蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Ald-Ph-PEG6-Boc

Ald-Ph-PEG6-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055013-49-3
• 分子式：C₂₇H₄₃NO₁₀
• 分子量：541.63
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二乙二醇单甲醚丙酸

m-PEG2-CH2CH2COOH 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,用于 PROTAC 合成。

• CAS号：209542-49-4
• 分子式：C₈H₁₆O₅
• 分子量：192.21000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-CH2-PEG8-azide

Ald-CH2-PEG8-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-13-4
• 分子式：C₁₈H₃₅N₃O₉
• 分子量：437.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-NH-Boc

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Ald-Ph-amido-C2-PEG3-NH-Boc 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：1807540-87-9
• 分子式：C₂₁H₃₂N₂O₇
• 分子量：424.488
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：614.9±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：325.7±31.5 °C

Thalidomide-O-PEG4-Boc

Thalidomide-O-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2411681-87-1
• 分子式：C₂₈H₃₈N₂O₁₁
• 分子量：578.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-生物素基-N'-(3-马来酰亚胺基丙酰基)-3,6-二氧杂辛烷-1,8-二胺

Biotin-PEG2-Mal 是基于 PEG 结构的 PROTAC linker,可以用来制备 PROTAC。

• CAS号：305372-39-8
• 分子式：C₂₃H₃₅N₅O₇S
• 分子量：525.618
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：897.0±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：496.3±34.3 °C

Thalidomide-5-O-C5-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-O-C5-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-O-C5-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2761385-94-6
• 分子式：C₁₈H₂₂ClN₃O₅
• 分子量：395.84
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amino-PEG3-NH2 hydrochloride

Pomalidomide-氨基-PEG3-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于Pomalidomide的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2380273-75-4
• 分子式：C₂₁H₂₇ClN₄O₈
• 分子量：498.91
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(E)-TCO-PEG4-NHS ester

(E) -TCO-PEG4-NHS酯是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1621096-79-4
• 分子式：C₂₄H₃₈N₂O₁₀
• 分子量：514.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-L-羟脯氨酸

Boc-Hyp-OH是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Boc Hyp OH也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：13726-69-7
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₅
• 分子量：231.246
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：390.9±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：123-127 °C(lit.)
• 闪点：190.2±27.9 °C

Thalidomide-5-O-CH2-COO(t-Bu)

Thalidomide-5-O-CH2-COO(t-Bu) 是 t-Bu 修饰的 Thalidomide (HY-14658),可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-5-O-CH2-COO(t-Bu) 末端的 t-Bu 保护基团,可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-5-O-CH2-COO(t-Bu) 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2682112-10-1
• 分子式：C₁₉H₂₀N₂O₇
• 分子量：388.37
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methyltetrazine-acid

Methyltetrazine-acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1380500-88-8
• 分子式：C₁₁H₁₀N₄O₂
• 分子量：230.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-PEG5-alcohol

N-Boc-PEG5-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1404111-67-6
• 分子式：C₁₅H₃₁NO₇
• 分子量：337.409
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：451.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：226.8±27.3 °C

Boc-NH-O-C1-NHS ester

Boc-NH-O-C1-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：80366-85-4
• 分子式：C₁₁H₁₆N₂O₇
• 分子量：288.25400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：114 °C
• 闪点：N/A

N-(DBCO-PEG4)-N-Biotin-PEG4-NHS

N-(DBCO-PEG4)-N-Biotin-PEG4-NHS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-72-8
• 分子式：C₅₄H₇₄N₆O₁₆S
• 分子量：1095.26
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG2-alcohol

endo-BCN-PEG2-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807501-85-4
• 分子式：C₁₇H₂₇NO₅
• 分子量：325.400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：496.9±30.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：254.3±24.6 °C

Propanol-PEG4-CH2OH

Propanol-PEG4-CH2OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：156868-17-6
• 分子式：C₁₂H₂₆O₆
• 分子量：266.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

乙酸-五聚乙二醇-乙酸

PEG6-(CH2CO2H)2 是一个对称的 PEG 连接桥,用于 Homo-PROTACs 的合成。Homo-PROTACs 是能诱导自降解的 VHL E3 泛素连接酶二价小分子二聚体。

• CAS号：77855-76-6
• 分子式：C₁₄H₂₆O₁₀
• 分子量：354.35
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis(m-PEG4)-N-OH

Bis(m-PEG4)-N-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2182601-79-0
• 分子式：C₁₈H₃₉NO₉
• 分子量：413.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-四聚乙二醇-羧酸

Amino-PEG3-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：134978-99-7
• 分子式：C₈H₁₇NO₅
• 分子量：207.22400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH-bis-PEG5

NH-bis-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：63721-06-2
• 分子式：C₂₀H₄₃NO₁₀
• 分子量：457.55600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG5-C2-NH2

Fmoc-NH-PEG5-C2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093277-71-3
• 分子式：C₂₇H₃₈N₂O₇
• 分子量：502.60
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Homo-PROTAC cereblon降解剂1

Homo-PROTAC cereblon degrader 1 (compound 15a) 是 CRBN 蛋白的高效降解剂,对IKZF1和IKZF3的影响很小。

• CAS号：2244520-98-5
• 分子式：C₃₂H₃₂N₆O₁₀
• 分子量：660.63
• 类别：E1/E2/E3酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide

Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。Ald-Ph-amido-C2-PEG3-azide 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：1807540-88-0
• 分子式：C₁₆H₂₂N₄O₅
• 分子量：350.370
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2,5-二氧代吡咯烷-1-基 1-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)-3-氧代-7,10,13,16,19,22-六氧杂-4-氮杂二十五烷-25-酸酯

Mal-amido-PEG6-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1137109-21-7
• 分子式：C₂₆H₃₉N₃O₁₃
• 分子量：601.60000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-PEG4-NHS ester

Thalidomide-O-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2411681-88-2
• 分子式：C₂₈H₃₃N₃O₁₃
• 分子量：619.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG6-t-butyl ester

Benzyl-PEG6-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2148296-00-6
• 分子式：C₂₄H₄₀O₈
• 分子量：456.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RIP2 Kinase Inhibitor 4

RIP2激酶抑制剂4是一种有效和选择性的RIPK2蛋白。RIP2激酶抑制剂4有效降解RIPK2(8的pIC50)并抑制相关TNF-α的释放[1]。

• CAS号：2126803-41-4
• 分子式：C₅₀H₆₆F₂N₁₄O₇S
• 分子量：1045.21
• 类别：RIP激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N,N'-bis-(azide-PEG3)-Cy5

NN'-bis-(azide-PEG3)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-46-9
• 分子式：C₄₁H₅₇ClN₈O₆
• 分子量：793.39
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(4R)-4-羟基-D-脯氨酸甲酯盐酸盐

D-脯氨酸,4-羟基-甲酯盐酸盐是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。D-脯氨酸,4-羟基-甲酯盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]

• CAS号：114676-59-4
• 分子式：C₆H₁₂ClNO₃
• 分子量：181.617
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：121-123 ºC
• 闪点：N/A