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中文名 AZ505二三氟乙酸盐
英文名 N-Cyclohexyl-N3-[2-(3,4-dichlorophenyl)ethyl]-N-(2-{[2-(5-hydroxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-8-yl)ethyl]amino}ethyl)-β-alaninamide
英文别名 AZ505 ditrifluoroacetate
AZ505 (ditrifluoroacetate)
描述 AZ505 ditrifluoroacetate 是一种有效,选择性的 SMYD2 抑制剂,IC50 为 0.12 μM。
相关类别
靶点

IC50: 0.12 μM (SMYD2)[1]

体外研究 AZ505二三氟乙酸盐具有高选择性,在体外亚微摩尔浓度下具有活性。 AZ505对SMYD2的IC50为0.12μM,比其他组蛋白甲基转移酶(如SMYD3(IC50>83.3μM),DOT1L(IC50>83.3μM)和EZH2(IC50> 83.3)的AZ505的IC50大> 600倍。 μM)[1]。 AZ505是一种有效的选择性SMYD2抑制剂,IC50为0.12μM。人SMYD(SET和MYND结构域蛋白)蛋白质赖氨酸甲基转移酶家族包含五个成员(SMYD1-5)。此外,AZ505不能抑制一组蛋白质赖氨酸甲基转移酶的酶活性。 AZ505被提名用于ITC结合研究,Kd为0.5μM。相反,p53底物肽的计算Kd为3.7μM。 AZ505与SMYD2的结合主要由熵驱动,这通常表明结合是通过疏水相互作用介导的,只有很少的特定氢键[2]。
激酶实验 SMYD2在昆虫细胞中表达并纯化。 AlphaScreen技术用于筛选我们的化学文库,用于SMYD2的小分子抑制剂。在室温下使用1.25nM SMYD2蛋白,200nM SAM和100nM生物素化在TDT缓冲液(50mM Tris-HCl [pH9.0],2mM DTT和0.01%吐温20)中进行甲基化(12μL)反应。 p53肽底物(生物素 - 氨基己酰基-GSRAHSSHLKSKKGQSTSRH)在低体积384孔板中。孵育75分钟后,加入5μL检测溶液(20 mM HEPES [pH 7.4],1.7 mg / mL BSA,340 mM NaCl,680μMSAH,0.04 mg / mL链霉抗生物素蛋白包被的AlphaScreen)淬灭反应供体和蛋白A包被的受体珠)和1nM的定制p53K370me1多克隆抗体。将反应板在室温下在黑暗中温育过夜,并使用Envision 2101多标签读数器读取。对于SMYD2显示> 50%抑制的化合物被指定用于浓度剂量 - 响应测定,并且还进行人工测定。从30μM开始选择七种化合物浓度,具有六个半对数稀释步骤。人工测定条件与SMYD2酶活性测定中的相同,除了不存在SMYD2蛋白和存在1nM甲基化的p53肽。使用内部软件从剂量 - 反应数据计算IC 50值[2]。
参考文献

[1]. Komatsu S, et al. Overexpression of SMYD2 contributes to malignant outcome in gastric cancer. Br J Cancer. 2015 Jan 20;112(2):357-64.

[2]. Ferguson AD, et al. Structural basis of substrate methylation and inhibition of SMYD2. Structure. 2011 Sep 7;19(9):1262-73.

分子式 C33H40Cl2F6N4O8
分子量 805.59
PSA 106.42000
LogP 5.41260
储存条件 2-8℃