蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

NH2-C2-NH-Boc-d4

NH2-C2-NH-Boc-d4是氘标记的NH2-C2-NH-Boc[1]。NH2-C2-NH-Boc(PROTAC连接体22)是一种基于烷基链的PROTAC接头,可用于合成PROTAC[2]。

• CAS号：509148-73-6
• 分子式：C₇H₁₂D₄N₂O₂
• 分子量：164.239
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：252.8±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：106.7±22.6 °C

N-Methyl-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5

N-Methyl-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-22-1
• 分子式：C₃₂H₄₁ClN₂O₃
• 分子量：537.13
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG12-Tos

Azide-PEG12-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1821464-56-5
• 分子式：C₃₁H₅₅N₃O₁₄S
• 分子量：725.85
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-三聚乙二醇

Azido-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：86520-52-7
• 分子式：C₆H₁₃N₃O₃
• 分子量：175.18600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：-33℃

AU-15330

AU-15330是SWI/SNF ATP酶亚单位SMARCA2和SMARCA4的蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)降解物。AU-15330在前列腺癌异种移植模型中诱导对肿瘤生长的有效抑制,并与AR拮抗剂恩扎鲁胺协同作用。AU-15330在无毒性的去势耐受性前列腺癌(CRPC)模型中诱导疾病缓解[1]。

• CAS号：2380274-50-8
• 分子式：C₃₉H₄₉N₉O₅S
• 分子量：755.93
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH-bis(PEG2-C2-Boc)

NH-bis(PEG2-C2-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1964503-36-3
• 分子式：C₂₂H₄₃NO₈
• 分子量：449.58
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG2-C6-Cl

Azido-PEG2-C6-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2568146-55-2
• 分子式：C₁₀H₂₀ClN₃O₂
• 分子量：249.74
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Mal-N-bis(PEG4-NH-Boc)

N-Mal-N-bis(PEG4-NH-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2128735-27-1
• 分子式：C₃₇H₆₆N₄O₁₅
• 分子量：806.94
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

四甘醇单苄醚

BnO-PEG4-OH 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：86259-87-2
• 分子式：C₁₅H₂₄O₅
• 分子量：284.348
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：398.7±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：194.9±25.1 °C

Tetrazine-Ph-PEG5-NHS ester

Tetrazine-Ph-PEG5-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1682653-80-0
• 分子式：C₂₇H₃₆N₆O₁₀
• 分子量：604.609
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-PEG2-C2-NH-Boc

Thalidomide-NH-PEG2-C2-NH-Boc 是一种合成的 E3 连接酶配体-连接体偶联物,结合了基于 Thalidomide 的 Cereblon 配体和一个PEG Linker,可用于 dBRD9 (化合物 6) 合成。dBRD9 是一种选择性 BRD9 PROTAC 探针。

• CAS号：2097509-40-3
• 分子式：C₂₄H₃₂N₄O₈
• 分子量：504.53
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二十二烷二酸

二十二碳二烯酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。二十二碳二烯酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：505-56-6
• 分子式：C₂₂H₄₂O₄
• 分子量：370.566
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：527.0±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：72-80 °C(lit.)
• 闪点：286.6±19.1 °C

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2694727-89-2
• 分子式：C₁₅H₁₆ClN₃O₅
• 分子量：353.76
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

生物素化-epsilon-氨基己酸-N-羟基丁二酰亚胺活化酯

Biotin-C5-NHS Ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：72040-63-2
• 分子式：C₂₀H₃₀N₄O₆S
• 分子量：454.540
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：169-171 °C
• 闪点：N/A

ERD-3111

ERD-3111 (Compound 44) 是一种具有口服活性的 PROTAC ERα 降解剂 (DC50: 0.5 nM)。ERD-3111 可抑制具有野生型 ER 的亲本 MCF-7 异种移植模型和两种临床相关的 ESR1 突变小鼠模型中的肿瘤生长。ERD-3111 可用于 ER+乳腺癌的研究。

• CAS号：2832865-25-3
• 分子式：C₄₅H₄₆F₄N₈O₅
• 分子量：854.89
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-methyl-N'-methyl-O-(m-PEG4)-O'-(propargyl-PEG4)-Cy5

N-methyl-N'-methyl-O-(m-PEG4)-O'-(propargyl-PEG4)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-50-5
• 分子式：C₄₇H₆₇ClN₂O₁₀
• 分子量：855.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG6-bromide

Benzyl-PEG6-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1449202-44-1
• 分子式：C₁₉H₃₁BrO₆
• 分子量：435.35
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.225±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：481.4±40.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

L-Azidohomoalanine

L-Azidohomoalanine 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：120042-14-0
• 分子式：C₄H₈N₄O₂
• 分子量：144.13200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：220-223ºC
• 闪点：N/A

m-PEG3-Aminooxy

m-PEG3-Aminooxy 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：248275-10-7
• 分子式：C₇H₁₇NO₄
• 分子量：179.21
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG17-methane

Propargyl-PEG17-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2169967-47-7
• 分子式：C₃₆H₇₀O₁₇
• 分子量：774.93
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-N-PEG7-acid

Fmoc-N-amido-PEG7-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1863885-74-8
• 分子式：C₃₂H₄₅NO₁₁
• 分子量：619.700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：758.0±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：412.2±32.9 °C

Ald-Ph-PEG6-acid

Ald-Ph-PEG6-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055013-55-1
• 分子式：C₂₃H₃₅NO₁₀
• 分子量：485.52
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ERD-308

ERD-308 是一个强效的、基于PROTAC技术的雌激素受体 (ER) 的降解剂,其在MCF-7 细胞中测得的DC50 值为 0.17 nM。

• CAS号：2320561-35-9
• 分子式：C₅₅H₆₅N₅O₉S₂
• 分子量：1004.26
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-羟基丙酸甲酯

Methyl 3-hydroxypropanoate 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：6149-41-3
• 分子式：C₄H₈O₃
• 分子量：104.104
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：180.5±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：72.6±12.6 °C

Pomalidomide-5-C9-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-5-C9-NH2 hydrochloride 是一种基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体,用于募集 cereblon 蛋白。Pomalidomide-5-C9-NH2 hydrochloride 可通过 linker 连接到蛋白质配体上形成 PROTAC。

• CAS号：2925306-22-3
• 分子式：C₂₂H₃₁ClN₄O₄
• 分子量：450.96
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG9-acid

Propargyl-PEG9-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1613752-50-3
• 分子式：C₂₂H₄₀O₁₁
• 分子量：480.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Biotin-N-bis(PEG4-acid)

N-Biotin-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1964503-35-2
• 分子式：C₃₂H₅₇N₃O₁₄S
• 分子量：739.87
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Sulfone-Bis-PEG4-acid

Sulfone-Bis-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055024-37-6
• 分子式：C₂₂H₄₂O₁₄S
• 分子量：562.63
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N,N'-DME-N-PEG2-Boc

N,N'-DME-N-PEG2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2279944-69-1
• 分子式：C₁₅H₃₂N₂O₄
• 分子量：304.43
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3,4-Dibromo-Mal-PEG4-Boc

3,4-Dibromo-Mal-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2030168-38-6
• 分子式：C₁₉H₂₉Br₂NO₈
• 分子量：559.24
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A