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Pseudothymidine

Pseudothymidine用途

Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷 (C-nucleosid) 类似物。

Pseudothymidine名称

[ CAS 号 ]:
65358-15-8

[ 中文名 ]:
Pseudothymidine

[ 英文名 ]:
Pseudothymidine

[英文别名 ]:

N-Methyl-1-phenylethylenediamine
N1-methyl-1-phenyl-ethanediyldiamine
2-Amino-1-methylamino-1-phenyl-aethan
1-methyl-2'-deoxypseudouridine
N1-methyl-1-phenylethylenediamine
N1-Methyl-1-phenyl-aethandiyldiamin
N1-Methyl-1-phenyl-aethylendiamin
N1-methyl-1-phenyl-1,2-ethanediamine
N1-metylo-2-fenyloetylenodiamina
2'-deoxy-1-methylpseudouridine

Pseudothymidine生物活性

[ 描述 ]:

Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷 (C-nucleosid) 类似物。

[ 相关类别 ]:

信号通路 >> 细胞周期/DNA损伤 >> 核苷抗代谢药/类似物

研究领域 >> 感染

[体外研究]

假胸苷是胸苷的C-核苷类似物[1]。计算的ΔΔG°50/mod为-0.5kcal/mol,ΔTm/ mod为0.82℃。对于含有9个dA-T /ψT对的双链体,ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 1.1kcal/mol。含有12个连续dA-T /ΨT碱基对的双链体的修饰产生ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 2.1kcal/mol [2]。

[激酶实验]

用含有多达12个连续dA残基的模板进行热DNA双链变性研究，所述dA残基与其含有连续T或假胸苷（ψT）残基的补体模板配对。实验在含有模板及其互补物（每种1.5μM）的缓冲液（45mM NaCl，45mM柠檬酸钠，pH 8.1，最终体积1.5mL）中进行。在25.0至90.0℃的范围内监测吸光度（260nm），温度变化为0.5℃/ min，进行五个加热循环。丢弃初始加热循环，并通过平均剩余四个循环的温度来确定Tm。通过从含有C-糖苷（包括假胸腺嘧啶核苷）的双链体的Tm中减去含有标准碱基的双链体的Tm来计算相似双链体之间的ΔTm[2]。

[参考文献]

[1]. S Lutz, et al. An in vitro screening technique for DNA polymerases that can incorporate modified nucleotides. Pseudo-thymidine as a substrate for thermostable polymerases. Nucleic Acids Res. 1999 Jul 1; 27(13): 2792-2798.

[2]. Havemann SA, et al. Incorporation of multiple sequential pseudothymidines by DNA polymerases and their impact on DNA duplex structure. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2008 Mar;27(3):261-78.

[相关活性小分子]

Pseudothymidine物理化学性质

[ 分子式 ]:
C₁₀H₁₄N₂O₅

[ 分子量 ]:
242.22900

[ 精确质量 ]:
242.09000

[ PSA ]:
115.41000

[ 储存条件 ]:
2-8℃

Pseudothymidine

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Pseudothymidine名称

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Pseudothymidine物理化学性质

Pseudothymidine合成路线

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