蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

PROTAC ERRα Degrader-2

PROTAC ERRalpha Degrader-2 包含 MDM2 配体结合基团,linker 和雌激素相关受体α (ERRa) 配体结合基团。PROTAC ERRalpha Degrader-2 是一种 ERRa 降解剂。

• CAS号：2306388-85-0
• 分子式：C₅₇H₅₅Cl₂F₆N₇O₈
• 分子量：1150.99
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C4-COOH

沙利度胺-O-C4-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2169266-67-3
• 分子式：C₁₈H₁₈N₂O₇
• 分子量：374.34
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3,6,9,12,15,18,21,24,27-九氧杂二十八烷酸

m-PEG8-CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：102013-72-9
• 分子式：C₁₉H₃₈O₁₁
• 分子量：442.49800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.122
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRAF-V600E degrader-2

PROTAC BRAF-V600E降解剂-2(化合物12)是一种强效的BRAF-V600 E降解剂,其对于BRAF和BRAF-V6100E的Kds分别为14.4 nM和9.5 nM。PROTAC BRAF-V600E降解器-2选择性降解BRAF-V600 E的激酶结构域,但不降解野生型BRAF。PROTAC BRAF-V600E降解物-2抑制黑色素瘤细胞生长[1]。

• CAS号：2417296-82-1
• 分子式：C₄₂H₃₉F₂N₇O₈S
• 分子量：839.86
• 类别：拉夫

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-Aminooxy-PEG3-acid

Boc-Aminooxy-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-82-4
• 分子式：C₁₄H₂₇NO₈
• 分子量：337.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromoacetamido-PEG2-C2-NHS ester

Bromoacetamido-PEG2-C2-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1353011-78-5
• 分子式：C₁₃H₁₉BrN₂O₇
• 分子量：395.203
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成 (参考文献中的化合物 DL7-TL)。

• CAS号：1950635-15-0
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₆
• 分子量：458.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG4-NHS ester

Biotin-PEG4-NHS ester 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：459426-22-3
• 分子式：C₂₅H₄₀N₄O₁₀S
• 分子量：588.671
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Active-mono-sulfone-PEG8-acid

Active-mono-sulfone-PEG8-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055048-45-6
• 分子式：C₃₇H₅₃NO₁₄S
• 分子量：767.88
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD9 Degrader-6

PROTAC BRD9降解剂-6是BRD9的强效降解剂(IC50=0.13 nM),可用于BAF复合物相关疾病的研究[1]。

• CAS号：2676211-62-2
• 分子式：C₄₇H₅₆N₈O₆
• 分子量：829.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JPS035

JPS035是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS035降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS035是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

• CAS号：2669785-84-4
• 分子式：C₄₉H₆₅N₇O₇S
• 分子量：896.15
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

马来酰亚胺-PEG4-NHS酯

Mal-amido-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：756525-99-2
• 分子式：C₂₂H₃₁N₃O₁₁
• 分子量：513.49500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.36±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cl-PEG4-acid

Cl-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：158553-98-1
• 分子式：C₁₀H₁₉ClO₆
• 分子量：270.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS-PEG1-THP

MS-PEG1-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1309248-13-2
• 分子式：C₈H₁₆O₅S
• 分子量：224.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-NHS ester

TCO-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1191901-33-3
• 分子式：C₁₃H₁₇NO₅
• 分子量：267.278
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：369.1±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：177.0±28.7 °C

N-Boc-N-bis(C2-PEG1-azide)

N-Boc-N-bis(C2-PEG1-azide) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-79-2
• 分子式：C₁₃H₂₅N₇O₄
• 分子量：343.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-CH2-PEG5-Boc

Ald-CH2-PEG5-Boc是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可以用于合成 PROTAC。

• CAS号：1446282-23-0
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.431
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：440.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：189.0±27.4 °C

N-(Boc-PEG2)-N-bis(PEG3-azide)

N-(Boc-PEG2)-N-bis(PEG3-azide) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-46-6
• 分子式：C₂₈H₅₃N₇O₁₁
• 分子量：663.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Brigatinib C

Brigatinib C是一种连接子,作为PROTAC连接子的一部分,靶向HJM-561(HY-156698)。

• CAS号：1197958-75-0
• 分子式：C₂₈H₃₇ClN₇O₂P
• 分子量：570.07
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Acid-C1-PEG5-Boc

Acid-C1-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2304558-22-1
• 分子式：C₁₇H₃₂O₉
• 分子量：380.43
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-十二聚乙二醇-羧酸

炔丙基聚乙二醇酸是一种基于聚乙二醇的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1421676-62-1
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-PEG27-amine

Amino-PEG27-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2252208-09-4
• 分子式：C₅₆H₁₁₆N₂O₂₇
• 分子量：1249.52
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG4-acid

TCO-PEG4-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG4-acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1802913-21-8
• 分子式：C₂₀H₃₅NO₈
• 分子量：417.494
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：574.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：301.2±30.1 °C

PROTAC ERRα Degrader-1

PROTAC ERRalpha Degrader-1 包含 MDM2 配体结合基团,linker 和雌激素相关受体 α (ERRa) 配体结合基团。PROTAC ERRalpha Degrader-1 是一种 ERRa 降解剂。

• CAS号：2306388-84-9
• 分子式：C₅₄H₄₉Cl₂F₆N₇O₈
• 分子量：1108.91
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Carboxy-PEG4-sulfonic acid

Carboxy-PEG4-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-25-3
• 分子式：C₁₁H₂₂O₉S
• 分子量：330.35
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-​PEG4-​propargyl

Mal-​PEG4-​propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1262681-30-0
• 分子式：C₁₅H₂₁NO₆
• 分子量：311.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH-bis(PEG2-C2-acid)

NH-bis(PEG2-C2-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1919044-99-7
• 分子式：C₁₄H₂₇NO₈
• 分子量：337.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 17

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 17 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：1950635-16-1
• 分子式：C₂₅H₃₁F₃N₄O₈
• 分子量：572.53
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EZH2 Degrader-1

PROTAC EZH2降解剂-1(化合物150d)是一种有效的PROTAC AZH2分解剂,其IC50为2.7nM,对EZH2甲基转移酶活性具有抑制作用。EZH2在许多肿瘤的发生和发展过程中起着重要作用[1]。

• CAS号：2641601-67-2
• 分子式：C₅₄H₆₇N₇O₈
• 分子量：942.15
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG5-Boc

Hydroxy-PEG6-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：850090-09-4
• 分子式：C₁₇H₃₄O₈
• 分子量：366.44700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A