蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

m-PEG3-Sulfone-PEG3-azide

m-PEG3-Sulfone-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1895922-76-5
• 分子式：C₁₅H₃₁N₃O₈S
• 分子量：413.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇

Hexaethylene glycol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2615-15-8
• 分子式：C₁₂H₂₆O₇
• 分子量：282.331
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：378.3±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：5-7 °C(lit.)
• 闪点：193.7±26.5 °C

C6-Bis-phosphoramidic acid diethyl ester

C6-Bis-phosphoramidic acid diethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1446282-35-4
• 分子式：C₁₄H₃₄N₂O₆P₂
• 分子量：388.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PEG5-Tos

PEG5-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：155130-15-7
• 分子式：C₁₇H₂₈O₈S
• 分子量：392.464
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：524.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：270.9±30.1 °C

Boc-Aminooxy-PEG3-acid

Boc-Aminooxy-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-82-4
• 分子式：C₁₄H₂₇NO₈
• 分子量：337.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromoacetamido-PEG2-C2-NHS ester

Bromoacetamido-PEG2-C2-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1353011-78-5
• 分子式：C₁₃H₁₉BrN₂O₇
• 分子量：395.203
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PTD10

PTD10是一种高效的PROTAC BTK降解剂(DC50:0.5 nM,KD:2.28 nM)。PTD10分别以0.5和0.6nM的DC50降解Ramos和JeKo-1细胞中的BTK。PTD10通过激活胱天蛋白酶依赖性途径和线粒体途径抑制细胞生长并诱导细胞凋亡。PTD10可用于B细胞失调的研究[1]。

• CAS号：2642231-19-2
• 分子式：C₄₉H₅₁N₁₁O₈
• 分子量：922.00
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SJFα

SJFα 是一种含 13 个原子连接桥的 PROTAC。SJFα 降解 p38α,DC50 为 7.16 nM,但降解 p38δ 效果较差 (DC50=299 nM),且在浓度高达 2.5 μM 时也不会降解其他 p38 亚型 (β 和 γ)。

• CAS号：2254609-27-1
• 分子式：C₅₉H₆₇F₂N₇O₁₁S
• 分子量：1120.27
• 类别：p38 MAPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 20 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成 (参考文献中的化合物 DL7-TL)。

• CAS号：1950635-15-0
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₆
• 分子量：458.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG3-Bis-sulfone

生物素-PEG3-双砜是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2055048-58-1
• 分子式：C₄₃H₅₆N₄O₁₁S₃
• 分子量：901.12
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-氮杂环丁烷-3-甲酸甲酯

1-Boc-氮杂环丁-3-羧酸甲酯是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。1-Boc-氮杂环丁烷-3-羧酸甲酯也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：610791-05-4
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₄
• 分子量：215.246
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：269.0±33.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：116.5±25.4 °C

反式4-羟基-D-脯氨酸盐酸盐

tans-4-羟基-D-脯氨酸盐酸盐是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。tans-4-羟基-D-脯氨酸盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PR

• CAS号：142347-81-7
• 分子式：C₅H₁₀ClNO₃
• 分子量：167.591
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：368.6ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：176.7ºC

Mal-NH-PEG12-CH2CH2COOPFP ester

Mal-NH-PEG12-CH2CH2COOPFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2136296-33-6
• 分子式：C₄₀H₅₉F₅N₂O₁₇
• 分子量：934.89
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PEG8-Tos

PEG8-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。PEG8-Tos 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：886469-23-4
• 分子式：C₂₃H₄₀O₁₁S
• 分子量：524.622
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：615.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：325.8±31.5 °C

Ald-Ph-amido-PEG2-C2-acid

Ald-Ph-amido-PEG2-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Ald-Ph-amido-PEG2-C2-acid 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807534-84-4
• 分子式：C₁₅H₁₉NO₆
• 分子量：309.315
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：568.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：297.6±30.1 °C

Lenalidomide-C5-amido-Boc

来那度胺-C5-氨基-Boc是以来那度胺为基础的Cereblon配体,用于补充CRBN蛋白。来那度胺-C5-氨基-Boc可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,形成PROTAC[1]。

• CAS号：2138441-25-3
• 分子式：C₂₃H₃₁N₃O₅
• 分子量：429.51
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二乙二醇二乙酸酯

Diethylene glycol diacetate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：628-68-2
• 分子式：C₈H₁₄O₅
• 分子量：190.194
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：248.0±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：19°C
• 闪点：100.4±20.4 °C

Boc-NH-PEG4-NHS ester

Boc-NH-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：859230-20-9
• 分子式：C₂₀H₃₄N₂O₁₀
• 分子量：462.491
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG4-NHS ester

Biotin-PEG4-NHS ester 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：459426-22-3
• 分子式：C₂₅H₄₀N₄O₁₀S
• 分子量：588.671
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG2)-N-Boc-PEG3-acid

N-(Azido-PEG2)-N-Boc-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2086689-01-0
• 分子式：C₂₀H₃₈N₄O₉
• 分子量：478.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ARD-2128

ARD-2128是一种高效、口服生物利用的丙酸雄激素受体(AR)降解剂。ARD-2128可有效降低AR蛋白,抑制肿瘤组织中AR调节基因,抑制肿瘤生长而无毒性迹象。ARD-2128具有研究前列腺癌的潜力[1]。

• CAS号：2222111-87-5
• 分子式：C₄₅H₅₀ClN₇O₆
• 分子量：820.37
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG3-acid

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-52-7
• 分子式：C₂₂H₄₂N₄O₁₀
• 分子量：522.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Active-mono-sulfone-PEG8-acid

Active-mono-sulfone-PEG8-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055048-45-6
• 分子式：C₃₇H₅₃NO₁₄S
• 分子量：767.88
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-5'-C8-acid

Pomalidomide-5'-C8-acid (Compound 3d') 是一种 E3 连接酶配体-linker 偶联物 (E3 ligase ligand-linker conjugate),包含基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 Cereblon (CRBN) 配体和 1 个 linker。Pomalidomide-5'-C8-acid 可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：2682112-09-8
• 分子式：C₂₂H₂₇N₃O₆
• 分子量：429.47
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-L-赖氨酸盐酸盐

Fmoc-Lys-OH盐酸盐是一种可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Fmoc Lys OH盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：139262-23-0
• 分子式：C₂₁H₂₅ClN₂O₄
• 分子量：404.887
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：607.6ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：321.3ºC

PROTAC BRD9 Degrader-6

PROTAC BRD9降解剂-6是BRD9的强效降解剂(IC50=0.13 nM),可用于BAF复合物相关疾病的研究[1]。

• CAS号：2676211-62-2
• 分子式：C₄₇H₅₆N₈O₆
• 分子量：829.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HO-PEG5-CH2COOH

HO-PEG5-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：52026-48-9
• 分子式：C₁₂H₂₄O₈
• 分子量：296.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JPS035

JPS035是一种以苯甲酰胺为基础的冯·希佩尔·林道(VHL)E3连接酶,以嵌合体(PROTAC)为靶点进行蛋白质水解。JPS035降解I类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)。JPS035是有效的HDAC1/2降解剂,与HCT116细胞中更大的总差异表达基因和增强的凋亡相关[1]。

• CAS号：2669785-84-4
• 分子式：C₄₉H₆₅N₇O₇S
• 分子量：896.15
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

β-Naphthoflavone-CH2-Br

β-Naphthoflavone-CH2-Br 是一种芳香烃受体 (AhR) 配体。β-Naphthoflavone-CH2-Br 用于合成 PROTACβ-NF-JQ1 (HY-130256)。

• CAS号：1282513-77-2
• 分子式：C₂₀H₁₃BrO₂
• 分子量：365.22
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

马来酰亚胺-PEG4-NHS酯

Mal-amido-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：756525-99-2
• 分子式：C₂₂H₃₁N₃O₁₁
• 分子量：513.49500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.36±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A