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NU7441 (KU-57788)

NU7441 (KU-57788)用途

KU-57788 是一种有效的,选择性的 DNA-PK 抑制剂,IC50 值为 13 nM。

NU7441 (KU-57788)名称

[ CAS 号 ]:
503468-95-9

[ 中文名 ]:
8-(4-二苯并噻吩基)-2-(4-吗啉基)-4H-1-苯并吡喃-4-酮

[ 英文名 ]:
NU7441 (KU-57788)

[英文别名 ]:

NU7441 (KU-57788)生物活性

[ 描述 ]:

KU-57788 是一种有效的,选择性的 DNA-PK 抑制剂,IC50 值为 13 nM。

[ 相关类别 ]:

信号通路 >> 细胞周期/DNA损伤 >> CRISPR/Cas9
信号通路 >> 细胞周期/DNA损伤 >> DNA-PK
信号通路 >> PI3K/Akt/mTOR 信号通路 >> DNA-PK
研究领域 >> 癌症

[ 靶点 ]

DNA-PK:13 nM (IC50)

CRISPR/Cas9


[体外研究]

无毒浓度0.3μM的NU7441在用低LET和高LET辐射照射的非小细胞肺癌细胞中诱导放射增敏,并且在照射的细胞中未显示双链断裂修复抑制。 NU7441(3μM)显示持续的γ-H2AX信号显着增加。 NU7441(0.3μM)引起显着的G2/M阻滞和DNA片段化的显着增加,并增强辐照的H1299细胞中的细胞衰老[1]。 NU7441(0.5至10μM)剂量和时间依赖性地抑制肝癌HepG2细胞的生长。 NU7441减少肝癌细胞中的pDNA-PKcs(S2056)蛋白表达。此外,NU7441和60CoγIR的双重治疗会影响DNA损伤的修复[2]。 NU7441在BRD4中是溶剂暴露的,这种抑制剂可归类为I型BRD抑制剂[4]。 NU7441降低了NHEJ的频率,同时提高了Cas9介导的DNA裂解后HDR的发生率[5]。

[体内研究]

肺癌细胞用低LET和高LET辐射照射,并且在照射的细胞中不显示双链断裂修复抑制。 KU-57788(3μM)显示持续的γ-H2AX信号显着增加。 KU-57788(0.3μM)引起显着的G2/M阻滞和DNA片段化的显着增加并且增强辐射的H1299细胞中的细胞衰老[1]。 KU-57788(0.5至10μM)剂量和时间依赖性地抑制肝癌HepG2细胞的生长。 KU-57788减少肝癌细胞中的pDNA-PKcs(S2056)蛋白表达。此外,KU-57788和60CoγIR的双重治疗会影响DNA损伤的修复[2]。 KU-57788弱抑制BRD4和BRDT,IC50分别为1μM和3.5μM。 KU-57788在BRD4中是溶剂暴露的,这种抑制剂可归类为I型BRD抑制剂[4]。 KU-57788降低了NHEJ的频率,同时提高了Cas9介导的DNA切割后HDR的发生率[5]。

[激酶实验]

使用StepOnePlus实时PCR系统通过DSF评估化合物对BRD4-1和BRDT-1的抑制活性。纯化的BRD4-1(4μM终浓度; 10 mM HEPES(pH7.5),100 mM NaCl和1 mM DTT)和BRDT-1(4μM终浓度; 50 mM磷酸盐(pH7.4),100 mM在96孔板中一式四份地测定NaCl和1mM DTT。加入抑制剂至终浓度为100μM和2%DMSO。蛋白质热移位染料(1:8000)用作荧光探针,并使用ROX Reporter通道(620nm)测量荧光。通过对热循环仪进行编程以使用0.2℃增量和每增量10秒的温育将温度从25℃升高至99℃来研究蛋白质稳定性。使用Protein Thermal Shift Software(v.1.1)中的Boltzmann方程计算转变曲线/熔化温度(Tm)的拐点。 JQ1(+)和dinaciclib分别用作BRD4-1的强和弱结合物的对照。通过使用DMSO对照孔作为参考来计算ΔTm。

[细胞实验]

将HepG2细胞(每孔4000个)在96孔板中培养24小时。一旦细胞完成附着,将0.1μM,1μM,5μM和10μM的KU-57788加入培养基中。在KU-57788处理12小时后,将10%CCK-8溶液加入培养基中,并继续培养2小时。通过光谱仪测定OD 450值,并分析结果以测量细胞生长。

[参考文献]

[1]. Sunada S, et al. Nontoxic concentration of DNA-PK inhibitor NU7441 radio-sensitizes lung tumor cells with little effect on double strand break repair. Cancer Sci. 2016 Sep;107(9):1250-5

[2]. Yang C, et al. NU7441 Enhances the Radiosensitivity of Liver Cancer Cells. Cell Physiol Biochem. 2016;38(5):1897-905

[3]. Hardcastle IR, et al. Discovery of potent chromen-4-one inhibitors of the DNA-dependent protein kinase (DNA-PK) using a small-molecule library approach. J Med Chem. 2005 Dec 1;48(24):7829-46

[4]. Ember SW, et al. The acetyl-lysine binding site of bromodomain-containing protein 4 (BRD4) interacts with diverse kinase inhibitors. ACS Chem Biol. 2014 Feb 25.

[5]. Robert F, et al. Pharmacological inhibition of DNA-PK stimulates Cas9-mediated genome editing. Genome Med. 2015 Aug 27;7:93


[相关活性小分子]

渥曼青霉素 | 布雷菲德菌素A | 诺考达唑 | SCR7 | LY3023414 | 9-(6-氨基-3-吡啶基)-1-[3-(三氟甲基)苯基]苯并[H]-1,6-萘啶-2(1H)-酮 | M3814 | 2-(4-吗啉基)-4H-萘并[1,2-B]吡喃-4-酮 | PIK-75 HCl | RS-1 | 齐多夫定 | CC-115 | LTURM34 | SF2523 | 2-[(4-羟基苯基)甲基]-6-(4-羟基苯基)-8-(环戊基甲基)-咪唑并[1,2-a]吡嗪-3-(7H)-酮

NU7441 (KU-57788)物理化学性质

[ 密度 ]:
1.4±0.1 g/cm3

[ 沸点 ]:
646.9±55.0 °C at 760 mmHg

[ 熔点 ]:
246.28° C

[ 分子式 ]:
C25H19NO3S

[ 分子量 ]:
413.488

[ 闪点 ]:
345.0±31.5 °C

[ 精确质量 ]:
413.108551

[ PSA ]:
70.92000

[ LogP ]:
5.98

[ 蒸汽压 ]:
0.0±1.9 mmHg at 25°C

[ 折射率 ]:
1.732

[ 储存条件 ]:
Store at +4°C

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