蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Boc-Aminooxy-PEG4-CH2CO2H

Boc-Aminooxy-PEG4-CH2CO2H 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2028281-90-3
• 分子式：C₁₅H₂₉NO₉
• 分子量：367.39
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C1-NH2 hydrochloride

(S,R,S)-AHPC-C1-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,包含基于(S,R,S)-AHPC的VHL配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2361120-26-3
• 分子式：C₂₄H₃₄ClN₅O₄S
• 分子量：524.08
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SJ988497

SJ988497是PROTAC JAK2降解器。SJ988497有效抑制CRLF2重排(CRLF2r)细胞增殖并降解CRBN新底物GSPT1。SJ988497由Ruxolitinib(HY-50856)衍生物、接头和CRBN配体波马度胺组成。SJ988497可用于急性淋巴细胞白血病(ALL)的研究[1]。

• CAS号：2595365-41-4
• 分子式：C₃₆H₃₆N₁₀O₅
• 分子量：688.74
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PZ703b

PZ703b是一种新型的BCL-XL蛋白降解剂,具有增强的BCL-2抑制作用。

• CAS号：2471970-56-4
• 分子式：C₈₀H₁₀₂ClF₃N₁₀O₁₁S₄
• 分子量：1600.43
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG2-CH2-Boc

Hydroxy-PEG2-C2-PFP ester 是一种基于 PEG 和 Alkyl/ether 结构的 PROTAC linker。Hydroxy-PEG2-C2-PFP ester 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：149299-82-1
• 分子式：C₁₀H₂₀O₅
• 分子量：220.263
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：306.1±22.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：109.5±15.8 °C

(S,R,S)-AHPC-propargyl

(S,R,S)-AHPC-propargyl (VH032-propargyl) 是一种 VHL 配体,用于 PROTAC 技术的 “click reaction”。

• CAS号：2098799-78-9
• 分子式：C₂₇H₃₄N₄O₅S
• 分子量：526.65
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide 4'-PEG2-azide

Pomalidomide 4'-PEG2叠氮化物是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于Pomalidomide的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2271036-45-2
• 分子式：C₁₉H₂₂N₆O₆
• 分子量：430.41
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG8-acid

TCO-PEG8-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG8-acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-03-2
• 分子式：C₂₈H₅₁NO₁₂
• 分子量：593.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG3-CH2-Boc

Hydroxy-PEG3-CH2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：518044-31-0
• 分子式：C₁₂H₂₄O₆
• 分子量：264.315
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：351.2±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：121.9±17.2 °C

Tr-PEG4-OH

Tr-PEG4-OH 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 4 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：125274-16-0
• 分子式：C₂₇H₃₂O₅
• 分子量：436.54000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methyltetrazine-PEG4-maleimide

Methyltetrazine-PEG4-maleimide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1802908-02-6
• 分子式：C₂₄H₃₀N₆O₇
• 分子量：613.662
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-马来酰亚胺十一烷酸 N-琥珀酰亚胺酯

Maleimide-C10-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：87981-04-2
• 分子式：C₁₉H₂₆N₂O₆
• 分子量：378.419
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：520.4±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：268.5±27.9 °C

N-(m-PEG4)-N'-(PEG4-NHS ester)-Cy5

N-(m-PEG4)-N'-(PEG4-NHS ester)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-30-1
• 分子式：C₄₉H₆₈ClN₃O₁₂
• 分子量：926.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIAIS164018

SIAIS164018是一种基于PROTAC的ALK和EGFR降解剂,由Brigatinib设计,ALK和ALK G1202R的IC50值分别为2.5 nM和6.6 nM。SIAIS164018强烈抑制癌细胞迁移和侵袭,导致G1细胞周期停滞并诱导凋亡。SIAIS164018的性能优于Brigatinib[1]。

• CAS号：2353492-68-7
• 分子式：C₄₃H₄₈ClN₁₀O₇P
• 分子量：883.33
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG2-sulfonic acid

Boc-PEG2-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-40-2
• 分子式：C₁₁H₂₂O₇S
• 分子量：298.35
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

聚乙二醇单甲醚

m-PEG-OH (MW 2000) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：9004-74-4
• 分子式：C₂₃H₄₈O₁₂
• 分子量：516.620
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.08
• 沸点：557.1±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：12 ºC
• 闪点：268 ºC

Ald-Ph-PEG5-Boc

Ald-Ph-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1433996-83-8
• 分子式：C₂₂H₃₄O₈
• 分子量：426.501
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：521.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：222.5±30.2 °C

(S,R,S)-AHPC-O-PEG1-propargyl

(S,R,S)-AHPC-O-PEG1-炔丙基(化合物10b)是一种E3配体,用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2098799-79-0
• 分子式：C₂₉H₃₈N₄O₆S
• 分子量：570.70
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(R)-Pomalidomide-pyrrolidine

(R) -泊马利度胺吡咯烷,一种CRBN配体,可通过连接物连接到蛋白质的配体以形成PROTAC。

• CAS号：2418618-52-5
• 分子式：C₁₇H₁₈N₄O₄
• 分子量：342.35
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DNP-PEG3-DNP

DNP-PEG3-DNP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1365655-92-0
• 分子式：C₂₀H₂₄N₆O₁₁
• 分子量：524.438
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：735.3±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：398.5±32.9 °C

DBCO-PEG4-triethoxysilane

DBCO-PEG4-triethoxysilane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-02-1
• 分子式：C₃₉H₅₇N₃O₁₀Si
• 分子量：755.97
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-PEG5-NH2

沙利度胺-PEG5-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2460263-40-3
• 分子式：C₂₃H₃₁N₃O₉
• 分子量：493.51
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 14

E3 ligase Ligand 14 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 14 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：2241489-43-8
• 分子式：C₃₈H₅₂N₄O₇
• 分子量：676.84
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-叔丁氧羰基-二聚乙二醇-羧酸

Boc-NH-PEG2-CH2CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于合成 PROTAC。

• CAS号：1365655-91-9
• 分子式：C₁₂H₂₃NO₆
• 分子量：277.314
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：429.9±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：213.8±25.9 °C

F-PEG2-COOH

F-PEG2-COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2383964-72-3
• 分子式：C₆H₁₁FO₄
• 分子量：166.15
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG6-t-butyl ester

Bis-PEG6-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：439114-12-2
• 分子式：C₂₂H₄₂O₉
• 分子量：450.56300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DNP-PEG4-alcohol

DNP-PEG4-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807520-99-5
• 分子式：C₁₄H₂₁N₃O₈
• 分子量：359.332
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：557.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：290.7±30.1 °C

Bis-(N,N’-amine-PEG3)-Cy5

Bis-(N,N’-amine-PEG3)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-36-7
• 分子式：C₄₁H₆₁ClN₄O₆
• 分子量：741.40
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH-bis(PEG3-C2-NH-Boc)

NH-bis(PEG3-C2-NH-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055024-51-4
• 分子式：C₂₆H₅₃N₃O₁₀
• 分子量：567.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-顺式-4-羟基-L-脯氨酸甲酯

N-Boc-顺式-4-羟基-L-脯氨酸甲酯是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。N-Boc-顺式-4-羟基-L-脯氨酸甲酯也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2

• CAS号：102195-79-9
• 分子式：C₁₁H₁₉NO₅
• 分子量：245.272
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：335.2±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：82-86ºC
• 闪点：156.6±27.9 °C