蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

PROTAC IRAK4 degrader-5

PROTAC IRAK4降解剂-5是一种基于PROTAC的IRAK4降解剂,从专利US20190192668A1化合物I-171中提取[1]。

• CAS号：2360530-61-4
• 分子式：C₄₁H₄₀F₃N₁₁O₉
• 分子量：887.82
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-3-methylbutanyl acetate-methanesulfonothioate-Me-C10-NH2 TFA

(S,R,S)-AHPC-3-甲基丁酰基乙酸酯-甲磺基诺磺酸酯-Me-C10-NH2 TFA是一种合成的E3连接酶配体-连接物,结合了(S,S,R)-AHPC配体,可用于PROTAC技术[1]。

• CAS号：2417370-89-7
• 分子式：C₄₁H₆₂F₃N₅O₁₀S₃
• 分子量：938.15
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG9

Tos-PEG9 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：62573-11-9
• 分子式：C₂₅H₄₄O₁₂S
• 分子量：568.67500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG4-TFP ester

Mal-amido-PEG4-TFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807540-84-6
• 分子式：C₂₄H₂₈F₄N₂O₉
• 分子量：564.481
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：686.7±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：369.1±31.5 °C

Azido-PEG4-4-nitrophenyl carbonate

Azido-PEG4-4-nitrophenyl carbonate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1422540-98-4
• 分子式：C₁₅H₂₀N₄O₈
• 分子量：384.341
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-八聚乙二醇

Propargyl-PEG8-OH 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG8-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1351556-81-4
• 分子式：C₁₉H₃₆O₉
• 分子量：408.484
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：483.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：246.2±27.3 °C

基于吉非替尼的PROTAC 3

Gefitinib-based PROTAC 3,通过 linker 将 EGFR 结合元件与 VHL 配体结合,作用于 HCC827 (外显子 19 缺失) 和 H3255 (L858R 突变) 细胞,诱导 EGFR 降解,DC50 分别为 11.7 nM 和 22.3 nM。

• CAS号：2230821-27-7
• 分子式：C₄₇H₅₇ClFN₇O₈S
• 分子量：934.51
• 类别：EGFR

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十二甘醇单甲醚

m-PEG12-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。m-PEG12-OH 也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 12 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：2050595-03-2
• 分子式：C₂₅H₅₂O₁₃
• 分子量：560.67
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-七聚乙二醇

Propargyl-PEG7-alcohol 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG7-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1422023-54-8
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.431
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：447.2±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：224.2±27.3 °C

2,5,8,11,14,17,20,23,26,29-十氧杂三十一烷-31-硫醇

m-PEG10-SH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：651042-85-2
• 分子式：C₂₁H₄₄O₁₀S
• 分子量：488.63300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.079
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-(((2R,3R,4R,5R,6R)-3-乙酰氨基-4,5-二乙酰氧基-6-(乙酰氧基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)戊酸

TLR4-IN-C34-C2-COO是一种结合了TLR4抑制剂TLR4-IN-C34的连接器。C34中的TLR4抑制肠细胞和巨噬细胞中的TLR4,并减少内毒素血症和坏死性小肠结肠炎小鼠模型中的全身炎症[1]。

• CAS号：1159408-54-4
• 分子式：C₁₉H₂₉NO₁₁
• 分子量：447.43
• 类别：Toll样受体(TLR)

• 密度：1.29±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：634.1±55.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：337.3±31.5 °C

Thalidomide-amido-PEG2-NH2

沙利度胺-酰胺基-PEG2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2380273-72-1
• 分子式：C₁₉H₂₂N₄O₇
• 分子量：418.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG1-Boc

Propargyl-PEG1-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：488150-84-1
• 分子式：C₁₀H₁₆O₃
• 分子量：184.232
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：239.2±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：93.1±15.0 °C

N'-Boc-N-(Gly-Oleoyl)-Lys

N'-Boc-N-(Gly-Oleoyl)-Lys 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-71-7
• 分子式：C₃₁H₅₇N₃O₆
• 分子量：567.80
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-BOC-2,2-二甲基丁酸

4-Boc-amino-22-dimethylbutyric acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：153039-17-9
• 分子式：C₁₁H₂₁NO₄
• 分子量：231.28900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.065g/cm3
• 沸点：369.9ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：177.5ºC

3-羟基氮杂环丁烷盐酸盐

阿泽替丁-3-醇盐酸盐是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。阿兹替丁-3-醇盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：18621-18-6
• 分子式：C₃H₈ClNO
• 分子量：109.555
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：170.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：90-92°C
• 闪点：120.4ºC

Boc-NH-PEG7-propargyl

Boc-NH-PEG7-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112737-90-1
• 分子式：C₂₂H₄₁NO₉
• 分子量：463.56
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG7-azide

Biotin-PEG7-azide 是基于 PEG 结构的 PROTAC linker,可以用来制备 PROTAC。

• CAS号：1334172-75-6
• 分子式：C₂₆H₄₈N₆O₉S
• 分子量：620.75900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amido-C1-Br

Pomalidomide-amido-C1-Br 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。Pomalidomide-amido-C1-Br 可通过 PROTAC 技术合成 B-Raf 降解剂 PROTAC B-Raf degrader 1 (HY-111758)。PROTAC B-Raf degrader 1 具有抗肿瘤活性。

• CAS号：2351106-38-0
• 分子式：C₁₅H₁₂BrN₃O₅
• 分子量：394.18
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG3-NHS ester

Biotin-PEG3-NHS ester 是基于 PEG 结构的 PROTAC linker, 可以用来制备 PROTAC。

• CAS号：1253286-56-4
• 分子式：C₂₃H₃₆N₄O₉S
• 分子量：544.618
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

α-Lipoic acid-NHS

α-Lipoic acid-NHS 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：40846-94-4
• 分子式：C₁₂H₁₇NO₄S₂
• 分子量：303.39800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：93.0-97.0°C
• 闪点：N/A

Fluorescein-PEG6-NHS ester

Fluorescein-PEG6-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1818294-35-7
• 分子式：C₄₀H₄₅N₃O₁₅S
• 分子量：839.861
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：976.2±75.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：544.2±37.1 °C

3-(2-羟基乙氧基)丙酸叔丁酯

Hydroxy-PEG1-(CH2)2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：671802-00-9
• 分子式：C₉H₁₈O₄
• 分子量：190.23700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.031±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：274.0±15.0℃at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

THP-PEG8-Tos

THP-PEG8-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：669556-37-0
• 分子式：C₂₄H₄₀O₁₀S
• 分子量：520.63300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HO-PEG24-OH

HO-PEG24-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2243942-52-9
• 分子式：C₄₈H₉₈O₂₅
• 分子量：1075.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-硝基异吲哚-1,3-二酮

CRBN配体-9(化合物4d)是CRBN配体(Ki:8.9μM)。CRBN配体-9可用于合成PROTACs[1][2]。

• CAS号：55003-81-1
• 分子式：C₁₃H₉N₃O₆
• 分子量：303.23
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromoacetamido-PEG5-azide

Bromoacetamido-PEG5-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1415800-37-1
• 分子式：C₁₄H₂₇BrN₄O₆
• 分子量：427.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

在6点钟

AT6 是一种 PROTAC AT1 类似物,PROTAC AT1 是一种高度选择性的溴结构域蛋白 (Brd4) 降解剂。

• CAS号：2098836-50-9
• 分子式：C₄₈H₅₈ClN₉O₇S₃
• 分子量：1004.68
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-amido-PEG2-NH2 hydrochloride

沙利度胺-氨基-PEG2-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2380273-73-2
• 分子式：C₁₉H₂₃ClN₄O₇
• 分子量：454.86
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Boc-Aminooxy-PEG7-bromide

t-Boc-Aminooxy-PEG7-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-15-6
• 分子式：C₂₁H₄₂BrNO₁₀
• 分子量：548.46
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A