蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

PROTAC BRD9 Degrader-4

PROTAC BRD9降解剂-4是一种用于治疗癌症的BRD9双功能降解剂。

• CAS号：2633632-34-3
• 分子式：C₄₂H₄₉FN₆O₇
• 分子量：768.87
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-4-O-C10-COOH

沙利度胺-4-O-C10-COOH是一种E3连接酶-配体-连接物共轭物,可用于合成普罗塔克。

• CAS号：2379870-45-6
• 分子式：C₂₄H₃₀N₂O₇
• 分子量：458.50
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HO-PEG20-OH

HO-PEG20-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：351342-08-0
• 分子式：C₄₀H₈₂O₂₁
• 分子量：899.07
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-((17-氨基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐

Pomalidomide-PEG5-C2-NH2 hydrochloride 是一种基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体,用于募集 cereblon 蛋白。Pomalidomide-PEG5-C2-NH2 hydrochloride 可通过 linker 连接到蛋白质配体上形成 PROTAC。

• CAS号：2357117-23-6
• 分子式：C₂₅H₃₇ClN₄O₉
• 分子量：573.04
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG3-CH2COOtBu

Tos-PEG3-CH2COOtBu 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1530778-24-5
• 分子式：C₁₉H₃₀O₈S
• 分子量：418.502
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：517.7±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：266.9±28.7 °C

m-PEG2-4-nitrophenyl carbonate

m-PEG2-4-nitrophenyl carbonate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：105108-59-6
• 分子式：C₁₂H₁₅NO₇
• 分子量：285.25
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-四聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Amino-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：581065-95-4
• 分子式：C₁₅H₃₁NO₆
• 分子量：321.41000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.040±0.06 g/cm3
• 沸点：400.1±35.0 ºC (760 Torr)
• 熔点：N/A
• 闪点：114.1±22.3 ºC

N-(Azido-PEG3)-N-Fluorescein-PEG4-acid

N-(Azido-PEG3)-N-Fluorescein-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-72-5
• 分子式：C₄₀H₄₉N₅O₁₄S
• 分子量：855.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-[2-(3-乙氧基-3-羰基丙氧基)-乙氧基]-丙酸

Acid-PEG2-ethyl propionate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：886362-90-9
• 分子式：C₁₀H₁₈O₆
• 分子量：234.24600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.145g/cm3
• 沸点：370.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：139.5ºC

5-((3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-N-(丙-2-炔-1-基)戊酰胺

生物素炔烃是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：773888-45-2
• 分子式：C₁₃H₁₉N₃O₂S
• 分子量：281.37400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.185±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：614.8±50.0 °C(Predicted)
• 熔点：169-170 °C
• 闪点：N/A

ARD-1676

ARD-1676 是口服有效的雄激素受体 (AR) PROTAC 降解剂,由 AR 配体和 cereblon 配体组成。ARD-1676 具有体内外降解 AR 的活性,可在小鼠异种移植肿瘤模型中抑制 VCaP 肿瘤生长。

• CAS号：2632305-36-1
• 分子式：C₄₄H₄₆ClN₇O₅
• 分子量：788.33
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KRAS G12D inhibitor 17

KRAS G12D抑制剂17(实施例8)是喹唑啉连接的(4R)-4-羟基-L-丙酰胺化合物,诱导G12D突变KRAS蛋白降解[1]。

• CAS号：2821793-99-9
• 分子式：C₆₀H₆₅FN₁₂O₇S
• 分子量：1117.30
• 类别：拉斯

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG5-C2-acid

Cbz-NH-PEG5-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-74-6
• 分子式：C₂₁H₃₃NO₉
• 分子量：443.488
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：599.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：316.3±30.1 °C

Phenol-amido-C1-PEG3-N3

PROTAC Linker 21 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 21 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：1096439-18-7
• 分子式：C₁₄H₂₀N₄O₅
• 分子量：324.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4,7,10,13,16,19,22-七氧杂二十三烷酸

m-PEG6-CH2CH2COOH 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：874208-91-0
• 分子式：C₁₆H₃₂O₉
• 分子量：368.42000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 dihydrochloride

(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 dihydrochloride (VH032-C6-NH2 dihydrochloride) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 VH032 的 VHL 配体和 1 个 linker。(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 hydrochloride 可用于合成靶向 AKT 的 PROTAC 降解剂,例 6,XF038-161A,源于专利文献 WO2019173516A1。

• CAS号：2341796-77-6
• 分子式：C₂₉H₄₅Cl₂N₅O₄S
• 分子量：630.67
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-CH2-Boc

VH032-CH2-Boc 是 Boc 修饰的 VH032 (HY-120217),可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032-CH2-Boc 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032-CH2-Boc 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2827750-24-1
• 分子式：C₃₀H₄₂N₄O₆S
• 分子量：586.74
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thiol-PEG3-NHBoc

巯基-PEG3-NHBoc是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1895922-68-5
• 分子式：C₁₃H₂₇NO₅S
• 分子量：309.422
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：419.4±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：207.5±27.3 °C

Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP

Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP 是一种可降解 (cleavable) 的含 3 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055047-18-0
• 分子式：C₃₄H₄₇N₉O₁₂
• 分子量：773.79
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-氨基十一酸

11-Aminoundecanoic acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。11-Aminoundecanoic acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2432-99-7
• 分子式：C₁₁H₂₃NO₂
• 分子量：201.306
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：334.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：188-191 °C(lit.)
• 闪点：156.3±20.4 °C

(S,R,S)-AHPC-3-methylbutanyl acetate-methanesulfonothioate-PEG3-NH2 TFA

(S,R,S)-AHPC-3-甲基丁酰基乙酸酯-甲磺基硫代磷酸酯-PEG3-NH2 TFA是一种合成的E3连接酶配体-接头缀合物,结合了PROTAC技术中使用的(S,S,R)-AHPC基配体和3单元PEG接头[1]。

• CAS号：2417370-48-8
• 分子式：C₃₈H₅₆F₃N₅O₁₃S₃
• 分子量：944.07
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-amido-C11-COOH

Thalidomide-O-amido-C11-COOH (化合物 IMiD acid 1) 是一种 E3 连接酶配体和连接子 CRBN (Cereblon) 偶联物。Thalidomide-O-amido-C11-COOH 可用于合成靶向降解 DOT1L 的 PROTAC。

• CAS号：2473270-96-9
• 分子式：C₂₇H₃₅N₃O₈
• 分子量：529.58
• 类别：用于PAC的PROTAC-连接子共轭物

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-Boc-氮杂环丁烷-3-羧酸

1-Boc-氮杂环丁-3-羧酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。1-Boc-azetidine-3-羧酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：142253-55-2
• 分子式：C₉H₁₅NO₄
• 分子量：201.220
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：321.0±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：100.1-101.9°C
• 闪点：147.9±25.9 °C

m-PEG6-Ms

m-PEG6-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：130955-39-4
• 分子式：C₁₄H₃₀O₉S
• 分子量：392.46300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-C9-NH2 hydrochloride

Thalidomide-NH-C9-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-NH-C9-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2305936-77-8
• 分子式：C₂₂H₃₁ClN₄O₄
• 分子量：450.96
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromoacetamido-PEG3-NH-Boc

Bromoacetamido-PEG3-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421933-39-2
• 分子式：C₁₅H₂₉BrN₂O₆
• 分子量：413.305
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：543.8±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：282.7±30.1 °C

Bromo-PEG2-MS

Bromo-PEG2-MS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1935075-34-5
• 分子式：C₅H₁₁BrO₄S
• 分子量：247.11
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氧基)乙酸叔丁酯

Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 是t-Bu 修饰的 Thalidomide (HY-14658),是合成 Thalidomide-4-OH (HY-123096) 的最后一步中间体。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 末端的 t-Bu 保护基团,可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：1950635-36-5
• 分子式：C₁₉H₂₀N₂O₇
• 分子量：388.37
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG4-CH2COOH

m-PEG4-CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：16024-66-1
• 分子式：C₁₁H₂₂O₇
• 分子量：266.28800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.125g/cm3
• 沸点：379.6ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：137.1ºC

Bis-PEG3-acid

Bis-PEG3-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG3-acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：96517-92-9
• 分子式：C₁₀H₁₈O₇
• 分子量：250.24600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A