蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

丙炔基-十聚乙二醇

Propargyl-PEG9-OH 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG9-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2055022-35-8
• 分子式：C₂₁H₄₀O₁₀
• 分子量：452.536
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：518.0±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：267.1±28.7 °C

Propargyl-PEG4-tetra-Ac-beta-D-glucose

Propargyl-PEG4-tetra-Ac-beta-D-glucose 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1360446-31-6
• 分子式：C₂₅H₃₈O₁₄
• 分子量：562.559999999999
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG3-SS-PEG3-azide

Azido-PEG3-SS-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1310827-27-0
• 分子式：C₁₆H₃₂N₆O₆S₂
• 分子量：468.592
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HaloPROTAC 2

HaloPROTAC 2, 是一种含有氯代烷烃的 PROTAC,可诱导 HaloTag 融合蛋白的降解。

• CAS号：1799506-06-1
• 分子式：C₃₈H₅₉ClN₄O₉S
• 分子量：783.41
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

S-acetyl-PEG3-alcohol

S-acetyl-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：153870-20-3
• 分子式：C₈H₁₆O₄S
• 分子量：208.27500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Iodo-PEG4-N3

Iodo-PEG4-N3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：936917-36-1
• 分子式：C₈H₁₆IN₃O₃
• 分子量：329.135
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG24-NHS ester

Azido-PEG24-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2375600-46-5
• 分子式：C₅₅H₁₀₄N₄O₂₈
• 分子量：1269.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG6-NHS ester

Biotin-PEG6-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055045-04-8
• 分子式：C₂₉H₄₈N₄O₁₂S
• 分子量：676.78
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-4-NH-PEG1-COO(t-Bu)

Thalidomide-4-NH-PEG1-COO(t-Bu) 是 t-Bu 修饰的 Thalidomide (HY-14658),可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-4-NH-PEG1-COO(t-Bu) 末端的 t-Bu 保护基团,可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-4-NH-PEG1-COO(t-Bu) 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2140807-19-6
• 分子式：C₂₂H₂₇N₃O₇
• 分子量：445.47
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG8-Tos

Tos-PEG8-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：57436-38-1
• 分子式：C₃₀H₄₆O₁₃S₂
• 分子量：678.80800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-PEG3-alcohol

Fmoc-PEG3-醇是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：560088-66-6
• 分子式：C₂₁H₂₅NO₅
• 分子量：371.42700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.208g/cm3
• 沸点：581.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：305.5ºC

NU223612

NU223612是一种有效的PROTAC(PROTACs),其降解Kd为640nM的吲哚胺2,3-双加氧酶1(IDO1)(吲哚胺2,3-双加酶(IDO))。NU223612通过CRBN介导的蛋白酶体降解有效地降解IDO1蛋白。NU223612以290nM的亲和力与CRBN结合。NU223612可以穿过血脑屏障(BBB)[1]。

• CAS号：2759420-43-2
• 分子式：C₄₉H₅₅FN₆O₉
• 分子量：890.99
• 类别：吲哚胺2,3-二氧化酶(IDO)

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DNP-NH-PEG4-C2-Boc

DNP-NH-PEG4-C2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-31-1
• 分子式：C₂₁H₃₃N₃O₁₀
• 分子量：487.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-5-NH-PEG1-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-NH-PEG1-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-NH-PEG1-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2863634-98-2
• 分子式：C₁₇H₂₁ClN₄O₅
• 分子量：396.83
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-CH2-PEG4-Boc

Ald-CH2-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1415329-20-2
• 分子式：C₁₅H₂₈O₇
• 分子量：320.379
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：401.7±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：173.2±26.0 °C

九乙二醇一苯甲醚

Benzyl-PEG9-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：868594-48-3
• 分子式：C₂₅H₄₄O₁₀
• 分子量：504.61100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG4-acid

Boc-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2244684-38-4
• 分子式：C₁₆H₃₀O₉
• 分子量：366.40
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG12-alcohol

Azide-PEG12-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1821464-55-4
• 分子式：C₂₄H₄₉N₃O₁₂
• 分子量：571.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三聚乙二醇-乙酸

PROTAC Linker 8 (Compound 15b) 是一种 PROTAC 连接桥,可用于合成一系列 SNIPER(ER)。SNIPER(ER) 含有两个通过连接桥连接的不同配体,一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。 SNIPER(ER) 诱导细胞中靶蛋白多泛素化和蛋白酶体降解。

• CAS号：51951-05-4
• 分子式：C₈H₁₆O₆
• 分子量：208.21
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Chloro-PEG5-chloride

Chloro-PEG5-chloride 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5197-65-9
• 分子式：C₁₀H₂₀Cl₂O₄
• 分子量：275.16900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HaloPROTAC3

新型卤标记融合蛋白降解剂

• CAS号：1799506-07-2
• 分子式：C₄₁H₅₅ClN₄O₈S
• 分子量：799.42
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DSPE-PEG2-mal

DSPE-PEG2-mal 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1915739-87-5
• 分子式：C₅₅H₁₀₀N₃O₁₄P
• 分子量：1058.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amido-PEG3-C2-NH2

Pomalidomide-amido-PEG3-C2-NH2 (Cereblon Ligand-Linker Conjugates 22) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 3 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：2328070-52-4
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₈
• 分子量：476.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BSJ-04-132

BSJ-04-132 是一种有效的,选择性的基于 Ribociclib (HY-15777) 的 CDK4 降解剂 (PROTAC),对 CDK4/D1 和 CDK6/D1 的 IC50 分别为 50.6 nM 和 30 nM。BSJ-04-132 不诱导 CDK6 和 IKZF1/3 降解,具有抗癌活性。

• CAS号：2349356-39-2
• 分子式：C₄₂H₄₉N₁₁O₇
• 分子量：819.91
• 类别：CDK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-Boc

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-94-7
• 分子式：C₂₈H₅₄N₄O₁₁
• 分子量：622.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VHL Ligand 3

PROTAC的VHL配体。

• CAS号：1448189-98-7
• 分子式：C₂₇H₃₈N₄O₅S
• 分子量：530.679
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：755.7±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：410.9±32.9 °C

Boc-NH-PEG3-sulfonic acid

Boc-NH-PEG3-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-32-2
• 分子式：C₁₃H₂₇NO₈S
• 分子量：357.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PAC

PAC 是由抗体通过 linker 与 PROTAC 偶联而组成的。PAC 的详细信息请参考专利文献 WO2017201449A1 中的化合物 PAC1。与 PROTAC (无 Ab) 相比,PAC 更加显著降低雌激素受体-α (ERα) 水平。

• CAS号：2158322-33-7
• 分子式：C₉₄H₁₀₇N₁₃O₁₆
• 分子量：1674.93
• 类别：用于PAC的PROTAC-连接子共轭物

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(PEG2-C2-acid)-N-bis(PEG2-propargyl)

N-(PEG2-C2-acid)-N-bis(PEG2-propargyl) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-49-6
• 分子式：C₂₁H₃₅NO₈
• 分子量：429.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

17-十八炔酸

Alkynyl Stearic Acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：34450-18-5
• 分子式：C₁₈H₃₂O₂
• 分子量：280.445
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：400.8±18.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：142-148 °C(lit.)
• 闪点：194.7±15.9 °C