蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

PROTAC ER Degrader-10

PROTAC ER降解剂-10是一种有效的PROTAC ER降解剂,可用于癌症研究。PROTAC ER Degrader-10从专利WO2021133886实例36中提取。

• CAS号：2504911-58-2
• 分子式：C₄₄H₄₅N₅O₆
• 分子量：739.86
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

四乙二醇单苄醚对甲苯磺酸酯

苄基-PEG4-Ots是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：89346-82-7
• 分子式：C₂₂H₃₂O₈S
• 分子量：456.55000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC AR-V7 degrader-2

PROTAC AR-V7除霜器-2是基于AR的PROTAC。PROTAC AR-V7降解剂-2通过降解AR-V7和AR-FL抑制CaP细胞增殖。PROTAC AR-V7降解剂-2诱导细胞凋亡[1]。

• CAS号：2488296-74-6
• 分子式：C₄₃H₅₃F₂N₇O₇S₂
• 分子量：882.05
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-PEG2-NH2 dihydrochloride

(S,R,S)-AHPC-PEG2-NH2 dihydrochloride (VH032-PEG2-NH2 dihydrochloride) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 (S,R,S)-AHPC 的 VHL 配体和 2 个单元 PEG linker。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2341796-76-5
• 分子式：C₂₈H₄₃Cl₂N₅O₆S
• 分子量：648.64
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TBK1 PROTAC 1

一种新型有效的选择性TBK1-PROTAC,DC50为12 nM,选择性降解TBK1,对相关激酶IKKε具有优异的选择性；一种评估TBK1作为突变K-Ras癌细胞靶标的化学工具。

• CAS号：2052306-13-3
• 分子式：C₅₃H₇₄BrN₉O₉S
• 分子量：1093.179
• 类别：IKK

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔-单乙二醇-羧酸

Propargyl-PEG1-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Propargyl-PEG4-acid 可用于合成 BTK-CRBN 类 PROTAC 分子,包括连接 Ibrutinib (HY-10997) 和 cereblon E3 连接酶配体的 PROTAC 4 和 PROTAC 5。在 10 μM 时,PROTAC 5 导致 BTK,CSK,LYN,和 LAT2 降解。

• CAS号：55683-37-9
• 分子式：C₆H₈O₃
• 分子量：128.12600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.14g/cm3
• 沸点：265.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：113.9ºC

Thalidomide-Piperazine-PEG3-NH2

沙利度胺-哌嗪-PEG3-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2357113-68-7
• 分子式：C₂₅H₃₅N₅O₇
• 分子量：517.57
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG4-TFP ester

基于PEG-4的PEG-ACS的合成中可以使用PEG-4的连接剂[1]。

• CAS号：1446282-42-3
• 分子式：C₂₄H₂₂F₈O₈
• 分子量：590.414
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：572.7±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：289.0±25.0 °C

Thalidomide-O-C6-NH2

Thalidomide-O-C6-NH2 是一种合成的 E3 连接酶配体 -linker 偶联物,用于PROTAC dTAG-13。dTAG-13 是FKBP12F36V 和 BET 的降解剂。

• CAS号：1957235-98-1
• 分子式：C₁₉H₂₃N₃O₅
• 分子量：373.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EGFR degrader 6

PROTAC EGFR降解剂6(化合物2)是一种PROTAC EGFR降解剂,在DC50为45.2 nM的HCC827细胞中有效降解EGFRDel19。PROTAC EGFR降解物6显著诱导HCC827细胞凋亡,并将细胞阻滞在G1期[1]。

• CAS号：2409793-28-6
• 分子式：C₄₉H₅₇FN₁₂O₅
• 分子量：913.05
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(PEG1-OH)-N-Boc-PEG2-propargyl

N-(PEG1-OH)-N-Boc-PEG2-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-85-0
• 分子式：C₁₆H₂₉NO₆
• 分子量：331.40
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG3-propargyl

Aminooxy-PEG3-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807537-27-4
• 分子式：C₉H₁₇NO₄
• 分子量：203.236
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：309.6±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：146.4±18.8 °C

S-acetyl-PEG6

S-acetyl-PEG6 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1352221-63-6
• 分子式：C₁₄H₂₈O₇S
• 分子量：340.433
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：441.7±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：220.9±28.7 °C

PROTAC Linker 32

PROTAC Linker 32 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 32 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：10436-21-2
• 分子式：C₁₇H₃₂N₂O₅
• 分子量：344.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG6-MS

Azido-PEG6-MS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：352439-38-4
• 分子式：C₁₃H₂₇N₃O₈S
• 分子量：385.43
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴代-PEG3-叠氮

Bromo-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1446282-43-4
• 分子式：C₈H₁₆BrN₃O₃
• 分子量：282.135
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

FKBP12 PROTAC RC32

FKBP12 PROTAC RC32 (RC32) 是基于 PROTAC 的有效 FKBP12 降解剂。FKBP12 PROTAC RC32 包含雷帕霉素 (Rapamycin；HY-10219) 和 E3 泛素连接酶配体 (Pomalidomide；HY-10984)。

• CAS号：2375555-66-9
• 分子式：C₇₅H₁₀₇N₇O₂₀
• 分子量：1426.69
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-四聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Amino-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：581065-95-4
• 分子式：C₁₅H₃₁NO₆
• 分子量：321.41000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.040±0.06 g/cm3
• 沸点：400.1±35.0 ºC (760 Torr)
• 熔点：N/A
• 闪点：114.1±22.3 ºC

(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 dihydrochloride

(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 dihydrochloride (VH032-C6-NH2 dihydrochloride) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 VH032 的 VHL 配体和 1 个 linker。(S,R,S)-AHPC-C6-NH2 hydrochloride 可用于合成靶向 AKT 的 PROTAC 降解剂,例 6,XF038-161A,源于专利文献 WO2019173516A1。

• CAS号：2341796-77-6
• 分子式：C₂₉H₄₅Cl₂N₅O₄S
• 分子量：630.67
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP

Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP 是一种可降解 (cleavable) 的含 3 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG3-Val-Cit-PAB-PNP 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055047-18-0
• 分子式：C₃₄H₄₇N₉O₁₂
• 分子量：773.79
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-氨基十一酸

11-Aminoundecanoic acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。11-Aminoundecanoic acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2432-99-7
• 分子式：C₁₁H₂₃NO₂
• 分子量：201.306
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：334.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：188-191 °C(lit.)
• 闪点：156.3±20.4 °C

Bromo-PEG2-MS

Bromo-PEG2-MS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1935075-34-5
• 分子式：C₅H₁₁BrO₄S
• 分子量：247.11
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氧基)乙酸叔丁酯

Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 是t-Bu 修饰的 Thalidomide (HY-14658),是合成 Thalidomide-4-OH (HY-123096) 的最后一步中间体。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 末端的 t-Bu 保护基团,可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-4-O-CH2-COO(t-Bu) 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：1950635-36-5
• 分子式：C₁₉H₂₀N₂O₇
• 分子量：388.37
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(3AS,4S,6AR)-六氢-2-氧代-N-(15-氧代-3,6,9,12-四氧杂-16-氮杂十九碳-18-炔-1-基)-1H-噻吩并[3,4-D]咪唑-4-戊酰胺

Biotin-PEG4-amide-Alkyne 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1006592-45-5
• 分子式：C₂₄H₄₀N₄O₇S
• 分子量：528.662
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.174
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N33-TEG-COOH

N33-TEG-COOH 是一种 PROTAC 连接桥,含有四个聚乙二醇 (PEG) 单元。详细信息请看参考文献 PMID: 26035625 中的 Compound 7。

• CAS号：201467-81-4
• 分子式：C₁₀H₁₉N₃O₆
• 分子量：277.27400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methylamino-PEG3-t-butyl ester

Methylamino-PEG3-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：217817-03-3
• 分子式：C₁₄H₂₉NO₅
• 分子量：291.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG2-propargyl

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG2-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-73-3
• 分子式：C₉H₁₃F₃O₃
• 分子量：226.19
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HJM-561

HJM-561是一种有效的、选择性的、口服生物可利用的 EGFR PROTAC。HJM-561 可克服 osimertinib (HY-15772) 耐药的 EGFR 三重突变,具有抗肿瘤活性。

• CAS号：2570251-68-0
• 分子式：C₄₅H₅₁ClN₉O₅P
• 分子量：864.37
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG2-CH2COOH

Hydroxy-PEG2-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：51951-04-3
• 分子式：C₆H₁₂O₅
• 分子量：164.156
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.0 g/cm3
• 沸点：343.4±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：144.3±0.0 °C

m-PEG12-NH-C2-acid

m-PEG12-NH-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1949843-39-3
• 分子式：C₂₈H₅₇NO₁₄
• 分子量：631.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A