蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚-4-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基叔丁基)氨基甲酸酯

Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 是一种 E3 连接酶配体与连接子的缀合物,由 Thalidomide (HY-14658) 和 NH-PEG3-NH-Boc 构成。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 末端的 Boc 保护基团可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2204246-03-5
• 分子式：C₂₆H₃₆N₄O₉
• 分子量：548.59
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG1-C2-methylamine

Azido-PEG1-C2-methylamine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-88-0
• 分子式：C₅H₁₂N₄O
• 分子量：144.17
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG8-TCO

TCO-PEG8-TCO 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG8-TCO 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-67-1
• 分子式：C₃₆H₆₄N₂O₁₂
• 分子量：716.90
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG2-hydrazide-Boc

Azido-PEG2-hydrazide-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-56-5
• 分子式：C₁₂H₂₃N₅O₅
• 分子量：317.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-乙二醇-丙酸叔丁酯

Azido-PEG2-C2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1271728-79-0
• 分子式：C₁₁H₂₁N₃O₄
• 分子量：259.302
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-Me-decanedioic acid

(S,R,S)-AHPC Me癸二酸是一种E3连接酶-配体-连接物共轭物,可用于合成PROTAC。

• CAS号：2380273-45-8
• 分子式：C₃₃H₄₈N₄O₆S
• 分子量：628.82
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(m-PEG4)-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5

N-(m-PEG4)-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-12-9
• 分子式：C₄₀H₅₇ClN₂O₇
• 分子量：713.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG12-NHS ester

Mal-amido-PEG12-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2101722-60-3
• 分子式：C₃₈H₆₃N₃O₁₉
• 分子量：865.92
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG1-NH2-1 hydrochloride

波马度胺-PEG1-NH2盐酸盐是一种交联剂-E3连接酶配体缀合物,由E3连接酶配位体波马度酰胺和具有末端胺的聚乙二醇化交联剂组成,用于与目标配体上的羧基反应[1]。

• CAS号：2380273-67-4
• 分子式：C₁₇H₁₉ClN₄O₆
• 分子量：410.81
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-PEG2-NH2

沙利度胺-PEG2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：1957235-94-7
• 分子式：C₁₇H₁₉N₃O₆
• 分子量：361.35
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JH-XII-03-02

JH-XII-03-02是一种有效的选择性LRRK2 PROTAC降解剂。JH-XII-03-02可用于帕金森研究。

• CAS号：2415900-86-4
• 分子式：C₄₃H₅₁N₉O₁₀
• 分子量：853.92
• 类别：LRRK2

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG8-NHS ester

Mal-amido-PEG8-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：756525-93-6
• 分子式：C₃₀H₄₇N₃O₁₅
• 分子量：689.70500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG5-NHS ester

m-PEG5-NHS ester 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：874208-94-3
• 分子式：C₁₆H₂₇NO₉
• 分子量：377.38700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-Piperazine-Piperidine

沙利度胺哌嗪哌啶是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基塞伦配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2229716-11-2
• 分子式：C₂₂H₂₇N₅O₄
• 分子量：425.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Hydroxy-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Hydroxy-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112734-70-8
• 分子式：C₃₈H₇₅NO₁₆
• 分子量：802.00
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-38-9
• 分子式：C₄₂H₆₂ClN₅O₈
• 分子量：800.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide 是一种合成的 E3 ligase ligand-linker conjugate,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 6 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：1835705-74-2
• 分子式：C₃₁H₄₄IN₃O₁₁
• 分子量：761.60
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KB02-JQ1

KB02-JQ1 是一种高选择性的基于 PROTAC 的 BRD4 降解剂 (molecular glue),但不降解 BRD2 或 BRD3。 KB02-JQ1 通过共价修饰 DCAF16 (E3 ligase) 促进 BRD4 降解,并可以提高生物系统中蛋白质降解的持久性。KB02-JQ1 由 JQ1 与泛素 E3 连接酶配体 (KB02) 通过 linker 连接而成。

• CAS号：2384184-44-3
• 分子式：C₃₈H₄₃Cl₂N₇O₆S
• 分子量：796.76
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AD4

AD4 是一种青蒿素衍生物,是靶向 PCLAF 的蛋白水解靶向嵌合体 (PROTACs)。AD4 可有效降解 RS4;11 细胞中的 PCLAF (IC50: 0.6 nM),从而激活 p21/Rb 轴,发挥抗肿瘤活性。AD4 还延长 RS4;11 移植的 NOD/SCID 小鼠的存活时间,具有体内效力。

• CAS号：2918262-09-4
• 分子式：C₅₅H₇₈N₄O₁₅
• 分子量：1035.23
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-84-8
• 分子式：C₂₄H₂₇F₅N₂O₉
• 分子量：582.47
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C6-COOH

沙利度胺-O-C6-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2169266-69-5
• 分子式：C₂₀H₂₂N₂O₇
• 分子量：402.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-五聚乙二醇-甲磺酸酯

Benzyl-PEG5-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807539-07-6
• 分子式：C₁₈H₃₀O₈S
• 分子量：406.491
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：529.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：274.0±30.1 °C

Cbz-PEG2-bromide

Cbz-PEG2-溴化物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2100283-00-7
• 分子式：C₁₄H₂₀BrNO₄
• 分子量：346.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1260092-43-0
• 分子式：C₁₂H₁₅NO₅
• 分子量：253.25100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

22-溴-2,5,8,11,14,17,20-七氧杂二十二烷

m-PEG7-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：104518-25-4
• 分子式：C₁₅H₃₁BrO₇
• 分子量：403.30600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-PEG9-amine

Amino-PEG9-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：474082-35-4
• 分子式：C₂₀H₄₄N₂O₉
• 分子量：456.571
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：527.4±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：263.9±22.4 °C

3-[3-[2-(生物素酰胺)乙基]氨基-3-氧代丙基]二硫基]丙酸琥珀酰亚胺酯

Biotin-bis-amido-SS-NHS 是一种基于 Alkyl/ether 结构的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：142439-92-7
• 分子式：C₂₂H₃₃N₅O₇S₃
• 分子量：575.72200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.43
• 沸点：N/A
• 熔点：129-131ºC
• 闪点：N/A

Ms-PEG3-CH2CH2COOH

Ms-PEG3-CH2CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2306832-21-1
• 分子式：C₁₀H₂₀O₈S
• 分子量：300.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG6-NHS ester

Azido-PEG6-NHS ester 是一种可降解 (cleavable) 的含 6 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG6-NHS ester 也是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055014-64-5
• 分子式：C₁₉H₃₂N₄O₁₀
• 分子量：476.48
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG24-alcohol

m-PEG24-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2376450-73-4
• 分子式：C₄₉H₁₀₀O₂₅
• 分子量：1089.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A