蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Pomalidomide-5-C5-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-5-C5-NH2 hydrochloride 是一种基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体,用于募集 cereblon 蛋白。Pomalidomide-5-C5-NH2 hydrochloride 可通过 linker 连接到蛋白质配体上形成 PROTAC。

• CAS号：2925306-39-2
• 分子式：C₁₈H₂₃ClN₄O₄
• 分子量：394.85
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-OH

TCO-OH 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：85081-69-2
• 分子式：C₈H₁₄O
• 分子量：126.19600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amino-sulfo

Mal-amino-sulfo 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：158018-81-6
• 分子式：C₁₂H₁₂N₂O₉S
• 分子量：360.29700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG4-S-PEG4-propargyl

Propargyl-PEG4-S-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055041-17-1
• 分子式：C₂₂H₃₈O₈S
• 分子量：462.60
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-20

PROTAC BRD4降解剂-20(化合物195)是一种双功能化合物,也是BRD4的降解剂[1]。

• CAS号：2086300-61-8
• 分子式：C₅₅H₅₈ClN₉O₇S₂
• 分子量：1056.69
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-alpha-D-mannose

Azido-PEG4-alpha-D-mannose 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1632372-86-1
• 分子式：C₁₄H₂₇N₃O₉
• 分子量：381.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-S-PEG3-Boc

m-PEG3-S-PEG3-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：2055040-96-3
• 分子式：C₂₀H₄₀O₈S
• 分子量：440.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴代-二聚乙二醇-四氢吡喃醚

Bromo-PEG2-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：152065-54-8
• 分子式：C₉H₁₇BrO₃
• 分子量：253.13
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：314.3±37.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：126.8±25.0 °C

五乙二醇单苄醚对甲苯磺酸酯

苄基-PEG5-Ots是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：129086-10-8
• 分子式：C₂₄H₃₄O₈S
• 分子量：482.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS67

MS67是一种有效和选择性的WD40重复结构域蛋白5(WDR5)降解剂,Kd为63 nM。MS67对其他蛋白质甲基转移酶、激酶、GPCR、离子通道和转运体无效。MS67显示出强烈的抗癌作用[1]。

• CAS号：2407452-77-9
• 分子式：C₅₂H₅₉F₄N₉O₇S
• 分子量：1030.14
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-脱羟乙基达沙替尼

Target Protein-binding moiety 8 是一种能够与 BCR-ABL 结合的结构,用于抑制 BCR-ABL 的活性。

• CAS号：910297-51-7
• 分子式：C₂₀H₂₂ClN₇OS
• 分子量：443.95300
• 类别：PROTAC

• 密度：1.404g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：>300ºC
• 闪点：N/A

Bis-aminooxy-PEG4

Bis-aminooxy-PEG4 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：98627-72-6
• 分子式：C₁₀H₂₄N₂O₆
• 分子量：268.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-beta-D-glucose

Azido-PEG4-beta-D-glucose 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1609083-15-9
• 分子式：C₁₄H₂₇N₃O₉
• 分子量：381.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG8-TFP ester

TCO-PEG8-TFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-06-5
• 分子式：C₃₄H₅₁F₄NO₁₂
• 分子量：741.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG8-amine

TCO-PEG8-amine 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG8-amine 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-92-2
• 分子式：C₂₇H₅₂N₂O₁₀
• 分子量：564.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙酸叔丁酯-六聚乙二醇

Hydroxy-PEG7-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：361189-64-2
• 分子式：C₁₉H₃₈O₉
• 分子量：410.50000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.068 g/ml
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三聚乙二醇-羧酸

Hydroxy-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：518044-49-0
• 分子式：C₉H₁₈O₆
• 分子量：266.288
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：420.7±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：155.5±20.8 °C

Mal-PEG4-Boc

Mal-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：518044-36-5
• 分子式：C₁₉H₃₁NO₈
• 分子量：401.451
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：499.9±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：256.1±27.3 °C

Biotin-PEG4-Amide-C6-Azide

Biotin-PEG4-Amide-C6-Azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1006592-62-6
• 分子式：C₂₇H₄₉N₇O₇S
• 分子量：615.79
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

cIAP1 Ligand-Linker Conjugates 16

cIAP1配体连接物共轭物16是E3连接酶配体连接物共轭物,可用于合成PROTAC。

• CAS号：2143956-63-0
• 分子式：C₂₉H₃₇N₉O₅S
• 分子量：623.73
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

八聚乙二醇一甲醚

Octaethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：25990-96-9
• 分子式：C₁₇H₃₆O₉
• 分子量：384.462
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：454.0±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：228.4±27.3 °C

Methyl acetate-PEG1-methyl acetate

Methyl acetate-PEG1-methyl acetate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：54665-51-9
• 分子式：C₈H₁₄O₆
• 分子量：206.19300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG3-NH2 TFA

Mal-PEG3-NH2 TFA 是一种具有马来酰亚胺和胺的线性异双功能 PEG 交联剂。Mal-PEG3-NH2 TFA 是一种不可降解 (non-cleavable) 的 ADC linker。

• CAS号：2830214-77-0
• 分子式：C₁₄H₂₁F₃N₂O₇
• 分子量：386.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Sulfo DBCO-PEG4-amine

Sulfo DBCO-PEG4-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055198-05-3
• 分子式：C₃₂H₄₆N₄O₁₀S
• 分子量：678.79
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-C4-NH-Boc

Thalidomide-NH-C4-NH-Boc (compound 15) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。

• CAS号：2093388-52-2
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₆
• 分子量：444.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-propargyl-PEG11

Bis-propargyl-PEG11 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1351373-49-3
• 分子式：C₂₈H₅₀O₁₂
• 分子量：578.69
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG6-Tos

Azide-PEG6-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：906007-10-1
• 分子式：C₁₉H₃₁N₃O₈S
• 分子量：461.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 19

E3 ligase Ligand 19 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 19 可以通过 linker 与靶蛋白配体 (比如 SMARCA BD 配体) 连接,形成 PROTAC 分子 (比如 PROTAC 1)。PROTAC 1是 SMARCA2 和 SMARCA4 的部分降解剂。

• CAS号：2306193-99-5
• 分子式：C₂₆H₃₃FN₄O₅S
• 分子量：532.63
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG3-NHS ester

endo-BCN-PEG3-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2101206-94-2
• 分子式：C₂₄H₃₄N₂O₉
• 分子量：494.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-叠氮基-3,6,9-三氧杂十一醇

Azido-PEG4-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：86770-67-4
• 分子式：C₈H₁₇N₃O₄
• 分子量：219.23800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A