蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

3-吖丁啶羧酸

氮杂环丁烯-3-羧酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。氮杂环丁-3-羧酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：36476-78-5
• 分子式：C₄H₇NO₂
• 分子量：101.104
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：242.0±33.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：286 °C (dec.)(lit.)
• 闪点：100.1±25.4 °C

N-Me-N-bis-PEG4

N-Me-N-bis-PEG4 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055046-22-3
• 分子式：C₁₇H₃₇NO₈
• 分子量：383.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-7

PROTAC IRAK4降解剂-7(化合物I-417)是一种具有抗肿瘤活性的口服活性PROTAC-IRAK4分解剂[1]。

• CAS号：2432994-31-3
• 分子式：C₄₄H₄₉F₂N₁₁O₆
• 分子量：865.93
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-苄氧基乙醇

2-(Benzyloxy)ethanol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。2-(Benzyloxy)ethanol 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：622-08-2
• 分子式：C₉H₁₂O₂
• 分子量：152.190
• 类别：组胺受体

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：254.4±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：<-75ºC
• 闪点：108.0±14.6 °C

DNP-四聚乙二醇-羧酸

DNP-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：858126-76-8
• 分子式：C₁₇H₂₅N₃O₁₀
• 分子量：431.39500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-氨基丙酸叔丁酯

Boc-C2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：15231-41-1
• 分子式：C₇H₁₅NO₂
• 分子量：145.19900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：192.3°C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG4-PFP ester

endo-BCN-PEG4-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421932-52-6
• 分子式：C₂₈H₃₄F₅NO₈
• 分子量：607.563
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：650.9±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：347.5±31.5 °C

HDAC6 degrader-1

HDAC6降解剂-1是一种包含选择性HDAC6抑制剂Nexturastat a(Nex a)作为HDAC6粘合剂、连接剂和用于招募E3连接酶的配体的PROTAC。HDAC6降解剂-1诱导HDAC6的显著降解,对其他HDACs表现出优异的选择性,并显示出对细胞增殖的有效抑制[1]。

• CAS号：2439058-23-6
• 分子式：C₄₀H₄₅N₉O₉
• 分子量：795.84
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-羟甲基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯

1-Boc-azetidine-3-yl-甲醇是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。1-Boc-azetidine-3-yl-甲醇也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]

• CAS号：142253-56-3
• 分子式：C₉H₁₇NO₃
• 分子量：187.236
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：270.3±13.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：55 °C
• 闪点：117.3±19.8 °C

Lenalidomide-5-aminomethyl

来那度胺-5-氨基甲基是以来那度胺为基础的脑啡肽(CRBN)配体,用于补充CRBN蛋白。来那度胺-5-氨基甲基可通过连接物连接到蛋白质的配体,形成PROTAC[1]。

• CAS号：1010100-28-3
• 分子式：C₁₄H₁₅N₃O₃
• 分子量：273.29
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,2'-氧双(乙胺)

22-Oxybis(ethylamine) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2752-17-2
• 分子式：C₄H₁₂N₂O
• 分子量：104.151
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：185.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：74.8±14.1 °C

Chloroacetamido-C4-NHBoc

Chloroacetamido-C4-NHBoc 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：133264-58-1
• 分子式：C₁₁H₂₁ClN₂O₃
• 分子量：264.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-叠氮基-3,6,9-三氧代十一酸

PROTAC Linker 14 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 14 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：172531-37-2
• 分子式：C₈H₁₅N₃O₅
• 分子量：233.22200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-六聚乙二醇-叠氮

Benzyl-PEG6-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：86770-73-2
• 分子式：C₁₉H₃₁N₃O₆
• 分子量：397.46600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,5,8,11,14,17-六氧杂二十烷-20-酸

m-PEG5-CH2CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：1347750-72-4
• 分子式：C₁₄H₂₈O₈
• 分子量：324.367
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：431.5±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：148.5±22.2 °C

N-(m-PEG4)-N'-(4-Hydroxycyclohexyl-1-amido-PEG4)-Cy5

N-(m-PEG4)-N'-(4-Hydroxycyclohexyl-1-amido-PEG4)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-72-1
• 分子式：C₅₁H₇₆ClN₃O₁₀
• 分子量：926.62
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SHP2 protein degrader-1

SHP2蛋白降解物-1是一种有效的SHP2变构抑制剂。SHP2蛋白降解物-1诱导SHP2降解和细胞凋亡。SHP2蛋白降解物-1具有研究SHP2相关疾病的潜力[1]。

• CAS号：2624181-69-5
• 分子式：C₄₂H₅₁Cl₂N₁₁O₈
• 分子量：908.83
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG4-OH

Mal-PEG4-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421933-37-0
• 分子式：C₁₂H₁₉NO₆
• 分子量：273.282
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：427.9±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：212.6±25.9 °C

Acid-PEG8-S-S-PEG8-acid

Acid-PEG8-S-S-PEG8-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：873013-93-5
• 分子式：C₃₈H₇₄O₂₀S₂
• 分子量：915.11200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-C1-PEG3-C4-OBn

Boc-C1-PEG3-C4-OBn (PROTAC Linker 15) 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。Boc-C1-PEG3-C4-OBn可用于合成一系列 PROTAC 分子,例如 PROTAC SGK3 degrader-1 (HY-125878)。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：2381196-81-0
• 分子式：C₂₃H₃₈O₆
• 分子量：410.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-PEG2-PFP ester

NH2-PEG3-BOC 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 2 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Bis-PEG2-PFP ester 也是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1314378-18-1
• 分子式：C₂₀H₁₂F₁₀O₆
• 分子量：538.289712
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG2-PFP ester

endo-BCN-PEG2-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421932-53-7
• 分子式：C₂₄H₂₆F₅NO₆
• 分子量：519.458
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：586.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：308.3±30.1 °C

三甘醇

PROTAC Linker 25 是一种 PEG 类的 PROTAC 连接桥。PROTAC Linker 25 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：112-27-6
• 分子式：C₆H₁₄O₄
• 分子量：150.173
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：288.0±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：−7 °C(lit.)
• 闪点：165.6±0.0 °C

Thalidomide-NH-PEG1-NH2 hydrochloride

沙利度胺-NH-PEG1-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2154342-56-8
• 分子式：C₁₇H₂₁ClN₄O₅
• 分子量：396.83
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-γ-氨基丁酸

Boc-GABA-OH 是一种 PROTAC linker,能用于合成 UNC6852。UNC6852 是一种靶向 EED 的 PROTAC 降解剂。

• CAS号：57294-38-9
• 分子式：C₉H₁₇NO₄
• 分子量：203.236
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：78-82 ºC
• 熔点：55-59 °C
• 闪点：113 ºC

RIPK2-IN-2

RIPK2-IN-2(实施例25)是RIP2激酶-PROTAC抑制剂。RIPK2-IN-2可阻断RIP2依赖性促炎信号,调节自身炎症疾病中的RIP2激酶活性[1]。

• CAS号：2143956-20-9
• 分子式：C₅₃H₆₅FN₁₄O₇S₂
• 分子量：1093.30
• 类别：RIP激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG4-methylamine

Propargyl-PEG4-methylamine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807530-11-5
• 分子式：C₁₂H₂₃NO₄
• 分子量：245.315
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：317.1±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.2±14.6 °C

Biotin-PEG11-amine

Biotin-PEG11-amine 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1418022-42-0
• 分子式：C₃₄H₆₆N₄O₁₃S
• 分子量：770.97
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG3-t-butyl ester

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG3-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112732-03-1
• 分子式：C₂₆H₅₀N₄O₁₀
• 分子量：578.70
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG-amine

炔丙基聚乙二醇胺是一种基于聚乙二醇的鱼精蛋白连接剂,可用于鱼精蛋白的合成[1]。

• CAS号：956348-61-1
• 分子式：(C₂H₄O)nC₅H₉NO
• 分子量：1112.340
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：911.7±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：479.1±26.6 °C