表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

CHR-3996

Nanatinostat (CHR-3996) 是一种有效的,有口服活性、I 类选择性的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂,IC50 值为 8 nM。

• CAS号：1256448-47-1
• 分子式：C₂₀H₁₉FN₆O₂
• 分子量：394.40
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1盐酸盐

PF-CBP1盐酸盐是一种CREB结合蛋白溴区的高度选择性抑制剂。

• CAS号：2070014-93-4
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃·HCl
• 分子量：525.08
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZIKV-IN-2

ZIKV-IN-2(化合物3a)是一种有效的ZIKV NS5甲基转移酶(MTase)抑制剂,IC50值为38.86μM。ZIKV-IN-2抑制ZIKV复制和感染。ZIKV-IN-2可用于寨卡病毒(ZIKV)的研究[1]。

• CAS号：910582-16-0
• 分子式：C₃₉H₄₂O₄
• 分子量：574.75
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

米托蒽醌

Mitoxantrone是拓扑异构酶II (topoisomerase II)的抑制剂；也可抑制蛋白激酶C (PKC), IC50值为8.5 μM。

• CAS号：65271-80-9
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₆
• 分子量：444.481
• 类别：拓扑异构酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：805.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：170-174ºC
• 闪点：441.1±34.3 °C

GSK097

GSK097是一种有效且选择性的溴代烷和BET蛋白第二溴代烷(BD2)抑制剂。GSK097对BD2的选择性是BD1的2000倍(BRD4数据),在FaSSIF介质中的溶解度大于1mg/mL[1]。

• CAS号：2159137-02-5
• 分子式：C₁₉H₂₁N₃O₃
• 分子量：339.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

伊他替尼

Itacitinib 是一种有效的,选择性的 JAK1 抑制剂,对其选择性是对 JAK2 的 20 多倍,JAK3 和 TYK2 的 100 多倍。

• CAS号：1334298-90-6
• 分子式：C₂₆H₂₃F₄N₉O
• 分子量：553.51400
• 类别：JAK

• 密度：1.57±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-JQ1 PA

(+)-JQ1 PA 是溴结构域和额外末端结构域 (BET) 抑制剂 JQ1 的衍生物,其 IC50 值为 10.4 nM。

• CAS号：2115701-93-2
• 分子式：C₂₂H₂₀ClN₅OS
• 分子量：437.95
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Momelotinib-3,3,5,5-d6

莫梅洛替尼-3,3,5,5-d6(CYT387-3,3,1,5,4-d6)是氘标记的莫梅洛替尼(HY-10961)。莫莫替尼对JAK1/JAK2具有抑制活性[1][2]。

• CAS号：1619927-67-1
• 分子式：C₂₃H₁₆D₆N₆O₂
• 分子量：420.50
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

托法替尼

Tofacitinib是 JAK1/2/3 抑制剂,IC50 分别为1,20 和 112 nM。

• CAS号：477600-75-2
• 分子式：C₁₆H₂₀N₆O
• 分子量：312.370
• 类别：JAK

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：585.8±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：308.1±30.1 °C

GNE-781

GNE-781 是一种高效的选择性 CBP 抑制剂,在 TR-FRET 实验中 IC50 为 0.94 nM。GNE-781 还抑制 BRET 和 BRD4 (1),IC50 分别为 6.2 nM 和 5100 nM。

• CAS号：1936422-33-1
• 分子式：C₂₇H₃₃F₂N₇O₂
• 分子量：525.59
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GNE-272

GNE-272是有效和选择性的 CBP/EP300 溴结构域体内探针,对CBP,EP300 和 BRD4的IC50 值分别为0.02,0.03 和 13 μM。

• CAS号：1936428-93-1
• 分子式：C₂₂H₂₅FN₆O₂
• 分子量：424.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-4950834

PF-4950834是一种有效的、选择性的、口服生物利用的ATP竞争性rho激酶抑制剂,对ROCK2和ROCK1的IC50值分别为8.35 nM和33.12 nM。PF-4950834抑制中性粒细胞迁移[1]。

• CAS号：1256264-62-6
• 分子式：C₂₁H₁₉N₃O₂
• 分子量：345.39
• 类别：岩石

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丁福明

Buformin (1-Butylbiguanide) 是一种有效的,具有口服活性的降血糖试剂 (antidiabetic agent),是一种 AMPK 活化剂。Buformin 降低肝糖异生并降低血糖生成。Buformin 也具有抗癌活性,可以应用于癌症研究,如宫颈癌、乳腺癌等。

• CAS号：692-13-7
• 分子式：C₆H₁₅N₅
• 分子量：157.21700
• 类别：AMPK

• 密度：1.22g/cm3
• 沸点：322.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：148.9ºC

TX-1123

TX-1123是Src、eEF2-K、PKA和EGFR-K/PKC的有效蛋白酪氨酸激酶(PTK)抑制剂。TX-1123是一种环氧化酶(COX)抑制剂,COX2和COX1的IC50值分别为1.16μM和15.7μM。TX-1123具有低线粒体毒性。TX-1123可用于癌症研究[1][2]。

• CAS号：157397-06-3
• 分子式：C₂₀H₂₄O₃
• 分子量：312.40300
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EPZ031686

EPZ031686是可口服的 SMYD3 抑制剂,IC50 为3 nM。

• CAS号：1808011-22-4
• 分子式：C₂₆H₃₄ClF₃N₄O₄S
• 分子量：591.086
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

P300/CBP-IN-3

P300/CBP-IN-3, a p300/CBP 组蛋白乙酰转移酶 (histone acetyltransferase) 抑制剂,化合物 6,来源于专利 WO 2019049061 A1。

• CAS号：2299226-01-8
• 分子式：C₂₄H₂₉N₇O
• 分子量：431.53
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：1.23±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SNIPER(BRD)-1

SNIPER(BRD)-1 由 IAP 拮抗剂 LCL-161 衍生物和 BET 抑制剂 (+)-JQ-1,通过 linker 连接组成。SNIPER(BRD)-1 通过泛素-蛋白酶体系统诱导 BRD4 降解。SNIPER(BRD)-1 也降解 cIAP1,cIAP2 和 XIAP,IC50 分别为 6.8 nM,17 nM 和 49 nM。

• CAS号：2095244-54-3
• 分子式：C₅₃H₆₆ClN₉O₈S₂
• 分子量：1056.73
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SPV 106

SPV106是组蛋白乙酰化酶(HAT)和GCN5相关的N-乙酰转移酶(GNAT)激活剂。SPV106可用于2型糖尿病(T2D)的研究[1]。

• CAS号：1036939-38-4
• 分子式：C₂₂H₄₀O₄
• 分子量：368.55100
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP/PI3K-IN-1

PARP/PI3K-IN-1 (化合物 15) 是一种有效的 PARP/PI3K 抑制剂,对 PARP-1,PARP-2,PI3Kα,PI3Kβ,PI3Kδ 和 PI3Kγ 的 pIC50 值分别为 8.22、8.44、8.25、6.54、8.13、6.08。PARP/PI3K-IN-1 是针对多种肿瘤疾病的高效抗癌化合物。

• CAS号：2337386-47-5
• 分子式：C₃₃H₂₈F₄N₈O₃
• 分子量：660.62
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KR-39038

KR-39038是一种口服有效的GRK5(G蛋白偶联受体激酶5)抑制剂,IC50为0.02μM。KR-39038通过抑制新生儿心肌细胞中的HDAC5途径显著抑制血管紧张素II诱导的细胞肥大。KR-39038显示出深刻的抗肥大作用和改善心功能。KR-39038可用于心力衰竭研究[1]。

• CAS号：2770300-35-9
• 分子式：C₂₄H₃₂ClFN₆O
• 分子量：475.00
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aviculin

Aviculin是一种木脂素糖苷,是一种有效的抗癌剂。Aviculin将MCF-7细胞的代谢活性降低到50%以下,IC50为75.47μM。Aviculin通过内在凋亡途径诱导乳腺癌细胞凋亡。Aviculin增加启动子caspase-9、执行子caspase-7和聚(ADP核糖)聚合酶(PARP)的表达。Aviculin显示Bax/Bcl-2比率增加[1]。

• CAS号：156765-33-2
• 分子式：C₂₆H₃₄O₁₀
• 分子量：506.54
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CeMMEC2

CeMMEC2是一种新型有效的BRD4抑制剂,IC50为0.9 uM,与BRD4的两个溴结构域结合,与(S)-JQ1相当。

• CAS号：902955-25-3
• 分子式：C₁₄H₁₉N₅
• 分子量：257.334
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4-binding moiety 1

PROTAC BRD4-binding moiety 1 是 BRD4 的配体。PROTAC BRD4-binding moiety 1 通过 linker 结合到 cereblon 配体上形成 PROTAC 以降解 BRD4 (HY-133136)。

• CAS号：2101200-10-4
• 分子式：C₂₃H₂₁N₃O₂
• 分子量：371.43
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RTS-V5

RTS-V5是HDAC/蛋白酶体的抑制剂,对HDAC1,HDAC2,HDAC3,HDAC6,HDAC8的IC50分别为6.9,18,15,0.27,0.53 μM。

• CAS号：2285346-31-6
• 分子式：C₂₇H₃₅N₅O₆
• 分子量：525.60
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Momelotinib-3,3,5,5-d4

莫梅洛替尼-3,3,5,5-d4(CYT387-3,3,1,5,4-d4)是氘标记的莫梅洛替尼(HY-10961)。莫莫替尼对JAK1/JAK2具有抑制活性[1][2]。

• CAS号：1619927-66-0
• 分子式：C₂₃H₁₈D₄N₆O₂
• 分子量：418.48
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4'-溴-白藜芦醇

4’-溴白藜芦醇是一种有效的双重抑制剂Sirtuin-1和Sirtuin-3。4'-溴白藜芦醇通过线粒体代谢重编程抑制黑色素瘤细胞生长。4’-溴-白藜芦醇通过代谢重编程并影响细胞周期和凋亡信号传导,在黑色素瘤细胞中发挥抗增殖作用【1】。

• CAS号：1224713-90-9
• 分子式：C₁₄H₁₁BrO₂
• 分子量：291.14000
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Miravirsen

Miravirsen(SPC-3649),一种β-d-氧锁核酸修饰的硫代磷酸反义寡核苷酸,抑制miR-122的生物发生。Miravirsen(SPC-3649)用于研究HCV感染[1]。

• CAS号：1072874-90-8
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(-)-曲古柳菌素A

(S)-Trichostatin A ((S)-TSA) 是一种 HDAC6 选择性抑制剂,对斑马鱼 HDAC6 和人 HDAC6 的 IC50 值分别为 9.88 nM和 11.1 nM。(S)-Trichostatin A 弱抑制其他人 HDAC。

• CAS号：122292-85-7
• 分子式：C₁₇H₂₂N₂O₃
• 分子量：302.36800
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4抑制剂-10

BRD4 Inhibitor-10 是一种有效的 BRD4-BD1 抑制剂,IC50 为 8 nM。详细信息请参考专利文献 WO2015022332A1 中 的化合物 II-25。

• CAS号：1660117-38-3
• 分子式：C₂₅H₂₇N₅O₂
• 分子量：429.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(4-氯-3-(三氟甲基)苯基)-2-乙氧基苯甲酰胺

CTB(霍乱毒素B亚单位)是一种有效的p300组蛋白乙酰转移酶激活剂[1]。CTB能有效诱导MCF-7细胞凋亡[2]。

• CAS号：451491-47-7
• 分子式：C₁₆H₁₃ClF₃NO₂
• 分子量：343.73
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A