蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

丙炔基-十二聚乙二醇-丙炔基

Bis-propargyl-PEG12 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1351373-50-6
• 分子式：C₃₀H₅₄O₁₃
• 分子量：622.742
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：623.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：222.7±30.0 °C

PROTAC AR Degrader-4

PROTAC AR Degrader-4 包含 cIAP1 配体结合基团,linker 和雄激素受体 (AR) 配体结合基团。基于 cIAP1 的降解剂也被称为 SNIPER。

• CAS号：1351169-31-7
• 分子式：C₄₃H₆₇N₃O₉
• 分子量：770.01
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-顺式-4-羟基-D-脯氨酸

N-Boc-cis-4-羟基-D-脯氨酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。N-Boc-顺式-4-羟基-D-脯氨酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成

• CAS号：135042-12-5
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₅
• 分子量：231.246
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：390.9±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：145ºC
• 闪点：190.2±27.9 °C

Thalidomide-5,6-Cl

沙利度胺-5,6-Cl是用于补充CRBN蛋白的沙利度胺基脑啡肽配体。沙利度胺-5,6-Cl可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,从而形成PROTAC。

• CAS号：2648939-40-4
• 分子式：C₁₃H₈Cl₂N₂O₄
• 分子量：327.12
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三聚乙二醇单癸醚

三甘醇单癸基醚是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：4669-23-2
• 分子式：C₁₆H₃₄O₄
• 分子量：290.43900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：0.936 g/mL at 20ºC(lit.)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2-(6-氯己氧基)乙氧基)乙胺 盐酸盐

2-(2-(6-氯己氧基)乙氧基)乙胺(盐酸盐)是一种基于PEG的鱼精蛋白连接剂,可用于鱼精蛋白的合成[1]。

• CAS号：1035373-85-3
• 分子式：C₁₀H₂₃Cl₂NO₂
• 分子量：260.20112
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG4-amino-t-Bu-DADPS-C6-azide

Biotin-PEG4-amino-t-Bu-DADPS-C6-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1260247-50-4
• 分子式：C₄₃H₆₇N₇O₉SSi
• 分子量：886.18
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-N-amido-PEG3-azide

Fmoc-N-amido-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1172605-58-1
• 分子式：C₂₃H₂₈N₄O₅
• 分子量：440.49200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸

炔丙基-PEG2-CH2COOH是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：944561-46-0
• 分子式：C₉H₁₄O₅
• 分子量：202.20
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.158±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：334.9±27.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：129.8±17.2 °C

Aldehyde-benzyl-PEG5-alkyne

Aldehyde-benzyl-PEG5-alkyne 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1378928-83-6
• 分子式：C₁₉H₂₆O₆
• 分子量：350.41
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

exo BCN-O-PNB

exo BCN-O-PNB 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1380006-72-3
• 分子式：C₁₇H₁₇NO₅
• 分子量：315.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-Boc-3-羟基吖丁啶

1-N-Boc-3-羟基氮杂环丁烷是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。1-N-Boc-3-羟基氮杂环丁烷也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC

• CAS号：141699-55-0
• 分子式：C₈H₁₅NO₃
• 分子量：173.210
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：253.7±33.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：42-44°C
• 闪点：107.2±25.4 °C

m-PEG4-phosphonic acid ethyl ester

m-PEG4-phosphonic acid ethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1872433-73-2
• 分子式：C₁₃H₂₉O₇P
• 分子量：328.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙氧基)丙酸

Boc-NH-PEG1-CH2CH2COOH 是一种可降解 (cleavable) 的含 1 个单元 PEG 的 ADC linker,同时也是 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成抗体偶联药物 (ADC) 和 PROTAC。

• CAS号：1260092-44-1
• 分子式：C₁₀H₁₉NO₅
• 分子量：233.262
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：385.0±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：186.7±23.7 °C

Benzyl-PEG6-THP

Benzyl-PEG6-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：230620-73-2
• 分子式：C₂₄H₄₀O₈
• 分子量：456.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG9-alcohol

Azido-PEG9-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1984776-37-5
• 分子式：C₁₈H₃₇N₃O₉
• 分子量：439.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 16

E3 ligase Ligand 16 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 16 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：2249750-27-2
• 分子式：C₃₂H₃₂Cl₂N₄O₆
• 分子量：639.53
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

A947

A947是一种有效且选择性的SMARCA2蛋白水解靶向嵌合体分子(PROTAC)。A947也是一种有效和适度选择性的SMARCA2降解剂。A947对SMARCA2溴结构域具有结合亲和力,Kd值为93nM。A947可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2378056-80-3
• 分子式：C₆₁H₇₆N₁₂O₇S
• 分子量：1121.40
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG4-t-butyl ester

Bis-PEG4-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-53-2
• 分子式：C₂₀H₃₈O₈
• 分子量：406.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG12-CH2COOH

Fmoc-NH-PEG12-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2291257-76-4
• 分子式：C₄₁H₆₃NO₁₆
• 分子量：825.94
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH2-PEG5-C6-Cl hydrochloride

NH2-PEG5-C6-Cl hydrochloride 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2241669-16-7
• 分子式：C₁₆H₃₅Cl₂NO₅
• 分子量：392.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴代-三聚乙二醇

Br-PEG3-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：57641-67-5
• 分子式：C₆H₁₃BrO₃
• 分子量：213.07000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.411±0.06 g/cm3
• 沸点：276.3±20.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：1957236-20-2
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₉
• 分子量：506.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MD13

MD13是一种巨噬细胞移动抑制因子(MIF)导向的PROTAC,Ki为71 nM。MD13可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2758431-97-7
• 分子式：C₃₅H₃₅N₅O₈
• 分子量：653.68
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG10-acid

Bis-PEG10-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG10-acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2055023-26-0
• 分子式：C₂₄H₄₆O₁₄
• 分子量：558.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-4

PROTAC IRAK4降解物-4是从专利US20190192668A1化合物I-127[1]中提取的PROTAC白细胞介素-1受体相关激酶4(IRAK4)降解物。

• CAS号：2360528-45-4
• 分子式：C₄₁H₃₈F₃N₁₁O₁₀
• 分子量：901.80
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇

Hexaethylene glycol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2615-15-8
• 分子式：C₁₂H₂₆O₇
• 分子量：282.331
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：378.3±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：5-7 °C(lit.)
• 闪点：193.7±26.5 °C

SJFα

SJFα 是一种含 13 个原子连接桥的 PROTAC。SJFα 降解 p38α,DC50 为 7.16 nM,但降解 p38δ 效果较差 (DC50=299 nM),且在浓度高达 2.5 μM 时也不会降解其他 p38 亚型 (β 和 γ)。

• CAS号：2254609-27-1
• 分子式：C₅₉H₆₇F₂N₇O₁₁S
• 分子量：1120.27
• 类别：p38 MAPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lenalidomide-C5-amido-Boc

来那度胺-C5-氨基-Boc是以来那度胺为基础的Cereblon配体,用于补充CRBN蛋白。来那度胺-C5-氨基-Boc可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,形成PROTAC[1]。

• CAS号：2138441-25-3
• 分子式：C₂₃H₃₁N₃O₅
• 分子量：429.51
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-5'-C8-acid

Pomalidomide-5'-C8-acid (Compound 3d') 是一种 E3 连接酶配体-linker 偶联物 (E3 ligase ligand-linker conjugate),包含基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 Cereblon (CRBN) 配体和 1 个 linker。Pomalidomide-5'-C8-acid 可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：2682112-09-8
• 分子式：C₂₂H₂₇N₃O₆
• 分子量：429.47
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A