表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

TPOP146

TPOP146是选择性的CBP/P300苯并西泮溴结构域抑制剂；对CBP和BRD4的Kd值分别为134 nM和5.02 μM。

• CAS号：2018300-62-2
• 分子式：C₂₇H₃₅N₃O₅
• 分子量：481.584
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：641.8±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：341.9±31.5 °C

木蝴蝶苷A

Oroxin A 是 Oroxylum indicum(L.)Kurz (紫薇科) 种子提取物 (OISE) 的主要成分,通过对接到 PPARγ 蛋白配体结合结构域激活 PPARγ。 Oroxin A 抑制 α-glucosidase α-葡萄糖苷酶的活性和抗氧化能力。Oroxin A 具有抗癌潜力。

• CAS号：57396-78-8
• 分子式：C₂₁H₂₀O₁₀
• 分子量：432.378
• 类别：PARP

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：784.0±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：279.0±26.4 °C

OTS193320

OTS193320(OTS-193320)是蛋白质甲基转移酶SUV39H2的有效抑制剂,IC50为22.2 nM；体外显着降低乳腺癌细胞中全球H3K9三甲基化(H3K9me3)并诱导凋亡细胞死亡,减弱γ-H2AX水平与单用DOX治疗相比,阿霉素,与单药治疗相比,导致乳腺癌细胞活力显着降低；引起SUV39H2阳性A549肺癌细胞的生长抑制作用,IC50为0.38 uM。

• CAS号：2093401-33-1
• 分子式：C₂₈H₃₀ClN₅O₄
• 分子量：536.029
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DB0614

DB0614(实施例21)是激酶的双功能化合物靶向蛋白质降解。DB0614降解AAK1、AURKA、BMP2K、CAMKK1、CDK16、CML、CDK6、EIF2AK2、FER、GAK、LCK、LIMK2、MAP3KH、MAPK8、MAPK9、NEK9、PLK4、PTK2B、SIK2、STK17A、STK117B、ULK1、ULK3和WEE1。DB0614可用于研究由异常激酶活性介导的疾病[1]。

• CAS号：2769753-47-9
• 分子式：C₄₁H₄₂N₈O₇S₂
• 分子量：822.95
• 类别：Ferroptosis

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

XF056-132

XF056-132是一种有效的WDR5(WD40重复结构域蛋白5)PROTAC降解剂[1]。

• CAS号：2407450-73-9
• 分子式：C₅₁H₅₇F₄N₉O₇S
• 分子量：1016.11
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RBN012759

RBN012759 是一种有效的,选择性和具有口服活性的 PARP14 抑制剂,IC50 值 <3 nM,比对 monoPARPs 的选择性高 300 倍,比对 polyPARPs 的选择性高 1000 倍。RBN012759 可以降低肿瘤前巨噬细胞的功能并引起肿瘤外植体的炎症反应。

• CAS号：2360851-29-0
• 分子式：C₁₉H₂₃FN₂O₃S
• 分子量：378.46
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD 9757

BRD9757是一种有效的无帽选择性HDAC6抑制剂,IC50为30nM。与I类(>20倍)和II类(>400倍)HDAC[1]相比,BRD9757对HDAC6表现出优异的选择性。

• CAS号：1423058-85-8
• 分子式：C₆H₉NO₂
• 分子量：127.14100
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

贝派度酸

ETC-1002 是 AMPK 的激活剂。

• CAS号：738606-46-7
• 分子式：C₁₉H₃₆O₅
• 分子量：344.48600
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tyk2-IN-9

Tyk2-IN-9(化合物26)是一种选择性Tyk-2抑制剂,对于Tyk2-JH2和JAK1-JH2,IC50s分别为0.076和1.8 nM。Tyk2-IN-9可用于炎症或自身免疫性疾病的研究[1]。

• CAS号：2694816-85-6
• 分子式：C₂₁H₂₅N₉O₃
• 分子量：451.48
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Psychosine-d5

精神碱-d5是氘标记的精神碱。精神碱是半乳糖苷酶(GALC)的底物,是克拉贝病的潜在生物标志物。精神药物是一种高度细胞毒性的脂质,能够在多种细胞中诱导细胞死亡。

• CAS号：2260670-12-8
• 分子式：C₂₄H₄₂D₅NO₇
• 分子量：466.66
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

WAY-323062

SIRT2-IN-9(化合物12)是SRIT2的选择性抑制剂,IC50值为1.3μM。SIRT2-IN-9抑制MCF-7乳腺癌细胞的增殖活性。SIRT2-IN-9可用于癌症研究[1]。

• CAS号：522650-91-5
• 分子式：C₂₁H₂₂N₆OS₂
• 分子量：438.57
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-15

PROTAC BRD4降解剂-15是一种有效的BRD4降解剂,BRD4 BD1和BD2的IC50分别为7.2 nM和8.1 nM。PROTAC BRD4降解剂-15能够有效降解PC3前列腺癌细胞中的BRD4蛋白[1]。

• CAS号：2417370-67-1
• 分子式：C₅₇H₆₂F₂N₁₀O₁₀S₂
• 分子量：1149.29
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,2-Didecanoylglycerol

1,2-二癸酰甘油是一种合成的二酰甘油,由血小板代谢为1,2-二癸酰磷脂酸(PA10)并激活蛋白激酶C(PKC)[1][2]。

• CAS号：17863-69-3
• 分子式：C₂₃H₄₄O₅
• 分子量：400.59
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

H-PHE-LYS-LYS-SER-PHE-LYS-LEU-NH2

FKKSFKL-NH2是一种蛋白激酶C选择性肽。FKKSFKL-NH2可用于各种生化的研究[1]。

• CAS号：137168-33-3
• 分子式：C₄₅H₇₃N₁₁O₈
• 分子量：896.130
• 类别：PKC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：1275.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：725.3±34.3 °C

GSK232

GSK232是一种高选择性的纤维素渗透剂CECR2抑制剂,具有优异的物理化学性能。

• CAS号：2702984-69-6
• 分子式：C₂₁H₂₇ClN₆O₃S
• 分子量：479.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-硬脂酰基-2-花生四烯酰基-sn-甘油

1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油是一种含有多不饱和脂肪酸的二酰甘油(DAG)。1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油可激活PKC。1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油也能增强非选择性阳离子通道(NSCC)活性[1][2]。

• CAS号：65914-84-3
• 分子式：C₄₁H₇₂O₅
• 分子量：645.007
• 类别：PKC

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：689.2±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：190.3±25.0 °C

PF-03622905

PF-03622905是一种有效的ATP竞争性PKC抑制剂,PKCα、PKCβI、PKCβII、PKCγ和PKCθ的IC50分别为5.6 nM、14.5 nM、13 nM、37.7 nM和74.1 nM。PF-03622905对PKC的特异性高于其他蛋白激酶[1]。

• CAS号：1072100-15-2
• 分子式：C₂₄H₃₅N₇O₃
• 分子量：469.58
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-10

HDAC6-IN-10是一种高选择性HDAC6抑制剂,IC50为0.73 nM。HDAC6-IN-10的选择性是其他HDAC亚型的144～10941倍。HDAC6-IN-10对多发性骨髓瘤细胞具有抗增殖活性[1]。

• CAS号：2408286-73-5
• 分子式：C₂₁H₂₀N₄O₄
• 分子量：392.41
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4-BD1/2-IN-2

BRD4-BD1/2-IN-2是一种有效的BRD4-BD2抑制剂,BRD4-BD2和BRD4-BD1的IC50分别小于0.5 nM和<300 nM(WO2021233371A1,化合物2)[1]。

• CAS号：2743464-27-7
• 分子式：C₃₀H₃₃N₅O₄
• 分子量：527.61
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-油酰基-2-乙酰基-sn-丙三醇

1-油酰-2-乙酰-sn甘油是一种合成的、细胞可渗透的二酰甘油类似物。1-油酰-2-乙酰-sn甘油激活钙依赖性蛋白激酶C(PKC)并诱导超氧化物的产生。

• CAS号：86390-77-4
• 分子式：C₂₃H₄₂O₅
• 分子量：398.577
• 类别：PKC

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：490.0±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：152.3±13.9 °C

MDL-811

MDL-811 是 SIRT6 的异构激活剂,可显著激活SIRT6 组蛋白 H3 的去乙酰化(H3K9Ac, H3K18Ac, 和 H3K56Ac)。MDL-811 可用以结肠癌的研究。

• CAS号：2275619-98-0
• 分子式：C₂₅H₂₅BrCl₂FN₃O₅S₂
• 分子量：681.42
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PRMT5-IN-17

PRMT5-IN-17(化合物6)是一种具有抗肿瘤活性的PRMT5抑制剂。PRMT5是一种蛋白质精氨酸甲基转移酶,是一种与表观遗传修饰相关的新的抗肿瘤靶点[1]。

• CAS号：2755304-03-9
• 分子式：C₂₆H₃₃N₇O₂
• 分子量：475.59
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NCGC00247743

NCGC00247743 是一种组蛋白赖氨酸脱甲基酶 KDM4 抑制剂。

• CAS号：1435192-04-3
• 分子式：C₂₄H₂₉N₃O₂
• 分子量：391.51
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

UCN-02

UCN-02 (7-epi-Hydroxystaurosporine) 是一种由链霉菌属 N-126 菌株产生的,选择性的蛋白激酶 C (PKC) 抑制剂,对 PKC 和 PKA 作用的 IC50 值分别为 62 nM 和 250 nM。 UCN-02 对 HeLa S3 细胞具有细胞毒性,能抑制其生长。

• CAS号：121569-61-7
• 分子式：C₂₈H₂₆N₄O₄
• 分子量：482.537
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SK-575

SK-575是一种针对PARP1嵌合体(PROTAC)的高效特异性蛋白水解降解剂。SK-575可有效抑制BRCA1/2突变癌细胞的生长。SK-575抑制MDA-MB-436和Capan-1细胞的生长,IC50值分别为19±6 nM和56±12 nM【1】。

• CAS号：2523016-96-6
• 分子式：C₄₇H₅₃FN₈O₈
• 分子量：876.97
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

桧木醇

Hinokitiol 是从日本扁柏中分离到的挥发油成分,能够降低 Nrf2 的表达,减少 DNMT1 和 UHRF1 的 mRNA 和蛋白的表达,具有抗感染、抗氧化及抗肿瘤等活性。

• CAS号：499-44-5
• 分子式：C₁₀H₁₂O₂
• 分子量：164.201
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：303.4±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：50-52 °C(lit.)
• 闪点：128.1±18.5 °C

BAY-3827

BAY-3827是一种有效且选择性的AMPK抑制剂,低浓度(10µM ATP浓度)时IC50值为1.4 nM,高浓度(2 mM ATP浓度时IC50为15 nM。BAY-3827对大多数331种激酶显示出超过500倍的选择性。BAY-3827阻止乙酰辅酶A羧化酶1的磷酸化,并在雄激素依赖性前列腺癌细胞系中显示出最强的抗增殖活性[1]。

• CAS号：2377576-35-5
• 分子式：C₂₇H₂₅FN₆O
• 分子量：468.53
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-苯基丁酸-D4

4-苯基丁酸-d2是氘标记的4-苯基丁酸[1]。4-苯基丁酸(4-PBA)是HDAC和内质网(ER)应激的抑制剂,用于癌症和感染研究。

• CAS号：461391-24-2
• 分子式：C₁₀H₈D₄O₂
• 分子量：168.22600
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK467

GSK467 是一种有效选择性的 KDM5 (也称 JARID1) 抑制剂,Ki 值为 10 nM,是 KDM4C 选择性的 180 倍,而对 KDM6 或其他 Jumonji 家族成员没有明显的抑制作用。

• CAS号：1628332-52-4
• 分子式：C₁₇H₁₃N₅O₂
• 分子量：319.32
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PKC-IN-4

PKC-IN-4(化合物7l)是一种有效的口服活性aPKC抑制剂,IC50为0.52µM。PKC-IN-4在体外抑制TNF-α诱导的NF-κB活性。PKC-IN-4阻断VEGF和TNFα诱导的视网膜血管通透性[1]。

• CAS号：2636771-29-2
• 分子式：C₂₁H₂₅N₅S
• 分子量：379.52
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A