蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Fmoc-N-PEG24-acid

Fmoc-N-PEG24-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2170484-59-8
• 分子式：C₆₆H₁₁₃NO₂₈
• 分子量：1368.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Mal-N-bis(PEG2-amine)

N-Mal-N-bis(PEG2-amine) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2128735-20-4
• 分子式：C₁₉H₃₄N₄O₇
• 分子量：430.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 17 hydrochloride

E3 ligase Ligand 17 hydrochloride 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 17 hydrochloride 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：2305369-00-8
• 分子式：C₁₅H₁₇ClN₄O₄
• 分子量：352.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET23

dBET23是BRD4异双功能小分子配体(PROTAC),在细胞降解测定中表现出BRD4 BD1(DC50/5h=50nM)的显着和选择性降解。

• CAS号：1957234-83-1
• 分子式：C₄₃H₄₅ClN₈O₉S
• 分子量：885.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24,27-九氧杂三十烷-30-酸叔丁酯

Amino-PEG9-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1818294-44-8
• 分子式：C₂₅H₅₁NO₁₁
• 分子量：541.672
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：576.2±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：91.9±25.0 °C

BnO-PEG1-CH2CO2tBu

BnO-PEG1-CH2CO2tBu 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1309451-06-6
• 分子式：C₁₅H₂₂O₄
• 分子量：266.33300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

沙利度胺-NH-C2-NH2三氟醋酸盐

Thalidomide-NH-(CH2)2-NH2 TFA 是烷基修饰的 Thalidomide (HY-14658),可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-NH-(CH2)2-NH2 TFA 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体,合成靶向 SHP2 蛋白的 PROTAC 小分子。

• CAS号：1957235-67-4
• 分子式：C₁₇H₁₇F₃N₄O₆
• 分子量：430.34
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：>224°C (dec.)
• 闪点：N/A

m-PEG3-amido-C3-triethoxysilane

m-PEG3-amido-C3-triethoxysilane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：2243566-45-0
• 分子式：C₁₇H₃₇NO₇Si
• 分子量：395.56
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Br-PEG3-C2-Boc

Br-PEG3-C2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Br-PEG3-C2-Boc 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：782475-37-0
• 分子式：C₁₃H₂₅BrO₅
• 分子量：341.239
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：375.4±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：180.8±23.7 °C

SIAIS117

SIAIS117是一种有效的Brigatinib-PROTAC降解剂。SIAIS117是基于Brigatinib和VHL-1连接的ALK协议。SIAIS117能有效降解ALK G1202R点突变。SIAIS117阻断SR和H2228癌细胞系的生长。SIAIS117具有小细胞肺癌的潜在抗增殖能力[1]。

• CAS号：2353494-84-3
• 分子式：C₅₇H₇₆ClN₁₀O₇PS
• 分子量：1111.77
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Carboxy-PEG4-phosphonic acid ethyl ester

Carboxy-PEG4-phosphonic acid ethyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1964503-39-6
• 分子式：C₁₅H₃₁O₉P
• 分子量：386.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二聚乙二醇-羧酸

Hydroxy-PEG2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1334286-77-9
• 分子式：C₇H₁₄O₅
• 分子量：178.18306
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(acid-PEG3)-N-bis(PEG3-azide)

N-(acid-PEG3)-N-bis(PEG3-azide) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2182602-17-9
• 分子式：C₂₅H₄₉N₇O₁₁
• 分子量：623.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

五乙二醇单苄醚对甲苯磺酸酯

苄基-PEG5-Ots是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：129086-10-8
• 分子式：C₂₄H₃₄O₈S
• 分子量：482.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS67

MS67是一种有效和选择性的WD40重复结构域蛋白5(WDR5)降解剂,Kd为63 nM。MS67对其他蛋白质甲基转移酶、激酶、GPCR、离子通道和转运体无效。MS67显示出强烈的抗癌作用[1]。

• CAS号：2407452-77-9
• 分子式：C₅₂H₅₉F₄N₉O₇S
• 分子量：1030.14
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-aminooxy-PEG4

Bis-aminooxy-PEG4 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：98627-72-6
• 分子式：C₁₀H₂₄N₂O₆
• 分子量：268.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三聚乙二醇-羧酸

Hydroxy-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：518044-49-0
• 分子式：C₉H₁₈O₆
• 分子量：266.288
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：420.7±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：155.5±20.8 °C

Mal-PEG3-NH2 TFA

Mal-PEG3-NH2 TFA 是一种具有马来酰亚胺和胺的线性异双功能 PEG 交联剂。Mal-PEG3-NH2 TFA 是一种不可降解 (non-cleavable) 的 ADC linker。

• CAS号：2830214-77-0
• 分子式：C₁₄H₂₁F₃N₂O₇
• 分子量：386.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-C4-NH-Boc

Thalidomide-NH-C4-NH-Boc (compound 15) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。

• CAS号：2093388-52-2
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₆
• 分子量：444.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG6-Tos

Azide-PEG6-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：906007-10-1
• 分子式：C₁₉H₃₁N₃O₈S
• 分子量：461.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG3-NHS ester

endo-BCN-PEG3-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2101206-94-2
• 分子式：C₂₄H₃₄N₂O₉
• 分子量：494.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-(苄氧基羰基)氮杂丁烷-3-羧酸

1-Cbz-azetidine-3-羧酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。1-Cbz-氮杂环丁烷-3-羧酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：97628-92-7
• 分子式：C₁₂H₁₃NO₄
• 分子量：235.236
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：421.2±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：208.5±28.7 °C

苄基(S)-11-苄基-1-(9H-芴-9-基)-3,6,9,12,15-五氧-2,18-二氧-4,7,10,13,16-五氮杂-20-酸脂

Fmoc-Gly-Gly-Phe-Gly-CH2-O-CH2-Cbz 是 PROTAC 连接子和马来酰亚胺-GGFG 肽连接子。Fmoc-Gly-Gly-Phe-Gly-CH2-O-CH2-Cbz 可用于合成 Deruxtecan。

• CAS号：2264011-97-2
• 分子式：C₄₀H₄₁N₅O₉
• 分子量：735.78
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基十三甘醇单甲醚

m-PEG12-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。m-PEG12-amine 也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 12 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：1977493-48-3
• 分子式：C₂₅H₅₃NO₁₂
• 分子量：559.688
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：583.6±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：291.3±22.4 °C

BnO-PEG5-Boc

BnO-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807537-31-0
• 分子式：C₂₃H₃₈O₈
• 分子量：442.543
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：507.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：214.4±28.8 °C

PROTAC BRD4 Degrader-17

PROTAC BRD4降解剂-17(化合物13i)是一种强效的PROTAC BR D4降解剂,其IC50值为29.54 nM(BRD4(BD1))和3.82 nM(BR D4(BD2))。PROTAC BRD4降解物-17显著减弱G2/M进展相关细胞周期蛋白B1的表达。PROTAC BRD4降解物-17显著诱导MV-4-11细胞凋亡[1]。

• CAS号：2585561-49-3
• 分子式：C₄₉H₄₇N₇O₉
• 分子量：877.94
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-C2-NH2(E3 ligase Ligand 17)

E3 ligase Ligand 17 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 17 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：1957235-66-3
• 分子式：C₁₅H₁₆N₄O₄
• 分子量：316.31
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG3-C2-NH-Boc

Aminooxy-PEG3-C2-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2062663-65-2
• 分子式：C₁₃H₂₈N₂O₆
• 分子量：308.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dFKBP-1

dFKBP-1 是一种基于 PROTAC 的有效的 FKBP12 降解剂。dFKBP-1 包含 FKBP12 配体 SLF,基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和一个 linker。

• CAS号：1799711-22-0
• 分子式：C₅₃H₆₄N₆O₁₄
• 分子量：1009.11
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-PEG4-acid

DBCO-PEG4-酸是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2110448-99-0
• 分子式：C₃₀H₃₆N₂O₈
• 分子量：552.62
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A