Pseudothymidine

• 常用名: Pseudothymidine
• 英文名: Pseudothymidine
• CAS号: 65358-15-8
• 分子量: 242.22900
• 密度: N/A
• 沸点: N/A
• 分子式: C₁₀H₁₄N₂O₅
• 熔点: N/A
• 闪点: N/A

Pseudothymidine用途

Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷 (C-nucleosid) 类似物。

Pseudothymidine名称

• 中文名: Pseudothymidine
• 英文名: pseudothymidine

Pseudothymidine生物活性

• 描述: Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷 (C-nucleosid) 类似物。
• 相关类别:
  信号通路 >> 细胞周期/DNA损伤 >> 核苷抗代谢药/类似物
  研究领域 >> 感染
• 体外研究: 假胸苷是胸苷的C-核苷类似物[1]。计算的ΔΔG°50/mod为-0.5kcal/mol,ΔTm/ mod为0.82℃。对于含有9个dA-T /ψT对的双链体,ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 1.1kcal/mol。含有12个连续dA-T /ΨT碱基对的双链体的修饰产生ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 2.1kcal/mol [2]。
• 激酶实验: 用含有多达12个连续dA残基的模板进行热DNA双链变性研究，所述dA残基与其含有连续T或假胸苷（ψT）残基的补体模板配对。实验在含有模板及其互补物（每种1.5μM）的缓冲液（45mM NaCl，45mM柠檬酸钠，pH 8.1，最终体积1.5mL）中进行。在25.0至90.0℃的范围内监测吸光度（260nm），温度变化为0.5℃/ min，进行五个加热循环。丢弃初始加热循环，并通过平均剩余四个循环的温度来确定Tm。通过从含有C-糖苷（包括假胸腺嘧啶核苷）的双链体的Tm中减去含有标准碱基的双链体的Tm来计算相似双链体之间的ΔTm[2]。
• 参考文献:

  [1]. S Lutz, et al. An in vitro screening technique for DNA polymerases that can incorporate modified nucleotides. Pseudo-thymidine as a substrate for thermostable polymerases. Nucleic Acids Res. 1999 Jul 1; 27(13): 2792-2798.

  [2]. Havemann SA, et al. Incorporation of multiple sequential pseudothymidines by DNA polymerases and their impact on DNA duplex structure. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2008 Mar;27(3):261-78.

Pseudothymidine物理化学性质

• 分子式: C₁₀H₁₄N₂O₅
• 分子量: 242.22900
• 精确质量: 242.09000
• PSA: 115.41000
• 储存条件: 2-8℃

Pseudothymidine英文别名

• N-Methyl-1-phenylethylenediamine
• N1-methyl-1-phenyl-ethanediyldiamine
• 2-Amino-1-methylamino-1-phenyl-aethan
• 1-methyl-2'-deoxypseudouridine
• N1-methyl-1-phenylethylenediamine
• N1-Methyl-1-phenyl-aethandiyldiamin
• N1-Methyl-1-phenyl-aethylendiamin
• N1-methyl-1-phenyl-1,2-ethanediamine
• N1-metylo-2-fenyloetylenodiamina
• 2'-deoxy-1-methylpseudouridine