蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

(2-Pyridyldithio)-PEG4-alcohol

(2-Pyridyldithio)-PEG4-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：851961-99-4
• 分子式：C₁₃H₂₁NO₄S₂
• 分子量：319.44
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-2

PROTAC IRAK4降解剂-2(化合物9)是一种基于PROTAC的IRAK4分解剂,可在151 nM的外周血单个核细胞(PBMC)中提供有效的IRAK 4降解,DC50。PROTAC IRAK4降解物-2诱导PBMC细胞中IRAK4蛋白水平降低,DC50为36 nM。PROTAC IRAK4降解物-2还导致PBMC中多种细胞因子的抑制[1]。

• CAS号：2374122-27-5
• 分子式：C₅₇H₆₈FN₁₁O₈S
• 分子量：1086.28
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-C6-NH-Boc

VH032-C6-NH-Boc 是 Boc 修饰的 VH032 (HY-120217),可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032-C6-NH-Boc 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032-C6-NH-Boc 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2306389-02-4
• 分子式：C₃₅H₅₃N₅O₆S
• 分子量：671.89
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-三乙二醇-丙酸

N3-PEG3-CH2CH2COOH 是基于PEG 的 PROTAC 连接桥,可用于合成BI-3663 (HY-111546)、BI-4216 和 BI-0319。N3-PEG3-CH2CH2COOH 同时也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 3 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：1056024-94-2
• 分子式：C₉H₁₇N₃O₅
• 分子量：247.248
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TL13-112

TL13-112是一种新型间变性淋巴瘤激酶(ALK)-PROTAC,通过LDK378和脑啡肽配体pomalidomide的结合而开发；还促进其他激酶的降解,包括PTK2(FAK),Aurora a,FER和RPS6KA1(RSK1)。

• CAS号：2229037-19-6
• 分子式：C₄₉H₆₀ClN₉O₁₀S
• 分子量：1002.573
• 类别：PROTAC

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,2-二甲基-4-氧代-3,8,11,14-四氧杂-5-氮杂十七烷-17-酸

Boc-N-amido-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-75-7
• 分子式：C₁₄H₂₇NO₇
• 分子量：321.367
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：471.1±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：238.7±27.3 °C

PROTAC IRAK3 degrade-1

PROTAC IRAK3 degrade-1是一种有效且选择性的IRAK3降解剂(IC50=5 nM)。

• CAS号：2712600-00-3
• 分子式：C₄₇H₆₃N₁₁O₆
• 分子量：878.07
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-C3-Boc

VH032-C3-Boc 是 Boc 修饰的 VH032 (HY-120217),可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032-C3-Boc 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032-C3-Boc 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2827750-25-2
• 分子式：C₃₂H₄₆N₄O₆S
• 分子量：614.80
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cbz-NH-PEG2-C2-acid

Cbz-NH-PEG2-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-76-8
• 分子式：C₁₅H₂₁NO₆
• 分子量：311.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-Piperazine-PEG1-NH2

沙利度胺-哌嗪-PEG1-NH2是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2357111-29-4
• 分子式：C₂₁H₂₇N₅O₅
• 分子量：429.47
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Br-PEG4-CH2-Boc

Br-PEG4-CH2-Boc 是一种 PROTAC linker 属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 。

• CAS号：1807505-29-8
• 分子式：C₁₄H₂₇BrO₆
• 分子量：371.26
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-溴-2-(2-甲氧基乙氧基)乙烷

m-PEG2-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：54149-17-6
• 分子式：C₅H₁₁BrO₂
• 分子量：183.044
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：184.4±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：73.9±0.0 °C

endo-BCN-PEG4-acid

endo-BCN-PEG4-acid 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTACs 的合成。

• CAS号：1421932-54-8
• 分子式：C₂₂H₃₅NO₈
• 分子量：441.515
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：608.2±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：321.6±31.5 °C

Azido-PEG3-aldehyde

Azido-PEG3-aldehyde 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807530-10-4
• 分子式：C₉H₁₇N₃O₄
• 分子量：231.249
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG5-1-o-(b-cyanoethyl-n,n-diisopropyl)phosphoramidite

Propargyl-PEG5-1-o-b-cyanoethyl-nn-diisopropylphosphoramidite 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1682657-14-2
• 分子式：C₂₀H₃₇N₂O₆P
• 分子量：432.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lipoamide-PEG3-Mal

Lipoamide-PEG3-Mal 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1314378-19-2
• 分子式：C₂₅H₄₁N₃O₇S₂
• 分子量：559.739
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：786.9±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：429.7±32.9 °C

PROTAC BRD9 Degrader-2

PROTAC BRD9降解剂-2是一种用于治疗癌症的BRD9双功能降解剂。

• CAS号：2633631-78-2
• 分子式：C₃₉H₄₈ClN₅O₇
• 分子量：734.28
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ms-PEG4-Ms

Ms-PEG4-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：55400-73-2
• 分子式：C₁₀H₂₂O₉S₂
• 分子量：350.40600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.31g/cm3
• 沸点：533.6ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：276.5ºC

Pomalidomide 4'-alkylC5-acid

Pomalidomide 4'-alkylC5-acid 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。

• CAS号：2225940-49-6
• 分子式：C₁₉H₂₁N₃O₆
• 分子量：387.39
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG4-Azido

苄基-PEG4-叠氮是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：86770-71-0
• 分子式：C₁₅H₂₃N₃O₄
• 分子量：309.36100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Benzyl-N-bis-PEG4

N-Benzyl-N-bis-PEG4 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1680183-01-0
• 分子式：C₂₃H₄₁NO₈
• 分子量：459.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amide-PEG2-oxyamine

Mal-amide-PEG2-oxyamine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2253965-09-0
• 分子式：C₁₃H₂₁N₃O₆
• 分子量：315.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(azide-PEG3)-N'-(Amine-C3-Amide-PEG4)-Cy5

N-(azide-PEG3)-N'-(Amine-C3-Amide-PEG4)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-70-9
• 分子式：C₄₇H₇₀ClN₇O₈
• 分子量：896.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG3-CH2COOtBu

Tos-PEG3-CH2COOtBu 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1530778-24-5
• 分子式：C₁₉H₃₀O₈S
• 分子量：418.502
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：517.7±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：266.9±28.7 °C

3-[2-(3-乙氧基-3-羰基丙氧基)-乙氧基]-丙酸

Acid-PEG2-ethyl propionate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：886362-90-9
• 分子式：C₁₀H₁₈O₆
• 分子量：234.24600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.145g/cm3
• 沸点：370.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：139.5ºC

Cbz-NH-PEG5-C2-acid

Cbz-NH-PEG5-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1347750-74-6
• 分子式：C₂₁H₃₃NO₉
• 分子量：443.488
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：599.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：316.3±30.1 °C

VH032-CH2-Boc

VH032-CH2-Boc 是 Boc 修饰的 VH032 (HY-120217),可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032-CH2-Boc 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032-CH2-Boc 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2827750-24-1
• 分子式：C₃₀H₄₂N₄O₆S
• 分子量：586.74
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-Boc-氮杂环丁烷-3-羧酸

1-Boc-氮杂环丁-3-羧酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。1-Boc-azetidine-3-羧酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：142253-55-2
• 分子式：C₉H₁₅NO₄
• 分子量：201.220
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：321.0±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：100.1-101.9°C
• 闪点：147.9±25.9 °C

m-PEG6-Ms

m-PEG6-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：130955-39-4
• 分子式：C₁₄H₃₀O₉S
• 分子量：392.46300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromoacetamido-PEG3-NH-Boc

Bromoacetamido-PEG3-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421933-39-2
• 分子式：C₁₅H₂₉BrN₂O₆
• 分子量：413.305
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：543.8±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：282.7±30.1 °C