蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

m-PEG6-Br

m-PEG6-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：125562-29-0
• 分子式：C₁₃H₂₇BrO₆
• 分子量：359.254
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：385.1±37.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：158.2±25.0 °C

15-叠氮基-4,7,10,13-四氧杂十五烷酸叔丁酯

Azido-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：581066-04-8
• 分子式：C₁₅H₂₉N₃O₆
• 分子量：347.407
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-C6-O-C5-O-C4-COOH

波马度胺-C6-O-C5-O-C4-COH是E3连接酶配体-接头缀合物,其包含波马度酰胺(HY-10984)基脑胶质配体和接头。泊马度胺-C6-O-C5-O-C4-COH可用于PROTAC的合成[1]。

• CAS号：2375774-54-0
• 分子式：C₂₉H₄₁N₃O₈
• 分子量：559.65
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DB1113

DB1113(实施例24)是激酶的双功能化合物靶向蛋白质降解。DB1113降解ABL1、ABL2、BLK、CDK11B、CDK4、CSK、EPHA3、FER、GAK、LIMK1、MAP3K20、MAP4K1、MAP4K2、MAP4K3、MAP4K5、MAPK14、MAPK7、MAPK8、MAPK9、MAPKAPK2、MAPKAPK3、NLK、PDIK1L、PTK2B、RIPK1、RPS6KA1、RPS6KA3、SIK2、SIK3、STK35、TNK2和ULK1。DB1113可用于疾病或疾病的研究由异常激酶活性介导[1]。

• CAS号：2769753-53-7
• 分子式：C₅₉H₆₈F₃N₁₃O₆S
• 分子量：1144.31
• 类别：Ferroptosis

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(5-氨基戊基)氨基甲酸叔丁酯

PROTAC Linker 23 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。PROTAC Linker 23 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：51644-96-3
• 分子式：C₁₀H₂₂N₂O₂
• 分子量：202.294
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：309.2±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：140.8±23.2 °C

11-溴代十一烷酸甲酯

Br-C10-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。Br-C10-methyl ester 可用于合成一系列 PROTAC 分子 (包括 MS432)。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 VHL 配体部分,另一种是靶蛋白配体。

• CAS号：6287-90-7
• 分子式：C₁₂H₂₃BrO₂
• 分子量：279.21400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.157 g/mL at 25ºC(lit.)
• 沸点：115ºC0.04 mm Hg(lit.)
• 熔点：13°C(lit.)
• 闪点：>230 °F

E3连接酶Ligand-Linker共轭6个游离碱

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 6 Free Base 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：2010159-60-9
• 分子式：C₂₈H₄₁N₅O₆S
• 分子量：575.72
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032 analogue-1

VH032 analogue-1 是 VH032 (HY-120217) 类似物,可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032 analogue-1 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032 analogue-1 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2111829-84-4
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₅S
• 分子量：474.57
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-aminoxy-Boc-PEG4-Tos

Tos-aminoxy-Boc-PEG4-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-42-4
• 分子式：C₂₇H₃₉NO₁₁S₂
• 分子量：617.73
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

甲基-PEG4-NHS酯

m-PEG4-NHS ester 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：622405-78-1
• 分子式：C₁₄H₂₃NO₈
• 分子量：333.334
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：431.7±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：214.9±31.5 °C

Fmoc-Lys (biotin-PEG4)-OH

Fmoc-Lys (biotin-PEG4)-OH 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1334172-64-3
• 分子式：C₄₂H₅₉N₅O₁₁S
• 分子量：842.01
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-溴-2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙烷

Bromo-PEG3-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：31255-26-2
• 分子式：C₈H₁₆Br₂O₃
• 分子量：320.01900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.57 g/cm3at 25°C (lit.)
• 沸点：146 °C at 0.06 Torr (lit.)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG8-amine

Biotin-PEG8-amine 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183447-27-8
• 分子式：C₂₈H₅₄N₄O₁₀S
• 分子量：638.81
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Dde Biotin-PEG4-alkyne

Dde Biotin-PEG4-alkyne 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1802908-00-4
• 分子式：C₃₂H₅₀N₄O₈S
• 分子量：650.83
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-05231023

PF-05231023 是一种长效的成纤维细胞生长因子21 (FGF21) 的类似物,是 FGF21 受体 的激动剂,有治疗 2 型糖尿病的潜能[1][5]。

• CAS号：1037589-69-7
• 分子式：C₂₆H₃₂N₄O₈
• 分子量：528.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

15-叠氮基-4,7,10,13-四氧杂十五烷酸

Azido-PEG4-C2-acid 是基于PEG 的 PROTAC 连接桥,可用于合成vRucaparib-TP4。Azido-PEG4-C2-acid 同时也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 4 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：1257063-35-6
• 分子式：C₁₁H₂₁N₃O₆
• 分子量：291.30100
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tri-(PEG1-C2-acid)

Tri-(PEG1-C2-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1381861-95-5
• 分子式：C₁₅H₂₇NO₉
• 分子量：365.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙烯酸琥珀酰亚胺-四聚乙二醇-氯乙酰胺

Chloroacetamido-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1353011-95-6
• 分子式：C₁₇H₂₇ClN₂O₉
• 分子量：438.857
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-PEG4-Propargyl

沙利度胺-PEG4-炔丙基是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2098799-77-8
• 分子式：C₂₄H₂₈N₂O₉
• 分子量：488.49
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-叠氮基-2-硝基苯甲酸-N-琥珀酰亚胺酯

ANB-NOS 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：60117-35-3
• 分子式：C₁₁H₇N₅O₆
• 分子量：305.203
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：131-133ºC
• 闪点：N/A

2-溴乙基醚

Bis2-bromoethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5414-19-7
• 分子式：C₄H₈Br₂O
• 分子量：231.914
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.8±0.1 g/cm3
• 沸点：216.3±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：85.0±0.0 °C

TCO-PEG3-amine

TCO-PEG3-amine 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG3-amine 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1800507-93-0
• 分子式：C₁₇H₃₂N₂O₅
• 分子量：344.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

O-(2-氨基乙基)-O'-[2-(生物素氨基)乙基]八甘醇

生物素-PEG9-胺是一种基于PEG的鱼精蛋白连接剂,可用于鱼精蛋白的合成[1]。

• CAS号：960132-48-3
• 分子式：C₃₀H₅₈N₄O₁₁S
• 分子量：682.86700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

A 410099.1 amide-PEG3-amine-Boc

A 410099.1 amide-PEG3-amine-Boc 是用于 PROTAC 的功能化 IAP 配体,其结合了 IAP 配体和末端带有酰胺的 amide-PEG3 linker,可与目标蛋白配体结合。

• CAS号：2415256-19-6
• 分子式：C₄₀H₆₄N₆O₉
• 分子量：772.97
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG4-O-NHS ester

m-PEG4-O-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：147912-03-6
• 分子式：C₁₄H₂₃NO₉
• 分子量：349.33400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-六聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Propargyl-PEG7-Boc 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG7-Boc 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1818294-29-9
• 分子式：C₂₂H₄₀O₉
• 分子量：448.548
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：494.3±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：207.8±27.4 °C

Aminooxy-PEG8-methane

Aminooxy-PEG8-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055024-52-5
• 分子式：C₁₇H₃₇NO₉
• 分子量：399.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PEG4-sulfonic acid

PEG4-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：173459-90-0
• 分子式：C₈H₁₈O₇S
• 分子量：258.289
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(Azido-PEG3-amido)-1,3-bis(NHS ester)

2-(Azido-PEG3-amido)-1,3-bis(NHS ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2320560-36-7
• 分子式：C₂₆H₃₈N₆O₁₄
• 分子量：658.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lenalidomide-PEG1-azide

Lenalidomide-PEG1-azide 是一种E3连接酶 lgand-linker 复合物。Lenalidomide-PEG1-azide 包含 cereblon 配体和连接子。Lenalidomide-PEG1-azide 可用于设计 PROTAC BRD4 Degrader-1 (HY-133131)。

• CAS号：2185795-67-7
• 分子式：C₁₇H₁₈N₆O₅
• 分子量：386.36
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A