蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Bromo-PEG5-phosphonic acid diethyl ester

Bromo-PEG5-phosphonic acid diethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1446282-41-2
• 分子式：C₁₆H₃₄BrO₈P
• 分子量：465.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG2-PFP ester

NH2-PEG3-BOC 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 2 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Bis-PEG2-PFP ester 也是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1314378-18-1
• 分子式：C₂₀H₁₂F₁₀O₆
• 分子量：538.289712
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG4-methylamine

Hydroxy-PEG4-methylamine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：90430-59-4
• 分子式：C₉H₂₁NO₄
• 分子量：207.26700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG2-PFP ester

endo-BCN-PEG2-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421932-53-7
• 分子式：C₂₄H₂₆F₅NO₆
• 分子量：519.458
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：586.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：308.3±30.1 °C

三甘醇

PROTAC Linker 25 是一种 PEG 类的 PROTAC 连接桥。PROTAC Linker 25 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：112-27-6
• 分子式：C₆H₁₄O₄
• 分子量：150.173
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：288.0±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：−7 °C(lit.)
• 闪点：165.6±0.0 °C

Thalidomide-NH-PEG1-NH2 hydrochloride

沙利度胺-NH-PEG1-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2154342-56-8
• 分子式：C₁₇H₂₁ClN₄O₅
• 分子量：396.83
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG2-acid

Bis-PEG2-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG1-propionic acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：19364-66-0
• 分子式：C₈H₁₄O₆
• 分子量：206.19300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG3-CH2COOH

Cbz-NH-PEG3-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：462100-05-6
• 分子式：C₁₆H₂₃NO₇
• 分子量：341.356
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：534.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：276.8±30.1 °C

(S,R,S)-AHPC-C2-NH2

(S,R,S)-AHPC-C2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于VH032的VHL配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2241643-69-4
• 分子式：C₂₅H₃₅N₅O₄S
• 分子量：501.64
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Boc-N-amido-PEG5-acetic acid

BocNH-PEG5-酸是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：890152-41-7
• 分子式：C₁₇H₃₃NO₉
• 分子量：395.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG5-azide

Biotin-PEG5-azide 是基于 PEG 结构的 PROTAC linker,可以用来制备 PROTAC。

• CAS号：1163732-89-5
• 分子式：C₂₂H₄₀N₆O₇S
• 分子量：532.654
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-γ-氨基丁酸

Boc-GABA-OH 是一种 PROTAC linker,能用于合成 UNC6852。UNC6852 是一种靶向 EED 的 PROTAC 降解剂。

• CAS号：57294-38-9
• 分子式：C₉H₁₇NO₄
• 分子量：203.236
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：78-82 ºC
• 熔点：55-59 °C
• 闪点：113 ºC

Benzyloxy carbonyl-PEG3-C2-acid

Benzyloxy carbonyl-PEG3-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-73-6
• 分子式：C₁₇H₂₄O₇
• 分子量：340.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-叔丁氧羰基-1,2-乙二胺

PROTAC Linker 22 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。PROTAC Linker 22 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：57260-73-8
• 分子式：C₇H₁₆N₂O₂
• 分子量：160.214
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：252.8±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：106.7±22.6 °C

Bis-CH2-PEG2-acid

Bis-CH2-PEG2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2250056-38-1
• 分子式：C₇H₁₂O₆
• 分子量：192.17
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ARD-61

ARD-61是一种高效、有效和特异的雄激素受体(AR)降解剂。ARD-61能有效地诱导AR+癌细胞系中的AR和孕酮受体(PR)降解。在小鼠MDA-MB-453异种移植模型中,ARD-61诱导细胞凋亡并有效诱导肿瘤生长抑制[1]。

• CAS号：2316837-08-6
• 分子式：C₆₁H₇₁ClN₈O₇S
• 分子量：1095.78
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RIPK2-IN-2

RIPK2-IN-2(实施例25)是RIP2激酶-PROTAC抑制剂。RIPK2-IN-2可阻断RIP2依赖性促炎信号,调节自身炎症疾病中的RIP2激酶活性[1]。

• CAS号：2143956-20-9
• 分子式：C₅₃H₆₅FN₁₄O₇S₂
• 分子量：1093.30
• 类别：RIP激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二苯基环辛炔-四聚乙二醇-活性酯

DBCO-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1427004-19-0
• 分子式：C₃₄H₃₉N₃O₁₀
• 分子量：649.688
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lipoamido-PEG2-OH

Lipoamido-PEG2-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1674386-82-3
• 分子式：C₁₄H₂₇NO₄S₂
• 分子量：337.499
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：546.5±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：284.3±25.9 °C

N-DBCO-N-bis(PEG2-C2-NHS ester)

N-DBCO-N-bis(PEG2-C2-NHS ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2128735-29-3
• 分子式：C₄₁H₄₆N₄O₁₄
• 分子量：818.82
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-NH-Boc

DBCO-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1539290-74-8
• 分子式：C₂₃H₂₄N₂O₃
• 分子量：376.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-N-bis(PEG2-propargyl)

N-Boc-N-bis(PEG2-propargyl) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-86-1
• 分子式：C₁₉H₃₁NO₆
• 分子量：369.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG5-C2-Boc

Tos-PEG5-C2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Tos-PEG5-C2-Boc 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：850090-10-7
• 分子式：C₂₄H₄₀O₁₀S
• 分子量：520.633
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：591.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：311.4±30.1 °C

Propargyl-PEG4-methylamine

Propargyl-PEG4-methylamine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807530-11-5
• 分子式：C₁₂H₂₃NO₄
• 分子量：245.315
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：317.1±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.2±14.6 °C

Boc-Aminooxy-PEG4-CH2-Boc

Boc-Aminooxy-PEG4-CH2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2062663-63-0
• 分子式：C₁₉H₃₇NO₉
• 分子量：423.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇单对甲苯磺酸酯

m-PEG6-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Tos-PEG6-m 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：155887-96-0
• 分子式：C₂₀H₃₄O₉S
• 分子量：450.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG5-Boc

Mal-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2250216-91-0
• 分子式：C₂₁H₃₅NO₉
• 分子量：445.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG11-amine

Biotin-PEG11-amine 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1418022-42-0
• 分子式：C₃₄H₆₆N₄O₁₃S
• 分子量：770.97
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2-(2-(2-羟基乙氧基)-乙氧基)乙氧基)氨基甲酸乙酯叔丁酯

PROTAC Linker 12 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 12 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：106984-09-2
• 分子式：C₁₃H₂₇NO₆
• 分子量：293.35700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.078g/cm3
• 沸点：414ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：204.2ºC

氨基-八乙二醇

NH2-PEG8-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。NH2-PEG8-OH 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：352439-37-3
• 分子式：C₁₆H₃₅NO₈
• 分子量：369.45100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A