表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

伪原薯蓣皂苷

Pseudoprotodioscin,一种呋喃葡糖苷,抑制 SREBP1/2 和 microRNA 33a/b 水平,降低胆固醇和甘油三酯合成相关的基因表达。

• CAS号：102115-79-7
• 分子式：C₅₁H₈₂O₂₁
• 分子量：1031.184
• 类别：微RNA

• 密度：1.45 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PCAF-IN-2

PCAF-IN-2(化合物17)是一种有效的PCAF抑制剂,IC50值为5.31µM。PCAF-IN-2具有抗肿瘤活性。CAF-IN-2诱导细胞凋亡并将细胞周期阻滞在G2/M期[1]。

• CAS号：56173-05-8
• 分子式：C₁₀H₇F₃N₆
• 分子量：268.20
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 2

AMPK激活剂2(化合物7a)是一种含氟的丙胍衍生物,上调AMPK信号通路,下调mTOR/4EBP1/p70S6K。AMPK激活剂2抑制人类癌细胞系(UMUC3、T24、A549)的增殖和迁移[1]。

• CAS号：2410961-69-0
• 分子式：C₁₃H₁₈F₃N₅
• 分子量：301.31
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

东莨菪甙； 东莨菪苷

Scopolin 是一种从拟南芥 (Arabidopsis) 根中分离出来的香豆素。Scopolin 通过激活SIRT1 介导的信号级联反应减轻了肝脂肪变性。

• CAS号：531-44-2
• 分子式：C₁₆H₁₈O₉
• 分子量：354.309
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：650.2±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：217ºC
• 闪点：241.5±25.0 °C

LLY-507

LLY-507是有效和选择性的蛋白-赖氨酸甲基转移酶 SMYD2 抑制剂,IC50 为15 nM。

• CAS号：1793053-37-8
• 分子式：C₃₆H₄₂N₆O
• 分子量：574.758
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：790.4±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：431.8±35.7 °C

Tazemetostat trihydrochloride

Tazemetostat trihydrochloride (EPZ-6438 trihydrochloride) 是一种有效,选择性,口服的 EZH2 抑制剂。Tazemetostat trihydrochloride 抑制含有 PRC2 复合体的野生型 EZH2 的活性, Ki 值为 2.5 nM。Tazemetostat trihydrochloride 抑制 EZH2,在肽测定和核小体测定中 IC50 分别为 11 和 16 nM。Tazemetostat trihydrochloride 抑制大鼠 EZH2,IC50 为 4 nM。Tazemetostat trihydrochloride 还抑制 EZH1,IC50 为 392 nM。

• CAS号：1403255-00-4
• 分子式：C₃₄H₄₇Cl₃N₄O₄
• 分子量：682.12
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT2-IN-10

SIRT2-IN-10(化合物12)是一种有效的SIRT2抑制剂,IC50为1.3μM。SIRT2-IN-10可用于癌症和神经退行性疾病的研究[1]。

• CAS号：296793-09-4
• 分子式：C₂₈H₂₁N₅OS
• 分子量：475.56
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

奥拉帕尼

Olaparib (AZD2281; KU0059436) 是一种有效的 PARP 抑制剂,抑制 PARP-1 和 PARP-2 的 IC50 分别为 5 和 1 nM。

• CAS号：763113-22-0
• 分子式：C₂₄H₂₃FN₄O₃
• 分子量：434.463
• 类别：自噬

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CMP-5

CMP-5(PRMT5-IN-5)是一种一流的小分子PRMT5特异性抑制剂,可阻断EBV驱动的B淋巴细胞转化和存活,对正常B细胞无影响；对其他I型无活性(PRMT1和PRMT4)和II型(PRMT7)酶；PRMT5的抑制导致miR96启动子上PRMT5/p65/HDAC3抑制复合物的募集丧失,miR96表达恢复和PRMT5下调。

• CAS号：880813-42-3
• 分子式：C₂₁H₂₁N₃
• 分子量：315.411
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：505.1±48.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：259.3±29.6 °C

(SER25)-PROTEIN KINASE C (19-31)

[Ser25]蛋白激酶C(19-31)是蛋白激酶C的底物(Km:0.3μM)。[Ser25]蛋白激酶C(19-31)源自PKCα(19-31)的伪底物调节结构域,25位的丝氨酸取代了野生型丙氨酸[1]。

• CAS号：136795-05-6
• 分子式：C₆₇H₁₁₈N₂₆O₁₇
• 分子量：1559.818
• 类别：PKC

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DPPY

DPPY(化合物6)是一种有效的PTK抑制剂,对于EGFR、BTK和JAK3,IC50值分别为<10、<10、<10 nM。DPPY对B细胞淋巴瘤细胞具有抗增殖活性。DPPY具有研究特发性肺纤维化的潜力[1]。

• CAS号：2095883-62-6
• 分子式：C₂₅H₂₆ClN₇O₃
• 分子量：507.97
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1

PF-CBP1是CREB结合蛋白溴多糖的高选择性抑制剂[1]。

• CAS号：1962928-21-7
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃
• 分子量：488.621
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：673.5±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：361.1±31.5 °C

TK4g

TK4g是一种Janus激酶(JAK)抑制剂,JAK2和JAK3的IC50值分别为12.61 nM和15.80 nM。TK4g可用于淋巴源性疾病和白血病癌症研究[1]。

• CAS号：2232890-86-5
• 分子式：C₁₉H₁₉N₃O₄S
• 分子量：385.44
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK2879552 dihydrochloride

GSK2879552 dihydrochloride是一种可口服的,不可逆的 LSD1/ KDM1A 抑制剂,具有抗肿瘤活性。

• CAS号：1902123-72-1
• 分子式：C₂₃H₃₀Cl₂N₂O₂
• 分子量：437.40
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S)-(6-乙酰氨基1-((4-甲基-2-氧代-2H-色烯-7-基)氨基)-1-氧代己烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯

Boc-Lys(Ac)-AMC是一种可渗透细胞的荧光HDAC基质(Ex/Em=355 nm/460 nm)[1][2]。

• CAS号：233691-67-3
• 分子式：C₂₃H₃₁N₃O₆
• 分子量：445.50900
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(Rac)-Ruxolitinib D9

(Rac)-RUXOLITINB D9((Rac)-INCB18424 D9)是氘标记的(Rac)-RUXOLITINB(Rac)-Ruxolitinib是一种JAK2抑制剂[1]。

• CAS号：2469553-67-9
• 分子式：C₁₇H₉D₉N₆
• 分子量：315.42
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EZH2-IN-4

EZH2-IN-4是一种口服活性、有效的EZH2抑制剂,其IC50分别为0.923 nM和2.65 nM,可对抗野生型(WT)5-成员(5-聚体)EZH2和突变型5-聚体EZH2。EZH2-IN-4具有抗癌活性[1]。

• CAS号：2088132-99-2
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BAY-598

BAY-598 是 SMYD2 的一个选择性小分子抑制剂。

• CAS号：1906919-67-2
• 分子式：C₂₂H₂₀Cl₂F₂N₆O₃
• 分子量：525.34
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

短叶老鹤草素A

Brevilin A 是一种从 Centipeda minima 中分离的倍半萜内酯,具有抗癌活性。Brevilin A 是一种选择性的 JAK-STAT 信号通路抑制剂,通过减弱 JAK 信号和 阻塞 STAT3 信号起作用。Brevilin A 通过线粒体途径和 PI3K/AKT/mTOR 失活诱导结肠腺癌细胞 CT26 的凋亡和自噬。

• CAS号：16503-32-5
• 分子式：C₂₀H₂₆O₅
• 分子量：346.417
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：494.0±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：216.0±28.8 °C

Xanthoangelol

Xanthoangelol 可从Angelica keiskei 中分离得到,可抑制肥胖引起的炎症反应。Xanthoangelol 具有抗菌活性。Xanthoangelol 可抑制单胺氧化酶。Xanthoangelol 诱导神经母细胞瘤和白血病细胞凋亡。

• CAS号：62949-76-2
• 分子式：C₂₅H₂₈O₄
• 分子量：392.48700
• 类别：细菌

• 密度：1.165g/cm3
• 沸点：605.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：334.2ºC

鲁索利替尼磷酸盐

Ruxolitinib phosphate是一种有效的 JAK1/2 抑制剂, IC50 分别为3.3 nM/2.8 nM,比JAK3选择性高130倍。

• CAS号：1092939-17-7
• 分子式：C₁₇H₂₁N₆O₄P
• 分子量：404.360
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

9-羟基十八酸

9-羟基十八烷酸(9-HSA)是一种HDAC1抑制剂,在5μM时可抑制约66.4%的HDAC1酶活性。9-羟基十八烷酸显示出抗癌活性[1]。

• CAS号：3384-24-5
• 分子式：C₁₈H₃₆O₃
• 分子量：300.48
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AU-15330

AU-15330是SWI/SNF ATP酶亚单位SMARCA2和SMARCA4的蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)降解物。AU-15330在前列腺癌异种移植模型中诱导对肿瘤生长的有效抑制,并与AR拮抗剂恩扎鲁胺协同作用。AU-15330在无毒性的去势耐受性前列腺癌(CRPC)模型中诱导疾病缓解[1]。

• CAS号：2380274-50-8
• 分子式：C₃₉H₄₉N₉O₅S
• 分子量：755.93
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

7-氯-4-(1-哌嗪基)喹啉

7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种重要的药物化学支架。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物是一种有效的sirtuin抑制剂,并可抑制5-羟色胺摄取(IC50为50μM)。7-氯-4-(哌嗪-1-基)喹诺酮类药物对P。IC50分别为1.18μM和0.97μM的恶性疟原虫[1]。

• CAS号：837-52-5
• 分子式：C₁₃H₁₄ClN₃
• 分子量：247.72300
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.257 g/cm3
• 沸点：433.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：113-116ºC
• 闪点：216ºC

软木肟酸

Suberoyl bis-hydroxamic acid (Suberohydroxamic acid; SBHA) 是竞争性且可透过细胞的 HDAC1 和 HDAC3 抑制剂,ID50 值分别为 0.25 μM 和 0.30 μM。Suberoyl bis-hydroxamic acid 使肿瘤细胞易于凋亡 (apoptosis) 并促进线粒体凋亡途径。Suberoyl bis-hydroxamic acid 可用于甲状腺髓样癌 (MTC) 的研究。

• CAS号：38937-66-5
• 分子式：C₈H₁₆N₂O₄
• 分子量：204.224
• 类别：HDAC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：153-155ºC(lit.)
• 闪点：N/A

ARTD10/PARP10-IN-1

ARTD10/PARP10-IN-1(化合物23)是一种有效的非选择性PARP抑制剂,靶向单ADP核糖转移酶ARTD7/PARP15、ARTD8/PARP14、ARTD10/PPARP10和多(ADP核糖)聚合酶-1(ARTD1/PARP1),IC50分别为1.7μM、1.6μM、0.8μM和4.4μM[1]。

• CAS号：1708103-76-7
• 分子式：C₁₂H₁₂N₂O₄
• 分子量：248.23
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methylstat

甲基stat是一种有效的组蛋白去甲基化酶抑制剂。Methylstat显示出低细胞毒性的抗增殖活性。甲基stat诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞在G0/G1期。甲基stat增加p53和p21蛋白水平的表达。甲基stat抑制各种细胞因子诱导的血管生成。Methylstat可用作化学探针,以解决其在血管生成中的作用[1][2]。

• CAS号：1310877-95-2
• 分子式：C₂₈H₃₁N₃O₆
• 分子量：505.562
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Alisertib sodium

Alisertib(MLN 8237)钠是一种口服活性和选择性极光A激酶抑制剂(IC50=1.2 nM),它与极光A激酶结合,导致有丝分裂纺锤体异常、有丝分裂累积。Alisertib钠通过靶向白血病细胞中的AKT/mTOR/AMPK/p38通路诱导凋亡和自噬。抗肿瘤活性[1][2][3]。

• CAS号：1028486-06-7
• 分子式：C₂₇H₁₉ClFN₄NaO₄
• 分子量：540.90500
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT6 activator 12q

SIRT6激活剂12q是有效的、选择性的和口服活性的SIRT6激活物,SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6的IC50值分别为171.20、>200、>200和0.58µM。SIRT6激活剂12q抑制细胞生长和迁移。SIRT6激活剂12q诱导G2期细胞凋亡和细胞周期阻滞。SIRT6激活剂12q显示出抗癌活性[1]。

• CAS号：2601734-99-8
• 分子式：C₃₁H₂₂N₂O₂
• 分子量：454.53
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4,5,7,8,-四甲氧基黄酮

6-​Demethoxytangeretin 6-去甲氧基三苯甲基黄嘌呤是从柑橘 (Citrus depressa) 分离的黄酮。 6-Demethoxytangeretin 具有抗炎和抗过敏活性,通过间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 和丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 途径抑制人肥大细胞中 IL-6 的产生和基因表达。6-​Demethoxytangeretin 促进 CRE 介导的转录 (与海马神经元的学习和记忆相关)。

• CAS号：6601-66-7
• 分子式：C₁₉H₁₈O₆
• 分子量：342.343
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.243±0.06 g/cm3
• 沸点：536.9±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：216-217 ºC
• 闪点：237.5±30.2 °C