蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Thalidomide-5-NH2-CH2-COOH

沙利度胺-5-NH2-CH2-COOH(化合物114)是原肌球蛋白受体激酶(trk)的有效和选择性抑制剂。沙利度胺-5-NH2-CH2-COOH是E3连接酶的配体。沙利度胺-5-NH2-CH2-COOH具有治疗一种或多种疾病的潜力(摘自专利WO2021170109A1)[1]。

• CAS号：2412056-27-8
• 分子式：C₁₅H₁₃N₃O₆
• 分子量：331.28
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propenyl-PEG3-Propenyl

Propenyl-PEG3-Propenyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：90736-68-8
• 分子式：C₁₂H₂₂O₄
• 分子量：230.30100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-Cbz-氮杂环丁烷-3-甲酸甲酯

1-Cbz-氮杂环丁-3-羧酸甲酯是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。1-Cbz-氮杂环丁烷-3-羧酸甲酯也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：757239-60-4
• 分子式：C₁₃H₁₅NO₄
• 分子量：249.262
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：414.9±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：204.7±28.7 °C

(2S,4R)-4-[[[[2-[[叔丁氧羰基]氨基]乙基]氨基]羰基]氧基]-1,2-吡咯烷二甲酸 1-(9H-芴-9-基甲基)酯

Fmoc Hyp(Bom)-OH是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Fmoc Hyp(Bom)-OH也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]<

• CAS号：187223-15-0
• 分子式：C₂₈H₃₃N₃O₈
• 分子量：539.577
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.35±0.1 g/cm3
• 沸点：749.0±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：406.8±32.9 °C

13-氨基-5,8,11-三氧杂-2-氮杂十三烷酸 1,1-二甲基乙酯

PROTAC Linker 15 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 15 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：101187-40-0
• 分子式：C₁₃H₂₈N₂O₅
• 分子量：292.37200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.05
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-NH-PEG4-C3-acid

Boc-N-amido-PEG4-C3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1416777-48-4
• 分子式：C₁₇H₃₃NO₈
• 分子量：379.446
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：515.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：265.6±30.1 °C

N-DBCO-N-bis(PEG2-C2-acid)

N-DBCO-N-bis(PEG2-C2-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2110449-00-6
• 分子式：C₃₃H₄₀N₂O₁₀
• 分子量：624.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG4-CH2-acid

Propargyl-PEG4-CH2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1872433-74-3
• 分子式：C₁₃H₂₂O₆
• 分子量：274.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG4)-N-bis(PEG4-t-butyl ester)

N-(Azido-PEG4)-N-bis(PEG4-t-butyl ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093152-79-3
• 分子式：C₄₀H₇₈N₄O₁₆
• 分子量：871.06
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG5-CH2COOH

Cbz-NH-PEG5-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1449390-66-2
• 分子式：C₂₀H₃₁NO₉
• 分子量：429.461
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：590.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：310.9±30.1 °C

荧光素-三聚乙二醇-氨基

Fluorescein-PEG3-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807539-04-3
• 分子式：C₂₉H₃₁N₃O₈S
• 分子量：581.637
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：827.9±75.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：454.5±37.1 °C

Mal-PEG1-PFP ester

Mal-PEG1-PFP ester 是一种基于Alkyl/ether 结构的 PROTAC linker,可以用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：1807530-08-0
• 分子式：C₁₅H₁₀F₅NO₅
• 分子量：379.236
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：452.8±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：227.7±28.7 °C

七乙二醇一苯甲醚

Benzyl-PEG7-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：423763-19-3
• 分子式：C₂₁H₃₆O₈
• 分子量：416.50600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.099±0.06 g/cm3
• 沸点：508.4±45.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-Tos

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1872433-61-8
• 分子式：C₁₇H₂₅F₃O₇S
• 分子量：430.44
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc)

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-56-1
• 分子式：C₃₄H₆₆N₄O₁₃
• 分子量：738.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG8-(CH2)12-phosphonic acid ethyl ester

m-PEG8-(CH2)12-phosphonic acid ethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112737-70-7
• 分子式：C₃₁H₆₅O₁₁P
• 分子量：644.81
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH-bis-PEG3

NH-bis-PEG3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：25743-12-8
• 分子式：C₁₂H₂₇NO₆
• 分子量：281.34600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG4-phosphonic acid ethyl ester

Boc-PEG4-phosphonic acid ethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1623791-77-4
• 分子式：C₁₉H₃₉O₉P
• 分子量：442.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG10-acid

Hydroxy-PEG10-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2375611-66-6
• 分子式：C₂₃H₄₆O₁₃
• 分子量：530.60
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG4-propargyl

m-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。m-PEG4-Propargyl 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1101668-39-6
• 分子式：C₁₂H₂₂O₅
• 分子量：246.300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：304.2±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：115.2±25.0 °C

Pomalidomide-5-C8-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-5-C8-NH2 hydrochloride 是一种基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体,用于募集 cereblon 蛋白。Pomalidomide-5-C8-NH2 hydrochloride 可通过 linker 连接到蛋白质配体上形成 PROTAC。

• CAS号：2863635-03-2
• 分子式：C₂₁H₂₉ClN₄O₄
• 分子量：436.93
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amido-C3-COOH

Pomalidomide-amido-C3-COOH 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。

• CAS号：2162120-77-4
• 分子式：C₁₈H₁₇N₃O₇
• 分子量：387.34
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Br-PEG6-CH2COOtBu

Br-PEG6-CH2COOtBu是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：297162-48-2
• 分子式：C₁₈H₃₅BrO₈
• 分子量：459.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MZP-54

MZP-54 是基于 PROTAC 技术的一种选择性的 BRD3/4 降解剂,对 Brd4BD2 的 Kd 值为 4 nM。

• CAS号：2010159-47-2
• 分子式：C₅₅H₆₆ClN₇O₉S
• 分子量：1036.67
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(2R,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺

(R,S,S)-VH032 是用于 PROTACs 合成的 Ligand for E3 Ligase。VH032 是一种 VHL 配体和 VHL/HIF-1α 相互作用抑制剂,用于募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。(R,S,S)-VH032 可合成靶向 tau 的小分子 PROTAC C004019 (HY-138669)。

• CAS号：2230826-33-0
• 分子式：C₂₂H₃₀N₄O₃S
• 分子量：430.56
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-PEG5-Br

Cbz-PEG5-Br是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2710803-69-1
• 分子式：C₂₀H₃₂BrNO₇
• 分子量：478.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Dde Biotin-PEG4-TAMRA-PEG4 Alkyne

Dde Biotin-PEG4-TAMRA-PEG4 Alkyne 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-55-7
• 分子式：C₇₂H₁₀₁N₉O₁₈S
• 分子量：1412.69
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-amido-PEG1-(C1-PEG)2-C2-NH2

沙利度胺-O-氨基-PEG1-(C1-PEG)2-C2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2435572-48-6
• 分子式：C₂₅H₃₄N₄O₉
• 分子量：534.56
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-C6-NH2 hydrochloride

沙利度胺-NH-C6-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2375194-37-7
• 分子式：C₁₉H₂₅ClN₄O₄
• 分子量：408.879
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Ethyl-N-methylpropionamide-PEG1-Br

N-Ethyl-N-methylpropionamide-PEG1-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1695856-63-3
• 分子式：C₈H₁₆BrNO₂
• 分子量：238.12
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A