XL413

XL413 是一种有效的,选择性的,ATP 竞争性的 Cdc7 抑制剂,IC50 值为 3.4 nM,同时对 CK2 和 PIM1 的 IC50 值分别为 215 和 42 nM,对 pMCM 的 EC50 值为 118 nM。

研究领域 >> 癌症

Cdc7:3.4 nM (IC50)

PIM1:42 nM (IC50)

CK2:215 nM (IC50)

XL413抑制细胞增殖(IC50 = 2685nM),降低细胞活力(IC50 = 2142nM)并在Colo-205细胞中引发胱天蛋白酶3/7活性(EC50 = 2288nM)。 XL413还显着抑制了软琼脂中colo-205的不依赖贴壁的生长(IC50 = 715 nM)[1]。 XL413显示对肿瘤的细胞毒性作用,HCC1954细胞中IC50为22.9μM,Colo-205细胞中IC50为1.1μM。 XL413在Colo-205细胞中诱导凋亡,但在HCC1954细胞中不诱导凋亡。 XL413是体外有效的DDK抑制剂,IC50为22.7 nM。 XL413在抑制HCC1954细胞中DDK依赖性Mcm2磷酸化方面存在缺陷,但在Colo-205细胞中有效[2]。

XL413(100 mg/kg,po)在小鼠中显示出优异的血浆暴露,并具有良好的PK特性。 XL413(10,30或100 mg/kg,口服)在所有剂量下耐受良好,没有明显的体重减轻[1]。

将20ng纯化的人DDK与递增浓度的每种DDK抑制剂一起预孵育5分钟。然后在含有50mM Tris-HCl（pH 7.5），10mM MgCl 2和1mM DTT的缓冲液中加入10μCi（γ）-32P ATP和1.5μM冷ATP，并在30℃温育30分钟。将蛋白质在1X Laemmli缓冲液中于100℃变性，然后在HyBlot CL膜上进行SDS-PAGE和放射自显影。 DDK的自磷酸化用作其激酶活性的指标。使用ImageJ定量32P标记的条带，并使用GraphPad计算IC 50值。

对于96孔板中的测定，每孔接种2500个细胞。 24小时后，用小分子抑制剂处理细胞，并在37℃下培养72小时。随后裂解细胞并使用CellTiter-Glo测定法测量ATP含量作为代谢活性细胞的指示物。使用GraphPad软件计算IC 50值。对于六孔板中的测定，每孔接种100,000个细胞。 24小时后，用小分子抑制剂处理细胞并孵育不同的时间点。用胰蛋白酶消化细胞，并在5mL磷酸盐缓冲盐水中制备悬浮液。将30μL该悬浮液与30μLCellTiter-Glo试剂混合，然后在室温下孵育10分钟。使用EnVision 2104 Multilabel Reader和BioTek Synergy Neo Microplate Reader测量发光。

[1]. Koltun ES, et al. Discovery of XL413, a potent and selective CDC7 inhibitor. Bioorg Med Chem Lett. 2012 Jun 1;22(11):3727-31.

[2]. Sasi NK, et al. The potent Cdc7-Dbf4 (DDK) kinase inhibitor XL413 has limited activity in many cancer cell lines and discovery of potential new DDK inhibitor scaffolds. PLoS One. 2014 Nov 20;9(11):e113300.

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