蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Thalidomide-O-amido-C6-NH2 hydrochloride

Thalidomide-O-amido-C6-NH2 hydrochloride 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2376990-31-5
• 分子式：C₂₁H₂₇ClN₄O₆
• 分子量：466.92
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG9-NHS ester

Mal-氨基-PEG9-NHS酯是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2575631-92-2
• 分子式：C₃₂H₅₁N₃O₁₆
• 分子量：733.76
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3,4-Dibromo-Mal-PEG2-amine

3,4-Dibromo-Mal-PEG2-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807534-86-6
• 分子式：C₁₀H₁₄Br₂N₂O₄
• 分子量：386.037
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.8±0.1 g/cm3
• 沸点：425.1±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：210.9±28.7 °C

m-PEG20-alcohol

m-PEG20-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1059605-06-9
• 分子式：C₄₁H₈₄O₂₁
• 分子量：913.09
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-NH-PEG8-CH2CH2COOPFP ester

Mal-NH-PEG8-CH2CH2COOPFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055023-14-6
• 分子式：C₃₂H₄₃F₅N₂O₁₃
• 分子量：758.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-N-PEG1-C2-NHS ester

Boc-N-PEG1-C2-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1260092-55-4
• 分子式：C₁₄H₂₂N₂O₇
• 分子量：330.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(Biotin-amido)-1,3-bis-(C1-PEG1-acid)

2-(Biotin-amido)-13-bis(carboxylethoxy)propane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2086689-02-1
• 分子式：C₁₉H₃₁N₃O₈S
• 分子量：461.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基十甘醇单甲醚

m-PEG10-amine 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 10 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。m-PEG10-amine 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1383658-09-0
• 分子式：C₂₁H₄₅NO₁₀
• 分子量：471.583
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：518.9±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：254.4±22.4 °C

DB0614

DB0614(实施例21)是激酶的双功能化合物靶向蛋白质降解。DB0614降解AAK1、AURKA、BMP2K、CAMKK1、CDK16、CML、CDK6、EIF2AK2、FER、GAK、LCK、LIMK2、MAP3KH、MAPK8、MAPK9、NEK9、PLK4、PTK2B、SIK2、STK17A、STK117B、ULK1、ULK3和WEE1。DB0614可用于研究由异常激酶活性介导的疾病[1]。

• CAS号：2769753-47-9
• 分子式：C₄₁H₄₂N₈O₇S₂
• 分子量：822.95
• 类别：Ferroptosis

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC ER Degrader-4

PROTAC ER Degrader-4 是一种 PROATC 雌激素受体 (ER) 降解剂,与 ER 结合,IC50 为 0.8 nM。PROTAC ER Degrader-4 在 MCF-7 细胞中诱导 ER 降解,IC50 为 0.3 nM。

• CAS号：2361114-15-8
• 分子式：C₅₃H₆₇F₃N₆O₈S
• 分子量：1005.19
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

XF056-132

XF056-132是一种有效的WDR5(WD40重复结构域蛋白5)PROTAC降解剂[1]。

• CAS号：2407450-73-9
• 分子式：C₅₁H₅₇F₄N₉O₇S
• 分子量：1016.11
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C8-NH2 dihydrochloride

(S,R,S)-AHPC-C8-NH2 dihydrochloride (VH032-C8-NH2 dihydrochloride) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 VH032 的 VHL 配体和 1 个 linker。(S,R,S)-AHPC-C8-NH2 可用于合成靶向 AKT 的 PROTAC 降解剂,例 8,XF038-164A,源于专利文献 WO2019173516A1。

• CAS号：2341796-80-1
• 分子式：C₃₁H₄₉Cl₂N₅O₄S
• 分子量：658.72
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

四乙二醇单十六烷基醚

Tetraethylene glycol monohexadecyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5274-63-5
• 分子式：C₂₄H₅₀O₅
• 分子量：418.65100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：37-38ºC
• 闪点：N/A

Mal-PEG8-NHS ester

Mal-PEG8-acid 是一种基于 PEG 结构的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：2055033-05-9
• 分子式：C₂₇H₄₂N₂O₁₄
• 分子量：618.63
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-58-0
• 分子式：C₃₈H₇₄N₄O₁₅
• 分子量：827.01
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-C2-SulfoNHS ester

DBCO-C2-SulfoNHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1803279-86-8
• 分子式：C₂₃H₁₈N₂O₈S
• 分子量：482.46
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG2-C2-sulfonic acid

Azido-PEG2-C2-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-39-9
• 分子式：C₆H₁₃N₃O₅S
• 分子量：239.249
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-C1-PEG3-C4-OH

Boc-C1-PEG3-C4-OH 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。Boc-C1-PEG3-C4-OH 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：2376724-97-7
• 分子式：C₁₆H₃₂O₆
• 分子量：320.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG3-C3-NH2

Biotin-PEG3-C3-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1374658-86-2
• 分子式：C₂₀H₃₈N₄O₅S
• 分子量：446.6
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-NH-PEG2-propargyl

Boc-NH-PEG2-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1895922-74-3
• 分子式：C₁₂H₂₁NO₅
• 分子量：259.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-15

PROTAC BRD4降解剂-15是一种有效的BRD4降解剂,BRD4 BD1和BD2的IC50分别为7.2 nM和8.1 nM。PROTAC BRD4降解剂-15能够有效降解PC3前列腺癌细胞中的BRD4蛋白[1]。

• CAS号：2417370-67-1
• 分子式：C₅₇H₆₂F₂N₁₀O₁₀S₂
• 分子量：1149.29
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG5-phosphonic acid

Bromo-PEG5-phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1446282-37-6
• 分子式：C₁₂H₂₆BrO₈P
• 分子量：409.21
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-(CH2)3-methyl ester

Azido-PEG4-(CH2)3-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-71-1
• 分子式：C₁₃H₂₅N₃O₆
• 分子量：319.35
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-propargyl

Thalidomide-propargyl 是一种基于 Thalidomide 的,可募集 CRBN 蛋白的 Cereblon 配体。Thalidomide-propargyl 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成含 IMiD的 PROTAC。

• CAS号：2098487-39-7
• 分子式：C₁₆H₁₂N₂O₅
• 分子量：312.27688
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG5-azide

Azido-PEG5-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：356046-26-9
• 分子式：C₁₂H₂₄N₆O₅
• 分子量：332.35600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-C10-OBn

溴-C10-OBn是一种可用于合成PROTAC的PROTAC连接剂。

• CAS号：78277-30-2
• 分子式：C₁₈H₂₇BrO₂
• 分子量：355.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：412.7±18.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：203.4±21.2 °C

Br-PEG4-THP

Br-PEG4-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1803547-60-5
• 分子式：C₁₃H₂₅BrO₅
• 分子量：341.24
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-三聚乙二醇-羧基

Propargyl-PEG3-acid是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 3 个单元 PEG 的 ADC linker,同时也是基于PEG的PROTAC linker,可用于合成6-OHDA-PEG3-yne。6-OHDA-PEG3-yne 包含6-OHDA (HY-B1081, HY-B1081A) 和Propargyl-PEG3-acid。

• CAS号：1347760-82-0
• 分子式：C₁₀H₁₆O₅
• 分子量：216.231
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：348.0±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：131.8±18.6 °C

BDP FL-PEG4-amine

BDP FL-PEG4-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183473-14-3
• 分子式：C₂₄H₃₇BF₂N₄O₅
• 分子量：510.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-NHS-ester

Azido-PEG4-NHS-ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807534-82-2
• 分子式：C₁₄H₂₂N₄O₈
• 分子量：374.346
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A