蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

1,2-双(2-碘乙氧基)乙烷

1,2-Bis(2-iodoethoxy)ethane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。1,2-Bis(2-iodoethoxy)ethane 可用于合成 MT802 (HY-122562) 和 SJF620 (HY-133137)。MT-802 和 SJF620 都是 PROTAC BTK 降解剂,DC50 分别为 1 和 7.9 nM。

• CAS号：36839-55-1
• 分子式：C₆H₁₂I₂O₂
• 分子量：369.96700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：2.028 g/mL at 25 °C(lit.)
• 沸点：293.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：>230 °F

Tos-PEG4-acid

Tos-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1453117-42-4
• 分子式：C₁₆H₂₄O₈S
• 分子量：376.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶Ligand-Linker Conjugates 12

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 12是用于 PROTAC 技术的化合物,其结合了E3连接酶配体和连接桥。

• CAS号：1797406-80-4
• 分子式：C₃₀H₄₃N₇O₇S
• 分子量：645.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Tos-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Tos-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112737-74-1
• 分子式：C₄₅H₈₁NO₁₈S
• 分子量：956.19
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-5-OH

Pomalidomide-5-OH(5-羟基Pomalidomide)是用于补充CRBN蛋白的基于Pomalidomide的cereblon(CRBN)配体。Pomalidomide-5-OH可以通过连接物连接到蛋白质的配体,形成PROTAC[1]。

• CAS号：1547162-41-3
• 分子式：C₁₃H₁₁N₃O₅
• 分子量：289.24
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.7±0.1 g/cm3
• 沸点：633.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：336.6±31.5 °C

Pomalidomide-C11-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-C11-NH2 hydrochloride 是一种基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体,用于募集 cereblon 蛋白。Pomalidomide-C11-NH2 hydrochloride 可通过 linker 连接到蛋白质配体上形成 PROTAC。

• CAS号：2722611-55-2
• 分子式：C₂₄H₃₅ClN₄O₄
• 分子量：479.01
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(m-PEG9)-N'-(PEG5-acid)-Cy5

N-(m-PEG9)-N'-(PEG5-acid)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-26-5
• 分子式：C₅₇H₈₉ClN₂O₁₆
• 分子量：1093.77
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十甘醇

Decaethylene glycol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5579-66-8
• 分子式：C₂₀H₄₂O₁₁
• 分子量：458.541
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：539.5±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：28ºC
• 闪点：280.1±28.7 °C

Pyrene-amido-PEG4-azide

Pyrene-amido-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-36-6
• 分子式：C₂₅H₂₈N₄O₄
• 分子量：448.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG6-OH

Tos-PEG6-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：42749-28-0
• 分子式：C₁₉H₃₂O₉S
• 分子量：436.517
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：555.5±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：289.7±30.1 °C

Pomalidomide-amino-PEG4-C4-Cl

Pomalidomide-amino-PEG4-C4-Cl (Intermediate 4d) 是一种 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide (HY-10984) 的 cereblon (CRBN) 配体和 1 个 linker。Pomalidomide-amino-PEG4-C4-Cl 可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：2924835-36-7
• 分子式：C₂₇H₃₆ClN₃O₉
• 分子量：582.04
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-C5-amino-C5-amino

Biotin-C5-amino-C5-amino 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：89889-51-0
• 分子式：C₂₂H₃₈N₄O₅S
• 分子量：470.62600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PEG2-bis(phosphonic acid diethyl ester)

PEG2-bis(phosphonic acid diethyl ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：500347-73-9
• 分子式：C₁₂H₂₈O₉P₂
• 分子量：378.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Carboxyfluorescein-PEG12-NHS

Carboxyfluorescein-PEG12-NHS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2246595-66-2
• 分子式：C₅₂H₆₈N₂O₂₂
• 分子量：1073.10
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3连接酶Ligand-Linker共轭物4

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 4 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：1797406-81-5
• 分子式：C₃₂H₄₇N₇O₈S
• 分子量：689.82
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

37-氨基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-十一氧杂-2-氮杂三十七烷酸叔丁酯

Boc-NH-PEG11-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1233234-77-9
• 分子式：C₂₉H₆₀N₂O₁₃
• 分子量：644.792
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：667.6±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：357.5±31.5 °C

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG1-t-butyl ester)

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG1-t-butyl ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2086689-00-9
• 分子式：C₂₆H₄₈N₄O₁₀
• 分子量：576.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-O-C2-NH-Boc

VH032-O-C2-NH-Boc 是 Boc 修饰的 VH032 (HY-120217),可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032-O-C2-NH-Boc 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032-O-C2-NH-Boc 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2409007-41-4
• 分子式：C₃₁H₄₅N₅O₇S
• 分子量：631.78
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG6-C1-Boc

Azido-PEG6-C1-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：297162-49-3
• 分子式：C₁₈H₃₅N₃O₈
• 分子量：421.486
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-六聚乙二醇-叠氮

Azido-PEG5-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：516493-93-9
• 分子式：C₁₂H₂₆N₄O₅
• 分子量：306.35900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG15-alcohol

m-PEG15-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：2258654-78-1
• 分子式：C₃₁H₆₄O₁₆
• 分子量：692.83
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-acid)

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-59-4
• 分子式：C₂₆H₅₂N₂O₁₃
• 分子量：600.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-PEG10-amine

Amino-PEG10-amine 是基于 PEG的PROTAC linker,可用于链接基于 DES设计的单体配体,为制备更具选择性和更高活性的雌激素受体拮抗剂用于提供新的方向。

• CAS号：928292-69-7
• 分子式：C₂₂H₄₈N₂O₁₀
• 分子量：500.62400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.082±0.06 g/cm3 (20 °C, 760 mmHg)
• 沸点：560.0±45.0 °C (760 mmHg)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG4-Boc

Benzyl-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2484091-04-3
• 分子式：C₂₀H₃₂O₆
• 分子量：368.46
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET57

dBET57 是一种有效选择性的 BRD4 异源双功能降解剂,基于 PROTAC 技术,对 BRD4BD1 作用的 DC50/5h 值为 500 nM,对 BRD4BD2 不起作用。

• CAS号：1883863-52-2
• 分子式：C₃₄H₃₁ClN₈O₅S
• 分子量：699.18
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-C6-NH2 TFA

Thalidomide-NH-C6-NH2 TFA是一种合成的 E3 连接酶配体 -linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。

• CAS号：2093386-51-5
• 分子式：C₂₁H₂₅F₃N₄O₆
• 分子量：486.44
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基十六甘醇单甲醚

m-PEG16-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：907577-50-8
• 分子式：C₃₃H₆₉NO₁₆
• 分子量：735.89800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG7-CH2-Boc

Hydroxy-PEG7-CH2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2378049-28-4
• 分子式：C₂₀H₄₀O₁₀
• 分子量：440.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC Linker 31

PROTAC Linker 31 是一种 PROTAC 连接桥,属于 Alkyl-Chain 类。PROTAC Linker 31 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：1263819-48-2
• 分子式：C₁₂H₁₈N₂O₂
• 分子量：222.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-propargyl

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-37-7
• 分子式：C₁₃H₂₁F₃O₅
• 分子量：314.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A