蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

HO-PEG5-CH2COOH

HO-PEG5-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：52026-48-9
• 分子式：C₁₂H₂₄O₈
• 分子量：296.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyloxy-C5-PEG1

Benzyloxy-C5-PEG1 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：159028-70-3
• 分子式：C₁₄H₂₂O₃
• 分子量：238.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

顺式-1-N-叔丁氧羰基-4-羟基-D-脯氨酸甲酯

N-Boc-cis-4-羟基-D-脯氨酸甲酯是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。N-Boc-顺式-4-羟基-D-脯氨酸甲酯也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：114676-69-6
• 分子式：C₁₁H₁₉NO₅
• 分子量：245.27200
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.216g/cm3
• 沸点：335.2ºC at 760mmHg
• 熔点：80 °C
• 闪点：156.6ºC

N-Boc-(2R,4S)--4-羟基-D-脯氨酸甲酯

Boc-trans-D-Hyp-OMe是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Boc-trans-D-Hyp-OMe也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：135042-17-0
• 分子式：C₁₁H₁₉NO₅
• 分子量：245.272
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：387.6±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：188.2±27.9 °C

二对甲苯磺酸戊乙二醇

Pentaethylene glycol di(p-toluenesulfonate) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：41024-91-3
• 分子式：C₂₄H₃₄O₁₀S₂
• 分子量：546.65100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.26
• 沸点：661.4ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：353.8ºC

2,3,4,6-Tetra-o-acetyl-alpha-galactosylpyranosyl bromide

2,3,4,6-Tetra-o-acetyl-alpha-galactosylpyranosyl bromide 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：529493-92-3
• 分子式：C₁₄H₁₉BrO₉
• 分子量：411.20
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C2-amide-benzofuranylmethyl-pyridine

(S,R,S)-AHPC-C2-酰胺-苯并呋喃甲酰甲基吡啶是一种双靶点蛋白聚糖,不仅可以靶向Smad3的泛素化和降解,而且可以提高HIF-α蛋白水平。(S,R,S)-AHPC-C2-酰胺-苯并呋喃甲酰甲基吡啶具有多径抗纤维化功能和肾保护功能,用于肾性贫血的研究[1]。

• CAS号：2347517-69-3
• 分子式：C₄₁H₄₆N₆O₆S
• 分子量：750.91
• 类别：HIF/HIF脯氨酰-羟化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SCO-PEG8-NHS

SCO-PEG8-NHS SCO 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。SCO-PEG8-NHS SCO 含有的 SCO 和 NHS 酯可以分别与氨基共价结合。SCO 通常用于与蛋白质或多肽的氨基酸残基(特别是赖氨酸)发生反应。

• CAS号：2143968-68-5
• 分子式：C₃₂H₅₂N₂O₁₄
• 分子量：688.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-N-bis(PEG4-C2-acid)

Mal-N-bis(PEG4-C2-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-52-1
• 分子式：C₂₉H₄₈N₂O₁₅
• 分子量：664.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC PTPN2 degrader-1

PROTAC PTPN2降解剂-1(化合物实施例77)是有效的PTPN2去除剂。PROTAC PTPN2降解物-1具有研究癌症或代谢疾病的潜力[1]。

• CAS号：2655638-07-4
• 分子式：C₃₃H₂₇FN₆O₈S
• 分子量：686.67
• 类别：磷酸酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Chloro-PEG2-Boc

Chloro-PEG2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1442085-43-9
• 分子式：C₁₀H₁₉ClO₄
• 分子量：238.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C8-NH2

沙利度胺-O-C8-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：1957235-91-4
• 分子式：C₂₁H₂₇N₃O₅
• 分子量：401.46
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2-溴乙氧基)乙醇

Bromo-PEG2-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：57641-66-4
• 分子式：C₄H₉BrO₂
• 分子量：169.01700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.514±0.06 g/cm3
• 沸点：228.9±15.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lipoamido-PEG4-acid

Lipoamido-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1314378-10-3
• 分子式：C₁₉H₃₅NO₇S₂
• 分子量：453.614
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：650.7±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：347.3±31.5 °C

靶蛋白结合部分4

Target Protein-binding moiety 4 是一个 BRD4(1) 抑制剂,其 IC50 值为 7.9 μM。

• CAS号：1300019-38-8
• 分子式：C₂₀H₁₇ClN₄O₃
• 分子量：396.83
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS177

MS177(MS-177)是一种基于EZH2抑制剂C24和CRBN配体泊马利多胺的有效和选择性EZH2去加德剂(PROTAC),DC50为0.2μm,在EOL-1细胞中。MS177有效降解细胞EZH2-PRC2,抑制白血病细胞中的全局H3K27me3。在EOL-1和MV4中,MS177的半数最大降解浓度(DC50)分别为0.2±0.1μM和1.5±0.2μM,最大降解(Dmax)分别为82%和68%；11个单元格。MS177有效抑制EZH2-PRC2功能,也有效诱导癌细胞中Myc降解,抑制EZH2-PRC2功能。MS177有效诱导白血病细胞生长抑制、凋亡和细胞周期进程阻滞,比EZH2抑制剂更有效。在PDX模型中,MS177(腹腔注射,50-1 g/kg)抑制AML生长,无明显毒性。

• CAS号：2225938-86-1
• 分子式：C₄₈H₅₅N₁₁O₈
• 分子量：914.037
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶Ligand-Linker共轭物14

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 14是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

• CAS号：1957236-21-3
• 分子式：C₂₅H₃₁F₃N₄O₁₁
• 分子量：620.53
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG6-PFP ester

Mal-PEG6-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1599486-33-5
• 分子式：C₂₅H₃₀F₅NO₁₀
• 分子量：599.498
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：623.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：330.6±31.5 °C

Ac4GalNAz

Ac4GalNAz 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：653600-56-7
• 分子式：C₁₆H₂₂N₄O₁₀
• 分子量：430.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KB02-COOH

KB02-COOH 是泛素 E3 连接酶配体 KB02 的合成片段。KB02 可用于 PROTAC 的合成,例如 KB02-JQ1 (HY-129917) 和 KB02-SLF (HY-129610)。

• CAS号：2375196-30-6
• 分子式：C₁₃H₁₄ClNO₄
• 分子量：283.71
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG5-NHS ester

Azido-PEG5-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1433996-86-1
• 分子式：C₁₇H₂₈N₄O₉
• 分子量：432.426
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-八聚乙二醇-叠氮

叠氮-PEG8-叠氮是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于PROTAC的合成。

• CAS号：361543-07-9
• 分子式：C₁₈H₃₆N₆O₈
• 分子量：464.514
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

THP-PEG3-OH

THP-PEG3-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。THP-PEG3-OH 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：60221-37-6
• 分子式：C₁₁H₂₂O₅
• 分子量：234.28900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-C7-COOH

Pomalidomide-C7-COOH 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,是 PROTAC BCL-XL 降解剂合成的中间体。

• CAS号：2225940-51-0
• 分子式：C₂₁H₂₅N₃O₆
• 分子量：415.44
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇一甲醚

Hexaethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：23601-40-3
• 分子式：C₁₃H₂₈O₇
• 分子量：296.357
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：375.6±37.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：180.9±26.5 °C

Bis-sulfone-PEG4-DBCO

双砜-PEG4-DBCO是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1854034-70-0
• 分子式：C₅₄H₅₉N₃O₁₂S₂
• 分子量：1006.19
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

七乙二醇单十二醚

十二烷基七甘醇是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：3055-97-8
• 分子式：C₂₆H₅₄O₈
• 分子量：494.702
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：553.9±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：27-29 °C
• 闪点：288.8±28.7 °C

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-amine)-PEG3-acid

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-amine)-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183440-70-0
• 分子式：C₂₄H₄₇N₅O₁₁
• 分子量：581.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ARD-2051

ARD-2051是一种有效的口服活性雄激素受体(AR)蛋白水解,靶向嵌合体降解物。ARD-2051在LNCaP和VCaP前列腺癌症细胞系中实现了0.6 nM的AR蛋白降解的DC50值。ARD-2051可用于前列腺癌症的研究[1]。

• CAS号：2632305-17-8
• 分子式：C₄₃H₄₅ClN₈O₅
• 分子量：789.32
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligand-Linker Conjugate 10

用于PROTAC的E3连接酶-配体-接头缀合物。

• CAS号：1957236-22-4
• 分子式：C₂₅H₃₄N₄O₁₀
• 分子量：550.565
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A