蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

二十一甘醇

HO-PEG21-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：928211-42-1
• 分子式：C₄₂H₈₆O₂₂
• 分子量：943.12
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG8-NHS ester

Mal-amido-PEG8-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：756525-93-6
• 分子式：C₃₀H₄₇N₃O₁₅
• 分子量：689.70500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PFP ester

Mal-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：138194-55-5
• 分子式：C₁₃H₆F₅NO₄
• 分子量：335.18
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG5-NHS ester

m-PEG5-NHS ester 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：874208-94-3
• 分子式：C₁₆H₂₇NO₉
• 分子量：377.38700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-十氧杂三十一烷酸

m-PEG9-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：405518-55-0
• 分子式：C₂₁H₄₂O₁₂
• 分子量：486.55100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.122
• 沸点：557.372ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：175.904ºC

N-芴甲氧羰基-十聚乙二醇-丙酸

Fmoc-NH-PEG10-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2101563-45-3
• 分子式：C₃₈H₅₇NO₁₄
• 分子量：751.857
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：826.4±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：453.6±34.3 °C

Thalidomide-Piperazine-Piperidine

沙利度胺哌嗪哌啶是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基塞伦配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2229716-11-2
• 分子式：C₂₂H₂₇N₅O₄
• 分子量：425.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Hydroxy-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Hydroxy-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112734-70-8
• 分子式：C₃₈H₇₅NO₁₆
• 分子量：802.00
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-38-9
• 分子式：C₄₂H₆₂ClN₅O₈
• 分子量：800.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,17-二氨基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷

Amino-PEG5-amine 是一种 PROTAC 连接桥 (5 个单元),属于 PEG 类。Amino-PEG5-amine 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：72236-26-1
• 分子式：C₁₂H₂₈N₂O₅
• 分子量：280.36100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.055g/cm3
• 沸点：379.915ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：181.118ºC

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide 是一种合成的 E3 ligase ligand-linker conjugate,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 6 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：1835705-74-2
• 分子式：C₃₁H₄₄IN₃O₁₁
• 分子量：761.60
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-amido-C5-acid

(S,R,S)-AHPC-amido-C5-acid 包含用于募集 E3 泛素连接酶的 VHL 配体和 linker。(S,R,S)-AHPC-amido-C5-acid 可用于合成 XY028-133 (HY-129180)。

• CAS号：2162120-87-6
• 分子式：C₂₉H₄₀N₄O₆S
• 分子量：572.72
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NMe-PEG4-C2-acid

Fmoc-NMe-PEG4-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2170240-98-7
• 分子式：C₂₇H₃₅NO₈
• 分子量：501.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG4-C2-NHS ester

Boc-PEG4-C2-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-75-5
• 分子式：C₂₀H₃₃NO₁₀
• 分子量：447.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KB02-JQ1

KB02-JQ1 是一种高选择性的基于 PROTAC 的 BRD4 降解剂 (molecular glue),但不降解 BRD2 或 BRD3。 KB02-JQ1 通过共价修饰 DCAF16 (E3 ligase) 促进 BRD4 降解,并可以提高生物系统中蛋白质降解的持久性。KB02-JQ1 由 JQ1 与泛素 E3 连接酶配体 (KB02) 通过 linker 连接而成。

• CAS号：2384184-44-3
• 分子式：C₃₈H₄₃Cl₂N₇O₆S
• 分子量：796.76
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AD4

AD4 是一种青蒿素衍生物,是靶向 PCLAF 的蛋白水解靶向嵌合体 (PROTACs)。AD4 可有效降解 RS4;11 细胞中的 PCLAF (IC50: 0.6 nM),从而激活 p21/Rb 轴,发挥抗肿瘤活性。AD4 还延长 RS4;11 移植的 NOD/SCID 小鼠的存活时间,具有体内效力。

• CAS号：2918262-09-4
• 分子式：C₅₅H₇₈N₄O₁₅
• 分子量：1035.23
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-84-8
• 分子式：C₂₄H₂₇F₅N₂O₉
• 分子量：582.47
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C6-COOH

沙利度胺-O-C6-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2169266-69-5
• 分子式：C₂₀H₂₂N₂O₇
• 分子量：402.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-Tos-PEG6

Bis-Tos-PEG6 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：42749-27-9
• 分子式：C₂₆H₃₈O₁₁S₂
• 分子量：590.70300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.24g/cm3
• 沸点：687.4ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：369.5ºC

TGN-020 sodium

TGN-020钠是一种选择性水通道蛋白4(AQP4)抑制剂,IC50为3.1μM[1][2]。TGN-020钠是一种基于烷基链的PROTAC接头,可用于PROTAC的合成[3]。TGN-020钠减轻大鼠脊髓压迫损伤后的水肿并抑制胶质瘢痕形成[4]。

• CAS号：1313731-99-5
• 分子式：C₈H₅N₄NaOS
• 分子量：228.21
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tetrazine-Ph-NHCO-C3-NHS ester

Tetrazine-Ph-NHCO-C3-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1244040-64-9
• 分子式：C₁₈H₁₈N₆O₅
• 分子量：398.37300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-五聚乙二醇-甲磺酸酯

Benzyl-PEG5-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807539-07-6
• 分子式：C₁₈H₃₀O₈S
• 分子量：406.491
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：529.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：274.0±30.1 °C

Cbz-PEG2-bromide

Cbz-PEG2-溴化物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2100283-00-7
• 分子式：C₁₄H₂₀BrNO₄
• 分子量：346.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-3

PROTAC BRD4 Degrader-3 (compound 1004.1) 是一种有效的 PROTAC BRD4 降解剂。

• CAS号：2313234-00-1
• 分子式：C₅₅H₆₅F₂N₉O₉S₂
• 分子量：1098.29
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG8-CH2CH2-NHS ester

m-PEG8-CH2CH2-NHS 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：1316189-13-5
• 分子式：C₂₄H₄₃NO₁₃
• 分子量：553.597
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：598.3±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：315.7±32.9 °C

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1260092-43-0
• 分子式：C₁₂H₁₅NO₅
• 分子量：253.25100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

22-溴-2,5,8,11,14,17,20-七氧杂二十二烷

m-PEG7-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：104518-25-4
• 分子式：C₁₅H₃₁BrO₇
• 分子量：403.30600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-azide

111-Trifluoroethyl-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-35-5
• 分子式：C₁₀H₁₈F₃N₃O₄
• 分子量：301.26
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Me-N-bis(PEG4-acid)

N-Me-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055014-77-0
• 分子式：C₂₃H₄₅NO₁₂
• 分子量：527.60
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Nonylbenzene-PEG8-OH

Nonylbenzene-PEG8-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：41506-14-3
• 分子式：C₃₁H₅₆O₉
• 分子量：572.77100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A