CAS 号为 1191237-69-0 的化合物,其化学名为 (2R,3R,4S,5R)-2-(4-氨基吡咯并[2,1-F][1,2,4]三嗪-7-基)-3,4-二羟基-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-甲腈,是一种核苷类衍生物。该化合物是抗病毒药物瑞德西韦(Remdesivir)的关键中间体,属于嘧啶并吡咯三嗪核苷结构,具有潜在的广谱抗病毒活性,尤其针对 RNA 病毒如冠状病毒。它的分子框架包括一个β-D-核糖核苷单元,在 2' 位引入氰基(-CN),并与 4-氨基吡咯并[2,1-F][1,2,4]三嗪杂环连接。这种结构设计增强了其在体内的代谢稳定性和生物活性。
从化学合成角度来看,该化合物的制备涉及核糖衍生物与杂环碱基的立体选择性偶联,通常采用 Vorbrüggen 糖基化反应或类似方法。该合成路线需严格控制立体化学配置,以确保 2R,3R,4S,5R 的天然核糖构型。合成过程复杂,涉及多步有机反应,适用于实验室规模或工业生产,但需在无菌条件下操作,并遵守 GMP 标准以避免污染。
合成路线概述
该化合物的合成一般分为三个主要阶段:核糖单元的制备、杂环碱基的合成以及二者的偶联。以下基于文献报道的典型路线(如 Gilead Sciences 的专利方法)进行描述,强调关键反应条件和注意事项。实际合成需参考最新专利(如 US 20100286134A1)和专业文献,以优化产率和纯度。
1. 核糖单元的制备
核糖核心以 2-氰基-2-脱氧核糖衍生物为基础,通常从廉价的 D-核糖起始。第一个关键步骤是引入 2-位氰基,同时保护羟基以控制反应选择性。
- 起始物料:D-核糖(或其乙酰化衍生物,如 1,2,3,5-四-O-乙酰-β-D-核糖吡喃糖)。
- 氰基引入:通过开环-闭环策略,使用氰化钠(NaCN)或三甲基硅氰(TMSCN)与糖的 2-位羟基反应。典型条件:在二甲基甲酰胺(DMF)溶剂中,室温下反应 4-6 小时,产率约 70-80%。这一步需使用 Lewis 酸催化剂如 BF₃·Et₂O,以促进立体选择性,形成 (2R)-2-氰基配置。
- 保护基团策略:生成的糖醛酸氰基化合物需引入保护基,如乙酰基(Ac)或苄基(Bn),以掩蔽 3',4',5' 位羟基。使用乙酸酐(Ac₂O)和吡啶在冰浴下反应 2 小时,避免过保护导致的副产物。
- 立体控制:整个过程依赖于核糖的天然 β-构象,通过 NMR 监测确保无 α-异构体形成。
此阶段产率通常为 60-75%,得到中间体 (2R,3R,4S,5R)-2-氰基-3,4,5-三-O-保护-四氢呋喃-2-甲腈。
2. 杂环碱基的合成
4-氨基吡咯并[2,1-F][1,2,4]三嗪-7-基(简称 PT 碱基)是该化合物的关键部分,其合成涉及吡咯和三嗪环的构建,通常从商用 4-氯吡咯并[2,1-F][1,2,4]三嗪起始。
- 起始物料:4-氯-7H-吡咯并[2,1-F][1,2,4]三嗪。
- 氨基引入:在 7-位引入取代基,先通过氨解取代 4-位氯原子。使用浓氨水(25% NH₄OH)在乙醇中,回流 8-12 小时,产率 >90%。这一步需控制温度以避免三嗪环开裂。
- 7-位活化:为后续糖基化,将 7-位转化为硅氧烷或氯化物。常见方法是使用 N,O-双(三甲基硅基)乙酰胺(BSA)处理,形成活性硅中间体。该反应在无水条件下进行,氮气保护,避免水分干扰。
- 纯化:通过柱色谱(硅胶,乙酸乙酯/己烷洗脱)分离,监控 TLC 以确保纯度 >95%。
PT 碱基的合成相对简便,整体产率可达 80%以上,但需注意其对光和热的敏感性,储存于 -20°C 下。
3. 糖-碱基偶联与去保护
偶联是合成核心,采用 Vorbrüggen 反应变体,利用活性糖和碱基在 Lewis 酸催化下形成 N-糖苷键。
- 反应条件:将保护的 2-氰基核糖(1 当量)与 PT 碱基(1.2 当量)在 DMF 或二氯甲烷(DCM)中混合,加入催化剂如 SnCl₂ 或 TMSOTf(0.1-0.2 当量)。反应温度控制在 0-25°C,搅拌 2-4 小时。立体选择性高,β-异构体选择性 >95%,得率 70-85%。
- 机制简述:Lewis 酸激活糖的 1-位,形成氧鎓离子中间体,随后 PT 碱基的 7-位氮攻击,形成 C-N 键。该步骤的关键是避免氰基水解,使用干燥溶剂和分子筛。
- 去保护:偶联后产物为全保护核苷,使用甲醇钠(NaOMe)在甲醇中室温反应 1 小时,去除乙酰基。进一步用氢化催化(如 Pd/C 和 H₂)去除苄基保护,若适用。最终产物通过 HPLC 纯化,收集 Rt ≈15 min 的组分。
- 表征:产物用 ¹H NMR 确认立体(J_{1',2'} ≈ 5 Hz 表示 β-构型)、MS (m/z [M+H]⁺ ≈ 378) 和 IR (CN 伸缩峰 ≈ 2250 cm⁻¹) 验证。
整个偶联和去保护阶段产率约 65%,总合成路线从起始物到最终产物的总产率 30-50%,视规模而定。
合成注意事项与挑战
- 安全考虑:氰化物试剂毒性高,操作需在通风橱中,使用 PPE(个人防护装备)。Lewis 酸具腐蚀性,避免皮肤接触。废液处理遵守环保法规,氰基废物需中和。
- 优化策略:工业规模可采用连续流反应器提升效率,减少副产物如 N7-糖苷异构体。手性 HPLC 用于 chiral 纯度检查,确保 ee >99%。
- 常见问题:低产率常因糖保护不均或碱基不纯导致。通过添加 DMAP 作为催化剂可改善糖基化选择性。光降解是另一挑战,反应全程避光。
- 替代路线:文献中也有酶促合成变体,使用核苷酸转移酶偶联,但适用于小规模。酶法产率高(>80%),但成本较高。
应用与展望
该化合物的合成不仅支持瑞德西韦的生产,还为设计新型抗病毒核苷铺平道路。其氰基修饰提升了亲脂性和抗酶降解能力。在药物化学中,类似路线可扩展到其他修饰如氟化或磷酸化。研究者应关注绿色合成,如使用可再生溶剂替换 DMF,以降低环境影响。
总之,该合成路线体现了现代有机化学的精确性和多学科整合,适用于制药领域。实际操作前,建议咨询专业数据库如 Reaxys 或 SciFinder 获取最新协议。