蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH

(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH 是一种合成的 E3 连接酶配体结合物,它结合了 VHL 配体和连接子。(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH 可用于 PROTAC DT2216 (HY-130604)。

• CAS号：2229976-21-8
• 分子式：C₃₀H₄₂N₄O₆S
• 分子量：586.74
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG4-t-butyl ester

Tos-PEG4-t-butyl ester (Tos-PEG4-Boc) 是一种 PROTAC 连接桥 (PROTAC linker),属于 PEG 类。Tos-PEG4-t-butyl ester (Tos-PEG4-Boc) 可用于合成一系列 PROTAC 分子,如 BI-3663 (HY-111546)。BI-3663 是一种高度选择性的 PTK2/FAK PROTAC,具有 E3 连接酶配体,能够降解 PTK2,IC50 值为 18 nM。

• CAS号：217817-01-1
• 分子式：C₂₀H₃₂O₈S
• 分子量：432.528
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：528.5±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：273.4±28.7 °C

NHS-PEG4-(m-PEG4)3-ester

NHS-PEG4-(m-PEG4)3-ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1333154-70-3
• 分子式：C₆₀H₁₁₀N₆O₂₈
• 分子量：1363.539
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

O-(2-叠氮乙基)-O′-甲基-三乙二醇

m-PEG4-azide (13-Azido-2,5,8,11-tetraoxatridecane) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：606130-90-9
• 分子式：C₉H₁₉N₃O₄
• 分子量：233.26500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG1-CH2COOH

Bromo-PEG1-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,用于合成 PROTAC。

• CAS号：1135131-50-8
• 分子式：C₄H₇BrO₃
• 分子量：183.001
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.7±0.1 g/cm3
• 沸点：316.4±17.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：145.2±20.9 °C

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 2

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 2 包含 E3 泛素连接酶的配体,以及 PROTAC 连接物,可将靶蛋白和泛素化机制结合起来。

• CAS号：1818885-63-0
• 分子式：C₂₇H₃₂N₄O₈
• 分子量：540.565
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：792.0±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：432.8±32.9 °C

Propargyl-PEG5-Br

炔丙基-PEG5-Br是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1287660-83-6
• 分子式：C₁₃H₂₃BrO₅
• 分子量：339.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG1-propanol

Benzyl-PEG1-propanol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：131326-24-4
• 分子式：C₁₂H₁₈O₃
• 分子量：210.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙氧基]乙氧基乙酸

Boc-NH-PEG2-CH2COOH 是一种基于 PEG 合成的 PROTAC linker,用于合成 PROTAC。

• CAS号：108466-89-3
• 分子式：C₁₁H₂₁NO₆
• 分子量：263.28800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：630.4°C
• 熔点：240°C
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG5-azide

Aminooxy-PEG5-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：1919045-02-5
• 分子式：C₁₂H₂₆N₄O₆
• 分子量：322.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG12-C2-acid

Cbz-NH-PEG12-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1334177-88-6
• 分子式：C₃₅H₆₁NO₁₆
• 分子量：751.85594
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十二乙二醇单甲醚丙酸

Methyl propionate-PEG12 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1239588-11-4
• 分子式：C₂₈H₅₆O₁₅
• 分子量：632.735
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：646.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：190.2±23.6 °C

m-PEG10-acid

m-PEG10-acid 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 10 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。m-PEG10-acid 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2409969-94-2
• 分子式：C₂₂H₄₄O₁₂
• 分子量：500.58
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DSPE-PEG4-DBCO

DSPE-PEG4-DBCO 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112738-14-2
• 分子式：C₇₁H₁₁₆N₃O₁₅P
• 分子量：1282.67
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methyltetrazine-PEG8-PFP ester

Methyltetrazine-PEG8-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-49-9
• 分子式：C₃₄H₄₃F₅N₄O₁₁
• 分子量：778.72
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG2-Ms

Propargyl-PEG2-Ms 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG2-Ms 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：943726-01-0
• 分子式：C₈H₁₄O₅S
• 分子量：222.259
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：358.0±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：170.3±23.7 °C

3,6,9,12,15-五氧杂十六烷-1-硫醇

m-PEG5-SH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：524030-00-0
• 分子式：C₁₁H₂₄O₅S
• 分子量：268.37000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.048
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc)

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-62-9
• 分子式：C₃₄H₆₈N₂O₁₃
• 分子量：712.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-(2-氯乙氧基)丙烷-1-醇

PEG2-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：78925-46-9
• 分子式：C₅H₁₁ClO₂
• 分子量：138.593
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：236.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：97.1±20.4 °C

Thiol-C9-PEG5

Thiol-C9-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：130727-42-3
• 分子式：C₁₉H₄₀O₅S
• 分子量：380.58300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-NH-Boc)-PEG3-acid

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-NH-Boc)-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183440-74-4
• 分子式：C₂₉H₅₅N₅O₁₃
• 分子量：681.77
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG13-alcohol

Propargyl-PEG13-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2867-46-1
• 分子式：C₂₉H₅₆O₁₄
• 分子量：628.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-八聚乙二醇-四氢吡喃醚

Benzyl-PEG8-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1611489-00-9
• 分子式：C₂₈H₄₈O₁₀
• 分子量：544.675
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：602.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：224.1±31.4 °C

Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA

Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 是一种 E3 连接酶配体与连接子的缀合物,由 Thalidomide (HY-14658) 和 NH-PEG3-NH-Boc 构成。Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2140807-20-9
• 分子式：C₂₀H₂₀F₃N₃O₉
• 分子量：503.38
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-aminooxy

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-aminooxy 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1895922-78-7
• 分子式：C₁₀H₂₀F₃NO₅
• 分子量：291.26
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-acid)

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-54-9
• 分子式：C₃₀H₅₈N₄O₁₅
• 分子量：714.80
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-Amido-tri-(t-butoxycarbonylethoxymethyl)-methane

Azido-PEG4-Amido-tri-(t-butoxycarbonylethoxymethyl)-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421933-29-0
• 分子式：C₃₆H₆₆N₄O₁₄
• 分子量：778.93
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG2-bromide

Propargyl-PEG2-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1287660-82-5
• 分子式：C₇H₁₁BrO₂
• 分子量：207.07
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG1-C1-Boc

Azido-PEG1-C1-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1820717-35-8
• 分子式：C₈H₁₅N₃O₃
• 分子量：201.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A