表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

I-BET567

I-BET567是一种有效的口服泛BET候选抑制剂,BRD4 BD1和BD2的PIC50分别为6.9和7.2。I-BET567已在肿瘤和炎症的小鼠模型中被证明有效[1]。

• CAS号：1887237-54-8
• 分子式：C₁₇H₁₈ClN₅O₂
• 分子量：359.81
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丁双胍盐酸盐

Buformin hydrochloride (1-Butylbiguanide hydrochloride) 是一种有效的,具有口服活性的降血糖试剂 (antidiabetic agent),是一种 AMPK 活化剂。Buformin 降低肝糖异生并降低血糖生成。Buformin 也具有抗癌活性,可以应用于癌症研究,如宫颈癌、乳腺癌等。

• CAS号：1190-53-0
• 分子式：C₆H₁₆ClN₅
• 分子量：193.67800
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：322.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：174-177ºC
• 闪点：148.9ºC

I-BRD9

I-BRD9是第一个选择性的BRD9细胞化学探针(pIC 50= 7.3)。

• CAS号：1714146-59-4
• 分子式：C₂₂H₂₂F₃N₃O₃S₂
• 分子量：497.554
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：721.0±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：389.9±35.7 °C

YF-2

YF-2 是一种高度选择性、可透过血脑屏障的组蛋白乙酰转移酶 (histone acetyltransferase) 激动剂,能够在海马区乙酰化 H3,对 CBP,PCAF 和 GCN5 的 EC50 值分别为 2.75 μM,29.04 μM 和 49.31 μM,对 HDAC 无作用。具有抗肿瘤和抗阿尔滋海默症的活性。

• CAS号：1311423-89-8
• 分子式：C₂₀H₂₂ClF₃N₂O₃
• 分子量：430.84800
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-甲基-4(1H)-喹唑啉酮

2-Methylquinazolin-4-ol 是一种高效、竞争性的 poly(ADP-ribose) synthetase 抑制剂,其 Ki 值为 1.1 μM。2-Methylquinazolin-4-ol 是哺乳动物天冬氨酸氨基转移酶 (ATCase) 抑制剂,其 IC50 值为 0.20 mM。

• CAS号：1769-24-0
• 分子式：C₉H₈N₂O
• 分子量：160.17300
• 类别：PARP

• 密度：1.26 g/cm3
• 沸点：305.4ºC at 760 mmHg
• 熔点：231-233ºC(lit.)
• 闪点：138.5ºC

伪原薯蓣皂苷

Pseudoprotodioscin,一种呋喃葡糖苷,抑制 SREBP1/2 和 microRNA 33a/b 水平,降低胆固醇和甘油三酯合成相关的基因表达。

• CAS号：102115-79-7
• 分子式：C₅₁H₈₂O₂₁
• 分子量：1031.184
• 类别：微RNA

• 密度：1.45 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 6

AMPK激活剂6(化合物GC)降低HepG2和3T3-L1细胞中的脂质含量并激活AMPK途径。AMPK激活剂6显著抑制血清中甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白-C(LDL-C)和其他生化指标的升高。AMPK激活剂6可用于研究非酒精性脂肪肝(NAFLD)和代谢综合征[1]。

• CAS号：189299-03-4
• 分子式：C₂₅H₂₈O₅
• 分子量：408.49
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PCAF-IN-2

PCAF-IN-2(化合物17)是一种有效的PCAF抑制剂,IC50值为5.31µM。PCAF-IN-2具有抗肿瘤活性。CAF-IN-2诱导细胞凋亡并将细胞周期阻滞在G2/M期[1]。

• CAS号：56173-05-8
• 分子式：C₁₀H₇F₃N₆
• 分子量：268.20
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 2

AMPK激活剂2(化合物7a)是一种含氟的丙胍衍生物,上调AMPK信号通路,下调mTOR/4EBP1/p70S6K。AMPK激活剂2抑制人类癌细胞系(UMUC3、T24、A549)的增殖和迁移[1]。

• CAS号：2410961-69-0
• 分子式：C₁₃H₁₈F₃N₅
• 分子量：301.31
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

东莨菪甙； 东莨菪苷

Scopolin 是一种从拟南芥 (Arabidopsis) 根中分离出来的香豆素。Scopolin 通过激活SIRT1 介导的信号级联反应减轻了肝脂肪变性。

• CAS号：531-44-2
• 分子式：C₁₆H₁₈O₉
• 分子量：354.309
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：650.2±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：217ºC
• 闪点：241.5±25.0 °C

LLY-507

LLY-507是有效和选择性的蛋白-赖氨酸甲基转移酶 SMYD2 抑制剂,IC50 为15 nM。

• CAS号：1793053-37-8
• 分子式：C₃₆H₄₂N₆O
• 分子量：574.758
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：790.4±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：431.8±35.7 °C

RVX-297

RVX-297 是一种高效、具有口服活性、对 BD2 有选择性的 BET 抑制剂。RVX-297 对 BRD2(BD2),BRD3(BD2),BRD4(BD2) 的 IC50 分别为 0.08、0.05、0.02 μM。RVX-297 抑制多种免疫细胞炎症基因的表达。RVX-297 对临床前模型急性炎症和自身免疫的有效。

• CAS号：1044871-04-6
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 12

AMPK激活剂12(化合物21)是有效的AMPK激活物和GDF15诱导物。AMPK激活剂12增加人肝细胞中GDF15蛋白水平[1]。

• CAS号：431920-24-0
• 分子式：C₂₃H₂₄BrNO₂
• 分子量：426.35
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tazemetostat trihydrochloride

Tazemetostat trihydrochloride (EPZ-6438 trihydrochloride) 是一种有效,选择性,口服的 EZH2 抑制剂。Tazemetostat trihydrochloride 抑制含有 PRC2 复合体的野生型 EZH2 的活性, Ki 值为 2.5 nM。Tazemetostat trihydrochloride 抑制 EZH2,在肽测定和核小体测定中 IC50 分别为 11 和 16 nM。Tazemetostat trihydrochloride 抑制大鼠 EZH2,IC50 为 4 nM。Tazemetostat trihydrochloride 还抑制 EZH1,IC50 为 392 nM。

• CAS号：1403255-00-4
• 分子式：C₃₄H₄₇Cl₃N₄O₄
• 分子量：682.12
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-4

JAK-IN-4 是一种 JAK 抑制剂的前体,在小鼠关节炎模型中具有免疫抑制作用。

• CAS号：1400877-37-3
• 分子式：C₁₈H₁₉N₄Na₂O₆P
• 分子量：464.32
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KPZ560

KPZ560 是 HDAC1 和 HDAC2 的有效抑制剂,IC50 分别为 12 nM 和 68 nM。KPZ560可以增加小鼠颗粒神经元树突的棘密度,并抑制乳腺癌细胞系 MCF 的细胞生长。

• CAS号：2397562-43-3
• 分子式：C₂₆H₂₁N₅O₃S₂
• 分子量：515.61
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Rucaparib camsylate

鲁卡帕里(AG014699)氨甲酰化物是一种口服活性、有效的PARP蛋白质抑制剂(PARP-1、PARP-2和PARP-3),PARP1的Ki为1.4 nM。鲁卡帕里布氨甲酰化酶是一种适度的己糖-6-磷酸脱氢酶(H6PD)抑制剂。鲁卡帕利酯在抗去势前列腺癌(CRPC)研究[1][2][3][4]中具有潜力。

• CAS号：1327258-57-0
• 分子式：C₁₉H₁₈FN₃O_.xC₁₀H₁₆O₄S
• 分子量：
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIRT2-IN-10

SIRT2-IN-10(化合物12)是一种有效的SIRT2抑制剂,IC50为1.3μM。SIRT2-IN-10可用于癌症和神经退行性疾病的研究[1]。

• CAS号：296793-09-4
• 分子式：C₂₈H₂₁N₅OS
• 分子量：475.56
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 7

AMPK活化剂7(化合物I-3-24)是EC50为8.8 nM的AMPK激活剂。AMPK激活剂7可用于研究涉及AMPK的疾病,特别是2型糖尿病、高血糖、代谢综合征、肥胖、高胆固醇血症和/或高血压等疾病[1]。

• CAS号：1623138-03-3
• 分子式：C₂₃H₂₂F₃N₃O₅
• 分子量：477.43
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

奥拉帕尼

Olaparib (AZD2281; KU0059436) 是一种有效的 PARP 抑制剂,抑制 PARP-1 和 PARP-2 的 IC50 分别为 5 和 1 nM。

• CAS号：763113-22-0
• 分子式：C₂₄H₂₃FN₄O₃
• 分子量：434.463
• 类别：自噬

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CMP-5

CMP-5(PRMT5-IN-5)是一种一流的小分子PRMT5特异性抑制剂,可阻断EBV驱动的B淋巴细胞转化和存活,对正常B细胞无影响；对其他I型无活性(PRMT1和PRMT4)和II型(PRMT7)酶；PRMT5的抑制导致miR96启动子上PRMT5/p65/HDAC3抑制复合物的募集丧失,miR96表达恢复和PRMT5下调。

• CAS号：880813-42-3
• 分子式：C₂₁H₂₁N₃
• 分子量：315.411
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：505.1±48.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：259.3±29.6 °C

KAT modulator-1

KAT调节剂-1(化合物3)是KAT调节剂。KAT调节剂-1可以与p300全长相互作用,但不能与催化结构域相互作用。KAT调节剂-1可用于表观遗传学研究[1]。

• CAS号：1314006-43-3
• 分子式：C₂₀H₃₆O₂
• 分子量：308.50
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(SER25)-PROTEIN KINASE C (19-31)

[Ser25]蛋白激酶C(19-31)是蛋白激酶C的底物(Km:0.3μM)。[Ser25]蛋白激酶C(19-31)源自PKCα(19-31)的伪底物调节结构域,25位的丝氨酸取代了野生型丙氨酸[1]。

• CAS号：136795-05-6
• 分子式：C₆₇H₁₁₈N₂₆O₁₇
• 分子量：1559.818
• 类别：PKC

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DPPY

DPPY(化合物6)是一种有效的PTK抑制剂,对于EGFR、BTK和JAK3,IC50值分别为<10、<10、<10 nM。DPPY对B细胞淋巴瘤细胞具有抗增殖活性。DPPY具有研究特发性肺纤维化的潜力[1]。

• CAS号：2095883-62-6
• 分子式：C₂₅H₂₆ClN₇O₃
• 分子量：507.97
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1

PF-CBP1是CREB结合蛋白溴多糖的高选择性抑制剂[1]。

• CAS号：1962928-21-7
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃
• 分子量：488.621
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：673.5±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：361.1±31.5 °C

TK4g

TK4g是一种Janus激酶(JAK)抑制剂,JAK2和JAK3的IC50值分别为12.61 nM和15.80 nM。TK4g可用于淋巴源性疾病和白血病癌症研究[1]。

• CAS号：2232890-86-5
• 分子式：C₁₉H₁₉N₃O₄S
• 分子量：385.44
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

cis-MZ 1

顺式MZ 1是MZ 1的阴性对照(HY-107425)。顺式MZ 1是针对BRD4[1]的PROTAC。

• CAS号：1797406-72-4
• 分子式：C₄₉H₆₀ClN₉O₈S₂
• 分子量：1002.64
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

7-氧代星形孢菌素

7-Oxostarosporine是一种有效的蛋白激酶C(PKC)抑制剂,通过诱导细胞凋亡和抑制核因子(NF)-κB/p-p65途径有效抑制肿瘤生长[1][2]。

• CAS号：125035-83-8
• 分子式：C₂₈H₂₄N₄O₄
• 分子量：480.51500
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PJ34(游离)

PJ34 是一种有效的特异性 PARPl/2 抑制剂,IC50 分别为 110 nM 和 86 nM。

• CAS号：344458-19-1
• 分子式：C₁₇H₁₇N₃O₂
• 分子量：295.336
• 类别：PARP

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：453.3±38.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：227.9±26.8 °C

GSK2879552 dihydrochloride

GSK2879552 dihydrochloride是一种可口服的,不可逆的 LSD1/ KDM1A 抑制剂,具有抗肿瘤活性。

• CAS号：1902123-72-1
• 分子式：C₂₃H₃₀Cl₂N₂O₂
• 分子量：437.40
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A