蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

NH-bis-PEG5

NH-bis-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：63721-06-2
• 分子式：C₂₀H₄₃NO₁₀
• 分子量：457.55600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG5-C2-NH2

Fmoc-NH-PEG5-C2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093277-71-3
• 分子式：C₂₇H₃₈N₂O₇
• 分子量：502.60
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-5,6-F

沙利度胺-5,6-F是用于补充CRBN蛋白的沙利度胺基脑啡肽配体。沙利度胺-5,6-F可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,从而形成PROTACs[1]。

• CAS号：1496997-41-1
• 分子式：C₁₃H₈F₂N₂O₄
• 分子量：294.21
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：534.6±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：277.1±30.1 °C

Homo-PROTAC cereblon降解剂1

Homo-PROTAC cereblon degrader 1 (compound 15a) 是 CRBN 蛋白的高效降解剂,对IKZF1和IKZF3的影响很小。

• CAS号：2244520-98-5
• 分子式：C₃₂H₃₂N₆O₁₀
• 分子量：660.63
• 类别：E1/E2/E3酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-PEG4-alcohol

DBCO-PEG4-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1416711-60-8
• 分子式：C₂₉H₃₆N₂O₆
• 分子量：508.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：1807540-88-0
• 分子式：C₁₆H₂₂N₄O₅
• 分子量：350.370
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 52 (TFA)

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 52 TFA (Compound 10) 包含 CRBN 型 E3 泛素连接酶配体和 Linker。E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 52 TFA (Compound 10) 是一种 PROTAC 前体。

• CAS号：2022182-58-5
• 分子式：C₂₀H₂₁F₃N₄O₈
• 分子量：502.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,5-二氧代吡咯烷-1-基 1-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)-3-氧代-7,10,13,16,19,22-六氧杂-4-氮杂二十五烷-25-酸酯

Mal-amido-PEG6-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1137109-21-7
• 分子式：C₂₆H₃₉N₃O₁₃
• 分子量：601.60000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-PEG4-NHS ester

Thalidomide-O-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2411681-88-2
• 分子式：C₂₈H₃₃N₃O₁₃
• 分子量：619.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG6-t-butyl ester

Benzyl-PEG6-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2148296-00-6
• 分子式：C₂₄H₄₀O₈
• 分子量：456.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RIP2 Kinase Inhibitor 4

RIP2激酶抑制剂4是一种有效和选择性的RIPK2蛋白。RIP2激酶抑制剂4有效降解RIPK2(8的pIC50)并抑制相关TNF-α的释放[1]。

• CAS号：2126803-41-4
• 分子式：C₅₀H₆₆F₂N₁₄O₇S
• 分子量：1045.21
• 类别：RIP激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG2-Ms

Azide-PEG2-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：176520-23-3
• 分子式：C₅H₁₁N₃O₄S
• 分子量：209.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N,N'-bis-(azide-PEG3)-Cy5

NN'-bis-(azide-PEG3)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-46-9
• 分子式：C₄₁H₅₇ClN₈O₆
• 分子量：793.39
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG23-amine

Azido-PEG23-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2172677-19-7
• 分子式：C₄₈H₉₈N₄O₂₃
• 分子量：1099.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(4R)-4-羟基-D-脯氨酸甲酯盐酸盐

D-脯氨酸,4-羟基-甲酯盐酸盐是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。D-脯氨酸,4-羟基-甲酯盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：114676-59-4
• 分子式：C₆H₁₂ClNO₃
• 分子量：181.617
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：121-123 ºC
• 闪点：N/A

HO-PEG6-CH2COOH

HO-PEG6-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：120394-66-3
• 分子式：C₁₄H₂₈O₉
• 分子量：340.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG3-propargyl

Biotin-PEG3-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421701-68-9
• 分子式：C₁₉H₃₁N₃O₅S
• 分子量：413.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-5

PROTAC IRAK4降解剂-5是一种基于PROTAC的IRAK4降解剂,从专利US20190192668A1化合物I-171中提取[1]。

• CAS号：2360530-61-4
• 分子式：C₄₁H₄₀F₃N₁₁O₉
• 分子量：887.82
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-3-methylbutanyl acetate-methanesulfonothioate-Me-C10-NH2 TFA

(S,R,S)-AHPC-3-甲基丁酰基乙酸酯-甲磺基诺磺酸酯-Me-C10-NH2 TFA是一种合成的E3连接酶配体-连接物,结合了(S,S,R)-AHPC配体,可用于PROTAC技术[1]。

• CAS号：2417370-89-7
• 分子式：C₄₁H₆₂F₃N₅O₁₀S₃
• 分子量：938.15
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG9

Tos-PEG9 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：62573-11-9
• 分子式：C₂₅H₄₄O₁₂S
• 分子量：568.67500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG4-TFP ester

Mal-amido-PEG4-TFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807540-84-6
• 分子式：C₂₄H₂₈F₄N₂O₉
• 分子量：564.481
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：686.7±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：369.1±31.5 °C

Azido-PEG4-4-nitrophenyl carbonate

Azido-PEG4-4-nitrophenyl carbonate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1422540-98-4
• 分子式：C₁₅H₂₀N₄O₈
• 分子量：384.341
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-八聚乙二醇

Propargyl-PEG8-OH 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG8-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1351556-81-4
• 分子式：C₁₉H₃₆O₉
• 分子量：408.484
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：483.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：246.2±27.3 °C

基于吉非替尼的PROTAC 3

Gefitinib-based PROTAC 3,通过 linker 将 EGFR 结合元件与 VHL 配体结合,作用于 HCC827 (外显子 19 缺失) 和 H3255 (L858R 突变) 细胞,诱导 EGFR 降解,DC50 分别为 11.7 nM 和 22.3 nM。

• CAS号：2230821-27-7
• 分子式：C₄₇H₅₇ClFN₇O₈S
• 分子量：934.51
• 类别：EGFR

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十二甘醇单甲醚

m-PEG12-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。m-PEG12-OH 也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 12 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：2050595-03-2
• 分子式：C₂₅H₅₂O₁₃
• 分子量：560.67
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-七聚乙二醇

Propargyl-PEG7-alcohol 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG7-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1422023-54-8
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.431
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：447.2±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：224.2±27.3 °C

2,5,8,11,14,17,20,23,26,29-十氧杂三十一烷-31-硫醇

m-PEG10-SH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：651042-85-2
• 分子式：C₂₁H₄₄O₁₀S
• 分子量：488.63300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.079
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-PEG12-alcohol

N-Boc-PEG12-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2218463-36-4
• 分子式：C₂₉H₅₉NO₁₄
• 分子量：645.78
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-(((2R,3R,4R,5R,6R)-3-乙酰氨基-4,5-二乙酰氧基-6-(乙酰氧基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)戊酸

TLR4-IN-C34-C2-COO是一种结合了TLR4抑制剂TLR4-IN-C34的连接器。C34中的TLR4抑制肠细胞和巨噬细胞中的TLR4,并减少内毒素血症和坏死性小肠结肠炎小鼠模型中的全身炎症[1]。

• CAS号：1159408-54-4
• 分子式：C₁₉H₂₉NO₁₁
• 分子量：447.43
• 类别：Toll样受体(TLR)

• 密度：1.29±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：634.1±55.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：337.3±31.5 °C

Thalidomide-amido-PEG2-NH2

沙利度胺-酰胺基-PEG2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2380273-72-1
• 分子式：C₁₉H₂₂N₄O₇
• 分子量：418.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A