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N-[12-[((7-硝基-2-1,3-苯并恶二唑-4-基)氨基]十二烷酰基] -D-赤型-鞘氨醇

用途

C12 NBD神经酰胺是神经酰胺的荧光类似物,可作为神经酰胺酶检测的底物[1][2]。

名称

[ CAS 号 ]:
202850-01-9

[ 中文名 ]:
N-[12-[((7-硝基-2-1,3-苯并恶二唑-4-基)氨基]十二烷酰基] -D-赤型-鞘氨醇

[ 英文名 ]:
N-[12-[(7-NITRO-2-1,3-BENZOXADIAZOL-4-YL)AMINO]DODECANOYL]-CERAMIDE

[英文别名 ]:

生物活性

[ 描述 ]:

C12 NBD神经酰胺是神经酰胺的荧光类似物,可作为神经酰胺酶检测的底物[1][2]。

[ 相关类别 ]:

研究领域 >> 其他

信号通路 >> 其他 >> 其他

[体外研究]

指南(以下是我们推荐的方案。该方案仅提供指南,应根据您的具体需要进行修改)。在本实验中,C12 NBD神经酰胺用作荧光nCDase底物,反应产物将通过反相高效液相色谱分离[2]：1.20µM底物、75 mM NaCl中的1 nM nCDase、25 mM HEPES(pH 8.0)和0.4%Triton X-100,在37°C下,最终体积为100µL,持续2小时。2.用1:1氯仿-甲醇提取样品,在氮气下干燥,并在60µL HPLC流动相B中再次悬浮。使用Spectra 3µm C8SR柱(3μm颗粒,3.0×150 mm)通过反相HPLC分离反应产物。3.流动相A在HPLC级水中含有0.2%甲酸和1mM甲酸铵。流动相B在HPLC级甲醇中含有0.2%甲酸(IL)和1mM甲酸铵。4.基于FRET的分析,使用20µM底物ES.173.cds、50 ng nCDase、75 mM NaCl、15 mM磷酸钠(pH 7.4)和0.3%Triton X-100在96个黑孔板中进行3小时。5.测量共振荧光(Ex=347 nm,Em=430和530 nm)。

[参考文献]

[1]. Tani M, et al. Specific and sensitive assay for alkaline and neutral ceramidases involving C12-NBD-ceramide. J Biochem. 1999 Apr;125(4):746-9.

[2]. Otsuka Y, et al. Identification of Small-Molecule Inhibitors of Neutral Ceramidase (nCDase) via Target-Based High-Throughput Screening. SLAS Discov. 2021 Jan;26(1):113-121.

物理化学性质

[ 密度 ]:
1.1±0.1 g/cm3

[ 分子式 ]:
C₃₆H₆₁N₅O₆

[ 分子量 ]:
659.899

[ 精确质量 ]:
659.462158

[ PSA ]:
166.33000

[ LogP ]:
11.44

[ 折射率 ]:
1.547

[ 储存条件 ]:
-20°C，密闭，干燥

N-[12-[((7-硝基-2-1,3-苯并恶二唑-4-基)氨基]十二烷酰基] -D-赤型-鞘氨醇

用途

名称

生物活性

物理化学性质

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