表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

GSK217

GSK217(GSK-217)是一种高效、高选择性的BET BD2抑制剂,pIC50为7.5(BRD4 BD2),选择性是BRD4 BD1的300倍。

• CAS号：2748687-92-3
• 分子式：C₂₀H₂₀N₆O
• 分子量：360.421
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

麦冬皂苷D'

Ophiopogonin D' 是从麦冬 (Ophiopogon japonicus) 的块茎中分离的,是一种罕见的天然存在的 C29 甾体糖苷。Ophiopogonin D' 针对两种人肿瘤细胞系 MG-63 和 SNU387 的有细胞毒活性,IC50 分别为 3.09 μM 和 3.63 μM。Ophiopogonin D' 以剂量依赖方式激活 SIRT1。

• CAS号：65604-80-0
• 分子式：C₄₄H₇₀O₁₆
• 分子量：855.017
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成 (参考文献中的化合物 DL7-TL)。

• CAS号：1950635-15-0
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₆
• 分子量：458.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

O-Desmethyl Midostaurin

O-Desmethyl Midostaurin (CGP62221; O-Desmethyl PKC412) 是 Midostaurin (HY-10230) 的活性代谢物,通过细胞色素 P450 肝酶代谢产生,可以作为 Midostaurin 在体内代谢的指标之一。Midostaurin 是一种多靶点蛋白激酶 (kinase) 抑制剂,IC50 范围为 22-500 nM。

• CAS号：740816-86-8
• 分子式：C₃₄H₂₈N₄O₄
• 分子量：556.61
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD9 Degrader-6

PROTAC BRD9降解剂-6是BRD9的强效降解剂(IC50=0.13 nM),可用于BAF复合物相关疾病的研究[1]。

• CAS号：2676211-62-2
• 分子式：C₄₇H₅₆N₈O₆
• 分子量：829.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JPS035

JPS035是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS035降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS035是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

• CAS号：2669785-84-4
• 分子式：C₄₉H₆₅N₇O₇S
• 分子量：896.15
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-246

BETd-246 是第二代 BET溴端结构域 (BRD) 的抑制剂,具有良好的选择性、有效性和抗肿瘤活性。

• CAS号：2140289-17-2
• 分子式：C₄₈H₅₅N₁₁O₁₀
• 分子量：946.02
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Prmt5-in-c17

PRMT5-IN-C17是一种新的强效、选择性和细胞活性蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)抑制剂。

• CAS号：330951-01-4
• 分子式：C₁₈H₁₇N₃O₄S
• 分子量：371.411
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HuR inhibitor KH-3

HuR抑制剂KH-3是一种小分子、选择性的HuR功能抑制剂,在FP和AlphaLISA分析中Ki分别为0.83和0.72μm。KH-3在体内外均能有效抑制乳腺癌细胞的生长。在体外实验转移模型中,KH-3抑制乳腺癌细胞侵袭,延迟肺集落的形成,提高小鼠存活率。KH-3通过破坏HuR-FOXQ1 mRNA相互作用抑制乳腺癌细胞侵袭。在横向主动脉收缩模型中,用KH-3抑制HuR可显著减少病理性心肌肥厚的进展。

• CAS号：1215115-03-9
• 分子式：C₂₁H₂₂N₂O₄S₂
• 分子量：430.537
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JNJ-9350

JNJ-9350是精胺氧化酶(SMOX)的抑制剂,IC50值为0.01μM。JNJ-9350还抑制多胺氧化酶(PAO),IC50值为0.79μM。JNJ-9350可用于癌症研究[1]。

• CAS号：326923-09-5
• 分子式：C₂₅H₂₂N₆O
• 分子量：422.48
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Antitumor agent-101

抗肿瘤剂-101是赖氨酸甲基转移酶G9a/GLP的选择性共价抑制剂,G9a和GLP的IC50分别为8.5nM和5.5nM。抗肿瘤剂-101在PANC-1异种移植物模型中显示出抗肿瘤功效[1]。

• CAS号：2848632-52-8
• 分子式：C₂₆H₃₈N₆O₃
• 分子量：482.62
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GEA-69

GeA-69 是一种选择性的,高细胞渗透性的 PARP14 变构抑制剂,靶向作用于其 macrodomain 2 (MD2),Kd 值为 2.1 µM。

• CAS号：2143475-98-1
• 分子式：C₂₀H₁₆N₂O
• 分子量：300.35
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

地西他滨

Decitabine (NSC 127716) 是一种DNA甲基转移酶抑制剂,通常用于治疗骨髓增生异常综合征(MDS) 和急性髓性白血病 (AML)。

• CAS号：2353-33-5
• 分子式：C₈H₁₂N₄O₄
• 分子量：228.205
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.9±0.1 g/cm3
• 沸点：485.8±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：~200 °C (dec.)
• 闪点：247.6±31.5 °C

PRMT5-IN-10

PRMT5-IN-10对蛋白甲基转移酶PRMT5:MEP50复合物具有良好的结构依赖性抑制作用。

• CAS号：2567564-23-0
• 分子式：C₁₃H₁₇N₅O₄
• 分子量：307.31
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(2S,3R)-LP99

(2S,3R)-LP99是一种有效和选择性的BRD7和BRD9抑制剂,BRD9的KD为99 nM。(2S,3R)-LP99在体外和细胞中抑制BRD7和BRD9与乙酰化组蛋白的结合。(2S,3R)-LP99表明BRD7/9在调节促炎细胞因子分泌中发挥作用[1]。

• CAS号：1808948-28-8
• 分子式：C₂₆H₃₀ClN₃O₄S
• 分子量：516.05
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-28

HDAC-IN-28是一种新型的HDAC抑制剂,具有抗肿瘤生长和转移的有效活性

• CAS号：1621154-88-8
• 分子式：C₂₃H₂₆N₄O₄S
• 分子量：454.54
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CARM1-IN-1

CARM1-IN-1是CARM1高效选择性抑制剂,IC50值为8.6uM,对PRMT1和SET7抑制活性很抵。

• CAS号：1020399-49-8
• 分子式：C₂₆H₂₁Br₂NO₃
• 分子量：555.25800
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thiomyristoyl

Thiomyristoyl是高效特异性的SIRT2抑制剂,IC50值为28 nM。

• CAS号：1429749-41-6
• 分子式：C₃₄H₅₁N₃O₃S
• 分子量：581.8612
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Patritumab

Patritumab(人抗EBB3重组抗体)是一种抗ERBB3的中和单克隆抗体。Patritumab显示出与西妥昔单抗(HY-P9905)的协同作用,有效抑制EGFR、HER2、HER3、ERK和Akt的磷酸化。Patritumab还诱导细胞凋亡,并抑制胰腺癌、非小细胞肺癌和结直肠癌异种移植瘤的生长[1]。

• CAS号：1262787-83-6
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：存活

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CD161

CD161 是一种有效且口服生物可利用的溴结构域和末端 (BET) 溴结构域抑制剂,对 BRD4 BD1 的 IC50 值 为 28.2 nM,Ki 值为 8.2 nM。CD161 是在大多数自然杀伤 (NK) 细胞上表达的 C 型凝集素样受体。CD161 对含有溴结构域的 24 种非 BET 蛋白具有高选择性。

• CAS号：1627716-22-6
• 分子式：C₂₆H₂₁N₅O₂
• 分子量：435.48
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EZH2 Degrader-1

PROTAC EZH2降解剂-1(化合物150d)是一种有效的PROTAC AZH2分解剂,其IC50为2.7nM,对EZH2甲基转移酶活性具有抑制作用。EZH2在许多肿瘤的发生和发展过程中起着重要作用[1]。

• CAS号：2641601-67-2
• 分子式：C₅₄H₆₇N₇O₈
• 分子量：942.15
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

色酚AS-E磷酸盐

KG-501 是 CREB 的抑制剂,其 IC50 值为 6.89 μM。

• CAS号：18228-17-6
• 分子式：C₁₇H₁₃ClNO₅P
• 分子量：377.71600
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.567g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CG347B

CG347B 是一种选择性的 HDAC6 抑制剂。

• CAS号：1598426-03-9
• 分子式：C₁₆H₁₇N₃O₂
• 分子量：283.325
• 类别：HDAC

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：457.2±47.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：230.3±29.3 °C

MOCPAC

MOCPAC是HDAC1特异性底物[1]。

• CAS号：787549-26-2
• 分子式：C₂₇H₃₁N₃O₆
• 分子量：493.55
• 类别：HDAC

• 密度：1.246g/cm3
• 沸点：804.4ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP7-probe-1

PARP7-probe-1是化学发光标记的PARP7探针。PARP7-probe-1是与PARP7活性位点结合的生物素化探针。PARP7-probe-1可用于PARP7功能的研究[1]。

• CAS号：2379390-76-6
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK591

EPZ015866是有效,选择性的蛋白质甲基转移酶5 (PRMT5) 抑制剂,IC50 为22 nM。

• CAS号：1616391-87-7
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₂
• 分子量：380.483
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：648.4±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：345.9±31.5 °C

MC2590

MC2590是一种有效的含吡啶的组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂。MC2590是HDAC1-3、−6、−8和−10的抑制剂(I/IIb类选择性抑制剂),ic50分别为0.098μM、0.156μM、0.039μM、0.015μM、0.047μM和0.071μM。MC2590还抑制HDAC亚型HDAC4(IC50=2.73μM)、HDAC5(IC50=1.35μM),HDAC7(IC50=20.06μM)和HDAC9(IC50+2.79μM)以及HDAC11(IC50=3.98μM)。MC2625诱导G2/M细胞周期阻滞,并调节促凋亡和抗凋亡微RNA以诱导凋亡[1]。

• CAS号：2284460-01-9
• 分子式：C₂₀H₁₇N₃O₃
• 分子量：347.37
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二甲双胍

Metformin (1,1-Dimethylbiguanide) 抑制肝脏中的线粒体呼吸链,导致 AMPK 活化,增强胰岛素敏感性,可用于 2 型糖尿病的研究。Metformin 可以透过血脑屏障,诱导自噬 (autophagy)。

• CAS号：657-24-9
• 分子式：C₄H₁₁N₅
• 分子量：129.164
• 类别：自噬

• 密度：1.0743
• 沸点：229.23°C
• 熔点：199-200 °C
• 闪点：58.1±22.6 °C

TP-472

TP-472是一种新型BRD9/7化学探针,具有优异的效力(BRD9 KD=33nM；ITC BRD7 KD=340nM),选择性比除BRD7外的所有其他溴结构域家族成员高30倍,具有细胞活性(BRD9纳米BRET测定中EC50 320 nM)；具有良好的PK特征,适用于体内应用。

• CAS号：2079895-62-6
• 分子式：C₂₀H₁₉N₃O₂
• 分子量：333.384
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

FKBP12 PROTAC dTAG-7

FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 是一种双功能降解剂。FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 既是一种 FKBP12F36V 的降解剂,又是一种选择性的 BET BRD4 降解剂,FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 通过将 BET 溴结构域桥接至 E3 泛素连接酶 (cereblon; CRBN) 而形成降解剂。

• CAS号：2064175-32-0
• 分子式：C₆₃H₇₉N₅O₁₉
• 分子量：1210.32
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A