蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Benzyloxy-C5-PEG1

Benzyloxy-C5-PEG1 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：159028-70-3
• 分子式：C₁₄H₂₂O₃
• 分子量：238.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cl-PEG4-acid

Cl-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：158553-98-1
• 分子式：C₁₀H₁₉ClO₆
• 分子量：270.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Halo PROTAC 1

Halo PROTAC 1 是一种 PROTAC 分子,通过 PEG 接头连接具有 HaloTag 融合的细胞内蛋白质的活性配体和具有诱导细胞内分子自噬活性的结构而成。

• CAS号：2241668-45-9
• 分子式：C₃₃H₄₉Cl₂N₇O₈S
• 分子量：774.76
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴代-二聚乙二醇-羧酸

Bromo-PEG2-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807503-92-9
• 分子式：C₇H₁₃BrO₄
• 分子量：241.080
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：347.2±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：163.8±23.7 °C

MS-PEG1-THP

MS-PEG1-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1309248-13-2
• 分子式：C₈H₁₆O₅S
• 分子量：224.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-八聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Azido-PEG8-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：1623791-99-0
• 分子式：C₂₃H₄₅N₃O₁₀
• 分子量：523.62
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-NHS ester

TCO-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1191901-33-3
• 分子式：C₁₃H₁₇NO₅
• 分子量：267.278
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：369.1±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：177.0±28.7 °C

N-Boc-N-bis(C2-PEG1-azide)

N-Boc-N-bis(C2-PEG1-azide) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-79-2
• 分子式：C₁₃H₂₅N₇O₄
• 分子量：343.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Iodoacetyl-PEG4-NHS ester

Iodoacetyl-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2517899-65-7
• 分子式：C₁₇H₂₇IN₂O₉
• 分子量：530.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

顺式-1-N-叔丁氧羰基-4-羟基-D-脯氨酸甲酯

N-Boc-cis-4-羟基-D-脯氨酸甲酯是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。N-Boc-顺式-4-羟基-D-脯氨酸甲酯也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：114676-69-6
• 分子式：C₁₁H₁₉NO₅
• 分子量：245.27200
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.216g/cm3
• 沸点：335.2ºC at 760mmHg
• 熔点：80 °C
• 闪点：156.6ºC

RSS0680

RSS0680(实施例22)是激酶的双功能化合物靶向蛋白质降解。RSS0680降解AAK1、CDK1、CDM16、CDK2、CDK4、CDK6、EIF2AK4、GAK、LATSl、LIMK2、MAPK6、MAPKAPK5、MARK2、MARK4、MKNK2、NEK9、RPS6KB1、SIK2、SNRK、STK17A、STK117B、STK35和WEEl。RSS0680可用于研究由异常激酶活性介导的疾病[1]。

• CAS号：2769753-48-0
• 分子式：C₅₂H₆₄N₁₀O₆S₃
• 分子量：1021.32
• 类别：CDK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBRD9

dBRD9是桥接BRD9溴结构域和cereblon E3泛素连接酶复合物的PROTAC；与亲本配体相比表现出显着增强的效力(10-100倍)。

• CAS号：2170679-45-3
• 分子式：C₄₀H₄₅N₇O₁₀
• 分子量：783.839
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-叠氮基-1-丁胺

4-Azidobutylamine 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain 类。4-Azidobutylamine 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：88192-20-5
• 分子式：C₄H₁₀N₄
• 分子量：114.14900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-CH2-PEG5-Boc

Ald-CH2-PEG5-Boc是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可以用于合成 PROTAC。

• CAS号：1446282-23-0
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.431
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：440.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：189.0±27.4 °C

N-(Boc-PEG2)-N-bis(PEG3-azide)

N-(Boc-PEG2)-N-bis(PEG3-azide) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-46-6
• 分子式：C₂₈H₅₃N₇O₁₁
• 分子量：663.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Brigatinib C

Brigatinib C是一种连接子,作为PROTAC连接子的一部分,靶向HJM-561(HY-156698)。

• CAS号：1197958-75-0
• 分子式：C₂₈H₃₇ClN₇O₂P
• 分子量：570.07
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

胱胺

Cystamine 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：51-85-4
• 分子式：C₄H₁₂N₂S₂
• 分子量：152.28100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.172g/cm3
• 沸点：264.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：114ºC

N-Boc-(2R,4S)--4-羟基-D-脯氨酸甲酯

Boc-trans-D-Hyp-OMe是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Boc-trans-D-Hyp-OMe也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：135042-17-0
• 分子式：C₁₁H₁₉NO₅
• 分子量：245.272
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：387.6±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：188.2±27.9 °C

二对甲苯磺酸戊乙二醇

Pentaethylene glycol di(p-toluenesulfonate) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：41024-91-3
• 分子式：C₂₄H₃₄O₁₀S₂
• 分子量：546.65100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.26
• 沸点：661.4ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：353.8ºC

(2-Pyridyldithio)-PEG4-propargyl

(2-Pyridyldithio)-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2170240-99-8
• 分子式：C₁₆H₂₃NO₄S₂
• 分子量：357.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-5'-PEG8-C2-COOH

泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH是一种E3连接酶-配体-连接物缀合物,由泊马度酰胺(HY-10984)和连接物组成。泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH可用于合成PROTACs[1]。

• CAS号：2138440-78-3
• 分子式：C₃₂H₄₇N₃O₁₄
• 分子量：697.73
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG5-azide

炔丙基-PEG5-叠氮化物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于PROTAC的合成[1]。

• CAS号：1589522-62-2
• 分子式：C₁₃H₂₃N₃O₅
• 分子量：301.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,3,4,6-Tetra-o-acetyl-alpha-galactosylpyranosyl bromide

2,3,4,6-Tetra-o-acetyl-alpha-galactosylpyranosyl bromide 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：529493-92-3
• 分子式：C₁₄H₁₉BrO₉
• 分子量：411.20
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮基-PEG4-胺

PROTAC Linker 20 是一种 PEG 类的 PROTAC 连接桥。PROTAC Linker 20 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：951671-92-4
• 分子式：C₁₀H₂₂N₄O₄
• 分子量：262.30600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.10 g/mL
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C2-amide-benzofuranylmethyl-pyridine

(S,R,S)-AHPC-C2-酰胺-苯并呋喃甲酰甲基吡啶是一种双靶点蛋白聚糖,不仅可以靶向Smad3的泛素化和降解,而且可以提高HIF-α蛋白水平。(S,R,S)-AHPC-C2-酰胺-苯并呋喃甲酰甲基吡啶具有多径抗纤维化功能和肾保护功能,用于肾性贫血的研究[1]。

• CAS号：2347517-69-3
• 分子式：C₄₁H₄₆N₆O₆S
• 分子量：750.91
• 类别：HIF/HIF脯氨酰-羟化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG5-mal

Mal-PEG5-mal 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：113387-03-4
• 分子式：C₂₀H₂₈N₂O₉
• 分子量：440.44
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SCO-PEG8-NHS

SCO-PEG8-NHS SCO 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。SCO-PEG8-NHS SCO 含有的 SCO 和 NHS 酯可以分别与氨基共价结合。SCO 通常用于与蛋白质或多肽的氨基酸残基(特别是赖氨酸)发生反应。

• CAS号：2143968-68-5
• 分子式：C₃₂H₅₂N₂O₁₄
• 分子量：688.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-N-bis(PEG4-C2-acid)

Mal-N-bis(PEG4-C2-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-52-1
• 分子式：C₂₉H₄₈N₂O₁₅
• 分子量：664.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC PTPN2 degrader-1

PROTAC PTPN2降解剂-1(化合物实施例77)是有效的PTPN2去除剂。PROTAC PTPN2降解物-1具有研究癌症或代谢疾病的潜力[1]。

• CAS号：2655638-07-4
• 分子式：C₃₃H₂₇FN₆O₈S
• 分子量：686.67
• 类别：磷酸酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG7-thiourea

Biotin-PEG7-thiourea 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-59-1
• 分子式：C₂₇H₅₁N₅O₉S₂
• 分子量：653.85
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A