1418308-27-6

• 常用中文名：6-氰基-N-[(1,2-二氢-4,6-二甲基-2-氧代-3-吡啶基)甲基]-1-(1-乙基丙基)-1H-吲哚-4-甲酰胺
• 常用英文名：EI1
• CAS号：1418308-27-6
• 分子式：C₂₃H₂₆N₄O₂
• 分子量：390.478
• 相关类别： 生物化工 抑制剂 表观遗传学(Epigenetics) Histone Methyltransferase 抑制剂
• 发布时间：2016-04-11 09:02:55
• 更新时间：2024-01-31 18:02:17
• EI1 是一种新颖的，有效的 EZH2 抑制剂，能够作用于 EZH2 (WT) 和 EZH2 (Y641F)，IC₅₀ 值分别为 15 nM 和 13 nM。

名称

• 中文名: 6-氰基-N-[(1,2-二氢-4,6-二甲基-2-氧代-3-吡啶基)甲基]-1-(1-乙基丙基)-1H-吲哚-4-甲酰胺
• 英文名: 6-Cyano-N-[(4,6-dimethyl-2-oxo-1,2-dihydro-3-pyridinyl)methyl]-1- (3-pentanyl)-1H-indole-4-carboxamide
• 英文别名: 6-Cyano-N-[(4,6-dimethyl-2-oxo-1,2-dihydro-3-pyridinyl)methyl]-1-(3-pentanyl)-1H-indole-4-carboxamide; 1H-Indole-4-carboxamide, 6-cyano-N-[(1,2-dihydro-4,6-dimethyl-2-oxo-3-pyridinyl)methyl]-1-(1-ethylpropyl)-; EI1

物化性质

• 密度: 1.2±0.1 g/cm3
• 沸点: 675.9±55.0 °C at 760 mmHg
• 分子式: C₂₃H₂₆N₄O₂
• 分子量: 390.478
• 闪点: 362.6±31.5 °C
• 精确质量: 390.205566
• PSA: 94.43000
• LogP: 2.92
• 外观性状: 粉末
• 蒸汽压: 0.0±2.1 mmHg at 25°C
• 折射率: 1.617
• 储存条件: -20℃

生物活性

• 描述: EI1 是一种新颖的,有效的 EZH2 抑制剂,能够作用于 EZH2 (WT) 和 EZH2 (Y641F),IC50 值分别为 15 nM 和 13 nM。
• 相关类别:
  信号通路 >> 表观遗传学 >> 表观遗传读者域
  信号通路 >> 表观遗传学 >> 组蛋白甲基转移酶
  研究领域 >> 癌症
• 靶点:

  IC50: 15 nM (EZH2 wild type), 13 nM (EZH2 Y641F mutant type)

• 体外研究: 在DLBCL细胞中,EI1抑制细胞H3K27甲基化并激活Ezh2靶基因p16表达。在小鼠胚胎成纤维细胞中,EI1还抑制H3K27me3和细胞增殖。此外,EI1选择性抑制携带Ezh2突变的DLBCL细胞的生长,并引起细胞周期停滞和细胞凋亡[1]。
• 激酶实验: 对于IC50测定，将EI1在DMSO中连续稀释三倍，总共12个浓度，起始浓度为1μM。将反应物在室温下温育120分钟，并通过加入猝灭溶液（2.5％TFA和320nM d4-SAH）终止反应。使用具有Turbulon Spray和Prominence UFLC的API 4000三重四极杆质谱法对SAH产生进行定量。使用阳性（无抑制剂）和阴性（无酶）对照标准化抑制百分比，并使用PRISM计算IC 50。 S-腺苷甲硫氨酸（SAM）竞争的酶学研究在反应条件略有改变的情况下进行：10μMEII用作连续稀释的起始剂量。 SAM在1μM和50μM之间的范围内滴定（对应于1×Km和50×Km），并且底物肽在其饱和条件（10μM）下存在于最终反应混合物中。对于组蛋白甲基转移酶（HMT），所有HMT都是来自大肠杆菌或杆状病毒系统的纯化重组蛋白。 G9a，SuV39H2，Set7 / 9，CARM1，SETD8，NSD3，SETD2和Dot1L的催化结构域和全长SmyD2蛋白用于生物化学测定。用酶学研究仔细表征HMT生化反应，并测定SAM和底物Km。对于大多数HMT，SAM和底物浓度保持在它们各自的Km，除了具有低SAM-Km值的那些（SmyD2和Set7 / 9），其中使用0.5μMSAM。使用相同的测定形式进行所有HMT反应，其中通过LC-MS定量来自生化反应的SAH的产生。
• 细胞实验: 将指数生长的弥散性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）细胞以1×10 5个细胞/ mL的密度接种于12孔板中，并具有指定浓度的EI1。通过Vi-CELL每隔3-4天测定活细胞数至14或15天。将小鼠胚胎成纤维细胞（MEF）以2.5×10 4细胞/ mL接种在六孔板中，并用EI1（3.3μM）或4-OH-三苯氧胺（100nM）处理。在第3天，第6天和第11天测定活细胞数。在细胞计数的天数，补充新鲜生长培养基和化合物并将细胞分裂回1×10 5个细胞/ mL的密度。总细胞数表示为每毫升分裂调节的活细胞。通过PRISM计算IC 50，并且所有增殖实验重复两次以上并且呈现代表性数据。
• 参考文献:

  [1]. Qi W, et al. Selective inhibition of Ezh2 by a small molecule inhibitor blocks tumor cells proliferation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Dec 26;109(52):21360-5.