表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

6-O-Isobutyrylbritannilactone

6-O-异丁酰内酯是一种天然的黑素生成抑制剂。6-O-异丁酰不列颠内酯是一种倍半萜,可以从菊粉的花中分离出来。6-O-异丁酰不列颠内酯抑制B16F10细胞中IBMX(HY-12318)诱导的黑色素生成。6-O-异丁酰不列颠内酯还调节ERK、PI3K/AKT和CREB,在斑马鱼胚胎模型中显示出抗黑色素原活性[1]。

• CAS号：1259933-02-2
• 分子式：C₁₉H₂₈O₅
• 分子量：336.42
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

INCB054329外消旋

INCB054329 Racemate 是 BET 蛋白的抑制剂。

• CAS号：1628607-62-4
• 分子式：C₁₉H₁₆N₄O₃
• 分子量：348.36
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GW779439X

GW779439X是一种在S。奥里斯面食激酶Stk1。GW779439X增强了β-内酰胺类抗生素对各种MRSA和MSSA菌株的活性,有些甚至跨越了从耐药到敏感的断点。GW779439X是一种AURKA抑制剂,通过半胱天冬酶3/7途径诱导细胞凋亡[1][2]。耐甲氧西林葡萄球菌。奥里斯；MSSA：对甲氧西林敏感的S。奥里斯

• CAS号：551919-98-3
• 分子式：C₂₂H₂₁F₃N₈
• 分子量：454.451
• 类别：细菌

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fedratinib hydrochloride hydrate

Fedratinib hydrochloride hydrate (TG-101348 hydrochloride hydrate) 是一种有效的,选择性的,ATP 竞争性和具有口服活性的 JAK2 抑制剂,对于 JAK2 和 JAK2V617F 激酶的 IC50 均为 3 nM。Fedratinib hydrochloride hydrate 对 JAK2 的选择性分别比 JAK1 和 JAK3 高 35 倍和 334 倍。Fedratinib hydrochloride hydrate 可诱导癌细胞凋亡 (apoptosis),并可用于骨髓增生性疾病的研究。

• CAS号：1374744-69-0
• 分子式：C₂₇H₄₀Cl₂N₆O₄S
• 分子量：615.615
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HJB97

HJB97 是一种高亲和力 BET 抑制剂,Ki 值分别为 0.9±0.2 nM (BRD2 BD1),0.27±0.09 nM (BRD2 BD2),0.18±0.01 nM (BRD3 BD1),0.21±0.03 nM (BRD3 BD2),0.5±0.2 nM (BRD4 BD1),1.0±0.1 nM (BRD4 BD2)。HJB97 是一种 PROTAC BET 降解剂。具有抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2093391-24-1
• 分子式：C₂₆H₂₈N₈O₃
• 分子量：500.55
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-IN-20

BET-IN-20 (compound 10) 是 BRD4 BD1 的抑制剂 (IC50=1.9 nM),具有抗癌活性。BET-IN-20 可促急性髓系白血病 (AML) 细胞凋亡,将细胞周期阻滞在 G0/G1 期。BET-IN-20 还抑制 c-Myc 和 CDK6,增强 PARP 裂解。

• CAS号：1300735-76-5
• 分子式：C₂₅H₂₄N₄O₂
• 分子量：412.48
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

盐酸巴多昔芬

Gandotinib (LY2784544) 是一种有效的 JAK2 抑制剂,IC50 为 3 nM。Gandotinib (LY2784544) 也抑制FLT3,FLT4,FGFR2,TYK2 和 TRKB,IC50 分别为 4,25,32,44 和 95 nM。

• CAS号：1229236-86-5
• 分子式：C₂₃H₂₅ClFN₇O
• 分子量：469.942
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-26

JAK-IN-26(化合物2)是一种口服活性JAK抑制剂,具有良好的药代动力学特性。JAK-IN-26抑制Jurkat细胞中IFN-α2B诱导的STAT3磷酸化(IC50=17.2 nM)[1]。

• CAS号：2417134-93-9
• 分子式：C₂₂H₂₄N₆O₃
• 分子量：420.46
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(1,1-二甲基乙基)-3-[[5-甲基-2-[[3-(4-吗啉基甲基)苯基]氨基]-4-嘧啶基]氨基]苯磺酰胺

JAK-IN-32 (XC) 是一种 JAK 激酶的双芳基间嘧啶抑制剂。

• CAS号：936091-56-4
• 分子式：C₂₆H₃₄N₆O₃S
• 分子量：510.65
• 类别：JAK

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：686.9±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：369.3±34.3 °C

ZEN-2759

ZEN-2759是BRD4(BD1)抑制剂。

• CAS号：1616400-50-0
• 分子式：C₁₇H₁₆N₂O₂
• 分子量：280.327
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-J4

GSK-J4是一种有效的H3K27me3组蛋白赖氨酸脱甲基酶 (KDM) 抑制剂,抑制 KDM6B和KDM6A的 IC50 分别为8.6 μM 和 6.6 μM。

• CAS号：1373423-53-0
• 分子式：C₂₄H₂₇N₅O₂
• 分子量：417.504
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：581.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：305.3±30.1 °C

LP99

LP99是第一种有效的选择性BRD7/9溴结构域抑制剂,BRD9的Kd为99 nM；以剂量依赖性方式抑制THP-1细胞分泌IL-6；降低H3.3中BRD7和BRD9的BRET和H4系统以剂量依赖性方式,两种组蛋白的细胞IC50值均在低微摩尔范围内。

• CAS号：1808951-93-0
• 分子式：C₂₆H₃₀ClN₃O₄S
• 分子量：516.052
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：726.6±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：393.2±35.7 °C

N-辛酰基-D-神经鞘氨醇

C8-Ceramide (N-Octanoyl-D-erythro-sphingosine) 是一种细胞渗透性的内源性神经酰胺类似物。C8-Ceramide 具有具有抗增殖特性,能作为化疗试剂。C8-Ceramide 能刺激树突状细胞促进 T 细胞对病毒感染的反应。C8-Ceramide 在体外能轻微地诱导 PKC 活化。

• CAS号：74713-59-0
• 分子式：C₂₆H₅₁NO₃
• 分子量：425.688
• 类别：细胞凋亡

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：595.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：68-70°C
• 闪点：313.9±30.1 °C

SIRT1激活剂3

SIRT1激活剂3是一种有效的SIRT1激活剂,以剂量依赖性方式抑制TNF-α。SIRT1激活剂3具有抗肥胖或抗糖尿病研究的潜力[1]。

• CAS号：839699-72-8
• 分子式：C₂₀H₂₅N₅O₂
• 分子量：367.445
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：651.4±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：347.7±31.5 °C

罗米鲁曲

Lomeguatrib 是一种有效的 MGMT 抑制剂,在非细胞体系和 MCF-7 细胞体系中,IC50 值分别为 9 nM 和 ∼6 nM。

• CAS号：192441-08-0
• 分子式：C₁₀H₈BrN₅OS
• 分子量：326.172
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.9±0.1 g/cm3
• 沸点：683.8±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：367.3±34.3 °C

CFT8634

CFT8634是从专利WO2021178920A1化合物173中提取的针对BRD9的降解剂。CFT8634可用于滑膜肉瘤和SMARCB1缺失实体瘤的研究[1]。

• CAS号：2704617-95-6
• 分子式：C₃₇H₄₅F₃N₆O₅
• 分子量：710.79
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP1-IN-6

PARP1-IN-6是一种双管蛋白/PARP-1抑制剂,IC50值分别为0.94和0.48μM。

• CAS号：1654735-36-0
• 分子式：C₁₆H₁₁FN₂O
• 分子量：266.27
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-06726304 acetate

PF-06726304 acetate 是一种有效的选择性 EZH2 抑制剂。PF-06726304 acetate 抑制野生型和 Y641N 突变型 EZH2,Ki 分别为 0.7 和 3.0 nM。PF-06726304 acetate 具有强效的抗肿瘤生长活性。

• CAS号：2080306-28-9
• 分子式：C₂₄H₂₅Cl₂N₃O₅
• 分子量：506.38
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CMP-5 hydrochloride

CMP-5(PRMT5-IN-5)是一种一流的小分子PRMT5特异性抑制剂,可阻断EBV驱动的B淋巴细胞转化和存活,对正常B细胞无影响；对其他I型无活性(PRMT1和PRMT4)和II型(PRMT7)酶；PRMT5的抑制导致miR96启动子上PRMT5/p65/HDAC3抑制复合物的募集丧失,miR96表达恢复和PRMT5下调。

• CAS号：1030021-40-9
• 分子式：C₂₁H₂₂ClN₃
• 分子量：351.872
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tinengotinib

Tinengotinib是一种或多种蛋白激酶的调节剂,如Aurora激酶和VEGFR激酶。Tinengotinib有潜力研究这些激酶异常介导的疾病,尤其是癌症相关疾病(摘自专利WO2018108079A1)[1]。

• CAS号：2230490-29-4
• 分子式：C₂₀H₁₉ClN₆O
• 分子量：394.86
• 类别：极光激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TYK2 JH2-IN-1-d3

TYK2？JH2-IN-1-d3是一种氘化的、口服活性和选择性TYK2抑制剂(化合物4h),靶向JH2结构域(IC50=0.1nM)[1]。

• CAS号：2376999-19-6
• 分子式：C₂₄H₂₁D₃FN₉O₃
• 分子量：508.52
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-5

HDAC6-IN-5(化合物11b)是一种有效的BBB穿透HDAC6抑制剂,IC50为0.025μM。HDAC6-IN-5对aβ1-42自聚集和乙酰胆碱酯酶具有较强的抑制活性,IC50值分别为3.0和0.72μM。HDAC6-IN-5可促进神经轴突生长,而无明显神经毒性【1】。

• CAS号：2413603-15-1
• 分子式：C₂₀H₁₄BrN₃O₂
• 分子量：408.25
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VTP50469

VTP50469 是一种有效的,高选择性和口服活性的 Menin-MLL 相互作用抑制剂,Ki 为 104 pM。VTP50469 具有高效的抗白血病活性。

• CAS号：2169916-18-9
• 分子式：C₃₂H₄₇FN₆O₄S
• 分子量：630.82
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

YF479

YF479是一种新型HDAC抑制剂,与羟肟酸(SAHA)相比,在体外和体内表现出更强的抗肿瘤活性。

• CAS号：1803281-22-2
• 分子式：C₂₂H₂₇BrN₂O₅
• 分子量：479.36
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

酪氨酸激酶抑制剂

前列腺素是一种天然萜类化合物,是PKC激活剂,Ki为12.5nM,对HIV-1有抑制作用。

• CAS号：60857-08-1
• 分子式：C₂₂H₃₀O₆
• 分子量：390.470
• 类别：HIV

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：550.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：216-219℃
• 闪点：188.7±23.6 °C

DCH36_06

DCH36_06是一种有效的选择性p300/CBP抑制剂,p300和CBP的IC50分别为0.6μM和3.2μM。DCH36_06介导的p300/CBP抑制导致白血病细胞中H3K18的低乙酰化。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：593273-05-3
• 分子式：C₁₈H₁₃ClN₂O₃S
• 分子量：372.83
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4H,-5H-噻吩并[2,3-c]异喹啉-5-酮

TIQ-A是一种有效的TNKS(聚ART,PARP)抑制剂,TNKS2的IC50为24 nM。TIQ-A是一种潜在的抗缺血剂[1]。

• CAS号：420849-22-5
• 分子式：C₁₁H₇NOS
• 分子量：201.244
• 类别：PARP

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：282.2±9.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：124.5±18.7 °C

SDR-04

SDR-04是一种BET抑制剂,具有很强的BRD4-BD1亲和力和抑制活性。SDR-04能有效抑制MV4；11癌细胞系增殖[1]。

• CAS号：879593-54-1
• 分子式：C₁₉H₁₆N₄O₂
• 分子量：332.36
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

烟酰胺核糖

Nicotinamide riboside 是烟酰胺核苷 (Nicotinamide riboside) 氯化物的晶体形式。Nicotinamide riboside 增加 NAD[+] 水平并激活 SIRT1 和 SIRT3,最终增强氧化代谢并防止高脂肪饮食诱导的代谢异常。Nicotinamide riboside 用于膳食补充剂。

• CAS号：1341-23-7
• 分子式：C₁₁H₁₅N₂O₅
• 分子量：255.247
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.201g/cm3
• 沸点：353.7ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：181.9ºC

BRD4 Inhibitor-28

BRD4 Inhibitor-28 (Compound 18) 是一种口服活性的 BRD4 抑制剂。BRD4 Inhibitor-28 抑制 BRD40-BD1、BRD40-BD2,IC50 为 15、55 nM。 BRD4 Inhibitor-28 还抑制 BRD2-BD1、BRD3-BD1、BRDT-BD1,IC50 分别为 19、25、68 nM。BRD4 Inhibitor-28 具有抗黑色素瘤活性。

• CAS号：2468960-80-5
• 分子式：C₂₃H₂₁N₃O₃
• 分子量：387.43
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A