表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

(+)-JQ1

(+)-JQ-1 是一种 BET bromodomain 抑制剂,抑制 BRD4(1/2) 的 IC50 分别为 77 nM 和 33 nM。

• CAS号：1268524-70-4
• 分子式：C₂₃H₂₅ClN₄O₂S
• 分子量：456.988
• 类别：自噬

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：610.4±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：322.9±34.3 °C

BET-IN-15

BET-IN-15(化合物1)是一种有效的口服活性BET抑制剂,BRD4-BD1、BRD4-BD2的IC50值分别为0.64、0.25nM。BET-IN-15显示出抗增殖活性[1]。

• CAS号：2408994-22-7
• 分子式：C₂₁H₁₈F₂N₄O₃S
• 分子量：444.45
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Resveratrol analog 2

Resveratrol analog 2 是白藜芦醇 (HY-16561) 的类似物 (analog)。白藜芦醇是一种天然的多酚类植物抗毒素,具有抗氧化、抗炎、保护心脏和抗癌的特性。

• CAS号：915378-82-4
• 分子式：C₁₆H₁₃FO₃
• 分子量：272.27
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TH1834 dihydrochloride

TH1834二盐酸盐(TH-1834,TH 1834)是一种新型有效的特异性组蛋白乙酰转移酶Tip60抑制剂；诱导乳腺癌细胞系凋亡,细胞毒性高于星形孢菌素；增加癌细胞系PC-3和DU-145中的γH2AX病灶结合IR；诱导细胞凋亡并增加乳腺未修复的DNA损伤癌细胞。

• CAS号：2108830-09-5
• 分子式：C₃₃H₄₂Cl₂N₆O₃
• 分子量：641.638
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Nesuparib

奈舒巴利是PARP的有效抑制剂。Nesuparib可用于神经病理性疼痛、神经退行性疾病和心血管疾病的研究(摘自专利WO20162000101A2)[1]。

• CAS号：2055357-64-5
• 分子式：C₂₃H₂₄N₆O
• 分子量：400.48
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

β 淀粉样蛋白片段1-40

β-Amyloid (1-40)是阿尔茨海默病患者脑斑块中发现的主要蛋白质。

• CAS号：131438-79-4
• 分子式：C₁₉₄H₂₉₅N₅₃O₅₈S
• 分子量：4329.867
• 类别：多肽产品

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-5959

GSK-5959是一种有效的, 渗透细胞的选择性BRPF1 Bromodoman抑制剂, IC50为80 nM, 作用于BRPF1比作用于其他35种Bromodoman (包括BRPF2/3和BET家族) 选择性强100多倍。

• CAS号：901245-65-6
• 分子式：C₂₂H₂₆N₄O₃
• 分子量：394.467
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：527.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：272.7±30.1 °C

depudecin

去乙酰化酶((-)-Depdecin)是一种组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂。可以从真菌Alternaria brassicicola[1][2]中分离出德普定素。

• CAS号：139508-73-9
• 分子式：C₁₁H₁₆O₄
• 分子量：212.24200
• 类别：HDAC

• 密度：1.415g/cm3
• 沸点：369.4ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：177.2ºC

MOZ-IN-2

MOZ-IN-2 是 MOZ (属于 histone acetyltransferases) 的抑制剂,其IC50 值为125 μM。

• CAS号：2055397-88-9
• 分子式：C₁₇H₁₃FN₄O₃S
• 分子量：372.3735232
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

YLF-466d接触

YLF-466D 是一种新型 AMPK 激活剂,可抑制血小板聚集。

• CAS号：1273323-67-3
• 分子式：C₂₉H₂₀ClNO₃
• 分子量：465.92700
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZT55

ZT55(JAK抑制剂ZT55)是一种新型有效的高选择性酪氨酸激酶JAK2抑制剂,IC50为31 nM；对JAK1/3无显着活性(IC50>10 uM)；对细胞JAK-STAT途径有显着作用,抑制JAK2V617F和下游STAT3/5转录因子中的酪氨酸磷酸化；抑制表达JAK2V617F的HEL细胞系的增殖,导致细胞周期停滞在G2/M期并诱导半胱天冬酶依赖性细胞凋亡；显着抑制体内HEL异种移植肿瘤的生长,阻断外周血的红细胞集落形成携带JAK2V617F的患者的造血祖细胞突变。

• CAS号：2138488-38-5
• 分子式：C₁₇H₁₆N₂O₃
• 分子量：296.326
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-氨基-1,8-萘二胺

4-氨基萘酰亚胺是一种有效的PARP抑制剂,可增强癌细胞γ辐射的细胞毒性[1]。

• CAS号：1742-95-6
• 分子式：C₁₂H₈N₂O₂
• 分子量：212.20
• 类别：PARP

• 密度：1.105 g/mL at 25ºC(lit.)
• 沸点：544.1ºC at 760 mmHg
• 熔点：360ºC
• 闪点：282.8ºC

Tankyrase-IN-3

Tankyrase-IN-3是一种Tankyrase 1(TNKS1)抑制剂,IC50值为22nM。Tankyrase-IN-3可用于癌症研究[1]。

• CAS号：938893-79-9
• 分子式：C₂₁H₂₁N₅O₄
• 分子量：407.42
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

WDR5-0103

WDR5-0103是一个有效的含WD重复序列蛋白5 (WDR5) 选择性拮抗剂, Kd值为450 nM。

• CAS号：890190-22-4
• 分子式：C₂₁H₂₅N₃O₄
• 分子量：383.441
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：495.2±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：253.3±28.7 °C

5-氟脱氧胞苷

5-氟-2'-脱氧胞苷是一种氟嘧啶核苷类似物,是一种DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂。5-氟-2'-脱氧胞苷是一种有效的胸苷酸合成酶抑制剂5-氟-2'-dUMP[1][2]的肿瘤选择性前药。

• CAS号：10356-76-0
• 分子式：C₉H₁₂FN₃O₄
• 分子量：245.208
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.8±0.1 g/cm3
• 沸点：465.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：196 °C
• 闪点：235.0±31.5 °C

A1874

A1874 是一种以nutlin 为基础的、BRD4-降解的 PROTAC,DC50 值为 32 nM (诱导细胞内的BRD4降解)。有效抑制多种癌细胞增殖。

• CAS号：2064292-12-0
• 分子式：C₅₈H₆₂Cl₃F₂N₉O₇S
• 分子量：1173.59
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCS 21311

TCS 21311 (NIBR3049) 是一种有效的高选择性 JAK3 抑制剂,其 IC50 为 8 nM,它的选择性是 JAK1,JAK2 和 TYK2 的100倍以上。TCS 21311 (NIBR3049) 抑制 PKCα,PKCθ 和 GSK3β,IC50 值分别为 13、68 和 3 nM。

• CAS号：1260181-14-3
• 分子式：C₂₇H₂₅F₃N₄O₄
• 分子量：526.50700
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

P300/CBP-IN-6

P300/CBP-IN-6 是一种有效的 p300/CBP histone acetyltransferase (HAT) 抑制剂,详细信息请参考专利文献 WO2019161162A1 中的化合物 33。

• CAS号：2374971-81-8
• 分子式：C₂₇H₂₆N₆O
• 分子量：450.53
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-(1,3-二氧代-1H-苯并[de]异喹啉-2(3H)-基)-N-羟基丁酰胺

Nullscript是Scriptaid的负控件。Nullscript是已知的Scriptaid的非活动类似物[1]。Scriptaid是一种典型的HDAC抑制剂[2]。Nullscript抑制隐孢子虫(C.parvum)生长,IC50值为2.1μM【3】。

• CAS号：300816-11-9
• 分子式：C₁₆H₁₄N₂O₄
• 分子量：298.293
• 类别：HDAC

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TH1834

TH1834(TH-1834,TH 1834)是一种新型有效的特异性组蛋白乙酰转移酶Tip60抑制剂；诱导乳腺癌细胞系凋亡,细胞毒性高于星形孢菌素；增加癌细胞系PC-3和DU-145中的γH2AX病灶。结合IR；诱导细胞凋亡并增加乳腺癌细胞中未修复的DNA损伤。

• CAS号：2108830-08-4
• 分子式：C₃₃H₄₀N₆O₃
• 分子量：568.722
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tenovin-6

Tenovin-6 是水溶的 SIRT1、SIRT2 抑制剂,p53 的激活剂,同时能抑制 HDAC8 的活性,对 SirT1 peptide deacetylase,SirT2 和 SirT3 的 IC50 值分别为 21 μM,10 μM 和 67 μM。

• CAS号：1011557-82-6
• 分子式：C₂₅H₃₄N₄O₂S
• 分子量：454.628
• 类别：MDM-2/p53

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

阿莫地喹

Amodiaquine (Amodiaquin) 是一种4-氨基喹啉类抗疟剂,是一种有效的具有口服活性的组胺 N-甲基转移酶 (histamine N-methyltransferase) 抑制剂。Amodiaquine 也是一种 Nurr1 激动剂,可特异性结合 Nurr1 的配体结合域,EC50 为 ~20 μM。抗炎作用。

• CAS号：86-42-0
• 分子式：C₂₀H₂₂ClN₃O
• 分子量：355.861
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：478.0±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：208°C
• 闪点：242.9±28.7 °C

JPS036

JPS036是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS036降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS036是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

• CAS号：2669785-85-5
• 分子式：C₅₁H₆₆FN₇O₇S
• 分子量：940.18
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

烟酰胺核糖氯化物(NR-CL)

Nicotinamide riboside chloride 是烟酰胺核苷 (Nicotinamide riboside) 氯化物的晶体形式,烟酰胺核苷是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (nicotinamide adenine dinucleotide, NAD[+]) 前体维生素。Nicotinamide riboside chloride 增加NAD[+] 水平并激活 SIRT1 和 SIRT3,最终增强氧化代谢并防止高脂肪饮食诱导的代谢异常。Nicotinamide riboside chloride 用于膳食补充剂。

• CAS号：23111-00-4
• 分子式：C₁₁H₁₅ClN₂O₅
• 分子量：290.70000
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ENMD-2076

ENMD-2076是多靶点激酶抑制剂,抑制 Aurora A,Flt3,KDR/VEGFR2,Flt4/VEGFR3,FGFR1,FGFR2,Src,PDGFRα 的IC50 值分别为1.86,14,58.2,15.9,92.7,70.8,20.2 and 56.4 nM。

• CAS号：934353-76-1
• 分子式：C₂₁H₂₅N₇
• 分子量：375.470
• 类别：极光激酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：535.0±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：277.4±30.1 °C

4'-((1R,2S)-2-氨基环丙基)联苯-3-醇

OG-L002 是一种有效且高度选择性的 LSD1 抑制剂,IC50 为 0.02 μM。OG-L002 是一种有效的单胺氧化酶 (MAO) 抑制剂,对 MAO-A 和 MAO-B 的 IC50 分别为 1.38 μM 和 0.72 μM。OG-L002 有效抑制 HSV IE 基因的表达。

• CAS号：1357302-64-7
• 分子式：C₁₅H₁₅NO
• 分子量：225.286
• 类别：HSV

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：416.7±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：205.8±28.7 °C

BN-104

Menin-MLL inhibitor 27 能抑制 Menin-MLL 相互作用,可用于癌症的研究,如急性骨髓性白血病。

• CAS号：2938995-50-5
• 分子式：C₃₁H₃₅FN₈O₂
• 分子量：570.66
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP10-IN-3

PARP10-IN-3是一种选择性单ADP核糖基转移酶PARP10抑制剂,人PARP10的IC50为480 nM。PARP10-IN-3显示了对PARP2和PARP15的有效抑制,人PARP2和人PARP15 IC50分别为1.7μM[1]。

• CAS号：2225800-19-9
• 分子式：C₁₄H₁₂N₂O₃
• 分子量：256.26
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET bromodomain inhibitor 1

BET bromodomain inhibitor 1 是一种具有口服活性的,选择性 BET 溴结构域抑制剂,对 BRD4 的 IC50 为 2.6 nM。BET bromodomain inhibitor 1 与 BRD2(2),BRD3(2),BRD4(1),BRD4(2) 和 BRDT(2) 高亲和力结合 (Kd 值分别为 1.3 nM、1.0 nM、3.0 nM、1.6 nM、2.1 nM)。BET bromodomain inhibitor 1 具有抗癌活性。

• CAS号：2411226-02-1
• 分子式：C₂₂H₁₉F₂N₃O₄S
• 分子量：459.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-06263276

PF-06263276 (PF 6263276) 是一种有效、选择性的 pan-JAK 抑制剂,对 JAK1、JAK2、JAK3 和 TYK2 的抑制作用 IC50 值分别为 2.2 nM、23.1 nM、59.9 nM 和 29.7 nM。

• CAS号：1421502-62-6
• 分子式：C₃₁H₃₁FN₈O₂
• 分子量：566.638
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A