表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

CSV0C018875

CSV0C018875是一种基于喹啉的EHMT2/G9a抑制剂。CSV0C018875的细胞毒性低于BIX-01294[1]。

• CAS号：442150-41-6
• 分子式：C₁₈H₁₇ClN₂O
• 分子量：312.79
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Menin-MLL inhibitor 24

美宁MLL抑制剂24(化合物A)是一种美宁混合谱系白血病1(美宁MLI)抑制剂。Menin-MLL抑制剂24可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2654081-35-1
• 分子式：C₃₂H₅₀FN₇O₃
• 分子量：599.78
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

pociredir

Pociredir(FTX-6058)是一种有效、选择性和口服活性的胚胎外胚层发育(EED)小分子抑制剂,KD值为0.163 nM。Pociredir(FTX-6058)可用于研究炎症或血红蛋白病,如镰状细胞病[1][2]。

• CAS号：2490674-02-5
• 分子式：C₂₂H₁₈FN₅O₂
• 分子量：403.41
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-氯-2,3-双(4-甲氧苯基)丙烯醛(Windorphen)

Windorphen 是一种 Wnt/β-catenin 信号抑制剂,专门针对 β-catenin-1 但不针对 β-catenin-2 的 C 端反式激活结构域的功能。Windorphen 选择性地靶向 p300,破坏哺乳动物 β-catenin 与 p300 的关联,但不破坏 CBP。

• CAS号：19881-70-0
• 分子式：C₁₇H₁₅ClO₃
• 分子量：302.75
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：1.198g/cm3
• 沸点：468.1ºC at 760mmHg
• 熔点：160-163ºC
• 闪点：184.7ºC

PS-432

PS-432是PKC1和PKCζ的变构抑制剂,IC50分别为16.9和18.5 uM；对PKCα,PKCβ,PKCδ和PKCθ没有抑制活性,也没有相关激酶如PDK1,PKB/Akt,RSK1,MSK1和Aurora A的活性；抑制肺癌细胞系A549(IC50=14.8±4.2 uM)和A427(IC50=10.4±0.3 uM)以及雄激素非依赖性前列腺癌细胞系DU145(IC50=20.8±9.0 uM)的增殖；体内耐受良好。

• CAS号：2083630-26-4
• 分子式：C₂₅H₁₉ClN₂O₅S
• 分子量：494.947
• 类别：PKC

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：662.5±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：354.5±34.3 °C

ZEN-3862

ZEN-3862 是一种 BET 抑制剂,抑制 BRD4(BD1) 和 BRD4(BD2) 的 IC50 分别为 0.16 和 0.13 μM。ZEN-3862 可用于形成 PROTAC 分子,从而诱导 BRD4 降解。

• CAS号：1952264-33-3
• 分子式：C₁₉H₁₇FN₂O₃
• 分子量：340.35
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CRA-026440 hydrochloride

CRA-026440盐酸盐是一种有效的广谱HDAC(HDAC)抑制剂。针对重组HDAC同工酶HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC6、HDAC8和HDAC10的Ki值分别为4nM、14nM、11nM、15nM、7nM和20nM。CRA-026440盐酸盐显示出抗肿瘤和抗血管生成活性[1]。

• CAS号：847459-98-7
• 分子式：C₂₃H₂₅ClN₄O₄
• 分子量：456.92
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

WM-662

WM-662是WDR5-MYC相互作用抑制剂,IC50为18μM。WM-662具有研究癌症、衰老和神经退行性疾病的潜力[1]。

• CAS号：1308257-47-7
• 分子式：C₁₉H₁₈ClN₅O₄
• 分子量：415.83
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

乙基 3-氨基-4-(4-苄基-1-哌嗪基)苯酸酯

DCLX069是一种选择性蛋白精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)抑制剂,IC50值为17.9µM。DCLX069对PRMT4和PRMT6的活性较低。DCLX069具有抗癌作用[1]。

• CAS号：792946-69-1
• 分子式：C₂₀H₂₅N₃O₂
• 分子量：339.431
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：515.9±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：265.8±30.1 °C

Thi-DPPY

Thi-DPPY(化合物8e)是一种有效的口服活性JAK3抑制剂,对BTK和JAK的IC50值分别为62.4和1.38 nM。Thi-DPPY对HBE细胞具有抗增殖活性。Thi-DPPY在体内具有抗炎活性。Thi-DPPY具有研究特发性肺纤维化的潜力[1]。

• CAS号：2307699-34-7
• 分子式：C₂₈H₂₈ClN₅O₄S
• 分子量：566.07
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Y08284

Y08284是一种高效、选择性、口服活性CBP溴代烷抑制剂,IC50为4.21 nM。Y08284抑制前列腺癌细胞系LNCaP、C4-2B和22Rv1的增殖。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：2688745-47-1
• 分子式：C₂₆H₂₅FN₄O₄
• 分子量：476.50
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotinylated-JQ1

生物素化JQ1(Biotin-JQ1)是JQ1的一种生物素化衍生物,对BRD4的溴代烷具有高度亲和力。生物素化JQ1抑制MM1。EC50为0.4μM的S多发性骨髓瘤细胞增殖[1]。

• CAS号：1635437-52-3
• 分子式：C₃₉H₅₃ClN₈O₆S₂
• 分子量：829.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-59

HDAC-IN-59 (compound 13a) 是一种有效的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制剂。HDAC-IN-59 可以促进细胞内 ROS 的产生,引起 DNA 损伤,阻断细胞周期 G2/M 期,并激活线粒体相关的凋亡途径诱导细胞凋亡。

• CAS号：2944459-43-0
• 分子式：C₂₀H₂₅NO₇
• 分子量：391.42
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK1/TYK2-IN-1

JAK1/TYK2-IN-1是TYK2和JAK1的双重抑制剂(IC50分别为29和41 nM)。

• CAS号：1883300-48-8
• 分子式：C₁₈H₂₀F₃N₇O
• 分子量：407.39
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EZH2-IN-9

EZH2-IN-9是EZH2的有效抑制剂。EZH2在SET区域的过度表达或突变(Y641F、Y641N、A687V、A677G点突变)都会导致H3K27me3异常升高,并促进多种肿瘤的生长和发展,如乳腺癌、前列腺癌、白血病等。EZH2-in-9具有研究癌症疾病的潜力(摘自专利WO2021180235A1,化合物17)[1]。

• CAS号：2700897-24-9
• 分子式：C₂₈H₃₂ClF₂N₃O₅S
• 分子量：596.09
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP1-IN-10

PARP1-IN-10(化合物12c)是一种无细胞毒性且有效的PARP1抑制剂,体外IC50值为50.62 nM。PARP1-IN-10导致细胞周期停滞在G2/M期和凋亡,并增强替莫唑胺(TMZ)的细胞毒性[1]。

• CAS号：2494001-21-5
• 分子式：C₂₀H₂₃N₃O₅
• 分子量：385.41
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AZ506

AZ506是一种有效的SMYD2抑制剂,IC50为17 nM。AZ506抑制细胞中SMYD2甲基转移酶活性,导致SMYD2介导的甲基化信号减少。

• CAS号：2043321-54-4
• 分子式：C₃₃H₄₀N₆O
• 分子量：536.71
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PS315

PS315 是 PS48 (HY-15967) 的衍生物,是一种变构性 PKC 抑制剂,可以与 aPKC 的 PIF 口袋结合并诱导活性位点残基 Lys111 置换。PS315 抑制 PKCζ (IC50=10 μM) 和 PKCη (IC50=30 μM) 的全长和催化结构域构建体。PS315 具有抗癌活性。

• CAS号：1221964-50-6
• 分子式：C₂₃H₁₉ClO₂
• 分子量：362.85
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

6(5H)-菲啶酮

6(5H)-Phenanthridinone 是一种有效的 PARP-1 抑制剂和免疫调节剂。6(5H)-Phenanthridinone 抑制细胞增殖,可用于癌症研究。

• CAS号：1015-89-0
• 分子式：C₁₃H₉NO
• 分子量：195.22
• 类别：PARP

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：274.8±7.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：290-292 °C(lit.)
• 闪点：158.7±3.1 °C

EPZ011989

EPZ011989是EZH2高效选择性且口服型抑制剂,对wt EZH2以及EZH2突变型Ki值<3nM。

• CAS号：1598383-40-4
• 分子式：C₃₅H₅₁N₅O₄
• 分子量：605.810
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：756.7±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：411.4±32.9 °C

HDAC6-IN-11

HDAC6-IN-11(化合物9)是一种选择性HDAC6抑制剂,IC50值为20.7nM。HDAC6-IN-11的选择性是HDAC和其他亚型的300倍以上。HDAC6-IN-11显示出对癌细胞的抗增殖活性[1]。

• CAS号：2409072-27-9
• 分子式：C₁₉H₁₆N₂O₄
• 分子量：336.34
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OUL35

OUL35(NSC39047)是ARTD10(PARP-10)的有效和选择性抑制剂,IC50为329 nM[1]。

• CAS号：6336-34-1
• 分子式：C₁₄H₁₂N₂O₃
• 分子量：256.25700
• 类别：PARP

• 密度：1.298g/cm3
• 沸点：488.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：257.9ºC

2-氰基-N-(2,5-二溴苯基)-3-羟基-2-丁烯酰胺

LFM-A13是一种强效的BTK、JAK2、PLK抑制剂,抑制重组BTK、Plx1和PLK3,IC50分别为2.5μM、10μM和61μM。LFM-A13具有抗增殖活性和抗癌活性。LFM-A13可用于癌症相关研究[1][3][4]

• CAS号：62004-35-7
• 分子式：C₁₁H₈Br₂N₂O₂
• 分子量：360.00
• 类别：Polo样激酶(PLK)

• 密度：1.9±0.1 g/cm3
• 沸点：487.9±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：248.9±28.7 °C

6-姜酚

[6]-Gingerol是从生姜中分离的活性物质,具有多种生物活性,包括抗癌,抗炎和抗氧化。

• CAS号：23513-14-6
• 分子式：C₁₇H₂₆O₄
• 分子量：294.386
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：453.0±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：30 - 32ºC
• 闪点：159.0±19.4 °C

PARP1-IN-7

PARP1-IN-7是聚ADP核糖聚合酶-1(PARP1)作为抗癌剂的抑制剂。

• CAS号：2084112-75-2
• 分子式：C₂₄H₂₃N₅O
• 分子量：397.47
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK690

GSK 690是赖氨酸特异性脱甲基酶1(LSD1)的可逆抑制剂,Kd值为9 nM,生化IC50为37 nM。

• CAS号：2101305-84-2
• 分子式：C₂₄H₂₃N₃O
• 分子量：369.459
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：530.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：274.6±30.1 °C

陶扎色替

Tozasertib 是 Aurora A/B/C 激酶抑制剂,Ki 值分别为 0.6,18,4.6 nM。

• CAS号：639089-54-6
• 分子式：C₂₃H₂₈N₈OS
• 分子量：464.586
• 类别：自噬

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EPZ004777盐酸盐

EPZ004777盐酸盐是高活性DOT1L抑制剂,IC50为0.4 nM。

• CAS号：1380316-03-9
• 分子式：C₂₈H₄₂ClN₇O₄
• 分子量：576.13100
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E67-2

E67-2是H3K9 Jumonji去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的有效选择性抑制剂,IC50为3.4 uM；选择性抑制H3K9 Jumonji去甲基化酶而不是H3K9甲基转移酶以及H3K4去甲基化酶,具有低细胞毒性。

• CAS号：1364914-62-4
• 分子式：C₂₁H₃₆N₆O₂
• 分子量：404.559
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

6-去氧异巴西红厚壳素

6-Deoxyisojacareubin 是一种 PKC 抑制剂,能以浓度依赖性方式抑制 QGY-7703 细胞的增殖。6-Deoxyisojacareubin 还是一种天然产物,可从 Garcinia nervosa 中获得。6-Deoxyisojacareubin 可用于癌症的研究。

• CAS号：26486-92-0
• 分子式：C₁₈H₁₄O₅
• 分子量：310.30
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A