蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

DBCO-Biotin

DBCO-生物素是用于抗体-药物缀合物的点击化学混合物。

• CAS号：1418217-95-4
• 分子式：C₂₈H₃₀N₄O₃S
• 分子量：502.628
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：905.9±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：501.6±34.3 °C

PROTAC Linker 31

PROTAC Linker 31 是一种 PROTAC 连接桥,属于 Alkyl-Chain 类。PROTAC Linker 31 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：1263819-48-2
• 分子式：C₁₂H₁₈N₂O₂
• 分子量：222.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-amido-CH2-PEG3-CH2-NH-Boc

沙利度胺-O-氨基-CH2-PEG3-CH2-NH-Boc是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物。沙利度胺-O-氨基-CH2-PEG3-CH2-NH-Boc结合了沙利度胺基cereblon配体和连接剂。沙利度胺-O-氨基-CH2-PEG3-CH2-NH-Boc可用于合成普罗塔克BET降解剂[1]。(来自专利WO2017180417A1化合物s7)。

• CAS号：1799711-31-1
• 分子式：C₃₀H₄₂N₄O₁₁
• 分子量：634.67
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG3-C2-NH2 hydrochloride

泊马利度胺-PEG3-C2-NH2(Cereblon配体连接物共轭物5)盐酸盐是一种合成的E3连接酶配体连接物共轭物,它结合了基于泊马利度胺的Cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2446474-09-3
• 分子式：C₂₁H₂₉ClN₄O₇
• 分子量：484.93
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-propargyl

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-37-7
• 分子式：C₁₃H₂₁F₃O₅
• 分子量：314.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG12-CH2COOH

Fmoc-NH-PEG12-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2291257-76-4
• 分子式：C₄₁H₆₃NO₁₆
• 分子量：825.94
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-amido-PEG2-C2-NH2 hydrochloride

Thalidomide-O-amido-PEG2-C2-NH2 hydrochloride 结合了 E3 连接酶配体和 linker,可作为免疫调节剂治疗癌症。

• CAS号：2376990-30-4
• 分子式：C₂₁H₂₇ClN₄O₈
• 分子量：498.91
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amino-PEG4-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-氨基-PEG4-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于Pomalidomide的cereblon配体和用于PROTAC技术的连接物[1]。

• CAS号：2331259-45-9
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₉
• 分子量：506.51
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

THP-PEG4-Pyrrolidine(N-Me)-CH2OH

THP-PEG4-Pyrrolidine(N-Me)-CH2OH 是基于 PEG 结构的 PROTAC linker, 可以用来制备 PROTAC K-Ras Degrader-1 (HY-129523)。

• CAS号：2378261-81-3
• 分子式：C₁₉H₃₇NO₇
• 分子量：391.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶配体4

E3 ligase Ligand 4 是一种 E3 泛素连接酶的配体,可用于 PROTAC 技术研究。

• CAS号：835616-60-9
• 分子式：C₁₃H₉FN₂O₄
• 分子量：276.22000
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.570±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶Ligand-Linker共轭物5

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 5 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：2097971-11-2
• 分子式：C₃₀H₄₆ClN₅O₇S
• 分子量：656.23
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC ERRα Degrader-2

PROTAC ERRalpha Degrader-2 包含 MDM2 配体结合基团,linker 和雌激素相关受体α (ERRa) 配体结合基团。PROTAC ERRalpha Degrader-2 是一种 ERRa 降解剂。

• CAS号：2306388-85-0
• 分子式：C₅₇H₅₅Cl₂F₆N₇O₈
• 分子量：1150.99
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH2-PEG5-C6-Cl hydrochloride

NH2-PEG5-C6-Cl hydrochloride 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2241669-16-7
• 分子式：C₁₆H₃₅Cl₂NO₅
• 分子量：392.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG3-t-butyl ester

Bis-PEG3-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1611468-29-1
• 分子式：C₁₈H₃₄O₇
• 分子量：362.46
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴代-三聚乙二醇

Br-PEG3-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：57641-67-5
• 分子式：C₆H₁₃BrO₃
• 分子量：213.07000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.411±0.06 g/cm3
• 沸点：276.3±20.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 21 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：1957236-20-2
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₉
• 分子量：506.51
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MD13

MD13是一种巨噬细胞移动抑制因子(MIF)导向的PROTAC,Ki为71 nM。MD13可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2758431-97-7
• 分子式：C₃₅H₃₅N₅O₈
• 分子量：653.68
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-CH2-alcohol

m-PEG3-CH2-alcohol 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：100688-48-0
• 分子式：C₈H₁₈O₄
• 分子量：178.22600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C4-COOH

沙利度胺-O-C4-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2169266-67-3
• 分子式：C₁₈H₁₈N₂O₇
• 分子量：374.34
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3,6,9,12,15,18,21,24,27-九氧杂二十八烷酸

m-PEG8-CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：102013-72-9
• 分子式：C₁₉H₃₈O₁₁
• 分子量：442.49800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.122
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG10-acid

Bis-PEG10-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG10-acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2055023-26-0
• 分子式：C₂₄H₄₆O₁₄
• 分子量：558.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C5-NH2

沙利度胺-O-C5-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2307477-23-0
• 分子式：C₁₈H₂₁N₃O₅
• 分子量：359.38
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG5-sulfonic acid

m-PEG5-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807505-35-6
• 分子式：C₁₁H₂₄O₈S
• 分子量：316.368
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRAF-V600E degrader-2

PROTAC BRAF-V600E降解剂-2(化合物12)是一种强效的BRAF-V600 E降解剂,其对于BRAF和BRAF-V6100E的Kds分别为14.4 nM和9.5 nM。PROTAC BRAF-V600E降解器-2选择性降解BRAF-V600 E的激酶结构域,但不降解野生型BRAF。PROTAC BRAF-V600E降解物-2抑制黑色素瘤细胞生长[1]。

• CAS号：2417296-82-1
• 分子式：C₄₂H₃₉F₂N₇O₈S
• 分子量：839.86
• 类别：拉夫

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-PEG2-C2-NHS ester

Fmoc-PEG2-CH2CH2-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807534-85-5
• 分子式：C₂₆H₂₈N₂O₈
• 分子量：496.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(叔丁氧羰基)-5-氨基戊酸

Boc-NH-C4-acid 是 PROTAC linker,属于 Alkyl/ether 类。Boc-NH-C4-acid 可用于化合物 PROTAC1 的合成,并且可以降解 PRC2 中的 EED,EZH2,和 SUZ12。

• CAS号：27219-07-4
• 分子式：C₁₀H₁₉NO₄
• 分子量：217.262
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：331.7±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：48-52 °C(lit.)
• 闪点：154.4±23.7 °C

Azido-PEG11-alcohol

Azido-PEG11-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2252392-53-1
• 分子式：C₂₂H₄₅N₃O₁₁
• 分子量：527.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-4

PROTAC IRAK4降解物-4是从专利US20190192668A1化合物I-127[1]中提取的PROTAC白细胞介素-1受体相关激酶4(IRAK4)降解物。

• CAS号：2360528-45-4
• 分子式：C₄₁H₃₈F₃N₁₁O₁₀
• 分子量：901.80
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG5-methyl ester

Boc-PEG5-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807530-04-6
• 分子式：C₁₉H₃₆O₉
• 分子量：408.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thiol-C9-PEG4-acid

Thiol-C9-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：716339-41-2
• 分子式：C₁₉H₃₈O₆S
• 分子量：394.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A