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针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子,理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言,PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们,PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势,小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制,通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力,因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现,以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病,例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外,这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前,已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET,雌激素受体(ER),雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献:
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.


抗感染 >
沙粒 细菌 CMV 肠道病毒 丝状病毒 真菌 HBV HCV HIV HSV 流感病毒 寄生物 逆转录酶 RSV SARS冠状病毒
抗体- 药物偶联物 >
ADC细胞毒素 ADC连接器 Drug-Linker Conjugates for ADC 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
细胞凋亡 >
细胞凋亡 Bcl-2家族 c-Myc的 胱天蛋白酶 DAPK Ferroptosis IAP MDM-2/p53 PKD RIP激酶 存活 胸苷酸合成酶 TNF受体
自噬 >
自噬 LRRK2 ULK 自噬
细胞周期/DNA损伤 >
叶酸 APC ATM/ATR 极光激酶 酪蛋白激酶 CDK 检查点激酶(Chk) CRISPR/Cas9 去泛素化酶 DNA烷基化剂/交联剂 DNA-PK DNA/RNA合成 真核起始因子(eIF) G-四链体 Haspin激酶 HDAC HSP IRE1 驱动蛋白 LIM激酶(LIMK) 微管/微管蛋白 MPS1 核苷抗代谢药/类似物 P97 PAK PARP PERK Polo样激酶(PLK) PPAR RAD51 岩石 抗衰老酶 SRPK 端粒酶 TOPK 拓扑异构酶 WEE1
细胞骨架 >
Arp2/3复合物 动力素 间隙连接蛋白 Integrin 驱动蛋白 微管/微管蛋白 MPS1 肌球蛋白 PAK
表观遗传学 >
AMPK 极光激酶 DNA甲基转移酶 表观遗传读者域 HDAC 组蛋白乙酰转移酶 组蛋白去甲基化酶 组蛋白甲基转移酶 JAK 微RNA PARP PKC 抗衰老酶 蛋白质精氨酸脱亚胺酶
G 蛋白偶联受体/G 蛋白 >
5-HT受体 腺苷受体 腺苷酸环化酶 脂联素受体 肾上腺素能受体 血管紧张素受体 Bombesin Receptor 缓激肽受体 大麻素受体 CaSR的 CCR CGRP受体 胆囊收缩素受体 CRFR CXCR 多巴胺受体 EBI2/GPR183 内皮素受体 GHSR 胰高血糖素受体 糖皮质激素受体 GNRH受体 GPCR19 GPR109A GPR119 GPR120 GPR139 GPR40 GPR55 GPR84 鸟苷酸环化酶 组胺受体 咪唑啉受体 白三烯受体 LPL受体 由mAChR MCHR1(GPR24) 褪黑激素受体 谷氨酸受体 Motilin Receptor 神经激肽受体 神经肽Y受体 神经降压素受体 阿片受体 食欲素受体(OX受体) 催产素受体 P2Y受体 前列腺素受体 蛋白酶激活受体(PAR) 拉斯 RGS蛋白质 Sigma Receptor 生长抑素受体 TSH受体 Urotensin Receptor 血管加压素受体 黑皮素受体
免疫及炎症 >
芳基烃受体 CCR 补充系统 COX CXCR FLAP 组胺受体 IFNAR 白细胞介素相关 IRAK MyD88的 一氧化氮合酶 NOD样受体(NLR) PD-1/PD-L1 PGE合成酶 盐诱导激酶(SIK) SPHK 血小板生成素受体 Toll样受体(TLR) 精氨酸
JAK/STAT信号通路 >
EGFR JAK 皮姆 STAT
MAPK/ERK信号通路 >
ERK JNK KLF MAP3K MAP4K MAPKAPK2(MK2) MEK 混合谱系激酶 MNK p38 MAPK 拉夫 核糖体S6激酶(RSK)
跨膜转运 >
ATP合成酶 BCRP 钙通道 CFTR 氯离子通道 CRAC频道 CRM1 EAAT2 GABA受体 GLYT HCN频道 iGluR 单胺转运蛋白 单羧酸转运蛋白 Na+/Ca2+交换器 Na+/HCO3-协同转运蛋白 Na+/K+ATP酶 胆碱受体 NKCC P-糖蛋白 P2X受体 钾通道 质子泵 SGLT 钠通道 TRP频道 URAT1
代谢酶/蛋白酶 >
15-PGDH 5 alpha还原酶 5脂氧合酶 乙酰辅酶A羧化酶 酰基转移酶 腺苷脱氨酶 腺苷激酶 醛脱氢酶(ALDH) 醛糖还原酶 氨肽酶 血管紧张素转换酶(ACE) ATGL ATP柠檬酸裂解酶 碳酸酐酶 组织蛋白酶 CETP COMT 细胞色素P450 二肽基肽酶 多巴胺β-羟化酶 E1/E2/E3酶 弹性蛋白酶 烯醇化酶 FAAH FABP 因子Xa 法呢基转移酶 脂肪酸合成酶(FAS) FXR 葡萄糖激酶 GSNOR 谷胱甘肽S-转移酶 HCV蛋白酶 己糖激酶 HIF/HIF脯氨酰-羟化酶 艾滋病毒整合酶 HIV蛋白酶 HMG-CoA还原酶(HMGCR) HSP 吲哚胺2,3-二氧化酶(IDO) 异柠檬酸脱氢酶(IDH) 乳酸脱氢酶 LXR MAGL 盐皮质激素受体 线粒体代谢 MMP NAMPT NEDD8活化酶 脑啡肽酶 PAI-1 PDHK PGC-1α 磷酸酶 磷酸二酯酶(PDE) 磷脂 前胶原C蛋白酶 蛋白酶体 丙酮酸激酶 RAR/RXR 肾素 ROR Ser/Thr蛋白酶 SGK 硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD) 凝血酶 色氨酸羟化酶 酪氨酸酶 黄嘌呤氧化酶
神经信号通路 >
5-HT受体 疼痛 腺苷激酶 β淀粉样蛋白 β-分泌 蛋白激酶 CGRP受体 COMT 多巴胺受体 多巴胺转运蛋白 FAAH GABA受体 GLYT iGluR 咪唑啉受体 mAChR 褪黑激素受体 单胺氧化酶 胆碱受体 神经激肽受体 阿片受体 5-羟色胺转运蛋白 γ分泌酶
NF-κB信号通路 >
NF-κB IKK KEAP1-Nrf2 MALT1
PI3K/Akt/mTOR 信号通路 >
AKT AMPK ATM/ATR DNA-PK GSK-3 MELK mTOR PDK-1 PI3K PI4K PIKfyve PTEN
蛋白裂解靶向嵌合体 >
PROTAC E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate E3 Ligase的配体 PROTAC Linker 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
蛋白酪氨酸激酶 >
ACK1 ALK BCR-ABL BMX激酶 BTK c-FMS c-Kit c-Met的/HGFR 盘基蛋白结构域受体 DYRK EGFR 艾弗林受体 FAK FGFR FLT3 IGF-1R 胰岛素受体 IRAK ITK PDGFR PKA PYK2 ROS SRC SYK TAM Receptor Trk Receptor VEGFR
干细胞及 Wnt 通路 >
酪蛋白激酶 ERK GLI GSK-3 Hedgehog Hippo (MST) JAK Notch OCT3/4 PKA 豪猪 岩石 SFRP-1 SMO STAT TGF-β/Smad蛋白 Wnt信号 YAP β-catenin γ分泌酶
TGF-beta/Smad 信号通路 >
TGF-β/Smad蛋白 PKC 岩石 TGF-β受体
维生素 D 相关 >
VD/VDR
其他 >
雄激素受体 芳香 雌激素受体/ERR 孕激素受体 甲状腺激素受体 其他

Boc-NH-PEG2-NH-Boc

Boc-NH-PEG2-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:475591-59-4
  • 分子式:C16H32N2O6
  • 分子量:348.43500
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Bis-propargyl-PEG1

Bis-propargyl-PEG1 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:40842-04-4
  • 分子式:C8H10O2
  • 分子量:138.16400
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Boc-Aminooxy-PEG2-C2-amine

Boc-Aminooxy-PEG2-C2-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:252378-69-1
  • 分子式:C11H24N2O5
  • 分子量:264.32
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Pomalidomide 4'-PEG3-azide

Pomalidomide 4'-PEG3叠氮化物是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,包含基于Pomalidomide的cereblon配体和连接物。聚马利度胺4'-PEG3叠氮化物可用于合成伊鲁卡巴利B-TP3(化合物3)。iRucaparib-TP3是一种高效的PARP1降解剂,通过使用PROTAC方法,基于鲁卡帕肋[1]。

  • CAS号:2271036-46-3
  • 分子式:C21H26N6O7
  • 分子量:474.47
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Lenalidomide-4-aminomethyl

来那度胺-4-氨基甲基是用于补充CRBN蛋白的来那度胺基cereblon(CRBN)配体。来那度胺-4-氨基甲基可通过连接物连接到蛋白质的配体,形成PROTAC[1]。

  • CAS号:790652-68-5
  • 分子式:C14H15N3O3
  • 分子量:273.29
  • 类别:E3 Ligase的配体
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

叠氮-六聚乙二醇-羧酸

Azido-PEG6-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:361189-66-4
  • 分子式:C15H29N3O8
  • 分子量:379.41
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

MZ 1

MZ 1 是基于 PROTAC 技术的 BRD4 蛋白质降解剂。

  • CAS号:1797406-69-9
  • 分子式:C49H60ClN9O8S2
  • 分子量:1002.64
  • 类别:表观遗传读者域
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC STAT3 degrader-2

PROTAC STAT3降解剂-2是一种选择性且有效的STAT3蛋白PROTAC降解剂,在Molm-16细胞中DC50为3.54μM。PROTAC STAT3降解剂-2有潜力用于癌症研究[1]。

  • CAS号:2429877-78-9
  • 分子式:C59H60F2N9O13P
  • 分子量:1172.13
  • 类别:STAT
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

m-PEG3-S-PEG4-propargyl

m-PEG3-S-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

  • CAS号:2055040-85-0
  • 分子式:C18H34O7S
  • 分子量:394.52
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Bromoacetamido-PEG2-C2-acid

Bromoacetamido-PEG2-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:1415800-44-0
  • 分子式:C9H16BrNO5
  • 分子量:298.131
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:1.5±0.1 g/cm3
  • 沸点:491.4±45.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:251.0±28.7 °C

Sulfo DBCO-PEG4-Maleimide

Sulfo DBCO-PEG4-Maleimide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:2055198-07-5
  • 分子式:C39H47N5O13S
  • 分子量:825.88
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Ms-PEG4-t-butyl ester

Ms-PEG4-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:870487-48-2
  • 分子式:C16H32O9S
  • 分子量:400.485
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:1.1±0.1 g/cm3
  • 沸点:499.9±40.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:256.1±27.3 °C

SCO-PEG3-COOH

SCO-PEG3-COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。SCO-PEG3-COOH 含有的 SCO 和 COOH 可以分别与氨基共价结合。SCO 通常用于与蛋白质或多肽的氨基酸残基(特别是赖氨酸)发生反应。

  • CAS号:2141976-36-3
  • 分子式:C18H29NO7
  • 分子量:371.43
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Diazo Biotin-PEG3-azide

Diazo Biotin-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:1339202-33-3
  • 分子式:C33H45N9O7S
  • 分子量:711.831
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

m-PEG7-Tos

m-PEG7-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:79622-11-0
  • 分子式:C22H38O10S
  • 分子量:494.59600
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Azido-PEG4-tetra-Ac-beta-D-glucose

Azido-PEG4-tetra-Ac-beta-D-glucose 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:153252-44-9
  • 分子式:C22H35N3O13
  • 分子量:549.53
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Lenalidomide-5-aminomethyl hydrochloride

来那度胺-5-氨基甲基盐酸盐是用于补充CRBN蛋白的来那度胺基cereblon(CRBN)配体。来那度胺-5-氨基甲基盐酸盐可通过连接物连接到蛋白质配体,形成PROTAC[1]

  • CAS号:1158264-69-7
  • 分子式:C14H16ClN3O3
  • 分子量:309.748
  • 类别:E3 Ligase的配体
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

DBCO-PEG1-acid

DBCO-PEG1-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:2228857-38-1
  • 分子式:C24H24N2O5
  • 分子量:420.46
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PROTAC RIPK degrader-2

PROTAC RIPK degrader-2 是一种非肽性PROTAC,它以丝氨酸苏氨酸激酶 RIPK2 为靶点,对 RIPK2 的降解具有高度选择性。

  • CAS号:1801547-16-9
  • 分子式:C52H65N7O11S3
  • 分子量:1060.31
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

NH2-PEG3-C6-Cl

NH2-PEG3-C6-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:1261350-60-0
  • 分子式:C12H26ClNO3
  • 分子量:267.79
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

四乙二醇二甲醚

Me-PEG4-Me 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:143-24-8
  • 分子式:C10H22O5
  • 分子量:222.279
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:1.0±0.1 g/cm3
  • 沸点:275.3±0.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:−30 °C(lit.)
  • 闪点:140.6±0.0 °C

一缩二乙二醇单乙酯

Ethyl acetate-PEG1 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:2093-20-1
  • 分子式:C6H12O4
  • 分子量:148.15700
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

十四甘醇

HO-PEG14-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:1189112-05-7
  • 分子式:C28H58O15
  • 分子量:634.751
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:1.1±0.1 g/cm3
  • 沸点:660.2±50.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:353.1±30.1 °C

Ac4GlcNAlk

Ac4GlcNAlk 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:1361993-37-4
  • 分子式:C19H25NO10
  • 分子量:427.40
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

ND1-YL2

ND1-YL2 是一种 PROTAC,能够通过 N-degron 途径选择性降解 SRC-1。ND1-YL2 能显著抑制体外和体内的癌症侵袭和迁移。ND1-YL2 可用于癌症的研究。

  • CAS号:2582803-80-1
  • 分子式:C114H189N27O28
  • 分子量:2385.88
  • 类别:PROTAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Acryloyl-PEG4-OH

Acryloyl-PEG4-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:26150-06-1
  • 分子式:C11H22O5
  • 分子量:234.28900
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Cbl-b-IN-2

Cbl-b-IN-2(实施例8)是一种口服生物可利用化合物,可抑制泛素蛋白酶体途径中的E3酶Casitas b系淋巴瘤原癌基因-b(Cbl-b)。Cbl-b-IN-2可用于调节免疫系统和易受免疫系统调节的疾病。Cbl-b-IN-2(实施例8)也可以单独或作为组合的一部分,与免疫检查点抑制剂、抗肿瘤剂和放射剂中的一种或多种一起给药于癌症个体[1]。

  • CAS号:2503325-21-9
  • 分子式:C29H30F5N5O2
  • 分子量:575.57
  • 类别:E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Pyrene-PEG2-azide

Pyrene-PEG2-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:2135330-58-2
  • 分子式:C23H22N4O3
  • 分子量:402.45
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

BM-PEG3

BM-PEG3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

  • CAS号:86099-06-1
  • 分子式:C16H20N2O7
  • 分子量:352.33900
  • 类别:PROTAC Linker
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:71-72ºC
  • 闪点:N/A

PROTAC RAF degrader 1

PROTAC-RAF降解器1(化合物512)是PROTAC-RAF降解器。PROTAC RAF降解剂1诱导BRAF突变体的靶向降解(BRAF V600E、V600K、G464V、G469A、K601E的DC50:5.4 nM、4.64 nM、15.5 nM、2.11 nM、63.9 nM)。PROTAC RAF降解剂1具有抗肿瘤活性。PROTAC RAF降解器1可用于研究由RAF聚集或积累或RAF组成型激活引起的疾病[1]。

  • CAS号:2413035-41-1
  • 分子式:C51H57F2N9O7S2
  • 分子量:1010.18
  • 类别:拉夫
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A