蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Mal-PEG4-Glu(TFP ester)-NH-m-PEG24

Mal-PEG4-Glu(TFP ester)-NH-m-PEG24 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2408741-87-5
• 分子式：C₇₈H₁₃₄F₄N₄O₃₅
• 分子量：1763.90
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2,6-二氧代-哌啶-3-基)-4-羟基-异吲哚-1,3-二酮

E3 ligase Ligand 2是用于 PROTAC 技术中的E3连接酶配体。

• CAS号：5054-59-1
• 分子式：C₁₃H₁₀N₂O₅
• 分子量：274.229
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：568.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：297.5±28.7 °C

NH2-PEG1-CH2CH2-Boc

NH2-PEG1-CH2CH2-Boc 是一种PROTAC linker,属于 PEG 和Alkyl/ether 类,可以用于合成PROTAC。

• CAS号：1260092-46-3
• 分子式：C₉H₁₉NO₃
• 分子量：189.252
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：264.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：90.5±16.7 °C

Ald-Ph-PEG4-NH-Boc

Ald-Ph-PEG4-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2110449-01-7
• 分子式：C₂₁H₃₂N₂O₈
• 分子量：440.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-PEG4-NHS ester

Fmoc-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1314378-14-7
• 分子式：C₃₀H₃₆N₂O₁₀
• 分子量：584.614
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG7-THP

Benzyl-PEG7-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：230620-75-4
• 分子式：C₂₆H₄₄O₉
• 分子量：500.62200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Propargyl-PEG2)-N-Boc-PEG3-t-butyl ester

N-(Propargyl-PEG2)-N-Boc-PEG3-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093152-78-2
• 分子式：C₂₅H₄₅NO₉
• 分子量：503.63
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG2-acid

Benzyl-PEG2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：91555-65-6
• 分子式：C₁₂H₁₆O₄
• 分子量：224.25
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚-4-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基叔丁基)氨基甲酸酯

Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 是一种 E3 连接酶配体与连接子的缀合物,由 Thalidomide (HY-14658) 和 NH-PEG3-NH-Boc 构成。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 末端的 Boc 保护基团可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-NH-PEG3-NH-Boc 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2204246-03-5
• 分子式：C₂₆H₃₆N₄O₉
• 分子量：548.59
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG8-TCO

TCO-PEG8-TCO 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG8-TCO 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-67-1
• 分子式：C₃₆H₆₄N₂O₁₂
• 分子量：716.90
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG2-hydrazide-Boc

Azido-PEG2-hydrazide-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-56-5
• 分子式：C₁₂H₂₃N₅O₅
• 分子量：317.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-Me-decanedioic acid

(S,R,S)-AHPC Me癸二酸是一种E3连接酶-配体-连接物共轭物,可用于合成PROTAC。

• CAS号：2380273-45-8
• 分子式：C₃₃H₄₈N₄O₆S
• 分子量：628.82
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG12-NHS ester

Mal-amido-PEG12-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2101722-60-3
• 分子式：C₃₈H₆₃N₃O₁₉
• 分子量：865.92
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-PEG2-NH2

沙利度胺-PEG2-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：1957235-94-7
• 分子式：C₁₇H₁₉N₃O₆
• 分子量：361.35
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-Piperazine-Piperidine

沙利度胺哌嗪哌啶是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基塞伦配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2229716-11-2
• 分子式：C₂₂H₂₇N₅O₄
• 分子量：425.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3

N-(m-PEG4)-N'-(azide-PEG4)-Cy3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-38-9
• 分子式：C₄₂H₆₂ClN₅O₈
• 分子量：800.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide

Pomalidomide-PEG6-butyl iodide 是一种合成的 E3 ligase ligand-linker conjugate,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 6 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：1835705-74-2
• 分子式：C₃₁H₄₄IN₃O₁₁
• 分子量：761.60
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KB02-JQ1

KB02-JQ1 是一种高选择性的基于 PROTAC 的 BRD4 降解剂 (molecular glue),但不降解 BRD2 或 BRD3。 KB02-JQ1 通过共价修饰 DCAF16 (E3 ligase) 促进 BRD4 降解,并可以提高生物系统中蛋白质降解的持久性。KB02-JQ1 由 JQ1 与泛素 E3 连接酶配体 (KB02) 通过 linker 连接而成。

• CAS号：2384184-44-3
• 分子式：C₃₈H₄₃Cl₂N₇O₆S
• 分子量：796.76
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester

Mal-NH-PEG4-CH2CH2COOPFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-84-8
• 分子式：C₂₄H₂₇F₅N₂O₉
• 分子量：582.47
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-PEG2-bromide

Cbz-PEG2-溴化物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2100283-00-7
• 分子式：C₁₄H₂₀BrNO₄
• 分子量：346.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH

Cbz-NH-PEG1-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1260092-43-0
• 分子式：C₁₂H₁₅NO₅
• 分子量：253.25100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

22-溴-2,5,8,11,14,17,20-七氧杂二十二烷

m-PEG7-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：104518-25-4
• 分子式：C₁₅H₃₁BrO₇
• 分子量：403.30600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-[3-[2-(生物素酰胺)乙基]氨基-3-氧代丙基]二硫基]丙酸琥珀酰亚胺酯

Biotin-bis-amido-SS-NHS 是一种基于 Alkyl/ether 结构的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：142439-92-7
• 分子式：C₂₂H₃₃N₅O₇S₃
• 分子量：575.72200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.43
• 沸点：N/A
• 熔点：129-131ºC
• 闪点：N/A

Ms-PEG3-CH2CH2COOH

Ms-PEG3-CH2CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2306832-21-1
• 分子式：C₁₀H₂₀O₈S
• 分子量：300.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG6-NHS ester

Azido-PEG6-NHS ester 是一种可降解 (cleavable) 的含 6 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG6-NHS ester 也是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055014-64-5
• 分子式：C₁₉H₃₂N₄O₁₀
• 分子量：476.48
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG24-alcohol

m-PEG24-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2376450-73-4
• 分子式：C₄₉H₁₀₀O₂₅
• 分子量：1089.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4降解AT1

BRD4 degrader AT1 是基于 PROTAC 技术的一种高度选择性的 Brd4 降解剂,在细胞中对 Brd4BD2 的 Kd 值为 44 nM。

• CAS号：2098836-45-2
• 分子式：C₄₈H₅₈ClN₉O₅S₃
• 分子量：972.68
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG5-THP

Benzyl-PEG5-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：230620-74-3
• 分子式：C₂₂H₃₆O₇
• 分子量：412.517
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：506.0±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：197.3±30.0 °C

Tos-PEG4-NH-Boc

PROTAC Linker 7 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 7 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：1246999-33-6
• 分子式：C₂₀H₃₃NO₈S
• 分子量：447.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-amine

111-Trifluoroethyl-PEG4-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1872433-72-1
• 分子式：C₁₀H₂₀F₃NO₄
• 分子量：275.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A