BD1、BRDT-BD1,IC50 分别为 19、25、68 nM。BRD4 Inhibitor-28 具有抗黑色素瘤活性。

• CAS号：2468960-80-5
• 分子式：C₂₃H₂₁N₃O₃
• 分子量：387.43
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-Methyl-2-butenoic acid [8-hydroxymethyl-1,5-dimethyl-5-(4-methyl-3-pentenyl)-12-oxabicyclo[9.1.0]dodeca-3,7-dien-2-yl] ester

Vibsanin A是一种蛋白激酶C(PKC)激活剂,对人类癌细胞系具有抗增殖活性。Vibsanin A也是一种HSP90抑制剂[1]。

• CAS号：72506-14-0
• 分子式：C₂₅H₃₈O₄
• 分子量：402.57
• 类别：HSP

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：501.0±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：158.5±23.6 °C

AMPK activator 8

AMPK激活剂8(化合物2)是一种AMP活化蛋白激酶(AMPK)激活剂,其EC50s分别为11、27、4、2和4nm,用于rAMPKα1β1γ1、rAMPKβ2β1γl、rAMPKα1β2γ1、rAMPKα2β2γl、rAMPKα2β1β3。AMPK激活剂8可用于2型糖尿病的研究[1]。

• CAS号：1852451-96-7
• 分子式：C₂₅H₂₁ClN₂O₆
• 分子量：480.90
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

iBRD4-BD1

iBRD4-BD1是选择性BRD4溴域抑制剂。iBRD4-BD1对BRD4溴域具有抑制活性,IC50值为12nM。iBRD4-BD1可用于炎症和肿瘤研究[1]。

• CAS号：2839318-17-9
• 分子式：C₂₉H₃₀F₃N₅O
• 分子量：521.58
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-IN-16

BET-IN-16(Comp I)是一种BET抑制剂。BET-IN-16显示出抗癌活性。BET-IN-16抑制前列腺癌症细胞生长,对LNCaP和22Rv1细胞的IC50值分别为0.043和0.034μM[1]。

• CAS号：2089390-09-8
• 分子式：C₃₁H₂₅N₅O₃
• 分子量：515.56
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BIX01338 hydrate

BIX-01338 hydrate是组蛋白赖氨酸甲基转移酶 (histone lysine methyltransferase) 抑制剂。

• CAS号：1228184-65-3
• 分子式：C₃₂H₂₆F₃N₃O₇
• 分子量：621.56
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N1-甲基-N1-[[4-[4-(异丙氧基)苯基]-1H-吡咯-3-基]甲基]-1,2-乙二胺

MS023是一种有效的,有细胞活性的,选择性人I型PRMTs抑制剂,IC50为4-119 nM。

• CAS号：1831110-54-3
• 分子式：C₁₇H₂₅N₃O
• 分子量：287.400
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：437.8±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：218.6±28.7 °C

ISOX-DUAL

ISOX-DUAL是一种CBP/BRD4双重抑制剂,CBP和BRD4的IC50值分别为0.65μM和1.5μM[1]。

• CAS号：1962928-22-8
• 分子式：C₃₁H₄₁N₅O₃
• 分子量：531.69
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：707.6±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：381.7±32.9 °C

CEM114

CEM114 是一种有效的化学表观遗传修饰剂 (CEM),可通过 CRISPR-Cas9 系统募集内源性染色质机制。

• CAS号：2279062-54-1
• 分子式：C₈₄H₁₂₂FN₉O₁₉S
• 分子量：1612.98
• 类别：CRISPR/Cas9

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MRK-740

MRK-740 是一种有效的,选择性的,与底物竞争的 PRDM9 组蛋白甲基转移酶抑制剂,IC50 为 80 nM。MRK-740 对 PRDM9 的选择性高于其他组蛋白甲基转移酶和其他非表观遗传靶标。MRK-740 减少 PRDM9 依赖性的 H3K4 三甲基化 (IC50 为 0.8 µM)。

• CAS号：2387510-80-5
• 分子式：C₂₅H₃₂N₆O₃
• 分子量：464.56
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mefuparib hydrochloride

Mefuparib盐酸盐是一种有效的,高选择性的竞争性PARP1/2抑制剂,IC50分别为3.2/1.9 nM；比其他主要核PARP(包括PARP3,TNKS1,TNKS2和PARP6)显示>406倍；减少聚(ADP-核糖)形成,增强γH2AX水平,在同源重组修复(HR)缺陷细胞中诱导G2/M停滞和随后的细胞凋亡；显示出对HR缺陷癌细胞的有效体外和体内增殖和生长抑制以及HR-熟练异种移植物对抗癌药物替莫唑胺的协同致敏作用。

• CAS号：1449746-00-2
• 分子式：C₁₇H₁₆ClFN₂O₂
• 分子量：334.775
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

IMM-H007

IMM-H007是一种有效的TGFβ1(转化生长因子β1)拮抗剂。IMM-H007通过激活AMPK(AMP活化蛋白激酶)对心血管疾病具有保护作用。IMM-H007通过失活NF-κB和JNK/AP1信号负性调节内皮炎症。IMM-H007抑制ABCA1降解。IMM-H007通过调节脂质代谢解决HFD喂养仓鼠的肝脂肪变性。IMM-H007可用于非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和炎性动脉粥样硬化的研究[1][2][3]。

• CAS号：1221412-23-2
• 分子式：C₂₂H₂₃N₅O₈
• 分子量：485.45
• 类别：AMPK

• 密度：1.54±0.1 g/cm3
• 沸点：684.6±65.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JNJ-64619178

JNJ-64619178 是一种伪不可逆的,选择性 PRMT5 抑制剂。

• CAS号：2086772-26-9
• 分子式：C₂₂H₂₃BrN₆O₂
• 分子量：483.36
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC4-IN-1

HDAC4-IN-1 (compound 1a) 是 IIa 类 HDACI 抑制剂 (IC50=0.077 μM)。HDAC4-IN-1 可以增强 caspase 诱导的细胞凋亡 (Apoptosis). HDAC4-IN-1 具有抗癌活性。HDAC4-IN-1 能够用于药物联合抗癌的研究。

• CAS号：1418293-39-6
• 分子式：C₁₆H₁₉F₃N₄O₂
• 分子量：356.34
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LLY-507

LLY-507是有效和选择性的蛋白-赖氨酸甲基转移酶 SMYD2 抑制剂,IC50 为15 nM。

• CAS号：1793053-37-8
• 分子式：C₃₆H₄₂N₆O
• 分子量：574.758
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：790.4±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：431.8±35.7 °C

CMP-5

CMP-5(PRMT5-IN-5)是一种一流的小分子PRMT5特异性抑制剂,可阻断EBV驱动的B淋巴细胞转化和存活,对正常B细胞无影响；对其他I型无活性(PRMT1和PRMT4)和II型(PRMT7)酶；PRMT5的抑制导致miR96启动子上PRMT5/p65/HDAC3抑制复合物的募集丧失,miR96表达恢复和PRMT5下调。

• CAS号：880813-42-3
• 分子式：C₂₁H₂₁N₃
• 分子量：315.411
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：505.1±48.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：259.3±29.6 °C

PF-CBP1

PF-CBP1是CREB结合蛋白溴多糖的高选择性抑制剂[1]。

• CAS号：1962928-21-7
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃
• 分子量：488.621
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：673.5±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：361.1±31.5 °C

GSK2879552 dihydrochloride

GSK2879552 dihydrochloride是一种可口服的,不可逆的 LSD1/ KDM1A 抑制剂,具有抗肿瘤活性。

• CAS号：1902123-72-1
• 分子式：C₂₃H₃₀Cl₂N₂O₂
• 分子量：437.40
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EZH2-IN-4

EZH2-IN-4是一种口服活性、有效的EZH2抑制剂,其IC50分别为0.923 nM和2.65 nM,可对抗野生型(WT)5-成员(5-聚体)EZH2和突变型5-聚体EZH2。EZH2-IN-4具有抗癌活性[1]。

• CAS号：2088132-99-2
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BAY-598

BAY-598 是 SMYD2 的一个选择性小分子抑制剂。

• CAS号：1906919-67-2
• 分子式：C₂₂H₂₀Cl₂F₂N₆O₃
• 分子量：525.34
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A